SlideShare una empresa de Scribd logo
1 de 34
Microbiología Ambiental
y Biotecnología
Mg. Luis Carlos Lizárraga Vargas
Identificación
Microbiana
• 1. Métodos basados en criterios morfológicos
• 2. Métodos basados en tinción diferencial
• 3. Métodos basados en pruebas bioquímicas
• 4. Métodos basados en pruebas serológicas
• 5. Métodos basados en detección molecular
1. Métodos basados en criterios
morfológicos
Tinción de wright
Tinción verde malaquita
Característica culturales
2. Métodos basados en tinción
diferencial
Tinción de GRAM +/-
Tinción de Ziehl Neelsen
Falsos positivos con
Nocardia sp y Actinomyces
3. Métodos basados en pruebas
bioquímicas (enterobacterias)
Índice
Analítico
de Perfil
( Tiras API)
Identificación Bacteriana
• Hidrólisis del Almidón
• Degradación de la caseína (Agar Leche
Descremada)
• Hidrólisis de la lecitina y reducción del telurito
(Agar yema de huevo)
• Licuefacción de la gelatina (Gelatina Nutritiva)
• Fermentación de carbohidratos
• Oxidación/Fermentación (Hugh and Leifson)
• Agar Hierro de Kligler
• Reducción de Nitratos
• Prueba de la coagulasa
• ………..
4. Métodos basados en ensayos
Serológicos
• Los Métodos serológicos implica la utilización de
preparaciones de inmunoglobulinas especificas
provenientes de muestras biológicas .
5. Métodos basados en detección
Molecular
IDENTIFICACIÓN DE ESPECIE
• secuencias del gen ARNr 16S
ADNr 16S ARNr 16S
/
Operon ribosomico “rrn”
IG IG
16S 23S 5S
ADNr 16s
Utilización como herramienta
filogenética y taxonómica
• Se trata de una molécula muy antigua,
presente en todas las bacterias
actuales. Constituye, por tanto, una
diana universal para su
identificación.
• Esta región es altamente
conservada, presenta regiones
comunes en todos los organismos
pero tienen variaciones en zonas
especificas en cada ESPECIE
bacteriana.
• Su estructura y función han
permanecido constantes durante un
tiempo muy prolongado.
Se aplica:
• En la identificación y
caracterización microbiana.
• En la taxonomía microbiana.
• Filogenia molecular para el
estudio de los ecosistemas
naturales microbianos.
Aplicaciones de la secuenciación del
ARNr 16S en la Identificación
1. Bacterias no cultivables, hecho que en ocasiones ha
conducido al descubrimiento de nuevos agentes
microbianos.
2. Bacterias cuyas características bioquímicas no se adaptan
a las de ningún género o especie reconocido, o que exhiben
un perfil bioquímico ambiguo.
3. Bacterias de crecimiento lento, que retrasa
considerablemente la identificación convencional.
METODOLOGIA
• Extracción de ADN
• Amplificación del gen (PCR)
• Secuenciación
• Bioinformatica
• Dado que resulta relativamente fácil
secuenciar el ADNr 16S existen bases
de datos amplias, en continuo
crecimiento.
Glass bead purification of
DNA
0.5 mm
Técnica de PCR
170 180 190
200 210 220 230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340 350 360 370
BIOINFORMATICA
NCBI
NCBI
Gracias por su atención

Más contenido relacionado

Similar a practica micro biología ambiental.pptx

Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...
Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...
Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...
yudyaranguren
 
RRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdf
RRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdfRRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdf
RRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdf
ssuser0afc411
 
1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica
1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica
1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica
bilderrojasrivadenei1
 
Molecular Epidemiology of Methicillin-Resistant
Molecular Epidemiology of Methicillin-ResistantMolecular Epidemiology of Methicillin-Resistant
Molecular Epidemiology of Methicillin-Resistant
Stanislav Cardona
 
Micosis teórico hongos clasificación 2020
Micosis teórico hongos clasificación 2020Micosis teórico hongos clasificación 2020
Micosis teórico hongos clasificación 2020
DvoraMachado
 
Cuaderno microbiologia productos agroalimentarios
Cuaderno microbiologia productos agroalimentariosCuaderno microbiologia productos agroalimentarios
Cuaderno microbiologia productos agroalimentarios
Massiel Gutierrez Espinosa
 

Similar a practica micro biología ambiental.pptx (20)

Defensa de la identificacion del hongo
Defensa de la identificacion del hongoDefensa de la identificacion del hongo
Defensa de la identificacion del hongo
 
00073457
0007345700073457
00073457
 
Pruebas bioquímicas
Pruebas bioquímicasPruebas bioquímicas
Pruebas bioquímicas
 
Taxonomia celular en general
Taxonomia celular en generalTaxonomia celular en general
Taxonomia celular en general
 
Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...
Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...
Mmi pruebas bioquímicas básicas utilizadas en el laboratorio de microbiología...
 
UD2 PRESENTACIÓN.pdf
UD2 PRESENTACIÓN.pdfUD2 PRESENTACIÓN.pdf
UD2 PRESENTACIÓN.pdf
 
I Jornada Actualización en Genética Reproductiva y Fertilidad
I Jornada Actualización en Genética Reproductiva y Fertilidad I Jornada Actualización en Genética Reproductiva y Fertilidad
I Jornada Actualización en Genética Reproductiva y Fertilidad
 
Enterobacteriasoportunistas 150819225658-lva1-app6892
Enterobacteriasoportunistas 150819225658-lva1-app6892Enterobacteriasoportunistas 150819225658-lva1-app6892
Enterobacteriasoportunistas 150819225658-lva1-app6892
 
Enterobacterias oportunistas
Enterobacterias oportunistas Enterobacterias oportunistas
Enterobacterias oportunistas
 
Módulo I, Tema 2: Análisis Integral de las Heces
Módulo I, Tema 2: Análisis Integral de las HecesMódulo I, Tema 2: Análisis Integral de las Heces
Módulo I, Tema 2: Análisis Integral de las Heces
 
RRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdf
RRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdfRRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdf
RRDD_CLASE_18_Microbiologia_09_12__2021.pdf
 
Farmacognosia convertido
Farmacognosia convertidoFarmacognosia convertido
Farmacognosia convertido
 
Farmacognosia convertido
Farmacognosia convertidoFarmacognosia convertido
Farmacognosia convertido
 
1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica
1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica
1.5._Subcelulares_VIRUS_I[1].pdf química orgánica
 
Molecular Epidemiology of Methicillin-Resistant
Molecular Epidemiology of Methicillin-ResistantMolecular Epidemiology of Methicillin-Resistant
Molecular Epidemiology of Methicillin-Resistant
 
Mm ppt
Mm pptMm ppt
Mm ppt
 
Epidemiologia colera.pptx
Epidemiologia colera.pptxEpidemiologia colera.pptx
Epidemiologia colera.pptx
 
Micosis teórico hongos clasificación 2020
Micosis teórico hongos clasificación 2020Micosis teórico hongos clasificación 2020
Micosis teórico hongos clasificación 2020
 
Unidad 2.3, 2.4 ,2.5 y 2.6.pptx
Unidad 2.3, 2.4 ,2.5 y 2.6.pptxUnidad 2.3, 2.4 ,2.5 y 2.6.pptx
Unidad 2.3, 2.4 ,2.5 y 2.6.pptx
 
Cuaderno microbiologia productos agroalimentarios
Cuaderno microbiologia productos agroalimentariosCuaderno microbiologia productos agroalimentarios
Cuaderno microbiologia productos agroalimentarios
 

Último

Hobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdf
Hobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdfHobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdf
Hobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdf
frank0071
 
IAAS- EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, epp
IAAS-  EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, eppIAAS-  EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, epp
IAAS- EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, epp
CatalinaSezCrdenas
 
Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...
Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...
Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...
frank0071
 
Gribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdf
Gribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdfGribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdf
Gribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdf
frank0071
 

Último (20)

REINO FUNGI: CONCEPTO, CARACTERISTICAS, ETC
REINO FUNGI: CONCEPTO, CARACTERISTICAS, ETCREINO FUNGI: CONCEPTO, CARACTERISTICAS, ETC
REINO FUNGI: CONCEPTO, CARACTERISTICAS, ETC
 
Matemáticas Aplicadas usando Python
Matemáticas Aplicadas   usando    PythonMatemáticas Aplicadas   usando    Python
Matemáticas Aplicadas usando Python
 
Enfermeria_Geriatrica_TeresaPerezCastro.doc
Enfermeria_Geriatrica_TeresaPerezCastro.docEnfermeria_Geriatrica_TeresaPerezCastro.doc
Enfermeria_Geriatrica_TeresaPerezCastro.doc
 
Mapa-conceptual-de-la-Seguridad-y-Salud-en-el-Trabajo-3.pptx
Mapa-conceptual-de-la-Seguridad-y-Salud-en-el-Trabajo-3.pptxMapa-conceptual-de-la-Seguridad-y-Salud-en-el-Trabajo-3.pptx
Mapa-conceptual-de-la-Seguridad-y-Salud-en-el-Trabajo-3.pptx
 
1890 –7 de junio - Henry Marmaduke Harris obtuvo una patente británica (Nº 88...
1890 –7 de junio - Henry Marmaduke Harris obtuvo una patente británica (Nº 88...1890 –7 de junio - Henry Marmaduke Harris obtuvo una patente británica (Nº 88...
1890 –7 de junio - Henry Marmaduke Harris obtuvo una patente británica (Nº 88...
 
Musculos Paraproteticos, protesis, musculos
Musculos Paraproteticos, protesis, musculosMusculos Paraproteticos, protesis, musculos
Musculos Paraproteticos, protesis, musculos
 
COMBATE 02 DE MAYO O COMBATE DE CALLAO.docx
COMBATE 02 DE MAYO O COMBATE DE CALLAO.docxCOMBATE 02 DE MAYO O COMBATE DE CALLAO.docx
COMBATE 02 DE MAYO O COMBATE DE CALLAO.docx
 
Hobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdf
Hobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdfHobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdf
Hobson, John A. - Estudio del imperialismo [ocr] [1902] [1981].pdf
 
Fresas y sistemas de pulido en odontología
Fresas y sistemas de pulido en odontologíaFresas y sistemas de pulido en odontología
Fresas y sistemas de pulido en odontología
 
Antequera, L. - Historia desconocida del descubrimiento de América [2021].pdf
Antequera, L. - Historia desconocida del descubrimiento de América [2021].pdfAntequera, L. - Historia desconocida del descubrimiento de América [2021].pdf
Antequera, L. - Historia desconocida del descubrimiento de América [2021].pdf
 
LIPIDOS y ACIDOS NUCLEICOS Y TODOS SUS SILLARES ESTRUCTURALES
LIPIDOS y ACIDOS NUCLEICOS Y TODOS SUS SILLARES ESTRUCTURALESLIPIDOS y ACIDOS NUCLEICOS Y TODOS SUS SILLARES ESTRUCTURALES
LIPIDOS y ACIDOS NUCLEICOS Y TODOS SUS SILLARES ESTRUCTURALES
 
IAAS- EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, epp
IAAS-  EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, eppIAAS-  EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, epp
IAAS- EPIDEMIOLOGIA. antisepcsia, desinfección, epp
 
CUADRO SINOPTICO IV PARCIAL/ TORAX . PDF
CUADRO SINOPTICO IV PARCIAL/ TORAX . PDFCUADRO SINOPTICO IV PARCIAL/ TORAX . PDF
CUADRO SINOPTICO IV PARCIAL/ TORAX . PDF
 
Ecuaciones Diferenciales de Primer Orden
Ecuaciones Diferenciales de Primer OrdenEcuaciones Diferenciales de Primer Orden
Ecuaciones Diferenciales de Primer Orden
 
Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...
Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...
Flores Galindo, A. - La ciudad sumergida. Aristocracia y plebe en Lima, 1760-...
 
Pelos y fibras. Criminalistica pelos y fibras
Pelos y fibras. Criminalistica pelos y fibrasPelos y fibras. Criminalistica pelos y fibras
Pelos y fibras. Criminalistica pelos y fibras
 
El Gran Atractor, la misteriosa fuerza que está halando a la Vía Láctea.pptx
El Gran Atractor, la misteriosa fuerza que está halando a la Vía Láctea.pptxEl Gran Atractor, la misteriosa fuerza que está halando a la Vía Láctea.pptx
El Gran Atractor, la misteriosa fuerza que está halando a la Vía Láctea.pptx
 
Gribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdf
Gribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdfGribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdf
Gribbin, John. - Historia de la ciencia, 1543-2001 [EPL-FS] [2019].pdf
 
La señal de los higos buenos y los higos malos
La señal de los higos buenos y los higos malosLa señal de los higos buenos y los higos malos
La señal de los higos buenos y los higos malos
 
Moda colonial de 1810 donde podemos ver las distintas prendas
Moda colonial de 1810 donde podemos ver las distintas prendasModa colonial de 1810 donde podemos ver las distintas prendas
Moda colonial de 1810 donde podemos ver las distintas prendas
 

practica micro biología ambiental.pptx

  • 1. Microbiología Ambiental y Biotecnología Mg. Luis Carlos Lizárraga Vargas
  • 3. • 1. Métodos basados en criterios morfológicos • 2. Métodos basados en tinción diferencial • 3. Métodos basados en pruebas bioquímicas • 4. Métodos basados en pruebas serológicas • 5. Métodos basados en detección molecular
  • 4. 1. Métodos basados en criterios morfológicos Tinción de wright Tinción verde malaquita
  • 5.
  • 7. 2. Métodos basados en tinción diferencial Tinción de GRAM +/- Tinción de Ziehl Neelsen Falsos positivos con Nocardia sp y Actinomyces
  • 8. 3. Métodos basados en pruebas bioquímicas (enterobacterias) Índice Analítico de Perfil ( Tiras API)
  • 9. Identificación Bacteriana • Hidrólisis del Almidón • Degradación de la caseína (Agar Leche Descremada) • Hidrólisis de la lecitina y reducción del telurito (Agar yema de huevo) • Licuefacción de la gelatina (Gelatina Nutritiva) • Fermentación de carbohidratos • Oxidación/Fermentación (Hugh and Leifson) • Agar Hierro de Kligler • Reducción de Nitratos • Prueba de la coagulasa • ………..
  • 10. 4. Métodos basados en ensayos Serológicos • Los Métodos serológicos implica la utilización de preparaciones de inmunoglobulinas especificas provenientes de muestras biológicas .
  • 11. 5. Métodos basados en detección Molecular
  • 12. IDENTIFICACIÓN DE ESPECIE • secuencias del gen ARNr 16S ADNr 16S ARNr 16S
  • 13. /
  • 14.
  • 15. Operon ribosomico “rrn” IG IG 16S 23S 5S ADNr 16s
  • 16. Utilización como herramienta filogenética y taxonómica • Se trata de una molécula muy antigua, presente en todas las bacterias actuales. Constituye, por tanto, una diana universal para su identificación.
  • 17. • Esta región es altamente conservada, presenta regiones comunes en todos los organismos pero tienen variaciones en zonas especificas en cada ESPECIE bacteriana.
  • 18. • Su estructura y función han permanecido constantes durante un tiempo muy prolongado.
  • 19. Se aplica: • En la identificación y caracterización microbiana. • En la taxonomía microbiana. • Filogenia molecular para el estudio de los ecosistemas naturales microbianos.
  • 20. Aplicaciones de la secuenciación del ARNr 16S en la Identificación 1. Bacterias no cultivables, hecho que en ocasiones ha conducido al descubrimiento de nuevos agentes microbianos. 2. Bacterias cuyas características bioquímicas no se adaptan a las de ningún género o especie reconocido, o que exhiben un perfil bioquímico ambiguo. 3. Bacterias de crecimiento lento, que retrasa considerablemente la identificación convencional.
  • 21. METODOLOGIA • Extracción de ADN • Amplificación del gen (PCR) • Secuenciación • Bioinformatica
  • 22. • Dado que resulta relativamente fácil secuenciar el ADNr 16S existen bases de datos amplias, en continuo crecimiento.
  • 23.
  • 24. Glass bead purification of DNA 0.5 mm
  • 25.
  • 27.
  • 28.
  • 29. 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370
  • 31. NCBI
  • 32.
  • 33.
  • 34. Gracias por su atención

Notas del editor

  1. Falsos positivos ….Nocardia y Actinomices
  2. Estas pruebas se fundamentan en demostrar si el microorganismo es capaz de fermentar azúcares, la presencia de enzimas, la degradación de compuestos, la producción de compuestos coloreados, etc
  3. Constituye, por tanto, una diana universal para su identificación
  4. de modo que las alteraciones en la secuencia reflejan probablemente cambios aleatorios.
  5. cepas cuya identificación por métodos fenotípicos resulta imposible, difícil o requiere mucho tiempo
  6. Y otras privadas, como MicroSeq (Applied Biosystems) y SmartGene IDNS (Integrated Database Network System)
  7. vidrio de sílice cal sodada
  8. Azul FAM/verde JOE/amarillo TANRA/rojo ROX