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Avogadro parte i
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Tutorial que inicia el uso del programa editor de moleculas Avogadro

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  • 1. “Dibujando estructuras moleculares” Sitio oficial: http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page Sitio en la colección 1 a 1 de Educ.ar: http://escritoriodocentes.educ.ar/datos/cien_avogadro.h
  • 2. La Pantalla: La primera vez que abran Avogadro se presentará la siguiente pantalla
  • 3. En la parte superior vemos…… Menú desplegableHerramientas
  • 4. Para cambiar el fondo de pantalla: Ir al menú superior, la opción “Ver” Luego vamos a.. Establecer el color de fondo Haciendo clic allí……
  • 5. Elijo el colorApareceuna paletade colorespara elegir ok
  • 6. Algunos ejemplos de colores de pantalla
  • 7. Pantalla:En la parte superior podemos ver la información de depuración: En este caso, dibujé la Molécula de CH4, que tiene 5 átomos y 4 enlaces covalentes simples. En la parte inferior se encuentran los ejes, para acceder vamos a la opción “Ver” / “Mostrar ejes”
  • 8. Nueva vista Vamos a la opción “Ver” “Nueva vista”Quedarán solapadas en la parte superior izquierda
  • 9. Duplicar vistas: Vamos a la opción “Ver” “Duplicar vistas”
  • 10. Podemos ver dos vistas distintas de la molécula, en este caso tenemos elpropeno, en el segundo dibujo se puede notar la unión covalente doble desdeun mejor ángulo También se puede apreciar como rotan los ejes de abajo
  • 11. Herramienta dibujo: “El lápiz”El lápiz es la herramienta que nos va a permitir dibujar átomos y enlazarlos para generar moléculas. “Preferencias de herramientas”, nos muestra la configuración del dibujo Si hacemos clic aquí….
  • 12. Podemos elegir el átomo Podemos elegir el tipo de enlace: •Simple •Doble •TripleSi queda tildada coloca los hidrógenos automáticamente.
  • 13. Si hacemos clic en “otro”, aparece laTabla periódica de elementos químicosy podemos elegir otro elemento.
  • 14. Con esta configuración voy Etano a dibujar carbonos con enlaces covalentes simples y los hidrógenos se ajustan automáticamente.Con el botón izquierdo genero átomos y luego arrastro con el mouse desdeuno de los átomos hacia el otro.
  • 15. Botón izquierdo del mouse Botón derecho del mouse •Hacer clic para generar •Hacer clic para átomos. borrar átomos. •Arrastrar para generar enlaces.
  • 16. Optimización de la geometría molecular Vamos a “Extensiones”/Optimizar Geometría Aparece este cartel Resultado final
  • 17. Guardar mi producción: Archivo/Exportar/Gráficos y lo vamos a guardar cómo imagen png
  • 18. Archivo/Exportar/Gráficos vectoriales y lo vamos a guardar en formato pdf