El documento discute nuevos análisis moleculares que cuestionan el origen clásico de los vertebrados. Propone dos nuevas formas de organizar el árbol filogenético de los deuterostomados basadas en evidencia molecular y morfológica, incluyendo agrupar a los cefalocordados con los equinodermos en lugar de los vertebrados. Se necesita más evidencia molecular para probar estas nuevas visiones, pero si se comprobaran, el anfioxo tendría un papel más relevante del que tiene actualmente.