El documento describe el Banco de Imágenes Médicas de la Comunidad Valenciana (BIMCV), un repositorio de imágenes médicas y registros clínicos anonimizados de los hospitales de la región de Valencia. BIMCV almacena datos de 5 millones de habitantes, incluyendo 5,3 millones de casos anuales de 210 técnicas de imagen diferentes. El repositorio se gestiona desde la Conselleria de Sanitat y proporciona acceso a los datos para la investigación y estudios poblacionales de imagen. BIMCV utiliza la

1. BIMCV - Medical Imaging Data Bank -
Population Imaging Node Valencia
IMAGING INFORMATICS FOR DATA SHARING
María de la Iglesia-Vayá
Unidad Mixta FISABIO – CIPF
delaiglesia_mar@gva.es ; miglesia@cipf.es

9. • El Banco digital de Imagen Médica de la Comunidad Valenciana (BIMCV) es un banco
de imágenes concebido como un repositorio de conocimiento orientado a favorecer
los avances tecnológicos en imagen médica y proporcionar servicios de cobertura
tecnológica para el soporte a proyectos I+D.
• BIMCV, gestionado desde la Conselleria de Sanitat, desarrolla y da acceso a una gran
base de datos anonimizada de imágenes y registros clínicos asociados. Este
repositorio Big Data cuenta con datos de los hospitales de la región de Valencia (5
millones de habitantes viviendo en un área de 23.255 Km2, con un promedio de 5,3
millones de casos por año procedentes de 210 técnicas de imágenes diferentes) y
cuyo acceso supone un gran avance para la investigación y los estudios de imagen
poblacional.

11. 1. Patient scheduled at Radiology Information System (RIS)
2. Patient exam request sent to “modality” (escanner) using HL7
3. Images obtained at modality
4. Modality constructs image in DICOM format
5. Modality transmits DICOM images to PACS using DICOM network
protocol
6. PACS stores images
7. Image transmitted to workstations using DICOM network protocol
8. Derived images/reports sent to PACS from workstations
9. Radiologist interpretations stored in RIS
THE IMAGING WORKFLOW

14. ANONIMIZACIÓN

15. ALMACENAMIENTO EN BIMCV

16. DATA INGESTA EN CLUSTER OpenMind.10k.cipf.es

17. PATRONES E INTELIGENCIA

18. Medical Imaging Data Structure (MIDS)

19. Medical Imaging Data Structure (MIDS)
MIDS se quiere establecer como un
estándar de almacenamiento de
imagenes médicas.
La idea viene dada por un estándar
denominado Brain Imaging Data
Structure. Este estándar se encuentra
limitado a estudios de cerebro en
Resonancia Magnética.
MIDS pretende extender esta estructura
a otras partes anatómicas y a otros tipos
de modalidades (PET, ecografía, TC, etc.)
https://github.com/BIMCV-CSUSP/MIDS

20. GENESIS

21. Cluster Big Data (Hadoop)
10k.Openmind.cipf.es
Data Warehouse
Alumbra
Hospitales, CMBD, XNAT

22. Data Analytics
Data Curation
+ …
HADOOP CLUSTER OPENMIND-10k
Web Application
Data Consumtion
Storage / Processing
Data Adquisition
Source Data
Data Provisioning

23. BRAIN-GIS
● Representación gráfica
de los datos a través de
la web
● Representación
interactiva que nos
permite filtrar en
función de distintos
parámetros
● Posibilidad de mostrar
datos estadísticos de las
distintas regiones
utilizando un mapa
coroplético
REPRESENTACIÓN DE DATOS
volBrain
freesurfer

24. INFRAESTRUCTURA DISPONIBLE
Cluster: 10k.Openmind.cipf.es

25. INFRAESTRUCTURA DISPONIBLE

26. USES CASES

27. Share your Brain (SyB) parte del Human Brain Project
Cluster: 10k.Openmind.cipf.es
https://www.humanbrainproject.eu/en/medicine/medical-informatics-platform/overview/

28. Share your Brain (SyB) parte del Human Brain Project
https://www.youtube.com/watch?v=2jMbEIcwKnA

29. Colaboraciones en BIG DATA

30. Colaboraciones en BIG DATA
Aurelia Bustos, Antonio Pertusa, Jose María Salinas, Maria de la Iglesia
1University of Alicante, 2Hospital San Juan de Alicante,
3Centre of Excellence in Biomedical Image – Valencia Regional Ministry of Health