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TECNOLOGOS EN PRODUCCION AGROPECUARIA
LUZ MARINA GUEVARA RINCON 710318
VICTOR MANUEL NAVARRO VERGEL 710160
CARACTERIZACION MOLECULAR DEL
GENERO PROCHILODUS DE LA CUENCA
DEL RIO MAGDALENA Y DEL
CATATUMBO
OBJETIVOS
OBJETIVO GENERAL
CARACTERIZAR MOLECULARMENTE EL GÉNERO PROCHILODUSCARACTERIZAR MOLECULARMENTE EL GÉNERO PROCHILODUS
DE LAS CUENCAS DEL RIO MAGDALENA Y DEL CATATUMBODE LAS CUENCAS DEL RIO MAGDALENA Y DEL CATATUMBO
OBJETIVO ESPECIFICO
•Caracterizar molecularmente el género Prochilodus
Reticulatus.
•Caracterizar molecularmente el género Prochilodus
Magdalenae.
•Comparar molecularmente los dos géneros P. Reticulatus y
P. Magdalenae
El Bocachico es un pez de agua dulce de costumbres
migratorias. Durante la temporada de aguas altas habita en las
ciénagas donde se alimenta de material vegetal en
descomposición y otros desechos en este periodo se engorda y
se prepara para su viaje corriente arriba, al inicio de la
temporada de corrientes bajas, cuando grandes bancos de
bocachico suben por los ríos, hasta corrientes de menor tamaño
(fenómeno conocido como la subienda).
Colombia cuenta con 1435 especies nativas de peces
dulceacuícolas, que representan casi el 5% de todos los
peces del mundo y el 29% de Centro y Sur América. De
ese total, 311 son endémicas, pero 42 están amenazadas
y extintas. Diferentes factores antropogénicas amenazan
la conservación de estas especies debido al deterioro
ambiental y a la sobrepesca. Entre estas especies está el
"bocachico" Prochilodus
.
El bocachico ha sido tradicionalmente el pez de mayor
importancia económica en Colombia, cientos de miles de
pescadores han dependido principalmente de el para su
sustento. Se calcula que en sus mejores momentos llego a
constituir el 60 % de la cuenca del río magdalena.
Desafortunada e irónicamente, este pez, uno de los más
prolíficos del país encabeza la lista de especies en grave
peligro de desaparecer.
Las secuencias de ADN mitocondrial demostraron gran utilidad para
diferenciar especies y para resolver las relaciones filogenéticas.
Recientemente Turner et al. (2004) utilizaron esta misma metodología
para estudiar poblaciones de Prochilodus en ríos del norte se
Sudamérica.
las investigaciones sobre la estructura poblacional y filogenética de
especies de Prochilodus basadas en marcadores moleculares, con el
fin de documentar el patrón de diferenciación entre especies e inferir
los procesos fundamentales que afectan la dinámica evolutiva de
estos peces en las grandes cuencas fluviales sudamericanas.
Muestras de tejido muscular fueron tomadas de peces
obtenidos en las localidades indicadas y preservadas en
etanol 95% para el estudio genético.
La extracción de ADN y subsiguiente amplificación de los
fragmentos mitocondriales vía PCR sigue los protocolos
publicados por Sivasundar et al. (2001).
Para obtener secuencias completas de cada alelo presente
en individuos heterocigotos, los productos de PCR fueron
clonados y varios clones aislados.
Secuencias de ADN mitocondrial y nuclear fueron alineadas y
sometidas a diversos análisis filogenéticos y genético-
poblacionales para estudiar la variación inter e intra-especifica.
Los árboles filogenéticos obtenidos se comparan con las
localidades de origen de las muestras y las denominaciones
taxonómicas para elaborar y contrastar hipótesis filogeográficas
(Avise, 2000).
Este método comparativo también se utilizó para generar
hipótesis filogeográficas y contrastarlas con aquellas derivadas de
los análisis filogenéticos.
Los miembros de la familia Prochilodontidae se diferencia
de otros peces, excepto en la etapa de larva, por sus
labios flexibles equipados con dos series de numerosos
dientes relativamente pequeños falciformes o espatulados.
La posición protráctil de los labios forma un disco oral
rodeado por los dientes.
Prochilodontidae habita una diversidad de hábitat desde
ambientes lenticos como lagunas, o ciénagas hasta
grandes ríos o quebradas moderadamente rápidas de la
región del piedemonte y está presente en aguas negras,
limpias o claras.
El nivel taxonómico de especies de Prochilodontidae es
tan grande como incierto como consecuencia de varios
factores intrínsecos (sobre todo similaridad de
diferentes especies) y extrínsecos (por ejemplo
descripciones originales poco uniformes y bajo número
de series tipo) a las especies.
La familia Prochilodontidae incluida en la clase
Actinopterigii (peces con aletas de radios y espinas), y
el Orden Characiformes, habitan en aguas dulces y
son peces primarios de aguas dulces. Esta familia se
encuentra distribuida desde los 12º C hasta los 34ºC.
Etimológicamente el nombre de esta familia proviene
del griego Pro= antes en frente de mas cheilos= labios
más la palabra donus que significa dientes.
Antes del levantamiento de los Andes, los ríos Magdalena,
Orinoco y Catatumbo confluían en el Lago de Maracaibo,
compartiendo la ictiofauna. El levantamiento de la cordillera,
aisló dichas cuencas, gestando un proceso de adaptación a
las nuevas condiciones y propiciando especialización y
especiación. Schultz (1949), posteriormente, el
levantamiento de la Serranía del Perija, aisló el rio
Magdalena del rio Catatumbo.
TAXONOMIA BOCACHICO DEL CATATUMBO
DOMINIO: Eucariota – Whittaker y Margulis, 1978
REINO: Animalia – Linnaeus, 1758
SUBREINO: Bilateria – (Hatschek, 1988) Cavalier-Smith, 1983
RAMA: Deuterostomado- Grobbern, 1908
INFRAREINO: Cordado – (Haeckel, 1874) Cavalier-Smith, 1998
PHYLUM: Cordado – Bateson, 1885
SUBPHYLUM: Vertebrados – Cuvier, 1812.
INFRAPHYLUM: Gnathostomata – Auct- vertebrados mandibulados.
SUPERCLASE: Osteíctios Huxlwey, 1880, peces óseos.
CLASE: Actinopterigios – Cope 1887 peces con aletas con radios y
espinas.
ORDEN: Characiformes
FAMILIA: Prochilodontidae
SUBFAMILIA Prochilodontinae
GENERO: Prochilodus – Agassiz, 1829
NOMBRE ESPECIFICO: reticulatus –Valenciennes 1850
NOMBRE CIENTIFICO: Prochilodus reticulatus Valenciennes, 1850.
TAXONOMIA BOCACHICO DEL MAGDALENA
DOMINIO: Eucariota – Whittaker y Margulis, 1978
REINO: Animalia – Linnaeus, 1758
SUBREINO: Bilateria – (Hatschek, 1988) Cavalier-Smith, 1983
RAMA: Deuterostomado- Grobbern, 1908
INFRAREINO: Cordado – (Haeckel, 1874) Cavalier-Smith, 1998
PHYLUM: Cordado – Bateson, 1885
SUBPHYLUM: Vertebrados – Cuvier, 1812.
INFRAPHYLUM: Gnathostomata – Auct- vertebrados mandibulados.
SUPERCLASE: Osteíctios Huxlwey, 1880, peces óseos.
CLASE: Actinopterigios – Cope 1887 peces con aletas con radios y espinas.
ORDEN: Characiformes
FAMILIA: Prochilodontidae
SUBFAMILIA Prochilodontinae
GENERO: Prochilodus – Agassiz, 1829
NOMBRE BINOMIAL Prochilodus magdalenae
Las funciones biológicas del ADN incluyen el
almacenamiento de información (genes y
genoma), la codificación de proteínas
(transcripción y traducción) y su auto
duplicación (replicación del ADN) para
asegurar la transmisión de la información a las
células hijas durante la división celular. Para
poder estudiar su estructura y función es
primordial extraer esta molécula, por tanto el
laboratorio que se realizara tiene como
objetivo obtener ADN de buena calidad.
Requiere aproximadamente de 3 horas para completar 30
ciclos, en cada ciclo consiste en una fase de desnaturalización
en donde la doble fibra de ADN se funden en fibras únicas; una
fase de alineación, es que los primers se unen a la secuencias
blanco de las fibras separadas, y una fase de extensión donde
la síntesis de ADN procede de los primers a partir de cada fibra
de la plantilla de ADN que genera dos nuevas copias de la
doble fibra de la plantilla original. Tras cada 30 ciclos una única
copia inicial inicia de la plantilla de ADN teóricamente puede ser
amplificada a un billón de copias
El rio magdalena: Nace en la laguna de La Magdalena localizada a los
01º 55' 40" de latitud norte y 76º 35' 08" de longitud oeste, en el macizo
colombiano de la cordillera de los Andes, en el extremo suroccidental de
una pequeña planicie del páramo de Las Papas, conocido localmente
como Valle de las Papas, a 3.685 m sobre el nivel del mar, en el
departamento del Huila, y vierte sus aguas en el mar Caribe en el sitio
Bocas de Ceniza, a los 11º 06' de latitud norte y 74º 51' de longitud oeste.
Tiene una longitud de 1.540 km y a lo largo de su curso recibe más o
menos 500 ríos, numerosas quebradas y registra al desembocar 6.700
metros cúbicos por segundo.
El rio Catatumbo: nace en el departamento Norte de Santander, en
la parte oriental de Colombia específicamente en el cerro de
Jurisdicciones a 3.850 msnm, en el municipio de Ábrego, al oeste
del departamento Norte de Santander y desemboca en Venezuela
en el lago de Maracaibo, al que aporta cerca del 60% de su agua
dulce. Su desembocadura es en forma de delta, que penetra hacia
el interior del lago, rompiendo en cierta forma la simetría del
mismo.
Su cuenca comprende 22.317 km², de los que 16.626 km² son
territorio colombiano y los restantes de Venezuela.
DESCRIPTIVA: Describe características de un conjunto de sujetos o áreas de
interés.
El objetivo de la investigación descriptiva consiste en llegar a conocer las
situaciones, costumbres y actitudes predominantes a través de la descripción
exacta de las actividades, objetos, procesos y personas. Su meta no se limita a la
recolección de datos, sino a la predicción e identificación de las relaciones que
existen entre dos o más variables. Los investigadores no son meros tabuladores,
sino que recogen los datos sobre la base de una hipótesis o teoría, exponen y
resumen la información de manera cuidadosa y luego analizan minuciosamente
los resultados, a fin de extraer generalizaciones significativas que contribuyan al
conocimiento
MATERIALES/DESCRIPCIÓN ENTIDAD
APORTANTE
VALOR
TOTAL
Estudio de caracterización Estudiante 2.000.000
Recopilación de la información primaria Estudiante-Dir. 1.000.000
Materiales UFPS Ocaña 3.000.000
Transporte UFPS Ocaña 2.000.000
Alimentación UFPS Ocaña 1.000.000
Apoyo logístico UFPS Ocaña 1.000.000
VALOR TOTAL 10.000.000
Tabla. Presupuesto
caracterización molecular del genero prochilodus

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  • 1.
  • 2. TECNOLOGOS EN PRODUCCION AGROPECUARIA LUZ MARINA GUEVARA RINCON 710318 VICTOR MANUEL NAVARRO VERGEL 710160
  • 3. CARACTERIZACION MOLECULAR DEL GENERO PROCHILODUS DE LA CUENCA DEL RIO MAGDALENA Y DEL CATATUMBO
  • 4.
  • 5.
  • 6.
  • 7.
  • 8. OBJETIVOS OBJETIVO GENERAL CARACTERIZAR MOLECULARMENTE EL GÉNERO PROCHILODUSCARACTERIZAR MOLECULARMENTE EL GÉNERO PROCHILODUS DE LAS CUENCAS DEL RIO MAGDALENA Y DEL CATATUMBODE LAS CUENCAS DEL RIO MAGDALENA Y DEL CATATUMBO OBJETIVO ESPECIFICO •Caracterizar molecularmente el género Prochilodus Reticulatus. •Caracterizar molecularmente el género Prochilodus Magdalenae. •Comparar molecularmente los dos géneros P. Reticulatus y P. Magdalenae
  • 9.
  • 10. El Bocachico es un pez de agua dulce de costumbres migratorias. Durante la temporada de aguas altas habita en las ciénagas donde se alimenta de material vegetal en descomposición y otros desechos en este periodo se engorda y se prepara para su viaje corriente arriba, al inicio de la temporada de corrientes bajas, cuando grandes bancos de bocachico suben por los ríos, hasta corrientes de menor tamaño (fenómeno conocido como la subienda).
  • 11. Colombia cuenta con 1435 especies nativas de peces dulceacuícolas, que representan casi el 5% de todos los peces del mundo y el 29% de Centro y Sur América. De ese total, 311 son endémicas, pero 42 están amenazadas y extintas. Diferentes factores antropogénicas amenazan la conservación de estas especies debido al deterioro ambiental y a la sobrepesca. Entre estas especies está el "bocachico" Prochilodus
  • 12. . El bocachico ha sido tradicionalmente el pez de mayor importancia económica en Colombia, cientos de miles de pescadores han dependido principalmente de el para su sustento. Se calcula que en sus mejores momentos llego a constituir el 60 % de la cuenca del río magdalena. Desafortunada e irónicamente, este pez, uno de los más prolíficos del país encabeza la lista de especies en grave peligro de desaparecer.
  • 13. Las secuencias de ADN mitocondrial demostraron gran utilidad para diferenciar especies y para resolver las relaciones filogenéticas. Recientemente Turner et al. (2004) utilizaron esta misma metodología para estudiar poblaciones de Prochilodus en ríos del norte se Sudamérica. las investigaciones sobre la estructura poblacional y filogenética de especies de Prochilodus basadas en marcadores moleculares, con el fin de documentar el patrón de diferenciación entre especies e inferir los procesos fundamentales que afectan la dinámica evolutiva de estos peces en las grandes cuencas fluviales sudamericanas.
  • 14. Muestras de tejido muscular fueron tomadas de peces obtenidos en las localidades indicadas y preservadas en etanol 95% para el estudio genético. La extracción de ADN y subsiguiente amplificación de los fragmentos mitocondriales vía PCR sigue los protocolos publicados por Sivasundar et al. (2001). Para obtener secuencias completas de cada alelo presente en individuos heterocigotos, los productos de PCR fueron clonados y varios clones aislados.
  • 15. Secuencias de ADN mitocondrial y nuclear fueron alineadas y sometidas a diversos análisis filogenéticos y genético- poblacionales para estudiar la variación inter e intra-especifica. Los árboles filogenéticos obtenidos se comparan con las localidades de origen de las muestras y las denominaciones taxonómicas para elaborar y contrastar hipótesis filogeográficas (Avise, 2000). Este método comparativo también se utilizó para generar hipótesis filogeográficas y contrastarlas con aquellas derivadas de los análisis filogenéticos.
  • 16. Los miembros de la familia Prochilodontidae se diferencia de otros peces, excepto en la etapa de larva, por sus labios flexibles equipados con dos series de numerosos dientes relativamente pequeños falciformes o espatulados. La posición protráctil de los labios forma un disco oral rodeado por los dientes. Prochilodontidae habita una diversidad de hábitat desde ambientes lenticos como lagunas, o ciénagas hasta grandes ríos o quebradas moderadamente rápidas de la región del piedemonte y está presente en aguas negras, limpias o claras.
  • 17. El nivel taxonómico de especies de Prochilodontidae es tan grande como incierto como consecuencia de varios factores intrínsecos (sobre todo similaridad de diferentes especies) y extrínsecos (por ejemplo descripciones originales poco uniformes y bajo número de series tipo) a las especies.
  • 18.
  • 19. La familia Prochilodontidae incluida en la clase Actinopterigii (peces con aletas de radios y espinas), y el Orden Characiformes, habitan en aguas dulces y son peces primarios de aguas dulces. Esta familia se encuentra distribuida desde los 12º C hasta los 34ºC. Etimológicamente el nombre de esta familia proviene del griego Pro= antes en frente de mas cheilos= labios más la palabra donus que significa dientes.
  • 20. Antes del levantamiento de los Andes, los ríos Magdalena, Orinoco y Catatumbo confluían en el Lago de Maracaibo, compartiendo la ictiofauna. El levantamiento de la cordillera, aisló dichas cuencas, gestando un proceso de adaptación a las nuevas condiciones y propiciando especialización y especiación. Schultz (1949), posteriormente, el levantamiento de la Serranía del Perija, aisló el rio Magdalena del rio Catatumbo.
  • 21. TAXONOMIA BOCACHICO DEL CATATUMBO DOMINIO: Eucariota – Whittaker y Margulis, 1978 REINO: Animalia – Linnaeus, 1758 SUBREINO: Bilateria – (Hatschek, 1988) Cavalier-Smith, 1983 RAMA: Deuterostomado- Grobbern, 1908 INFRAREINO: Cordado – (Haeckel, 1874) Cavalier-Smith, 1998 PHYLUM: Cordado – Bateson, 1885 SUBPHYLUM: Vertebrados – Cuvier, 1812. INFRAPHYLUM: Gnathostomata – Auct- vertebrados mandibulados. SUPERCLASE: Osteíctios Huxlwey, 1880, peces óseos. CLASE: Actinopterigios – Cope 1887 peces con aletas con radios y espinas. ORDEN: Characiformes FAMILIA: Prochilodontidae SUBFAMILIA Prochilodontinae GENERO: Prochilodus – Agassiz, 1829 NOMBRE ESPECIFICO: reticulatus –Valenciennes 1850 NOMBRE CIENTIFICO: Prochilodus reticulatus Valenciennes, 1850.
  • 22. TAXONOMIA BOCACHICO DEL MAGDALENA DOMINIO: Eucariota – Whittaker y Margulis, 1978 REINO: Animalia – Linnaeus, 1758 SUBREINO: Bilateria – (Hatschek, 1988) Cavalier-Smith, 1983 RAMA: Deuterostomado- Grobbern, 1908 INFRAREINO: Cordado – (Haeckel, 1874) Cavalier-Smith, 1998 PHYLUM: Cordado – Bateson, 1885 SUBPHYLUM: Vertebrados – Cuvier, 1812. INFRAPHYLUM: Gnathostomata – Auct- vertebrados mandibulados. SUPERCLASE: Osteíctios Huxlwey, 1880, peces óseos. CLASE: Actinopterigios – Cope 1887 peces con aletas con radios y espinas. ORDEN: Characiformes FAMILIA: Prochilodontidae SUBFAMILIA Prochilodontinae GENERO: Prochilodus – Agassiz, 1829 NOMBRE BINOMIAL Prochilodus magdalenae
  • 23.
  • 24.
  • 25. Las funciones biológicas del ADN incluyen el almacenamiento de información (genes y genoma), la codificación de proteínas (transcripción y traducción) y su auto duplicación (replicación del ADN) para asegurar la transmisión de la información a las células hijas durante la división celular. Para poder estudiar su estructura y función es primordial extraer esta molécula, por tanto el laboratorio que se realizara tiene como objetivo obtener ADN de buena calidad.
  • 26.
  • 27.
  • 28. Requiere aproximadamente de 3 horas para completar 30 ciclos, en cada ciclo consiste en una fase de desnaturalización en donde la doble fibra de ADN se funden en fibras únicas; una fase de alineación, es que los primers se unen a la secuencias blanco de las fibras separadas, y una fase de extensión donde la síntesis de ADN procede de los primers a partir de cada fibra de la plantilla de ADN que genera dos nuevas copias de la doble fibra de la plantilla original. Tras cada 30 ciclos una única copia inicial inicia de la plantilla de ADN teóricamente puede ser amplificada a un billón de copias
  • 29. El rio magdalena: Nace en la laguna de La Magdalena localizada a los 01º 55' 40" de latitud norte y 76º 35' 08" de longitud oeste, en el macizo colombiano de la cordillera de los Andes, en el extremo suroccidental de una pequeña planicie del páramo de Las Papas, conocido localmente como Valle de las Papas, a 3.685 m sobre el nivel del mar, en el departamento del Huila, y vierte sus aguas en el mar Caribe en el sitio Bocas de Ceniza, a los 11º 06' de latitud norte y 74º 51' de longitud oeste. Tiene una longitud de 1.540 km y a lo largo de su curso recibe más o menos 500 ríos, numerosas quebradas y registra al desembocar 6.700 metros cúbicos por segundo.
  • 30. El rio Catatumbo: nace en el departamento Norte de Santander, en la parte oriental de Colombia específicamente en el cerro de Jurisdicciones a 3.850 msnm, en el municipio de Ábrego, al oeste del departamento Norte de Santander y desemboca en Venezuela en el lago de Maracaibo, al que aporta cerca del 60% de su agua dulce. Su desembocadura es en forma de delta, que penetra hacia el interior del lago, rompiendo en cierta forma la simetría del mismo. Su cuenca comprende 22.317 km², de los que 16.626 km² son territorio colombiano y los restantes de Venezuela.
  • 31. DESCRIPTIVA: Describe características de un conjunto de sujetos o áreas de interés. El objetivo de la investigación descriptiva consiste en llegar a conocer las situaciones, costumbres y actitudes predominantes a través de la descripción exacta de las actividades, objetos, procesos y personas. Su meta no se limita a la recolección de datos, sino a la predicción e identificación de las relaciones que existen entre dos o más variables. Los investigadores no son meros tabuladores, sino que recogen los datos sobre la base de una hipótesis o teoría, exponen y resumen la información de manera cuidadosa y luego analizan minuciosamente los resultados, a fin de extraer generalizaciones significativas que contribuyan al conocimiento
  • 32. MATERIALES/DESCRIPCIÓN ENTIDAD APORTANTE VALOR TOTAL Estudio de caracterización Estudiante 2.000.000 Recopilación de la información primaria Estudiante-Dir. 1.000.000 Materiales UFPS Ocaña 3.000.000 Transporte UFPS Ocaña 2.000.000 Alimentación UFPS Ocaña 1.000.000 Apoyo logístico UFPS Ocaña 1.000.000 VALOR TOTAL 10.000.000 Tabla. Presupuesto