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Universidad Técnica Particular de Loja

Integrantes: Daniela González, Adriana Loaiza,Violeta Tello, Ana Zumba.

  Manifestaciones del gen GRIK2 codificando en el receptor 6 del glutamato en la
  enfermedad de Huntington

  INTRODUCCIÓN
  Escogimoseste tema porque se trata de un trastorno debido a un defecto
  genético que se presenta con síntomas inusuales y desagradables, además de
  tener poca incidencia, tiene tratamientos aún desconocidos sin poseer cura.
  La enfermedad de Huntington constituye un trastorno neurodegenerativoque se
  manifiesta a través de alteraciones neuroanatómicas y neurofisiológicas del
  lenguaje, ya que está causado por la destrucción de una
  subpoblaciónespecífica de neuronas gabérgicasdel núcleo caudado, aunque
  también con el tiempo se suelen ver afectadas igualmenteneuronas
  pertenecientes a otras regiones cerebrales.
  Esta enfermedad se debe a la presencia de una expansiónanormal del triplete
  CAG en la secuencia del gen HTT, que resulta patológica cuando el número de
  repeticionessupera las 34 (Gusella, MacDonald. 2006), y se advierte una
  correlación directa entrela longitud del segmento repetido y la precocidad con
  que se manifiestael trastorno (Djousseet al. 2003). No obstante, dicha
  precocidad tambiénparece depender, aunque en menor medida, de otros
  factores, enparticular, de la presencia de determinados polimorfismos en elgen
  GRIK2, que codifica el receptor 6 del glutamato(Rubinsztein et al. 1997). El gen
  HTT codifica una proteína denominadahuntingtina y se expresa durante el
  desarrollo embrionario en diversasregiones del cerebro, aunque también en
  otros tejidos corporales, si bien el patrón espacial de expresión del gen no
  coinciden     necesariamente      con    las   poblaciones     neuronales    que
  resultanafectadas finalmente por las variantes mutadas de la proteína (Gusella,
  MacDonald.2006).Estas proteínas defectuosas promueven la formación de
  cuerposde inclusión y agregados amiloideos insolubles en el citoplasmay/o en
  el núcleo de las neuronas afectadas (Thakur, Wetzel. 2002) (Bhattacharyya et
  al. 2005).
  Por otra parte,conviene indicar que se siguedesconociendo la función
  fisiológicaprecisa de esta proteína (Cattaneo et al. 2005) , aunquese ha
  sugerido, fundamentalmente apartir del análisis de los dominiosestructurales
  que presenta y de sucapacidad para interaccionar con lasmembranas y con
  otras proteínas celulares,que podría participar en elprocesamiento del ARN
  mensajero,en el transporte de vesículas y en laregulación de la morfología y de
  lalocalización de los orgánulos celulares (Takano , Gusella. 2002).
PREGUNTA DE INVESTIGACIÓN
 ¿Cuáles son las diferencias en las secuencias del gen GRIK2 en la enfermedad
 de Huntignton?.¿Cuáles son los polimorfismos existentes del gen GRIK2 en la
 enfermedad de Huntigton?


 METODOLOGIA
   1. Buscar información sobre el gen GRIK2 en el programa GenBank.
   2. Usar la aplicación Blast del programa GenBank y encontrar las variantes
      del gen a estudiarse.
   3. Descargar el programa ClustalX que nos ayudara a comparar las
      variantes.
   4. Seguidamente poner los pares de bases de la primera isoforma en el
      ClustalX, junto con las otras variantes encontradas para comparar las
      diferencias entre ellos.
   5. Comparar la secuencia normal de genes con las variantes.
   6. Adjuntar los resultados a la teoría ya descrita.


RESULTADOS




 1ra Variante Transcripción: El variante 1 codifica la isoforma. La edición del
 ARN Ile567Val cambios, Tyr571Cys y Gln621Arg.
2da Variante Transcripción: Esta variante (2) contiene un exón adicional en la
región 3 'de codificación, en comparación con la variante transcripción 1. La
isoforma resultante (2) es más corta y tiene un distinto C-terminal en
comparación con isoforma 1. La edición del ARN Ile567Val cambios, Tyr571Cys
y Gln621Arg

3ra Variante Transcripción: Esta variante (3) contiene un exón adicional en la
región 3 'de codificación, en comparación con la variante transcripción 1. La
isoforma resultante (3) es más corta y tiene un distinto C-terminal en
comparación con isoforma 1. La edición del ARN Ile567Val cambios, Tyr571Cys
y Gln621Arg.



BIBLIOGRAFÍA

-   Djousse L, Knowlton B, Hayden M, Almqvist EW, Brinkman R, Ross C, et al. Interaction of normal
    and expanded CAG repeat sizes influences age at onset of Huntington disease. Am J Med Genet
    2003; 119A: 279-82.
-   Rubinsztein DC, Leggo J, Chiano M, Dodge A, Norbury G, Rosser E, et al. Genotypes at the GluR6
    kainate receptor locus are associated with variation in the age of onset of Huntington disease.
    ProcNatlAcadSci U S A 1997; 94: 3872-6.
-   Thakur AK, Wetzel R. Mutational analysis of the structural organization of polyglutamine
    aggregates. ProcNatlAcadSci U S A 2002; 99: 17014-9.
-   Bhattacharyya AM, Thakur AK, Wetzel R. Polyglutamine aggregation nucleation: thermodynamics of
    a highly unfavorable protein folding reaction. ProcNatlAcadSci U S A 2005; 102: 15400-5.
-   Cattaneo E, Zuccato C, Tartari M. Normal huntingtin function: an alternativeapproach to
    Huntington’s disease. Nat Rev Neurosci 2005; 6: 919-30.
-   Takano H, Gusella JF. The predominantly HEAT-like motif structure of huntingtin and its association
    and coincident nuclear entry with dorsal, an NF-kB/Rel/dorsal family transcription factor. BMC
    Neurosci 2002; 3: 15.

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  • 1. Universidad Técnica Particular de Loja Integrantes: Daniela González, Adriana Loaiza,Violeta Tello, Ana Zumba. Manifestaciones del gen GRIK2 codificando en el receptor 6 del glutamato en la enfermedad de Huntington INTRODUCCIÓN Escogimoseste tema porque se trata de un trastorno debido a un defecto genético que se presenta con síntomas inusuales y desagradables, además de tener poca incidencia, tiene tratamientos aún desconocidos sin poseer cura. La enfermedad de Huntington constituye un trastorno neurodegenerativoque se manifiesta a través de alteraciones neuroanatómicas y neurofisiológicas del lenguaje, ya que está causado por la destrucción de una subpoblaciónespecífica de neuronas gabérgicasdel núcleo caudado, aunque también con el tiempo se suelen ver afectadas igualmenteneuronas pertenecientes a otras regiones cerebrales. Esta enfermedad se debe a la presencia de una expansiónanormal del triplete CAG en la secuencia del gen HTT, que resulta patológica cuando el número de repeticionessupera las 34 (Gusella, MacDonald. 2006), y se advierte una correlación directa entrela longitud del segmento repetido y la precocidad con que se manifiestael trastorno (Djousseet al. 2003). No obstante, dicha precocidad tambiénparece depender, aunque en menor medida, de otros factores, enparticular, de la presencia de determinados polimorfismos en elgen GRIK2, que codifica el receptor 6 del glutamato(Rubinsztein et al. 1997). El gen HTT codifica una proteína denominadahuntingtina y se expresa durante el desarrollo embrionario en diversasregiones del cerebro, aunque también en otros tejidos corporales, si bien el patrón espacial de expresión del gen no coinciden necesariamente con las poblaciones neuronales que resultanafectadas finalmente por las variantes mutadas de la proteína (Gusella, MacDonald.2006).Estas proteínas defectuosas promueven la formación de cuerposde inclusión y agregados amiloideos insolubles en el citoplasmay/o en el núcleo de las neuronas afectadas (Thakur, Wetzel. 2002) (Bhattacharyya et al. 2005). Por otra parte,conviene indicar que se siguedesconociendo la función fisiológicaprecisa de esta proteína (Cattaneo et al. 2005) , aunquese ha sugerido, fundamentalmente apartir del análisis de los dominiosestructurales que presenta y de sucapacidad para interaccionar con lasmembranas y con otras proteínas celulares,que podría participar en elprocesamiento del ARN mensajero,en el transporte de vesículas y en laregulación de la morfología y de lalocalización de los orgánulos celulares (Takano , Gusella. 2002).
  • 2. PREGUNTA DE INVESTIGACIÓN ¿Cuáles son las diferencias en las secuencias del gen GRIK2 en la enfermedad de Huntignton?.¿Cuáles son los polimorfismos existentes del gen GRIK2 en la enfermedad de Huntigton? METODOLOGIA 1. Buscar información sobre el gen GRIK2 en el programa GenBank. 2. Usar la aplicación Blast del programa GenBank y encontrar las variantes del gen a estudiarse. 3. Descargar el programa ClustalX que nos ayudara a comparar las variantes. 4. Seguidamente poner los pares de bases de la primera isoforma en el ClustalX, junto con las otras variantes encontradas para comparar las diferencias entre ellos. 5. Comparar la secuencia normal de genes con las variantes. 6. Adjuntar los resultados a la teoría ya descrita. RESULTADOS 1ra Variante Transcripción: El variante 1 codifica la isoforma. La edición del ARN Ile567Val cambios, Tyr571Cys y Gln621Arg.
  • 3. 2da Variante Transcripción: Esta variante (2) contiene un exón adicional en la región 3 'de codificación, en comparación con la variante transcripción 1. La isoforma resultante (2) es más corta y tiene un distinto C-terminal en comparación con isoforma 1. La edición del ARN Ile567Val cambios, Tyr571Cys y Gln621Arg 3ra Variante Transcripción: Esta variante (3) contiene un exón adicional en la región 3 'de codificación, en comparación con la variante transcripción 1. La isoforma resultante (3) es más corta y tiene un distinto C-terminal en comparación con isoforma 1. La edición del ARN Ile567Val cambios, Tyr571Cys y Gln621Arg. BIBLIOGRAFÍA - Djousse L, Knowlton B, Hayden M, Almqvist EW, Brinkman R, Ross C, et al. Interaction of normal and expanded CAG repeat sizes influences age at onset of Huntington disease. Am J Med Genet 2003; 119A: 279-82. - Rubinsztein DC, Leggo J, Chiano M, Dodge A, Norbury G, Rosser E, et al. Genotypes at the GluR6 kainate receptor locus are associated with variation in the age of onset of Huntington disease. ProcNatlAcadSci U S A 1997; 94: 3872-6. - Thakur AK, Wetzel R. Mutational analysis of the structural organization of polyglutamine aggregates. ProcNatlAcadSci U S A 2002; 99: 17014-9. - Bhattacharyya AM, Thakur AK, Wetzel R. Polyglutamine aggregation nucleation: thermodynamics of a highly unfavorable protein folding reaction. ProcNatlAcadSci U S A 2005; 102: 15400-5. - Cattaneo E, Zuccato C, Tartari M. Normal huntingtin function: an alternativeapproach to Huntington’s disease. Nat Rev Neurosci 2005; 6: 919-30. - Takano H, Gusella JF. The predominantly HEAT-like motif structure of huntingtin and its association and coincident nuclear entry with dorsal, an NF-kB/Rel/dorsal family transcription factor. BMC Neurosci 2002; 3: 15.