Charla sobre Biología Sintética en GarageLab. Mayo, 2012.

1. Biología Sintética
Dr. Alejandro D. Nadra
Dpto. De Química Biológica
Fac. De Cs. Exactas y Naturales – UBA
anadra@qi.fcen.uba.ar
GarageLab
11 de Junio de 2012

2. Intro
Objetivos:
● Crear vida artificial
● Construcción de sistemas biológicos nuevos y el
establecimiento de principios para su diseño racional
Premisa:
● Los sistemas biológicos pueden ser modificados y
construidos a partir de ”partes” re­utilizables.

3. Ingeniería de la vida
Conceptos:
Abstracción
Modularización/desacople
Estandarización
Componentes biológicos:
Modulares
Estandar
Reutilizables
Niveles de organización:
Partes­> dispositivos­> sistemas

4. Herramientas
 ”Módulos” estandarizados (banco de partes)
 Principios de diseño/ingeniería (racional)
 Síntesis de genes (!)
 Modelado y simulación

6. Proceso de trabajo
!
Diseño de Diseño del
secuencias sistema
Síntesis del Banco de partes Modelado y
DNA simulación
Evaluación y
caracterización

7. Algunos logros y perspectivas
Logros:
­Osciladores/generadores de ruido/switchs génicos (circuitos)
­Computación in vivo (puertas logicas)
­Detectores varios
­Producción de artemisinina recombinante (ing. metabólica)
­Síntesis y transferencia de un genoma completo (técnico)
­Acercar la academia a la industria
­Motivar y entusiasmar jóvenes promesas: iGEM
Perspectivas:
Fuentes renovables de energía
Bioremediación
Tratamiento/cura de enfermedades esquivas
(Resolver los problemas de siempre con nuevas herramientas)

8. Ejemplos
BioBricks (Tom Knight, Drew Endy y Christopher Voigt)
1) Partes: son los bloques iniciales y codifican funciones biológicas básicas (ej. un
gen, una proteína, un promotor, etc)
2) Dispositivos: son colecciones de partes que implementan una función
definida. (ej. un grupo de genes que responde a luz y produce un determinado
metabolito en respuesta)
3) Sistemas: Combinaciones de dispositivos interconectados para ejecutar tareas
de alto nivel.

9. The Registry of Standard
Biological Parts

10. Detector de fase exponencial
Banana Control
http://openwetware.org/wiki/IGEM:MIT/2006

11. Detector de límite

12. Bacto­Blood
Berkeley iGEM team
2007

13. Bacto­Blood
Controller
Plasmid 1: Controls Copy # and T7Pol BAC 2: Regulated Expression

14. Bacto­Blood
recombinant Haemoglobin Haemoglobin Chaperone Hem Biosynthesis
Auto­Oxidation control

16. Artemisinin biosynthesis
Jay Keasling
JBEI, Amrys

17. Artemisinin biosynthesis

18. Biología Sintética en Argentina
Comenzando...
Curso 2011
Curso 2012
Equipo iGEM http:igem.qb.fcen.uba.ar
Proyecto en UADE
Proyecto en FCEyN
Proyecto en GarageLab
Keclon?

19. Agradecimientos
Ignacio E. Sanchez, QB FCEyN - UBA
Raik Grünberg, IRIC, Canada
Equipo iGEM Buenos_Aires
Y a ustedes, por su atención!

20. Algunas críticas
Bioseguridad:
Bioterrorismo
Ecológicos
Eticos:
Creación de nueva vida
”Resucitación de patógenos extintos”
Manipulación de organismos
Propiedad intelectual:
La tendencia open-source boicotea la inversión
Bioquímicos y biólogos moleculares clásicos:
Nada nuevo bajo el sol