Uso de softward de adn (mega x)

UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONA DE INGENIERIA AMBIENTAL
“Año de la universalización de la salud’’
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL
TEMA:
USO DEL SOFTWARE MEGA DNA
Curso:
Biotecnología
Presentado por :
Rosalinda Apaza Apaza
Docente :
Dr. Herbert H. Soto Gonzales
Escuela Profesional:
Ingeniería Ambiental
Ciclo: VII
22 de Octubre 2021
ILO -PERU

INDICE
I. INTRODUCCION .....................................................................................................................3
II. OBJETIVO.................................................................................................................................4
II.I. OBJETIVO GENERAL ..........................................................................................................4
II.II. OBJETIVO ESPECIFICO .....................................................................................................4
III. MARCO TEORICO...............................................................................................................4
III.I. MEGA X................................................................................................................................4
III.II. ARBOL FILOGENETICO ...................................................................................................4
III.III. SECUENCIA ADN............................................................................................................4
IV. METODOLOGIA ..................................................................................................................5
IV.I. MATERIALES .......................................................................................................................5
IV.II. PROCEDIMIENTO ............................................................................................................5
V. RESULTADOS........................................................................................................................12
VI. CONCLUSIONES ...............................................................................................................13
VII. BIBLIOGRAFIA..................................................................................................................14

I. INTRODUCCION
En esta practica da a conocer el uso de software de genes DNA para reconstruir un árbol
filogenético que contenía con 15 secuencias con el aplicativo de MEGA X .
La Bioinformática ha demostrado obtener mejoras en la investigación en áreas afines.
Biólogos usan programas para alinear secuencias y crear estructuras, que son de importancia
para analizar los resultados dados por dichos programas de software. De esta manera, se ha
logrado descubrir especies nuevas, determinar a qué especie pertenece una muestra de un ser
vivo, curas, entre otros descubrimientos. (Madrigal-Valverde1, 2017)
Como Charles Darwin, creador de la teoría evolutiva, fue la primera persona en plantear un
sistema de clasificación de los seres vivos de acuerdo a su origen; y en 1966 cuando el
biólogo alemán Willi Hennig sentó las bases del análisis filogenético y creó la sistemática
filogenética, de la cual se desprendieron dos ramas, la sistemática hennigiana y la sistemática
cladista, o cladismo. Cada una de ellas defiende la idea de estudiar a las especies según
diversos parámetros. (ciencia, 2020)
Los métodos filogenéticos reconstruyen árboles (dendrogramas) en los que las ramas y los
nodos unen diferentes taxones. Estos taxones pueden ser especies, individuos, genes, etc. Al
recorrer las ramas desde los nodos terminales hacia nodo original recorremos la historia
evolutiva de ese gen o organismo.
Básicamente la técnica consiste en comparar la secuencia de un determinado gen o espacio
intergénico, entre diferentes accesiones . Normalmente se compara la secuencia de una o
varias problema contra la misma secuencia de accesiones depositadas en las bases de datos.
Este proceso nos dará a conocer sus características y identificaciones de cada gen de ADN
con el fin de poder observar su árbol filogenético.

II. OBJETIVO
II.I. OBJETIVO GENERAL
Conocer la calidad gen 16S y generar un alineamiento de ADN dando una forma de un árbol
filogenético en una base de gen niFH.
II.II. OBJETIVO ESPECIFICO
 Identificar y reconocer según la calidad de la secuencia del ADN.
 realizar el alineamiento de los genes del ADN.
 Elaborar un árbol filogenético del gen niFH.
III. MARCO TEORICO
III.I. MEGA X
Es un software informático para realizar análisis estadísticos de la evolución molecular y para
construir árboles filogenéticos además Implementa muchos métodos analíticos y
herramientas para filo genómica y filo medicina. se ha actualizado para utilizar múltiples
núcleos informáticos para muchos análisis evolutivos moleculares. (Sudhir Kumar, 2018)
III.II. ARBOL FILOGENETICO
es un diagrama que representa las relaciones evolutivas entre organismos y las secuencias de
genes o proteínas pueden compararse entre especies y usarse para construir , según se
muestran en las puntas de las ramas del árbol ya que se conectan entre sí de manera que
representan la historia evolutiva de las especies, esto es, la manera en la que pensamos que
evolucionaron a partir de un ancestro común mediante una serie de eventos de divergencia
(separación en dos ramas). (Filogenia, s.f.)
III.III. SECUENCIA ADN
es una técnica de laboratorio utilizada para determinar la secuencia exacta de las bases (A,
C, G y T) en una molécula de ADN , La secuencia de bases de ADN lleva la información
que una célula necesita para ensamblar proteínas y moléculas de ARN. (Secuenciación del
ADN, s.f.)

IV. METODOLOGIA
IV.I. MATERIALES
IV.II. PROCEDIMIENTO
Computadora
software MEGA X
Pagina de NCBI
archivos de carpeta
Primeramente, ingresamos al
programa MEGA X, luego se
hace clic en ALING.
donde luego se hace otro clic
en QUERY DALABANKS Al
abrir nos saldrá una pagina
de HOME -NUCLEOTIDE
1
2

En la parte de la búsqueda se pone
16s o NIFH , para que salga opciones
de muestras donde solo se escogerá
10 muestras .
Donde se obtiene , dar clic en la
opción E-coli rrnA gene .
Una vez seleccionado hacer clic en la
primera muestra.
Hacer clic en T Add Alignmet
3
4
5
6
Una ves obtenido la muestra hacer
clic en la flecha para regresar a la
página principal

Y así sucesivamente se hará para
toda las muestra que se llegue a
elegir .
Una vez que nos salga una opción
hacer clic en OK , donde nos abre
una pagina de MIX de genes :
Aliganment Explorer
7
8
En este caso es opcional elegir tres
muestras de ADN.
9

Donde se muestra el resultado de las
10 muestras de ADN
Seleccionamos la parte repetida
para que no salda largo el resultado
10
0
11
0
Hacer clic en EDIT
dentro de ello nos aparecerá varias
opciones donde buscaremos el SELCT ALL
y dar clic
12
0

Dar clic en la parte de la figura de un
musculo
Luego hacer clic en ALING DNA
13
0
Luego de insertar hacer clic en OK
Seguidamente se procesa esto
tardara unos minutos
14
0
Se obtenio el alineamiento de las
muestras que están insertadas
15
0

ESCUELA PROFESIONA DE INGENIERIA AMBIENTAL 16
0
Eliminar las columnas vacías , una
vez seleccionado dar clic a X
Al eliminar se obtiene el resultado
Clic en EXPORTAR
Hacer clic en MEGA FORMAL
Dar un clic en DATA
17
18

Dar clic en YES
Guardar en un archivo con el nombre
de ALINEAMIENTO Y hacer clic en
guardar y lugo dar clic en OK
Ir a la pagina principal de
MEGA X
Clic en PHYLOGENY
Dar otro clic en
CONSTRUCT/TES UPGMA TREE
Dar clic en OK
19
20
21

V. RESULTADOS
según los resultados que se obtuvo en la realización del árbol filogenético se han analizado
sus similitudes y diferentes rasgos donde se ha visto que hay especies que se relacionan con
otros genes .
Donde se obtuvo el
ARBOL FITOGENETICO
22

VI. CONCLUSIONES
En el transcurso del desarrollo nos describe el método de la construcción del árbol
filogenético para el gen niFH donde consta con 15 secuencias con el programa de MEGA X
que es un herramienta que podemos manipular fácilmente ya que nos da opciones de realizar
cualquier tipo de genes y es muy útil para cualquier bioinformacion .
Básicamente la técnica consiste en comparar la secuencia de un determinado gen o espacio
intergénico, Normalmente se compara la secuencia de una o varias problema contra la misma
secuencia de accesiones depositadas en las bases de datos. eliminar los espacios vacíos y
comparar la secuencia con las que están depositadas en las bases de datos, que es lo que se
denomina alineación.
Donde es importante saber que es una parte de la metodología de investigación que se realizo
en este documento con el fin de poder observar el árbol filogenético.

VII. BIBLIOGRAFIA
ciencia. (6 de mayo de 2020). Obtenido de https://www.significados.com/filogenia/.
Filogenia. (s.f.). Obtenido de https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/natural-
selection/phylogeny/a/building-an-evolutionary-tree.
Madrigal-Valverde1, K. A. (2017). Uso de herramientas para alineación de secuencias y creación de
árboles filogenéticos para la determinación de especies. Obtenido de
https://www.scielo.sa.cr/pdf/tem/v30s1/0379-3982-tem-30-s1-30.pdf.
Secuenciación del ADN. (s.f.). Obtenido de https://www.genome.gov/es/genetics-
glossary/Secuenciacion-del-ADN.
Sudhir Kumar, G. S. (2018). MEGA X. Obtenido de https://www.semanticscholar.org/paper/MEGA-
X%3A-Molecular-Evolutionary-Genetics-Analysis-Kumar-
Stecher/df3dd2979920efe6d348edaf0795973ea342d3d8.

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