Para un análisis completo del origen de la quena se plantean dos alternativas.

1. CONTROVERSIA EN EL ORIGEN DE LA QUENA
La quena es el instrumento de viento más antiguo que se conoce,sus
orígenes se remontannada menosque a la Prehistoria,antes incluso de que
el Imperio Inca se formara.Y sabemos esto por las inscripciones encontradas
en restos de cerámicade antiguas culturasdelPerú,como Nazca o Mochica.
Su uso se expandió rápidamente por toda la zona centralde los Andes,donde
se ejecutabapara reverenciar a las divinidades y también para festejarciertos
acontecimientos en pequeñas aldeas,rito que aún hoy día se sigue
practicando.
Es de origen preincaico. Las evidencias más antiguas están en la cerámica
mochica (costa norte del Perú) y Nazca (Costa central del Perú), pues hay
también evidencias de origen nazca, de sicus hechos de cerámica y huesos
de animales y humanos.Originario delTawantinsuyu,su dispersión alcanza a
Peru, Argentina, Ecuador, Colombia, Bolivia y Norte grande de Chile.
La popularidad de su uso "moderno" en conjuntos folclóricos ha opacado su
uso tradicional en las comunidades originarias de los Andes, donde se toca
para festividades específicas y acompañando danzas (por ejemplo la danza
también llamada "Quena-Quena").Sin embargo,este instrumento aún es muy
utilizado en las áreas rurales de Perú y Bolivia. El museo de instrumentos
musicales de La Paz presenta al menos 21 tipos diferentes de quenas
tradicionales.
LA OTRA VERSIÓN
Aunque es originario de España, la quena es un instrumento de viento,
elaborado en madera, que fue creado en un principio para burlarse de los
españoles que habíanllegado al país mofándose de nuestras costumbres.Los
indígenas, para retribuir esa burla, imitaban cualquier sonido con lo que
encontraban; es por eso que la quena es una sátira de la flauta española,
explicó el maestro de música, del colegio La Dolorosa, José Navarro.
El nombre de la quena proviene de un dialecto que utilizaban los indígenas,
que significa flauta de hueso. “La primera quena fue elaborada en un fémur,
haciéndole sus respectivos orificios para poder tocarla”, manifestó Navarro,
quien agregó que al no poseer el instrumento una embocadura fue hecha
totalmente hueca para poder producir un sonido parecido al de la flauta.