La Reserva Ecológica Manglares Churute alberga una gran diversidad de fauna vertebrada, incluyendo monos aulladores, nutrias, gavilanes y más de 250 especies de aves. Se aplicó una encuesta a visitantes y residentes para identificar la fauna, reconociendo senderos como El Mate y la laguna de canclones. El canclon, ave simbólica de la reserva, fue una de las especies más representadas junto con monos y otras aves y mamíferos.