Este documento describe los diferentes métodos para clasificar bacterias, incluyendo clasificación fenotípica basada en características macroscópicas y microscópicas, pruebas bioquímicas, serotipado y sensibilidad a antibióticos. También cubre clasificación analítica basada en análisis de lípidos, proteínas y enzimas celulares. Finalmente, señala que la clasificación genotípica a través del análisis de secuencias de ADN es el método más preciso para clasificar bacterias
Métodos y estrategias de secuenciamiento de alto rendimiento. AplicacionesBiocientificaSA
Presentación: "Métodos y estrategias de secuenciamiento de alto rendimiento. Aplicaciones" en el Curso Básico y Taller de PCR en Tiempo Real. HIGA Rossi La Plata, 22 y 23 de Noviembre, 2012. Organiza: Laboratorio de Virología y Biología Molecular H.I.G.A. R. Rossi - La Plata. Auspicia: Servicio de Docencia e Investigación - HIGA Rossi La Plata y Comunidad Vita - Biocientífica S.A.
La extracción del ADN constituye el primer y fundamental paso para cualquier tipo de estudio o propósito científico en el campo de la Biología Molecular, por lo que es de vital importancia tener una muestra de ADN de buena calidad. Para obtener un ADN de buena calidad, frecuentemente se requiere tener conocimiento de un buen método de aislamiento. En este estudio se realizó el método fenol cloroformo
Phenol:Chloroform:Isoamyl Alcohol(25:24:1) de SIGMA Labs., basado en el método de fenol-cloroformo, que se fundamenta en el uso de solventes orgánicos que por diferencia de densidades y por su capacidad para degradar proteínas permite la purificación de aislamiento de ADN
Las características de un organismo están especificadas en su información genética, la cual se establece como una secuencia de ácidos nucleicos, donde la suma total de esta secuencia es lo que conforma su genoma
Métodos y estrategias de secuenciamiento de alto rendimiento. AplicacionesBiocientificaSA
Presentación: "Métodos y estrategias de secuenciamiento de alto rendimiento. Aplicaciones" en el Curso Básico y Taller de PCR en Tiempo Real. HIGA Rossi La Plata, 22 y 23 de Noviembre, 2012. Organiza: Laboratorio de Virología y Biología Molecular H.I.G.A. R. Rossi - La Plata. Auspicia: Servicio de Docencia e Investigación - HIGA Rossi La Plata y Comunidad Vita - Biocientífica S.A.
La extracción del ADN constituye el primer y fundamental paso para cualquier tipo de estudio o propósito científico en el campo de la Biología Molecular, por lo que es de vital importancia tener una muestra de ADN de buena calidad. Para obtener un ADN de buena calidad, frecuentemente se requiere tener conocimiento de un buen método de aislamiento. En este estudio se realizó el método fenol cloroformo
Phenol:Chloroform:Isoamyl Alcohol(25:24:1) de SIGMA Labs., basado en el método de fenol-cloroformo, que se fundamenta en el uso de solventes orgánicos que por diferencia de densidades y por su capacidad para degradar proteínas permite la purificación de aislamiento de ADN
Las características de un organismo están especificadas en su información genética, la cual se establece como una secuencia de ácidos nucleicos, donde la suma total de esta secuencia es lo que conforma su genoma
3. CLASIFICACION FENOTIPICA
Marcadores bioquímicos (biotipado)
Capacidad de fermentar hidratos de carbono especificos
Presencia de proteasas, lipasas o nucleasas especificas
Subdivision de los grupos mas allá de la especie
Fines epidemiológicos
Determinacion del biotipo
Microbiologia medica, 5ta edición, Patríck R. Murray, PhD, Madrid, España
4. CLASIFICACION FENOTIPICA
Serotipado Tecnica donde se utilizan los anticuerpos que poseen las bacterias
Util en casos donde los microorganismos son inertes frente a las
pruebas bioquímicas o cuyo cultivo es difícil, son asociados a
síndromes específicos o se deben identificar de forma rápida
(francisella, treponema pallidum, serotipo 1057 de e. coli, s. pyogenes).
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5. CLASIFICACION FENOTIPICA
Patrones de sensibilidad
frente a distintos
antibióticos
Lisotipado (suceptibilidad
a determinados virus que
infectan a las bacterias)
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6. CLASIFICACION ANALÍTICA
Patron cromatográfico de los acidos micoliticos de la pared
celular
Analisis de lípidos en la totalidad de la celula
A nivel subespecie y con fines epidemiológicos análisis de
proteínas celulares (espectroscopia de masas: análisis
proteómico) y las enzimas celulares (electroforesis enzimática
tipo multiloci)
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7. CLASIFICACION GENOTIPICA
Metodo mas preciso de clasificación de las bacterias
Inicialmente Relacion guanina/citosina
Hibridacion del adn (herramienta en microorganismos de crecimiento lento como micobacterias y hongos)
Analisis de secuencias de acidos nucleicos (ampliación del método de hibridación: localizan secuencias especificas y caracteristicas en los acidos
nucleicos)
Analisis de plasmidos, ribotipado y análisis de fragmento del adn cromosomico
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