La Universidad Nacional de La Plata es una universidad autónoma que dicta su propio estatuto y elige a sus propias autoridades. El gobierno de la universidad está compuesto por el Presidente, la Asamblea Universitaria y el Consejo Superior. El Presidente es el representante máximo de la universidad y se encarga de la planificación, organización y presupuesto. La Asamblea Universitaria puede modificar el estatuto y elegir al Presidente. El Consejo Superior está compuesto por representantes de cada una de las 17 facultades y es encabezado por el Presidente.