La contaminación causada por los relaves mineros ha llevado a la rana gigante, que habita en las lagunas de Junín, casi a la extinción nuevamente, a pesar de los esfuerzos para reproducirla en cautiverio. El Lago Junín contiene grandes cantidades de metales pesados provenientes de una mina cercana, lo que ha ocasionado la muerte de la mayoría de la flora y fauna que viven allí. Los indicadores ecológicos pueden usarse para identificar zonas contaminadas y en proceso de degradación.