5. RE mediante mapas ELC
Mapa ELC de Cuba
Coordenadas de los datos de pasaporte
y
x
Banco
germoplasma
75
300
Cuartiles
alta
media alta
media baja
baja
200
100
50
1
25
1
2
3
4 5 6 7
Categorías ELC
8
9
10
Fuentes
externas
Pruebas
Χ2
No. entradas
% celdas
Distribución total
categorías mapa
No. entradas
Sitios donde se ha observado la especie
2
3
4 5 6 7
Categorías ELC
8
9
10
1
2
3
4 5 6 7
Categorías ELC
8
9
10
300
200
100
10. DIV mapas
Una forma diferente de visualizar la diversidad
Sitios de recolección con una calidad mínima de georreferenciación
11. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Superposición de cuadrículas (celdas de XxX km)
12. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Selección de celdas donde tenemos sitios de recolección
13. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Detección de celdas de vecindario (a un radio del centroide de X km)
14. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Generación de áreas de influencia a partir de cada centroide
Detección de entradas recolectadas dentro de la zona de influcencia
15. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Análisis multivariante/multivariado local
OTU
VAR1
VAR2
VAR3
VAR4
VAR5
89
233
0.56
13
600
0
233
198
1.43
13
700
0
152
201
0.88
10
600
1
Algoritmo de distancia
OTU
89
233
89
0
233
10
0
152
15
14
Promedio distancia = (10+15+14)/3
= 13
152
0
16. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Igualmente para todas las celdas donde caen sitios de recolección
17. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Igualmente para las celdas vecindario
18. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Resultado 1:
Número de entradas analizadas por celda
0
0
0
0
1
3
2
1
1
0
1
1
2
1
1
1
0
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
19. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Resultado 2:
Distancias promedio asignadas a cada celda
0
13
2
0
0
0
0
0
0
0
0
8
0
20. Una forma diferente de visualizar la diversidad
Sesgos en la recolección? Corrección por «bootstrapping»
Mediana = 2
1
2
.
.
.
.
.
.
n
25. Colnúcleo y FIGS-R
Colecciónes nucleares (núcleo) ecogeográficas
Mapas ELC
Representatividad
Alocación
Disponibilidad de semillas
Estrategia de identificación focalizada de germoplasma
En base a información ecogeográfica
Utilizará algunos parámetros del mejoramiento convencional
Sistemas de filtrado y opcionalmente por modelación
En cooperación con proyecto PGR secure (VII programa marco – UE)