El gen ATP4A codifica la subunidad alfa de la bomba de protones y potasio ATPasa, una proteína de membrana que intercambia iones H+ y K+ a través de la membrana celular utilizando energía de ATP. La ATPasa gástrica es una heterodímero compuesto por la subunidad alfa codificada por el gen ATP4A y una subunidad beta, responsable de la secreción de ácido gástrico.