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Anabela Plos
Node Manager - GBIF Argentina
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Calafate (Berberis microphylla) Bariloche, P. Zermoglio (CC-BY-SA)
Resumen
Introducción
Historia
Sistema
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Actividades
con GBIF
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¿Qué datos puedo publicar?
• Materiales biológicos depositados en colecciones
• Datos provenientes de iniciativas de Ciencia Ciudadana: Inaturalist,
eBird, otros
• Datos provenientes de publicaciones científicas
• Agregar datos de otras iniciativas: OBIS, Paleobiology Database,
TROPICOS
• Repatriación de datos (de otras colecciones que publican)
¿Qué datos puedo re-usar?
¡Todos!*
* Citando el DOI y de acuerdo a la licencia de uso
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC)
¿Cómo compartir datos de biodiversidad?
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin
(CC-BY-NC)
Estándares utilizados
• Datos: Darwin Core (DwC)
• Metadatos: GBIF Metadata Profile (GMP) basado
en Ecological Metadata Language (EML)
Uso de Licencias Creative Commons
CC0, CC-BY, CC-BY-NC
Generación de Digital Object Identifier (DOI’s)
• Para cada conjunto de datos
• Para cada consulta
Nodo GBIF Argentina - HOY
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC)
Algo de historia…
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin
(CC-BY-NC)
Finales ‘90’s
Reunión en el Museo Argentino de Ciencias Naturales
“Bernardino Rivadavia” - Dr. Edgardo Romero
→ Red Nacional de Colecciones Biológicas (RNCB)
2002
→ Nodo argentino de la Global Biodiversity Information
Facility – GBIF. MACN-MinCyT
2009
→ Creación del Sistema Nacional de Datos Biológicos
SNDB, MinCyT
Nodo GBIF Argentina
El nodo tiene un Jefe de Delegación y un Administrador de Nodo, financiados
por el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
(CONICET). Dicho nodo se aloja físicamente en el Museo Argentino de
Ciencias Naturales “Bernardino Rivadavia” (MACN).
Nodo GBIF Argentina
El SNDB fue concebido como una red, de manera similar a GBIF, donde se
nuclean los datos de las instituciones proveedoras y se publican a través
del portal nacional.
La estructura nacional que colabora con GBIF es el Sistema Nacional de
Datos Biológicos (SNDB) que está alojado en la Secretaría de Ciencia,
Tecnología e Innovación Productiva
Objetivos del SNDB
• Promever el intercambio de datos de biodiversidad;
• Aumentar la accesibilidad, proyección y calidad de datos de
biodiversidad, utilizando redes virtuales;
• Fortalecer el uso de buenas prácticas tanto en la conservación como
en el manejo de las colecciones biológicas;
• Ofrecer tanto herramientas como programas de entrenamiento para
las personas/instituciones/ colecciones interesadas.
Carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris) PN El Palmar, AR.
Constanzamcl (CC-BY-NC)
Evolución del Portal de Datos de Biodiversidad Argentina
907921 907921 911469
1750871
3548
839402
398070
907.921 911.469
1.750.871
2.148.941
200000
485000
770000
1055000
1340000
1625000
1910000
2195000
2480000
2765000
2010-2015 2016 2017 2018
Total registros expuestos en el Portal de Datos
Registros incorporados por año
Registros al año previo
IPT
DATOS
METADATOS
MAPEO
Darwin
Core
Archive
Sistema Nacional de Datos Biológicos
Carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris) PN El Palmar, AR.
Constanzamcl (CC-BY-NC)
• Registro de instituciones y colecciones
• Financiamiento
• Digitalización
• Mejora de colecciones
• Capacitaciones
• Portal Nacional de Biodiversidad
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Carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris) PN El Palmar, AR.
Constanzamcl (CC-BY-NC)
• Registro de instituciones y colecciones
• Financiamiento
• Digitalización
• Mejora de colecciones
• Capacitaciones
• Portal Nacional de Biodiversidad
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC)
Actividades con GBIF
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin
(CC-BY-NC)
Participación:
• Representación Regional (2016-2021)
• 2nd Vice Chair Nodes Committee (2021-hoy)
• Miembro BID Steering Group (2017-hoy)
Otras actividades:
• Mentor, Tutor
• Traductor
• Embajador de datos abiertos
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC)
Actividades con GBIF
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin
(CC-BY-NC)
Premios
• Jóvenes investigadores (2019)
Publicacion data paper
• Vectores con importancia en salud humana
Capacity Enhancement Support Programme
• Participación: 9 proyectos
• Coordinación: 3 proyectos
El plan original
2 workshops
Buenos Aires – Diciembre 2019
38 participantes de 27 instituciones
17 / 24 provinces
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC)
CESP Project 2019-014
Tackling the spatial challenge in the Southern
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• Pre-workshop (virtual): 2 semanas
• Workshop (on-site): 1 semana
• Post-workshop (virtual): 8 semanas
• Cada participante generó entre 100-150
localidades georreferenciadas
Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC)
CESP Project 2019-014
Tackling the spatial challenge in the Southern
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Santiago de Chile – Abril 2020
Virtual : Agosto a Noviembre 2020
39 participantes de 21 institutiones
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• Cada participante generó entre 80-100
localidades georreferenciadas
CESP Project 2019-014
Tackling the spatial challenge in the Southern
Cone through georeferencing training
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Encuesta - 357 respuestas
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Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC)
GBIF desarrolló un catálogo global de
colecciones → actualización de datos de
Argentina
Las instituciones siguen publicando datos,
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Se continúa con la mesa de ayuda para la
publicación desde el MACN-CONICET
Reactivamos la Red Nacional de (Datos) y
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Próximos pasos
Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC)
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ciencia ciudadana que recopilen datos
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Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC)
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• Listados de instituciones y colecciones
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• Listado de iniciativas de CC
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argentina (publicadores de datos)
Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC)
Algo más de información,
invitaciones y presentes…
Una invitación
Otra invitación
Una oportunidad
• + de 5.000 registros de presencia nuevos en GBIF
• con datos y metadatos de alta calidad
• con cobertura de especies/taxones que se encuentran
en el suelo al menos en una etapa de su ciclo de vida
Un presente
Muchas gracias!
Preguntas??
Anabela Plos , Node Manager - GBIF Argentina
plos@macn.gov.ar
https://orcid.org/0000-0003-3877-7408

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  • 1. Argentina y datos primarios de biodiversidad: experiencias luego de 20 años Anabela Plos Node Manager - GBIF Argentina plos@macn.gov.ar https://orcid.org/0000-0003-3877-7408 Calafate (Berberis microphylla) Bariloche, P. Zermoglio (CC-BY-SA)
  • 3. ¿Qué es GBIF? La Infraestructura Mundial de Información en Biodiversidad (GBIF) está destinada a proporcionar a cualquier persona, en cualquier lugar, acceso abierto y gratuito a datos sobre cualquier tipo de forma de vida que hay en la Tierra.
  • 4.
  • 5. Digitalizar refiere a la captura de información en forma electrónica. La unidad básica es el dato de biodiversidad. El resultado de la digitalización se encuentra en una variedad de formatos, como tablas, bases de datos planas o relacionales, mapas, o archivos de SIG. ¿Qué es digitalizar?
  • 6. ¿Qué categorías de datos hay? Presencias (occurrences) Listados (checklist) Datos de monitoreo (event data)
  • 7. ¿Qué datos puedo publicar? • Materiales biológicos depositados en colecciones • Datos provenientes de iniciativas de Ciencia Ciudadana: Inaturalist, eBird, otros • Datos provenientes de publicaciones científicas • Agregar datos de otras iniciativas: OBIS, Paleobiology Database, TROPICOS • Repatriación de datos (de otras colecciones que publican)
  • 8. ¿Qué datos puedo re-usar? ¡Todos!* * Citando el DOI y de acuerdo a la licencia de uso
  • 9. Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) ¿Cómo compartir datos de biodiversidad? Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Estándares utilizados • Datos: Darwin Core (DwC) • Metadatos: GBIF Metadata Profile (GMP) basado en Ecological Metadata Language (EML) Uso de Licencias Creative Commons CC0, CC-BY, CC-BY-NC Generación de Digital Object Identifier (DOI’s) • Para cada conjunto de datos • Para cada consulta
  • 11. Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Algo de historia… Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Finales ‘90’s Reunión en el Museo Argentino de Ciencias Naturales “Bernardino Rivadavia” - Dr. Edgardo Romero → Red Nacional de Colecciones Biológicas (RNCB) 2002 → Nodo argentino de la Global Biodiversity Information Facility – GBIF. MACN-MinCyT 2009 → Creación del Sistema Nacional de Datos Biológicos SNDB, MinCyT
  • 12. Nodo GBIF Argentina El nodo tiene un Jefe de Delegación y un Administrador de Nodo, financiados por el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Dicho nodo se aloja físicamente en el Museo Argentino de Ciencias Naturales “Bernardino Rivadavia” (MACN).
  • 13. Nodo GBIF Argentina El SNDB fue concebido como una red, de manera similar a GBIF, donde se nuclean los datos de las instituciones proveedoras y se publican a través del portal nacional. La estructura nacional que colabora con GBIF es el Sistema Nacional de Datos Biológicos (SNDB) que está alojado en la Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva
  • 14. Objetivos del SNDB • Promever el intercambio de datos de biodiversidad; • Aumentar la accesibilidad, proyección y calidad de datos de biodiversidad, utilizando redes virtuales; • Fortalecer el uso de buenas prácticas tanto en la conservación como en el manejo de las colecciones biológicas; • Ofrecer tanto herramientas como programas de entrenamiento para las personas/instituciones/ colecciones interesadas.
  • 15. Carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris) PN El Palmar, AR. Constanzamcl (CC-BY-NC)
  • 16. Evolución del Portal de Datos de Biodiversidad Argentina 907921 907921 911469 1750871 3548 839402 398070 907.921 911.469 1.750.871 2.148.941 200000 485000 770000 1055000 1340000 1625000 1910000 2195000 2480000 2765000 2010-2015 2016 2017 2018 Total registros expuestos en el Portal de Datos Registros incorporados por año Registros al año previo
  • 18. Sistema Nacional de Datos Biológicos Carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris) PN El Palmar, AR. Constanzamcl (CC-BY-NC) • Registro de instituciones y colecciones • Financiamiento • Digitalización • Mejora de colecciones • Capacitaciones • Portal Nacional de Biodiversidad
  • 19. Sistema Nacional de Datos Biológicos Carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris) PN El Palmar, AR. Constanzamcl (CC-BY-NC) • Registro de instituciones y colecciones • Financiamiento • Digitalización • Mejora de colecciones • Capacitaciones • Portal Nacional de Biodiversidad
  • 20. Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Actividades con GBIF Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Participación: • Representación Regional (2016-2021) • 2nd Vice Chair Nodes Committee (2021-hoy) • Miembro BID Steering Group (2017-hoy) Otras actividades: • Mentor, Tutor • Traductor • Embajador de datos abiertos
  • 21. Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Actividades con GBIF Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) Premios • Jóvenes investigadores (2019) Publicacion data paper • Vectores con importancia en salud humana Capacity Enhancement Support Programme • Participación: 9 proyectos • Coordinación: 3 proyectos
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  • 29. El plan original 2 workshops Buenos Aires – Diciembre 2019 38 participantes de 27 instituciones 17 / 24 provinces Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) CESP Project 2019-014 Tackling the spatial challenge in the Southern Cone through georeferencing training
  • 30. • Pre-workshop (virtual): 2 semanas • Workshop (on-site): 1 semana • Post-workshop (virtual): 8 semanas • Cada participante generó entre 100-150 localidades georreferenciadas Palomita (Codonorchis lessonii) Ushuaia, AR. Gomzin (CC-BY-NC) CESP Project 2019-014 Tackling the spatial challenge in the Southern Cone through georeferencing training
  • 31. Santiago de Chile – Abril 2020 Virtual : Agosto a Noviembre 2020 39 participantes de 21 institutiones 9 / 16 regiones • Cada participante generó entre 80-100 localidades georreferenciadas CESP Project 2019-014 Tackling the spatial challenge in the Southern Cone through georeferencing training
  • 32. Abiertos a toda la comunidad (+1,000 registros) Encuesta - 357 respuestas Optional → certificado (casi 100 certificados) ¿Cómo alcanzar a más personas?
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  • 37. Próximos pasos Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC) GBIF desarrolló un catálogo global de colecciones → actualización de datos de Argentina Las instituciones siguen publicando datos, sin ayuda económica de parte del MinCyT Se continúa con la mesa de ayuda para la publicación desde el MACN-CONICET Reactivamos la Red Nacional de (Datos) y Colecciones Biológicas
  • 38. Próximos pasos Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC) Apoyo, desde el nodo, a las iniciativas de ciencia ciudadana que recopilen datos biológicos. Migración a repositorios institucionales de los conjuntos de datos disponibles en GBIF (DwCA + Readme + campos de metadatos) Reforzar las relaciones con las dependencias que se encarguen de la Estrategia Nacional de Biodiversidad (Ambiente, Cancillería, MinCyT)
  • 39. Próximos pasos Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC) Próximo lanzamiento de un portal hosteado por GBIF, para nuclear: • Registros de y sobre Argentina • Listados de instituciones y colecciones (GrSciColl) • Listado de iniciativas de CC • Noticias relevantes para la comunidad argentina (publicadores de datos)
  • 40. Mara (Dolichotis patagonicus) Utracán, AR. G.M. Alonso (CC-BY-NC) Algo más de información, invitaciones y presentes…
  • 43. Una oportunidad • + de 5.000 registros de presencia nuevos en GBIF • con datos y metadatos de alta calidad • con cobertura de especies/taxones que se encuentran en el suelo al menos en una etapa de su ciclo de vida
  • 45. Muchas gracias! Preguntas?? Anabela Plos , Node Manager - GBIF Argentina plos@macn.gov.ar https://orcid.org/0000-0003-3877-7408