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Regeneración en grillo
Isaac Martínez Ugalde
Introducción
• Únicamente se da en ninfas instar 3
• Es un proceso regulado a muchos niveles
• Cascadas de transducción de señales
• Postranscripcional
• Epigenético
• Avances en … regeneración de SN y extremidades
Instar 1-6
• La amputación de extremidades es muy
común
• Se requiere la formación de de blastema
• Los mecanismos de formación de blastema
son poco claros en grillo
• La formación del blastema inicia a las 24 hrs
• MUCHAS moléculas implicadas
Ohuchi et al., 2015
Gryllus bimaculatus
RNA-seq (Tetsuya et al., 2013)
• Una visión global de la formación del blastama en
G.bimaculatus
• Se evalúa la expresión génica durante la formación del
blastema en la parte distal
• Evaluación de niveles de expresión
• Ontología de genes
• qPCR
• RNAi
• 55,043 UT (261 bp) ensambladas entre extremidades
regeneradas y sanas (velvet y oases)
• 466 únicos de extremidades regeneradas
• 11,492 con niveles de expresión mas altos
• Blast2Go para ontología
• 2724 transcritos únicamente dieron hit en BlastX por
tamaño y falta de datos genómicos de G. bimaculatus
Pediculus humorous y Tribolium castaneum
• De los 2724, 2344 fueron anotados con
terminología Go
• Principales términos :
• Transducción de señales
• Interacción P-P
• Receptores
• Factor de transcripción
• También se encontraron sobre expresados
genes de apoptosis MMPs, piwi y AGO3
• Wg/Wnt, Hh/Shh, JAK/STAT, EGF, Dpp/TGF,
VEGF, Insulina/IGF, Notch, Toll
Evaluación de niveles de expresión
• ¿JAK/STAT es esencial para la formación del blastema?
• Se valido la funcionalidad de esta vía de señalización con RNAi
• Gb’dome Gb’hop y Gb’Stat
• Los experimentos se hicieron en instar 3 y se observaron los siguientes
estadios
• Gb’Stat y Gb’dome están asociados a la formación
del blastema
• Gb’hop esta asociado al crecimiento de las
extremidades
• Por el efecto fenotípico del RNAi se enfocan en STAT
• Correlacionan los niveles de ciclina E con
prolifreación duarnte la formación temprana de
blastema
• Con RNAi Gb’Stat disminuyen los niveles de
expresión de ciclina E
Gb’Stat regula la prolifreación
Regulación negativa de JAK/STAT
Otras moléculas implicadas
• Dachshund y Distal less
• Exd y hth
• Wnt y Hh
Ishimaru et al., 2015
Factores epigenéticos
• miRNA’s, piwiRNA, RISC, Histonas
• Muy poco caracterizado en grillo
• El grupo de Tetsuya encontró ncRNA’s pero no hubo mas datos
• Primeros avances con histonas en 2015
• La formación del blastema puede darse por
células troncales (neblasto) o por procesos de
transdiferenciación
• En planaria por ejemplo se da por células
troncales
• Su identidad celular esta asociada a la regulación
por HMT de la familia SET/MLL
• En insectos la formación del blastema
transdiferenciación celular
• HMT de la familia Polycomb regulan el proceso
Reddien et al., 2016
Itzhaki 2014
Hamada et al., 2015
• Gryllus Enhancer of zeste Gb’E(z)
• Ubiquitously transcribed tetratricopeptide
repeat gene on the X chromosome Gb’Utx
• H3K27
• La metilación se ve disminuida por
Gb’E(z)RNAi
• Gb’UtxRNAi incrementa los niveles de
mtilación
• E(z) y Utx se sobre expresan post
amputación
Tsetuya et al., 2013 reportan
sobreexpresión de estas
moléculas ´post amputación
• Gb’E(z) en el dominio SET tiene 96% y
95% de homología con Dm’Ez y EZH2
(dos parálogos en humano y ratón)
• Gb’Utx JmjC tiene 91% y 83% con Utx y
KDM6 (3 parálogos en humano y raton)
• Hibridación in situ para determinar los
patrones de expresión de Gb’Utx y
Gb’E(z)
• Uso de RNAi para evaluar efectos
fenotípicos
• Gb’E(z)RNAi induce la formación de un
segmento extra
• Gb’UtxRNA induce defectos en la
formación de articulaciones
del tarso
• Gb’E(z) también esta asociado a la
formación de segmentos
• La regulación de los estados de metilación de la H3K27 es esencial para la
regeneración de extremidades

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Regeneración en grillo

  • 1. Regeneración en grillo Isaac Martínez Ugalde
  • 2. Introducción • Únicamente se da en ninfas instar 3 • Es un proceso regulado a muchos niveles • Cascadas de transducción de señales • Postranscripcional • Epigenético • Avances en … regeneración de SN y extremidades Instar 1-6
  • 3. • La amputación de extremidades es muy común • Se requiere la formación de de blastema • Los mecanismos de formación de blastema son poco claros en grillo • La formación del blastema inicia a las 24 hrs • MUCHAS moléculas implicadas Ohuchi et al., 2015 Gryllus bimaculatus
  • 4. RNA-seq (Tetsuya et al., 2013) • Una visión global de la formación del blastama en G.bimaculatus • Se evalúa la expresión génica durante la formación del blastema en la parte distal • Evaluación de niveles de expresión • Ontología de genes • qPCR • RNAi
  • 5. • 55,043 UT (261 bp) ensambladas entre extremidades regeneradas y sanas (velvet y oases) • 466 únicos de extremidades regeneradas • 11,492 con niveles de expresión mas altos • Blast2Go para ontología • 2724 transcritos únicamente dieron hit en BlastX por tamaño y falta de datos genómicos de G. bimaculatus Pediculus humorous y Tribolium castaneum
  • 6. • De los 2724, 2344 fueron anotados con terminología Go • Principales términos : • Transducción de señales • Interacción P-P • Receptores • Factor de transcripción • También se encontraron sobre expresados genes de apoptosis MMPs, piwi y AGO3 • Wg/Wnt, Hh/Shh, JAK/STAT, EGF, Dpp/TGF, VEGF, Insulina/IGF, Notch, Toll
  • 7. Evaluación de niveles de expresión • ¿JAK/STAT es esencial para la formación del blastema?
  • 8. • Se valido la funcionalidad de esta vía de señalización con RNAi • Gb’dome Gb’hop y Gb’Stat • Los experimentos se hicieron en instar 3 y se observaron los siguientes estadios
  • 9. • Gb’Stat y Gb’dome están asociados a la formación del blastema • Gb’hop esta asociado al crecimiento de las extremidades • Por el efecto fenotípico del RNAi se enfocan en STAT • Correlacionan los niveles de ciclina E con prolifreación duarnte la formación temprana de blastema • Con RNAi Gb’Stat disminuyen los niveles de expresión de ciclina E Gb’Stat regula la prolifreación
  • 11. Otras moléculas implicadas • Dachshund y Distal less • Exd y hth • Wnt y Hh Ishimaru et al., 2015
  • 12. Factores epigenéticos • miRNA’s, piwiRNA, RISC, Histonas • Muy poco caracterizado en grillo • El grupo de Tetsuya encontró ncRNA’s pero no hubo mas datos • Primeros avances con histonas en 2015
  • 13. • La formación del blastema puede darse por células troncales (neblasto) o por procesos de transdiferenciación • En planaria por ejemplo se da por células troncales • Su identidad celular esta asociada a la regulación por HMT de la familia SET/MLL • En insectos la formación del blastema transdiferenciación celular • HMT de la familia Polycomb regulan el proceso Reddien et al., 2016 Itzhaki 2014
  • 14. Hamada et al., 2015 • Gryllus Enhancer of zeste Gb’E(z) • Ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat gene on the X chromosome Gb’Utx • H3K27 • La metilación se ve disminuida por Gb’E(z)RNAi • Gb’UtxRNAi incrementa los niveles de mtilación • E(z) y Utx se sobre expresan post amputación Tsetuya et al., 2013 reportan sobreexpresión de estas moléculas ´post amputación
  • 15. • Gb’E(z) en el dominio SET tiene 96% y 95% de homología con Dm’Ez y EZH2 (dos parálogos en humano y ratón) • Gb’Utx JmjC tiene 91% y 83% con Utx y KDM6 (3 parálogos en humano y raton) • Hibridación in situ para determinar los patrones de expresión de Gb’Utx y Gb’E(z)
  • 16. • Uso de RNAi para evaluar efectos fenotípicos • Gb’E(z)RNAi induce la formación de un segmento extra • Gb’UtxRNA induce defectos en la formación de articulaciones del tarso • Gb’E(z) también esta asociado a la formación de segmentos
  • 17.
  • 18. • La regulación de los estados de metilación de la H3K27 es esencial para la regeneración de extremidades

Notas del editor

  1. unica
  2. Factores apoptoticos Metaloproteasas Kisasa El blastema en grillos depende de transdiferenciacion
  3. EGFR: receptor del factor de crecimiento epidérmico UT: unidades transcripcionales Discutible que solo se enfocan en los 11,492 y no en los de expresión única
  4. proliferation, differentiation, apoptosis and oncogenesis
  5. RPKM : reads per kb of exons per million
  6. Le regeneración se va dando por estadios de la ninfa, en el uno de forma el blastema y hasta llegar a estadio 5 se forma la extremidad completa Los efectos son visbles hasta intart 5 5.5 días Clasificación de la severidad Dome : regenera la tibia pero no el tarso Hop :regenera tibia y tarzo minaturizado Stat :
  7. Ciclina E se expresa en face S
  8. SOCS son inhibidores de proliferación celular con interferentes se obsreva un correcto desarrollo e incrementos en los niveles de ciclina E
  9. Dachshund …. Formacion de la tibia y primer tarso Distal lees esencial para la formación de la zona distal …. Asociado al desarrollo de los tarsos , espolones y garra Wnt y hh dorsal- ventral extradenticle (exd) and homothorax (hth), factores de transcripcion para la fomaciondel eje anterior
  10. Regulan Diferenciacion, desdifreenciación y transdiferenciacion
  11. Hasta aquí los mecanismos de regulación génica durante la frormaicon del blastema eran poco claros Grupo de Tsetuya Diemtilaciones inhiben trimetilaciones activan Metiltransfarasa Demetilasa puede trimetilar
  12. Sentido permite observar la transcripción con bajos niveles La antisnetido permite detectar altos niveles de exprecion
  13. Silenciamiento parcial
  14. Patas metatorasicas y también formación de segmento extra Cortes próximo distales para la formación del segmento extra
  15. Dac = dastchun (formación de segmentos en pata) ………….. tibia Egfr = receptor de factor de crecimiento epidermal BarH = gen asocaido al desarrollo de nervios…………………..tarso Dll = distal lees )formación del circulo imaginario …………. Tarso C nivles de exprecion de dac The Gb’Egfr, Gb’BarH and Gb’Dll expression patterns were not altered in the Gb’E(z)RNA