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GUIA DE USO PRACTICO PARA EL MANEJO DE PUBMED




              MATERIAL DE APOYO
                ELABORADO PARA LOS ESTUDIANTES DE III SEMESTRE
          Sistemas y Tecnologías de la información
           Facultad de odontología
                               Universidad El Bosque


                       ANGELO ANDRES LAVERDE BARRERA




Agosto 2005                                                      Angelo Andres Laverde
REFLEXIONES INICIALES
    La humanidad a generado más información en los últimos 30 años que en los
    pasados 5000

    Una edición normal de un día de semana del “The New York Times”    contiene más
    información que la que oyó en toda su vida una persona promedio de la Inglaterra
    del siglo XVII

    Se publican internacionalmente 1000 libros por día

    El conocimiento impreso se duplica cada 8 años

    El tiempo de duplicación en las publicaciones periódicas en medicina es de 19 años,
    el conocimiento médico aumenta cuatro veces durante el ejercicio profesional de un
    médico*
                                       *Wyatt, J, Use and sources of medical knowledge. Lancet, 1991. 338(8779): p. 1368-73.

Agosto 2005                                                                                       Angelo Andres Laverde
REFLEXIONES INICIALES
    Se publican cerca de 2 millones de artículos biomédicos anualmente**

    Habría que leer 6000 artículos biomédicos por día para mantenerse al tanto de los
    avances de la medicina***

    En la actualidad existen alrededor de 25.000 revistas médicas y se publican más
    de 2.000.000 de artículos por año, unos 2000/día. Por lo que se calcula que un
    médico para poder leer todo lo que se publica en un año sobre su especialidad
    necesitaría 19 horas diarias durante los 365 días del año.




     **Arndt, KA, Information excess in medicine. Overview, relevance to dermatology, and strategies for coping. Arch Dermatol, 1992. 128(9): p. 1249-56
     ***Lundberg, GD, 2nd, Perspective from the editor of JAMA, The Journal of the American Medical Association. Bull Med Libr Assoc, 1992. 80(2): p. 110-4
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Las leyes de Murphy


              La información que uno tiene no es la que uno quiere

              La información que uno quiere no es la que uno necesita

              La información que uno necesita no es la que puede obtener

              La información que puede obtener es más cara de lo que uno quiere
              pagar


        “La frustración aparece cuando existe una gran cantidad de información,
              pero no nos brinda lo que necesitamos o queremos conocer”
                                       Wurman, R., Facts. statistics and the anxiety syndrome. Lancet, 1991. 337: p. 37-38




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¿Por qué buscar en PUBMED?
      Contiene más de 12 millones de referencias a artículos de publicaciones periódicas
      de todo el mundo en el ámbito de la biomedicina.

      Indiza citas desde 1966 a la fecha.

      Citas de más de 4600 publicaciones periódicas en 30 idiomas

      Cerca del 52% de las mismas fueron originalmente publicadas en EE.UU.

      El 86% tiene como idioma de origen el inglés

      El 76% de las citas posee resúmenes escritos por los autores.

      Aproximadamente 8,000 referencias son ingresadas semanalmente a la base.
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Antes de usar PubMed tenga en cuenta:

                             Estrategia de búsqueda


                                 ¿Entiendo realmente lo que estoy buscando?

                                               Me aclaro el tema con un especialista en el área


                                               No subestimar las guías, diccionarios y libros de
                                               referencia
       Aclaración del tema



                                   ¿Conozco el significado exacto del tema?

                                              Busca los términos más adecuado y autorizados


                                              Hacer uso de tesauros y diccionarios tematicos



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Antes de usar PubMed tenga en cuenta:

                              Estrategia de búsqueda

                                          Informes de Casos

                                          Articulo de revisión

                                           Artículo Histórico

   ¿Que tipo de información              Revisión Multicasual
          necesito ?
                                      Revisión de Casos Relatados

                                            Artículo Clásico

                                            Ensayo Clínico

                                             Metaanálisis

Agosto 2005                                                         Angelo Andres Laverde
Antes de usar PubMed tenga en cuenta:

                              Estrategia de búsqueda



                                              Ingles

                                              Alemán

        ¿En que idioma                        Francés
      deseo la información?
                                              Español

                                               Ruso




Agosto 2005                                                Angelo Andres Laverde
Antes de usar PubMed tenga en cuenta:

                          Estrategia de búsqueda
                                   Infantes: Nacimiento – 23 meses

                                     Todos los niños: 0-18 años

                                  Recién nacidos: nacimiento – 1 mes

                                          Niños: 6 – 12 años
         Si aplicará,
¿Cuál es la edad del paciente?      Niños preescolares: 2 – 5 años

                                     Adolescentes: 13 – 18 años

                                        Adultos: 19 – 44 años

                                     Adulto medio: 45 – 64 años

                                            Mayores: 65 -

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Antes de usar PubMed tenga en cuenta:

                          Estrategia de búsqueda



                                             Solo abstracts

                                         Solo textos completos
    ¿Cómo quiero la información?
                                       Disponibles en la Biblioteca

                                       ¿Estoy dispuesto a pagar?




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¿QUE ES PUBMED?

 PubMed es una base de datos desarrollada por la National Center for Biotechnology
 Information (NCBI) en la National Library of Medicine (NLM).


 Permite el acceso a bases de datos bibliográficas compiladas por la NLM: MEDLINE,
 PreMEDLINE (citas enviadas por los editores), Genbak y Complete Genoma.


 Medline contiene subbases de datos como: AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary
 Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals, PubMed Central.




Agosto 2005                                                             Angelo Andres Laverde
1 Ingrese a la página web de la base de datos.

              http://www.pubmed.com




Agosto 2005                                             Angelo Andres Laverde
Introduzca el o los términos que desee buscar en el casillero
                     2   en blanco del formulario (en inglés) y pulse el botón Go o la
                         tecla Enter.

              http://www.pubmed.com




                 Dental Caries AND Risk Factors




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3   Despliegue de resultados




                                                             Indica el número
                                                        Indica el número
                                                         de artículos de revisión
                                                    de artículos encontrados

                                                    Este icono indica
                                                    que el ABSTRAC
                                                      esta disponible
                                                    Este icono indica
                                                que el TEXTO COMPLETO
                                                     esta disponible
                  Los angulares [ ] indican            Este icono indica
              que el artículo esta en otro idioma     que SOLO LA CITA
                       distinto al ingles               esta disponible



Agosto 2005                                                       Angelo Andres Laverde
4   Limitamos los resultados




Agosto 2005                                  Angelo Andres Laverde
4    Limitamos los resultados


                Dental Caries AND Risk Factors

                                                   Como nuestra búsqueda es
                                                  Selecciona deidioma
                                                     En área el odontología
                                           en el Decidimos si es interés elegir
                                                 lo más recomendado es
                                                 que se desea la información
                                                         Dental Journals
                                            Buscar en Humanos ó animales



                                                      Elegimos el tipo
                                                       Elegimos la edad
                                                 de articulo que deseamos.
                                                   del paciente o muestra
                                                         Ej. Revisión
  Indicamos                                        del estudio. Ej. Niños de
   el rango                                                6-12 años
de fechas que
  deseamos




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5   Seleccionamos los resultados más relevantes



          Al terminar de
       elegir los artículos,
    Ingresamos al Clipboard


                   Luego enviamos estos
                   artículos seleccionados
                al Clipboard (casillero) para
                guardarlos temporalmente.

                Permite guardar por 8 horas
                   Hasta 500 registros
                                                Escogemos los artículos
                                                    de preferencia.




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6   Uso del Clipboard




                         TEXT: Permite ver las referencias sin gráficos.
              Muy FILE: Permite descargar directamente o acomputador las
                   útil para pasar las referencias a Word al un editor de texto
                                    referencias encontradas
                E-MAIL: Permite enviar las referencias al correo electrónico.
              CLIP-REMOVE:Permite comprar el articulo mediante no se desean
                    ORDER:     Permite eliminar las referencias que tarjeta
                              de crédito y/o convenio bibliotecario

                     Mostrara sólo los artículos
                           seleccionados




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6   Uso del Single Citation matcher




                          Útil para recuperar referencias bibliograficas
                                           de artículos




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7     Uso del Single Citation matcher

              Sin necesidad de incluir todos los datos de la referencia
               puedo recuperarla solo con los datos más relevantes.
                  Por ejemplo en este caso solo se incluyo el año,
                 volumen y pagina inicial; ya que la probabilidad de
              que se publicaran varios artículos en el mismo volumen,
                         y en la misma pagina es muy poca




                              EJERCICIO: Recuperar la siguiente referencia:
                           Tickle M, Williams M, Jenner T, Blinkhorn A. The effects of
                       socioeconomic status and dental attendance on dental caries‘
                         experience, and treatment patterns in 5-year-old children.
                                   Br Dent J. 1999 Feb 13;186(3):135-7.

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7   Uso del MeSH Database




                             Útil para normalizar los términos de
                          búsqueda. Evita la sinónima, polisemia y
                            el doble significado. Solo recupera los
                           términos en las palabras claves de los
                                            artículos




Agosto 2005                                           Angelo Andres Laverde
7   Uso del MeSH Database




   Despliega el termino ó términos encontrados
   Proporcionando adicionalmente un definición
               muy clara y precisa

                                                 Escribimos solo una de las palabras
                                                 Clave que necesitamos en el cajón
                                                            de búsqueda




                                       Click para ingresar




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7    Uso del MeSH Database




              Básicamente la base de datos esta preguntando: ¿Qué
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                                Bibliografia

  NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE. About Entrez [en linea]. Disponible En:
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Database/index.html , [fecha de consulta: 22 de agosto de
  2005]


  DELAMOTHE T, Smith R. PubMed Central: creating an Aladdin's cave of ideas. BMJ.
  2001 Jan 6;322(7277):1-2.


  ROBERTS RJ. PubMed Central: The GenBank of the published literature. Proc Natl
  Acad Sci U S A. 2001 Jan 16;98(2):381-2




Agosto 2005                                                             Angelo Andres Laverde
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  • 1. GUIA DE USO PRACTICO PARA EL MANEJO DE PUBMED MATERIAL DE APOYO ELABORADO PARA LOS ESTUDIANTES DE III SEMESTRE Sistemas y Tecnologías de la información Facultad de odontología Universidad El Bosque ANGELO ANDRES LAVERDE BARRERA Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 2. REFLEXIONES INICIALES La humanidad a generado más información en los últimos 30 años que en los pasados 5000 Una edición normal de un día de semana del “The New York Times” contiene más información que la que oyó en toda su vida una persona promedio de la Inglaterra del siglo XVII Se publican internacionalmente 1000 libros por día El conocimiento impreso se duplica cada 8 años El tiempo de duplicación en las publicaciones periódicas en medicina es de 19 años, el conocimiento médico aumenta cuatro veces durante el ejercicio profesional de un médico* *Wyatt, J, Use and sources of medical knowledge. Lancet, 1991. 338(8779): p. 1368-73. Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 3. REFLEXIONES INICIALES Se publican cerca de 2 millones de artículos biomédicos anualmente** Habría que leer 6000 artículos biomédicos por día para mantenerse al tanto de los avances de la medicina*** En la actualidad existen alrededor de 25.000 revistas médicas y se publican más de 2.000.000 de artículos por año, unos 2000/día. Por lo que se calcula que un médico para poder leer todo lo que se publica en un año sobre su especialidad necesitaría 19 horas diarias durante los 365 días del año. **Arndt, KA, Information excess in medicine. Overview, relevance to dermatology, and strategies for coping. Arch Dermatol, 1992. 128(9): p. 1249-56 ***Lundberg, GD, 2nd, Perspective from the editor of JAMA, The Journal of the American Medical Association. Bull Med Libr Assoc, 1992. 80(2): p. 110-4 Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 4. Las leyes de Murphy La información que uno tiene no es la que uno quiere La información que uno quiere no es la que uno necesita La información que uno necesita no es la que puede obtener La información que puede obtener es más cara de lo que uno quiere pagar “La frustración aparece cuando existe una gran cantidad de información, pero no nos brinda lo que necesitamos o queremos conocer” Wurman, R., Facts. statistics and the anxiety syndrome. Lancet, 1991. 337: p. 37-38 Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 5. ¿Por qué buscar en PUBMED? Contiene más de 12 millones de referencias a artículos de publicaciones periódicas de todo el mundo en el ámbito de la biomedicina. Indiza citas desde 1966 a la fecha. Citas de más de 4600 publicaciones periódicas en 30 idiomas Cerca del 52% de las mismas fueron originalmente publicadas en EE.UU. El 86% tiene como idioma de origen el inglés El 76% de las citas posee resúmenes escritos por los autores. Aproximadamente 8,000 referencias son ingresadas semanalmente a la base. Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 6. Antes de usar PubMed tenga en cuenta: Estrategia de búsqueda ¿Entiendo realmente lo que estoy buscando? Me aclaro el tema con un especialista en el área No subestimar las guías, diccionarios y libros de referencia Aclaración del tema ¿Conozco el significado exacto del tema? Busca los términos más adecuado y autorizados Hacer uso de tesauros y diccionarios tematicos Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 7. Antes de usar PubMed tenga en cuenta: Estrategia de búsqueda Informes de Casos Articulo de revisión Artículo Histórico ¿Que tipo de información Revisión Multicasual necesito ? Revisión de Casos Relatados Artículo Clásico Ensayo Clínico Metaanálisis Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 8. Antes de usar PubMed tenga en cuenta: Estrategia de búsqueda Ingles Alemán ¿En que idioma Francés deseo la información? Español Ruso Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 9. Antes de usar PubMed tenga en cuenta: Estrategia de búsqueda Infantes: Nacimiento – 23 meses Todos los niños: 0-18 años Recién nacidos: nacimiento – 1 mes Niños: 6 – 12 años Si aplicará, ¿Cuál es la edad del paciente? Niños preescolares: 2 – 5 años Adolescentes: 13 – 18 años Adultos: 19 – 44 años Adulto medio: 45 – 64 años Mayores: 65 - Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 10. Antes de usar PubMed tenga en cuenta: Estrategia de búsqueda Solo abstracts Solo textos completos ¿Cómo quiero la información? Disponibles en la Biblioteca ¿Estoy dispuesto a pagar? Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 11. ¿QUE ES PUBMED? PubMed es una base de datos desarrollada por la National Center for Biotechnology Information (NCBI) en la National Library of Medicine (NLM). Permite el acceso a bases de datos bibliográficas compiladas por la NLM: MEDLINE, PreMEDLINE (citas enviadas por los editores), Genbak y Complete Genoma. Medline contiene subbases de datos como: AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals, PubMed Central. Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 12. 1 Ingrese a la página web de la base de datos. http://www.pubmed.com Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 13. Introduzca el o los términos que desee buscar en el casillero 2 en blanco del formulario (en inglés) y pulse el botón Go o la tecla Enter. http://www.pubmed.com Dental Caries AND Risk Factors Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 14. 3 Despliegue de resultados Indica el número Indica el número de artículos de revisión de artículos encontrados Este icono indica que el ABSTRAC esta disponible Este icono indica que el TEXTO COMPLETO esta disponible Los angulares [ ] indican Este icono indica que el artículo esta en otro idioma que SOLO LA CITA distinto al ingles esta disponible Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 15. 4 Limitamos los resultados Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 16. 4 Limitamos los resultados Dental Caries AND Risk Factors Como nuestra búsqueda es Selecciona deidioma En área el odontología en el Decidimos si es interés elegir lo más recomendado es que se desea la información Dental Journals Buscar en Humanos ó animales Elegimos el tipo Elegimos la edad de articulo que deseamos. del paciente o muestra Ej. Revisión Indicamos del estudio. Ej. Niños de el rango 6-12 años de fechas que deseamos Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 17. 5 Seleccionamos los resultados más relevantes Al terminar de elegir los artículos, Ingresamos al Clipboard Luego enviamos estos artículos seleccionados al Clipboard (casillero) para guardarlos temporalmente. Permite guardar por 8 horas Hasta 500 registros Escogemos los artículos de preferencia. Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 18. 6 Uso del Clipboard TEXT: Permite ver las referencias sin gráficos. Muy FILE: Permite descargar directamente o acomputador las útil para pasar las referencias a Word al un editor de texto referencias encontradas E-MAIL: Permite enviar las referencias al correo electrónico. CLIP-REMOVE:Permite comprar el articulo mediante no se desean ORDER: Permite eliminar las referencias que tarjeta de crédito y/o convenio bibliotecario Mostrara sólo los artículos seleccionados Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 19. 6 Uso del Single Citation matcher Útil para recuperar referencias bibliograficas de artículos Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 20. 7 Uso del Single Citation matcher Sin necesidad de incluir todos los datos de la referencia puedo recuperarla solo con los datos más relevantes. Por ejemplo en este caso solo se incluyo el año, volumen y pagina inicial; ya que la probabilidad de que se publicaran varios artículos en el mismo volumen, y en la misma pagina es muy poca EJERCICIO: Recuperar la siguiente referencia: Tickle M, Williams M, Jenner T, Blinkhorn A. The effects of socioeconomic status and dental attendance on dental caries‘ experience, and treatment patterns in 5-year-old children. Br Dent J. 1999 Feb 13;186(3):135-7. Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 21. 7 Uso del MeSH Database Útil para normalizar los términos de búsqueda. Evita la sinónima, polisemia y el doble significado. Solo recupera los términos en las palabras claves de los artículos Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 22. 7 Uso del MeSH Database Despliega el termino ó términos encontrados Proporcionando adicionalmente un definición muy clara y precisa Escribimos solo una de las palabras Clave que necesitamos en el cajón de búsqueda Click para ingresar Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 23. 7 Uso del MeSH Database Básicamente la base de datos esta preguntando: ¿Qué Esta buscando sobre Caries dental? Seleccionamos los subtemas de nuestro interes Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 24. 7 Uso del MeSH Database Luego de haber seleccionado los subtemas Procedemos a desplegar el menú SEND TO Y elegimos la opción SEARCH BOX WITH AND Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 25. 7 Uso del MeSH Database Click para ejecutar La búsqueda Nos despliega el algoritmo de búsqueda Que empleara la base de datos. Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 26. FINAL GUÍA BASICA PUBMED GRACIAS Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 27. GUIA PARA USUARIOS AVANZADOS: MOTORES DE BÚSQUEDA Bibliografia NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE. About Entrez [en linea]. Disponible En: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Database/index.html , [fecha de consulta: 22 de agosto de 2005] DELAMOTHE T, Smith R. PubMed Central: creating an Aladdin's cave of ideas. BMJ. 2001 Jan 6;322(7277):1-2. ROBERTS RJ. PubMed Central: The GenBank of the published literature. Proc Natl Acad Sci U S A. 2001 Jan 16;98(2):381-2 Agosto 2005 Angelo Andres Laverde
  • 28. Todos los derechos sobre este son propiedad exclusiva de su autor titular: Angelo Andrés Laverde, y del Sistema de Información Doble Vía. Este documento está protegido por la constitución de 1991, las leyes 23 de 1982, 44 de 1992 y la Decisión Andina 351 de 1993, las cuales regulan el ejercicio del Derecho de Autor y propiedad intelectual en nuestro país. Mayor información: doble_via@colombia.com Cel. 310 863 66 59 Bogotá, Colombia. Copyright of Project Doble Vía is the property of Doble Via: Sistema de información and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use.