BIOTECNOLOGIA

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UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA
AMBIENTAL
INFORME:
MANEJO DEL SOFTWARE MEGA X DNA
CURSO:
BIOTECNOLOGIA
ESTUDIANTE:
SANTI COLQUE, GUSTAVO GONZALO EDUARDO
CÓDIGO:
2018205080
DOCENTE:
SOTO GONZALES, HEBERT HERNAN
19 de Setiembre del 2021 – ILO

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INDICE
INTRODUCCION .......................................................................................................................................... 3
OBJETIVOS .................................................................................................................................................. 4
Objetivo General..................................................................................................................................... 4
Objetivo Especifico.................................................................................................................................. 4
MATERIALES................................................................................................................................................ 4
MARCO TEÓRICO ........................................................................................................................................ 5
• MEGA X........................................................................................................................................... 5
• Mega En Plataformas Informáticas (MegaX)................................................................................... 5
• Árbol filogenético............................................................................................................................ 5
METODOLOGÍA........................................................................................................................................... 6
RESULTADOS............................................................................................................................................. 17
CONCLUSIONES......................................................................................................................................... 18
BIBLIOGRAFÍA .......................................................................................................................................... 19

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INTRODUCCION
En la segunda parte se utilizó el programa MEGA para la construcción de un árbol
filogenético que contenía el gen NIFH con 15 secuencias. Para la obtención del árbol
se realizó una serie de pasos manipulando el programa MEGA.
MEGA DNA es un software el cual ha sido diseñada para el análisis comparativo de
secuencias de genes homólogos, ya sea de familias multigénicas o de diferentes
especies. (SudhirKumar,2018)
Permite realizar una identificación más rápida de microorganismos, bacterias, hongos y
la construcción de un árbol filogenético. De manera profundizada más acerca del a
utilización de esta herramienta que nos facilita su análisis mediante diversas funciones
que contiene, a su vez permitirá conocer el funcionamiento de un árbol filogenético de
cada una de las muestras que se vaya analizar. (SudhirKumar,2018)
Cuando hablamos de una molécula de ADN, nos referimos a un Ácido
Desoxirribonucleico. Ya que esta es una molécula de gran peso
molecular(macromolécula), constituida por tres sustancias distintas: ácido fosfórico, un
monosacáridos aldehído del tipo pentosa (la desoxirribosa), y una base nitrogenada
que puede ser púrica (por ser derivada de la purina de dos anillos heterocíclicos) o
pirimidínica (por ser derivada de la pirimidina de un solo anillo)
(ChristopherP.Austin,s.f.)

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OBJETIVOS
Objetivo General
Evaluar la calidad y alineamiento de ADN y generar un árbol filogenético en base al gen
16s.
Objetivo Especifico
- Conocer el funcionamiento del Software Mega x.
- Reconocer la calidad de las secuencias de ADN.
- Realizar el alineamiento
- Elaboración de un árbol filogenético del gen 16s.
MATERIALES
- Software MEGAX
- Una laptop
- Conectividad a internet

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MARCO TEÓRICO
• MEGA X
El software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA) es un software
informático para realizar análisis estadísticos de la evolución molecular y para construir
árboles filogenéticos. Incluye muchos métodos sofisticados y herramientas para
filogenética y filomedicina.
MEGA X también se ha actualizado para utilizar múltiples núcleos informáticos para
muchos análisis evolutivos moleculares.
• Mega En Plataformas Informáticas (MegaX)
El software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA) se desarrolló por
primera vez para MS DOS a principios de la década de 1990 (Kumaretal.1994) y luego
se actualizó para su uso en MS Windows ocho veces, incluyendo MEGA1 a MEGA6 y
MEGA-CC y MEGA-MD (Kumaretal.2001,2016).
Por lo tanto, MEGA se ha transformado en una versión multiplataforma que se ejecuta
de forma nativa en Linux y Microsoft Windows. Este avance elimina la limitación
exclusiva de Windows de MEGA, que se ha vuelto particularmente aguda debido al
creciente uso de Linux en la investigación biológica. Esta transformación también
allana el camino para el desarrollo de una versión MEGA X para marcos en un futuro
próximo.
• Árbol filogenético
En un árbol filogenético, las especies de interés se muestran en las puntas de las
ramas del árbol. Las ramas se conectan entre sí de manera que representan la historia
evolutiva de las especies, esto es, la manera en la que pensamos que evolucionaron a
partir de un ancestro común mediante una serie de eventos de divergencia (separación
en dos ramas). En cada punto de ramificación se encuentra el ancestro común más
reciente que comparten todas las especies que descienden a partir de ese punto de
ramificación. Las líneas del árbol representan largas series de ancestros que se
extienden desde una especie hasta la siguiente.

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METODOLOGÍA
Inicio de la práctica
- Abrimos el Software MEGA X
- Hacemos clic en ALING y damos otro clic en Query Databanks
Query Databanks

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- Al abrir Query Databanks nos abrirá una página de Home-Nucleotide
- En nucleótido se pone 16s, la cual dará muchas muestras y solo se escogerá 10.

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- Damos el primer clic en la primera muestra.
- Obtenemos Informacion del gen 16s.
CLICK AQUÍ

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- Dar clic en T Add Alignmet
- Obtenemos lo siguiente y le damos clic en OK
ADD ALIGNMET

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- Al dar OK se abre una página de MIX: Aliganment Explorer
- Y para todas las muestras se hará el mismo procedimiento, obtenemos de la
siguiente manera.

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Alineamiento de secuencia de ADN Bacteriano
- Dar clic a EDIT, Buscar SELECT ALL y darle clic, lo cual obtendremos lo
siguiente:
CLIC EN SELET
ALL

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- Damos clic en el MUSCULO y dar en ALING DNA.
- Obtenemos el alineamiento de las muestras insertadas.
CLIC EN ALING
DNA

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- Eliminación de columnas vacías, Seleccionando y dando clic a X
- Al eliminar se obtiene de la siguiente manera.

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Formulación del árbol filogenético
- Dar clic a DATA, clic en EXPORTAR, clic en MEGA FORMAL/ALINEAMIENTO,
clic en guardar.
- Guardar con el nombre de ALINEAMIENTO.
DAR CLIC

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- El segundo nombre se le pondrá PRACTICA A1 y darle clic en OK, dar clic en
YES para la confirmación.
- Ir a MEGA X, clic en PHYLOGENY otro clic en CONSTRUCT/TES UPGMA
TREE. Despues dar clic en oK

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- Obtenemos el ÁRBOL FITOGENÉTICO

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RESULTADOS

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CONCLUSIONES
Este documento describe un método para la construcción del árbol filogenético
para el gen 16s. Se obtuvo el árbol filogenético del gen 16s con 30 secuencias con
el programa bioinformático MEGA X el cual es muy fácil de manejar y es una
herramienta muy útil para cualquier bioinformático y un programa de cajón para
cualquier laboratorio.
En el programa MEGA X, mediante el uso de la herramienta PHYLOGENY se
puede observar que en algunas bacterias tienen relación una con otra y también
nos brindó una explicación sólida de porqué las distintas especies cambian con el
pasar de los tiempos y a que estas tan bien son bien adaptadas a sus hábitats.
Es claro recalcar, que este trabajo nos muestra tan solo una pequeña parte de las
investigaciones que se desarrollan, pero las opciones para nuevas investigaciones
son amplias. Sin embargo, mediante la indignación, se encontró con que son aún
pocos los doctores que cuentan con la información o experiencia necesaria para
entender estas investigaciones que se realizan.

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BIBLIOGRAFÍA
ChristopherP.Austin,M.(s.f.).ADN(ÁcidoDesoxirribonucleico).Obtenidodehttps://w
ww.genome.gov/es/ge netics-glossary/ADN-acido-
Desoxirribonucleico#:-
:text=ADN%20es%20el%20nombre%20qu%C3%ADmic
o,(desoxirribosa)%20y%20grupos%20fosfato.
DeNecochea,R.,
&Canul,J.(2004).Métodosfisicoquímicosenbiotecnología:Secuenciaciónde
ácidosnucleicos.InstitutodeBiotecnología.México:UniversidadNacionalAut
ónomade México.
Hall,T.,Biosciences,l.,&C.A.,C.(2011).BioEdit:Unsoftwareimportanteparalabiologí
amolecular.GERFBulletinofBiosciences,60-61.
HOMERO, D. (2008). COMPUESTOS HETEROCICLICOS. Obtenido de
https://www.fcnym.unlp.edu.ar/catedras/quimicaorg/practicas/12_Guia_y_TP
12_Compuestos_Heterociclicos.pdf