Estrategias de
búsqueda bibliográfica
y
análisis de datos
Marcelo Garcia Dieguez
Universidad Nacional del Sur


             Ciclo Clinico Carrera de Medicina
               Universidad Nacional del Sur



                     Bahía Blanca - 2010
•   Marcelo es un estudiante que comenzó su rotación en
    clínica médica. Hoy le toco ver a Víctoria una paciente
    de 58 que consulta por ictericia y antecedente de
    colecistectomia laparoscópica por litiasis vesicular tres
    años antes, elevación de bilirrubina a predominio directo
    y Fosfatasa alcalina elevada. Le realizaron una ecografía
    por guardia que mostró un colédoco de 10 mm pero no
    visualizo litiasis. Cuando discute con su docente. El
    docente le pregunta que estudio pediría a continuación.
    Uno de sus compañeros rápidamente sugiere una
    colangiografía retrograda endoscópica, y el docente
    pregunta por que no una colangioresonancia. Marcelo se
    queda con la duda porque tenia la idea de que la
    ecografía es muy sensible y especifica para diagnostico
    de litiasis coledociana, ¿esta descartado ese diagnostico
    con estos resultados?
•   Cuando vuelve a prestar atención ya estan discutiendo
    de tratamiento y el docente les deja la pregunta de cual
    si deben medicar con antibióticos ya que por el
    laboratorio a todas luces es una obstrucción coledociana
• ESCRIBA AL MENOS DOS
  PREGUNTAS UTILIZANDO
  LA ESTRATEGIA PICO
• DETALLE COMO
  SELECCIONAR LAS
  PALABRAS CLAVES PARA
  SU BUSQUEDA
Primera etapa

  • Preguntas
    contextuales
  • General o
    Especifica
  • Estrategia PICO
  • Que tipo de
    estudio
►P acientes-poblacion / Situación
►I ntervencion / Exposición
►C ontrol
►O utcome
Tipo de pregunta y estudio a
  localizar
        Pregunta sobre …                Tipo de Estudio

Diagnóstico                Estudio trasversal
                           Revisión Sistemática
                           Guía de Práctica Clínica (GPC)

Etiología                  Estudios de Cohortes
                           Caso-Control
                           Revisión Sistemática
                           GPC

Pronóstico/Supervivencia   Estudios de Cohortes-
                           Revisión Sistemática
                           GPC

Intervención               Ensayo Clínico Aleatorizado y Controlado
                           Revisión Sistemática
                           GPC

Frecuencia                 Estudios de Cohortes
                           Estudio trasversal
                           Revisión Sistemática
                           GPC
•   Marcelo es un estudiante que comenzó su rotación en
    clínica médica. Hoy le toco ver a Víctoria una paciente
    de 58 que consulta por ictericia y antecedente de
    colecistectomia laparoscópica por litiasis vesicular tres
    años antes, elevación de bilirrubina a predominio directo
    y Fosfatasa alcalina elevada. Le realizaron una
    ecografía por guardia que mostró un colédoco de 10
    mm pero no visualizo litiasis. Cuando discute con su
    docente. El docente le pregunta que estudio pediría a
    continuación. Uno de sus compañeros rápidamente
    sugiere una colangiografía retrograda endoscópica,
    y el docente pregunta por que no una
    colangioresonancia. Marcelo se queda con la duda
    porque tenia la idea de que la ecografía es muy
    sensible y especifica para diagnostico de litiasis
    coledociana, ¿esta descartado ese diagnostico con
    estos resultados?
•   Cuando vuelve a prestar atención ya estan discutiendo
    de tratamiento y el docente les deja la pregunta de cual
    si deben medicar con antibióticos ya que por el
    laboratorio a todas luces es una obstrucción coledociana
• PICO Escriba su pregunta

• Palabras derivados
  – Subraye y selecciones los términos
    de su pregunta en español escriba
    sinónimos
• Traducción a buscador
  – Seleccione descriptores, palabras,
    palabras truncadas, que pueden
    ser equivalentes en ingles de la
    columna anterior y serán las que
    finalmente trasladara al buscador
Usando PICO para guiar la
búsqueda
• Escenario – Pacientes con litiasis coledociana o sindrome
   coledociano la ecografia que valor diagnostico tiene
• Pregunta
    –   Población – en litiasis coledociana 1
    –   Intervencion (ecografía)                    2
    –   Comparación – comparado con nada (gold standard)
    –   (Outcome) Resultado – precisión diagnostica
                                                              3


 1. Subrraye los términos
 2. Numere el orden de importancia de 1-4
Usando PICO para guiar la
búsqueda
• Escenario – Pacientes con litiasis coledociana o sindrome
   coledociano la ecografia que valor diagnostico tiene
• Pregunta
    –   Población – en litiasis coledociana Choledocholithiasis
    –   Intervencion (ecografía) ultrasonography
    –   Comparación – comparado con nada (gold standard)
    –   (Outcome) Resultado – precisión diagnostica
          Sensitiivity and specificity


 1. Subrraye los términos
 2. Numere el orden de importancia de 1-4
 3. Piense en alternativas, de sinónimos, y truncados
¿cómo ubicar los Palabras claves?
• Pedir ayuda a un bibliotecario
• Buscar en bases de datos en linea
  que los listan como PubMed
• Buscar en catalogo DeCS en
  www.bvs.org.ar / www.bireme.br
• Busque una buena cita y fijese
  como ha sido indizada
¿Qué es el DESC?

 • DeCS - Descriptores en Ciencias de
   la Salud

 • Vocabulario estructurado y trilingüe
   creado por BIREME para uso en la
   indización de artículos de revistas
   científicas, libros, congresos, informes
   técnicos, así como para ser usado en la
   búsqueda y recuperación de asuntos de
   la literatura científica en las bases de
   datos LILACS, MEDLINE y otras
¿Qué es el DESC?

• Fue desarrollado a partir del MeSH - Medical Subject
  Headings de la U.S. National Library of Medicine con el
  objetivo de permitir el uso de terminología común para
  búsqueda en tres idiomas.

• Los conceptos que componen el DeCS son
  organizados en una estructura jerárquica permiten la
  búsqueda en términos más amplios o más específicos o
  todos los términos que pertenezcan a una misma
  estructura jerárquica.

• Para ingresar:      http://www.bireme.br
Consulta al DESC
¿Dónde buscamos?

• Colegas
• Libros
• The Cochrane
  Library
• MEDLINE
• LILALCS
• Internet
¿Dónde buscamos?

                          Sistemas de decisión computarizados
         Sistemas
                          Guías de Practica Clínica basadas en
                               evidencia
       Sumarios           Libros Basados en evidencias


   Sinopsis de Sintesis   DARE – Heath System Evidence- Eppi


                          Revisiones Sistemáticas (Biblioteca
        Sintésis              Cochrane)

                          Revistas de abstracts basado en evidencia
 Sinópsis de eStudios
                          Artículos originales publicados en revistas
       eStudios
http://www.infodoctor.org/rafabravo/buscador/piramide.swf
MEDLINE: Definiciones



      • Biblioteca Nacional de Medicina de los
        EEUU. (National Library of Medicine - NLM)
        con sede en Bethesda (Maryland).(1836)
      • Acronimo de MEDical Literature Analysis
        and Retraival System (MEDLARS) on-line
      • Base datos bibliográfica computarizada
        1966 a la fecha- On Line desde 1971
      • Más de 19 millones de citas
      • 4500 revistas biomédicas de 70 países
                    www.pubmed.gov
¿Qué es LILACS?
• Literatura Latinoamericana y del
  Caribe en Ciencias de la Salud.
• base cooperativa del Sistema BIREME,
• literatura publicada en la Región
  desde 1982.
• 670 revistas.
• más de 150.000 registros y otros
  documentos.
Accesos a LILACS

• http://www.bireme.br/
En la página web de la BVS – www.bvsalud.org or
www.bireme.br
Entrar en la opción Búsqueda Bibliográfica




               Ciclo Clinico Carrera de Medicina
                 Universidad Nacional del Sur



                       Bahía Blanca - 2010
Esta expresión de búsqueda es más restrita
que la expresión anterior.
Para añadir una temática en esta búsqueda, clic
en Refinar
En el formulario de búsqueda tenemos la expresión que recupera los
ensayos en la línea 1.
Para añadir otro tema en la búsqueda, ingrese na línea 2.
Clic en Buscar
En este enlace tenemos una expresión de búsqueda de
ensayos clínicos en LILACS.
Un clic recupera los ensayos, se presenta en LILACS, en la
pantalla de resultados.
Gracias!!!
 Ciclo Clinico Carrera de Medicina
   Universidad Nacional del Sur



         Bahía Blanca - 2010
MEDLINE : Búsquedas
                              Campos
                TI   AU   SO AD   AB   MeSH


            1
Registros




            2
Medline: Thesaurus
MeSH vs Free Text




                           Very old
    Old people

                 eledrly
                                      Medline
MEDLINE:


 MeSH : Descriptor o palabra clave
 Tesauro : relación de todos los
 descriptores o palabras-clave que
 se utilizan para indizar una base
 de datos
 Total de Palabras: cerca de 18.000
          Palabras
MEDLINE: Estructura del Thesaurus


                                       TERMINOS
               ADULTS
                                       AMPLIOS


                                       TERMINOS
GERIATRICS      AGED       LONGEVITY   RELACIONADOS



      FRAIL              AGED 80        TERMINOS
     ELDERLY            AND OVER        ESTRECHOS
Medline: MeSH Tree
Medline: Thesaurus
MeSH vs Free Text




              AGED como MeSH


     Old people             Very old
                  eledrly

                                       Medline
Medline: Thesaurus
MeSH vs Free Text




           AGED como MeSH



          AGED como FREE TEXT

                                Medline
Operadores Lógicos, “O” e “Y”




        O                     Y
 A             B        A            B
        (or)                 (and)




Se incluyen
Se incluyen             Se recuperan
                        Se recuperan
ambos conjuntos
ambos conjuntos         si coinciden
                        si coinciden
TRUCOS


Trucar y poner comodines (*)    NEAR = AND palabras cercanas




BOOLEANOS en mayúsculas                        Palabras en el Título

                          Agrupar con ()
Estructrura general de las
busquedas

•   (Poblacion OR sinonimo 1 OR …) AND
•   (Intervención OR sinonimo 1 OR …) AND
•   (Comparador OR sinonimo 1 OR …) AND
•   (Outcome OR sinonimo 1 OR …)
MEDLINE: Recuperación de Artículos
           Relevantes
           PRECISION:
No de artículos relevantes recuperados
   Total de artículos recuperados                     Relevantes
                                         No
                                         Relevantes



                                                        Nuestra
                                                        búsqueda
          SENSIBILIDAD
No de artículos relevantes recuperados
Total de artículos relevantes de la BD
MEDLINE:
    Precisión vs. Sensibilidad

                                                           FORMULACION
                                                           ESPECIFICA
Sensibilidad media: 77%                                    ESTRECHA
 Precisión media: 34%
                               PRECISION



                                                                               FORMULACION
                                                                               GENERAL, AMPLIA




                                                                SENSIBILIDAD
     Adaptado de Salton GS, McGill MJ, McGraw-Hill, 1983: 170     “RECALL”
     en Lowe HJ; Barnett GO. JAMA 271: 1103-6.
Índice de Interés Temático
Diagnósticos           Altas y       Índice de Interés
                      Muertes     (trabajos/AyM x1000)
Virus lentos de SNC        40              2000
Miastenia Gravis          930               156
Enfermedad de Crohn      6670                44
                     ¡¡¡CADA PACIENTE SE
Artritis Reumatoidea    26060                33
                     PUBLICO DOS VECES!!!
Infarto de Miocardio   102720                10
Reemplazo de Cadera     37400                 5.0
Várices                 47100                 0.6



  Frankel and West1993
Citation Matcher
• Herramienta para buscar
  artículos cuando se
  dispone la cita
• Se ingresan los datos
  conocidos en los diferentes
  campos
MEDLINE: Mesh Database
MEDLINE: Mesh Database
MEDLINE: Clincal Queries

Medline 2011

  • 1.
    Estrategias de búsqueda bibliográfica y análisisde datos Marcelo Garcia Dieguez Universidad Nacional del Sur Ciclo Clinico Carrera de Medicina Universidad Nacional del Sur Bahía Blanca - 2010
  • 2.
    Marcelo es un estudiante que comenzó su rotación en clínica médica. Hoy le toco ver a Víctoria una paciente de 58 que consulta por ictericia y antecedente de colecistectomia laparoscópica por litiasis vesicular tres años antes, elevación de bilirrubina a predominio directo y Fosfatasa alcalina elevada. Le realizaron una ecografía por guardia que mostró un colédoco de 10 mm pero no visualizo litiasis. Cuando discute con su docente. El docente le pregunta que estudio pediría a continuación. Uno de sus compañeros rápidamente sugiere una colangiografía retrograda endoscópica, y el docente pregunta por que no una colangioresonancia. Marcelo se queda con la duda porque tenia la idea de que la ecografía es muy sensible y especifica para diagnostico de litiasis coledociana, ¿esta descartado ese diagnostico con estos resultados? • Cuando vuelve a prestar atención ya estan discutiendo de tratamiento y el docente les deja la pregunta de cual si deben medicar con antibióticos ya que por el laboratorio a todas luces es una obstrucción coledociana
  • 3.
    • ESCRIBA ALMENOS DOS PREGUNTAS UTILIZANDO LA ESTRATEGIA PICO • DETALLE COMO SELECCIONAR LAS PALABRAS CLAVES PARA SU BUSQUEDA
  • 4.
    Primera etapa • Preguntas contextuales • General o Especifica • Estrategia PICO • Que tipo de estudio
  • 5.
    ►P acientes-poblacion /Situación ►I ntervencion / Exposición ►C ontrol ►O utcome
  • 6.
    Tipo de preguntay estudio a localizar Pregunta sobre … Tipo de Estudio Diagnóstico Estudio trasversal Revisión Sistemática Guía de Práctica Clínica (GPC) Etiología Estudios de Cohortes Caso-Control Revisión Sistemática GPC Pronóstico/Supervivencia Estudios de Cohortes- Revisión Sistemática GPC Intervención Ensayo Clínico Aleatorizado y Controlado Revisión Sistemática GPC Frecuencia Estudios de Cohortes Estudio trasversal Revisión Sistemática GPC
  • 7.
    Marcelo es un estudiante que comenzó su rotación en clínica médica. Hoy le toco ver a Víctoria una paciente de 58 que consulta por ictericia y antecedente de colecistectomia laparoscópica por litiasis vesicular tres años antes, elevación de bilirrubina a predominio directo y Fosfatasa alcalina elevada. Le realizaron una ecografía por guardia que mostró un colédoco de 10 mm pero no visualizo litiasis. Cuando discute con su docente. El docente le pregunta que estudio pediría a continuación. Uno de sus compañeros rápidamente sugiere una colangiografía retrograda endoscópica, y el docente pregunta por que no una colangioresonancia. Marcelo se queda con la duda porque tenia la idea de que la ecografía es muy sensible y especifica para diagnostico de litiasis coledociana, ¿esta descartado ese diagnostico con estos resultados? • Cuando vuelve a prestar atención ya estan discutiendo de tratamiento y el docente les deja la pregunta de cual si deben medicar con antibióticos ya que por el laboratorio a todas luces es una obstrucción coledociana
  • 8.
    • PICO Escribasu pregunta • Palabras derivados – Subraye y selecciones los términos de su pregunta en español escriba sinónimos • Traducción a buscador – Seleccione descriptores, palabras, palabras truncadas, que pueden ser equivalentes en ingles de la columna anterior y serán las que finalmente trasladara al buscador
  • 9.
    Usando PICO paraguiar la búsqueda • Escenario – Pacientes con litiasis coledociana o sindrome coledociano la ecografia que valor diagnostico tiene • Pregunta – Población – en litiasis coledociana 1 – Intervencion (ecografía) 2 – Comparación – comparado con nada (gold standard) – (Outcome) Resultado – precisión diagnostica 3 1. Subrraye los términos 2. Numere el orden de importancia de 1-4
  • 10.
    Usando PICO paraguiar la búsqueda • Escenario – Pacientes con litiasis coledociana o sindrome coledociano la ecografia que valor diagnostico tiene • Pregunta – Población – en litiasis coledociana Choledocholithiasis – Intervencion (ecografía) ultrasonography – Comparación – comparado con nada (gold standard) – (Outcome) Resultado – precisión diagnostica Sensitiivity and specificity 1. Subrraye los términos 2. Numere el orden de importancia de 1-4 3. Piense en alternativas, de sinónimos, y truncados
  • 11.
    ¿cómo ubicar losPalabras claves? • Pedir ayuda a un bibliotecario • Buscar en bases de datos en linea que los listan como PubMed • Buscar en catalogo DeCS en www.bvs.org.ar / www.bireme.br • Busque una buena cita y fijese como ha sido indizada
  • 12.
    ¿Qué es elDESC? • DeCS - Descriptores en Ciencias de la Salud • Vocabulario estructurado y trilingüe creado por BIREME para uso en la indización de artículos de revistas científicas, libros, congresos, informes técnicos, así como para ser usado en la búsqueda y recuperación de asuntos de la literatura científica en las bases de datos LILACS, MEDLINE y otras
  • 13.
    ¿Qué es elDESC? • Fue desarrollado a partir del MeSH - Medical Subject Headings de la U.S. National Library of Medicine con el objetivo de permitir el uso de terminología común para búsqueda en tres idiomas. • Los conceptos que componen el DeCS son organizados en una estructura jerárquica permiten la búsqueda en términos más amplios o más específicos o todos los términos que pertenezcan a una misma estructura jerárquica. • Para ingresar: http://www.bireme.br
  • 14.
  • 15.
    ¿Dónde buscamos? • Colegas •Libros • The Cochrane Library • MEDLINE • LILALCS • Internet
  • 16.
    ¿Dónde buscamos? Sistemas de decisión computarizados Sistemas Guías de Practica Clínica basadas en evidencia Sumarios Libros Basados en evidencias Sinopsis de Sintesis DARE – Heath System Evidence- Eppi Revisiones Sistemáticas (Biblioteca Sintésis Cochrane) Revistas de abstracts basado en evidencia Sinópsis de eStudios Artículos originales publicados en revistas eStudios
  • 17.
  • 19.
    MEDLINE: Definiciones • Biblioteca Nacional de Medicina de los EEUU. (National Library of Medicine - NLM) con sede en Bethesda (Maryland).(1836) • Acronimo de MEDical Literature Analysis and Retraival System (MEDLARS) on-line • Base datos bibliográfica computarizada 1966 a la fecha- On Line desde 1971 • Más de 19 millones de citas • 4500 revistas biomédicas de 70 países www.pubmed.gov
  • 26.
    ¿Qué es LILACS? •Literatura Latinoamericana y del Caribe en Ciencias de la Salud. • base cooperativa del Sistema BIREME, • literatura publicada en la Región desde 1982. • 670 revistas. • más de 150.000 registros y otros documentos.
  • 27.
    Accesos a LILACS •http://www.bireme.br/
  • 28.
    En la páginaweb de la BVS – www.bvsalud.org or www.bireme.br Entrar en la opción Búsqueda Bibliográfica Ciclo Clinico Carrera de Medicina Universidad Nacional del Sur Bahía Blanca - 2010
  • 30.
    Esta expresión debúsqueda es más restrita que la expresión anterior. Para añadir una temática en esta búsqueda, clic en Refinar
  • 31.
    En el formulariode búsqueda tenemos la expresión que recupera los ensayos en la línea 1. Para añadir otro tema en la búsqueda, ingrese na línea 2. Clic en Buscar
  • 32.
    En este enlacetenemos una expresión de búsqueda de ensayos clínicos en LILACS. Un clic recupera los ensayos, se presenta en LILACS, en la pantalla de resultados.
  • 33.
    Gracias!!! Ciclo ClinicoCarrera de Medicina Universidad Nacional del Sur Bahía Blanca - 2010
  • 34.
    MEDLINE : Búsquedas Campos TI AU SO AD AB MeSH 1 Registros 2
  • 35.
    Medline: Thesaurus MeSH vsFree Text Very old Old people eledrly Medline
  • 36.
    MEDLINE: MeSH :Descriptor o palabra clave Tesauro : relación de todos los descriptores o palabras-clave que se utilizan para indizar una base de datos Total de Palabras: cerca de 18.000 Palabras
  • 37.
    MEDLINE: Estructura delThesaurus TERMINOS ADULTS AMPLIOS TERMINOS GERIATRICS AGED LONGEVITY RELACIONADOS FRAIL AGED 80 TERMINOS ELDERLY AND OVER ESTRECHOS
  • 38.
  • 39.
    Medline: Thesaurus MeSH vsFree Text AGED como MeSH Old people Very old eledrly Medline
  • 40.
    Medline: Thesaurus MeSH vsFree Text AGED como MeSH AGED como FREE TEXT Medline
  • 41.
    Operadores Lógicos, “O”e “Y” O Y A B A B (or) (and) Se incluyen Se incluyen Se recuperan Se recuperan ambos conjuntos ambos conjuntos si coinciden si coinciden
  • 42.
    TRUCOS Trucar y ponercomodines (*) NEAR = AND palabras cercanas BOOLEANOS en mayúsculas Palabras en el Título Agrupar con ()
  • 43.
    Estructrura general delas busquedas • (Poblacion OR sinonimo 1 OR …) AND • (Intervención OR sinonimo 1 OR …) AND • (Comparador OR sinonimo 1 OR …) AND • (Outcome OR sinonimo 1 OR …)
  • 44.
    MEDLINE: Recuperación deArtículos Relevantes PRECISION: No de artículos relevantes recuperados Total de artículos recuperados Relevantes No Relevantes Nuestra búsqueda SENSIBILIDAD No de artículos relevantes recuperados Total de artículos relevantes de la BD
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    MEDLINE: Precisión vs. Sensibilidad FORMULACION ESPECIFICA Sensibilidad media: 77% ESTRECHA Precisión media: 34% PRECISION FORMULACION GENERAL, AMPLIA SENSIBILIDAD Adaptado de Salton GS, McGill MJ, McGraw-Hill, 1983: 170 “RECALL” en Lowe HJ; Barnett GO. JAMA 271: 1103-6.
  • 46.
    Índice de InterésTemático Diagnósticos Altas y Índice de Interés Muertes (trabajos/AyM x1000) Virus lentos de SNC 40 2000 Miastenia Gravis 930 156 Enfermedad de Crohn 6670 44 ¡¡¡CADA PACIENTE SE Artritis Reumatoidea 26060 33 PUBLICO DOS VECES!!! Infarto de Miocardio 102720 10 Reemplazo de Cadera 37400 5.0 Várices 47100 0.6 Frankel and West1993
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    Citation Matcher • Herramientapara buscar artículos cuando se dispone la cita • Se ingresan los datos conocidos en los diferentes campos
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