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Conceptos Básicos de
Genética
CONCEPTOS Y DEFINICIONES
Gen Cariotipo
(Cariograma)
Cromosoma (homólogos y no
homólogos)
Locus (Loci) Ploidía. Diploide, triploide…
Poliploide
Alelo Genotipo Haploide-diploide-triploide
ADN Fenotipo Cromosomas autosómicos -
sexuales
Gen Homocigótico-
heterocigótico
Genoma Entrecruzamiento
Genes ligados Fenotipo dominante,
recesivo,
codominante
TIPOS DE GENOMAS
• Organismos acelulares: Virus (ADN y ARN).
• Organismos procariotas: Cromosomas bacterianos
y ADN plasmidial (Bacterias y algunas algas).
• Organismos eucariotas: Genoma nuclear
(Cromosomas) y Genoma de orgánulos (Mitocondrias
y Cloroplastos).
El genoma es la totalidad de la información genética que posee un
organismo en particular.
El término fue acuñado por Hans Winkler, profesor de Botánica en la
Universidad de Hamburgo como un acrónimo de las palabras gene y
chromosoma.
ADN
Estructura del
ADN en
doble hélice Histonas
(proteínas de soporte)
Cromosomas nucleares
ADN Cloroplástico
ADN Mitocondrial
Genoma
Bases nitrogenadas (nucleótidos)
Bases complementarias (A=T, G=C)
..AGCTTTAGCCGTTATTAGCCGCAATGCCGCTAAGCC
..TCGAAATCGGCAATAATCGGCGTTACGGCGATTCGG
5’ 3’
3’ 5’
Secuencia de nucleótidos
La secuenciación es la determinación del orden preciso en que
se encuentran los nucleótidos (Adenina, Timina, Citosina o
Guanina) en un trozo de ADN dado.
Medidas del tamaño del genoma
• Pares de bases o pares de nucleótidos. Mide la longitud del
ADN.
1, 10pb. 1000pb= 1Kpb. 106pb = 1Mpb
• El contenido de ADN de un juego de cromosomas haploide
recibe el nombre de VALOR C (C-Value). Pico gramos. 1 pg
= 10-12 g
• 1 pg de ADN = 978 Mpb = 109 pb = 1000 millones pb
• Ejemplo: Genoma humano: 3.203 × 109 pb
GENOMAS VIRALES
• Los virus (acelulares) están
formados por una cubierta
proteica y un núcleo central que
contiene el genoma.
• Pueden estar constituidos por
ADN (cadena sencilla o doble) o
ARN (doble o sencilla).Tanto
circular como lineal.
• Tamaños muy variables. Aprox.
50.000 pb (50 Kb).
GENOMA BACTERIANO
• Se encuentra en un único
cromosoma. Es una molécula de ADN
doble hélice y circular.
• Tamaños variables:
• Mycoplasma genitalium: 580 Kb.
Burkhorderia xenovorans: 9703 Kb
Escherichia coli: 3200 Kb
• Cada célula procariota puede contener
más de una copia del genoma circular.
Virus Pb Nº genes
Hepatitis D virus 1.700 2
Hepatitis B virus 3.200 4
HIV-1 9.200 9
Bacteriophage λ 48.500 92
EL ADN MITOCONDRIAL
• Esta representado por 1-10
copias por orgánulo.
• Forma circular, doble cadena y
superenrollado.
• No está empaquetado en
nucleosomas.
• Su longitud varía entre 15-17
Kb. (16.559-16.570 pb).
• Codifican entre 13-20 proteínas,
22 tRNA y 2 rRNA.
EL ADN MITOCONDRIAL
• Las secuencias son únicas, no se repiten y no disponen de intrones o
espaciadores.
• Se hereda maternalmente (con algunas excepciones).
• No presenta recombinación (con excepciones). Significa que el ADNmt se
presenta como un único haplotipo que se transmite de madres a hijos.
• Ello implica que los únicos cambios que haya podido haber en el ADN
mitocondrial se deben exclusivamente a mutaciones a lo largo de multitud de
generaciones. Esto lo hace ideal para el estudio de locus que suministren
información para estudios de ecología molecular, e.g. trazar poblaciones.
• Tiene una elevada tasa de mutación (5-10 veces superior al nuclear). La tasa
de sustituciones en mamíferos se ha calculado en 5,7 x 10-8 por sitio y por año.
Ineficiencia en la reparación de errores en la replicación. La Región control
(800-1.200 pb) es la zona más variable.
ADN CLOROPLÁSTICO
• Es mucho mas grande que el
mitocondrial, entre 120-220 Kb
(media: 150).
• Mayor número de copias por
orgánulo. Son circulares.
• Tasas de variación son 3 veces
mayor que en mtDNA en plantas
superiores pero 4-5 veces menor
que el ADN nuclear. Afecta a la
resolución de los marcadores
moleculares
• Se heredan maternalmente
(angiospermas).
• En Nicotiana tabacum: 113 genes:
21 proteínas ribosomas, 4 rRNA,
30 tRNA, 29 genes de fotosíntesis.
• Difieren entre los diferentes
grupos de algas.
GENOMA NUCLEAR EUCARIOTICO
• ADN + Histonas = Cromosoma.
• Localizados en el núcleo.
• Variación en número, forma y
tamaño.
• Desde 2 cromosomas (N=1)
(Myrmecia pilosula, hormiga) hasta
1.600 en Aulacantha (protozoa).
En el ser humano: 46 (23 parejas)
• En cada cromosoma hay una
molécula de ADN.
• En cada cromosoma hay un
número variable de genes.
Myrmecia pilosula
Aulacantha
Empaquetamiento del ADN
para formar cromosomas
De forma lineal la longitud
del ADN humano sería 2 m
Nº aprox. de células en el
cuerpo humano (2 x 1012)
100.000 vueltas a La Tierra
4 billones de metros
La secuencia completa de
una célula humana
ocuparía
Una célula haploide humana posee aproximadamente 3,65 picogramos
de ADN, lo cual equivale a unos 3.200 millones de pares de bases.
Esto representa una razón de
compactación de aproximadamente 10.000 a 1.
Nº PARES DE BASES EN DIFERENTES
MOLÉCULAS DE ADN
Cariotipo y cariograma
Cariotipo es el patrón cromosómico de una
especie expresado a través de un código,
establecido por convenio, que describe las
características de sus cromosomas.
Cariograma, es un esquema, foto o dibujo de los
cromosomas de una célula metafásica ordenados de
acuerdo a su morfología y tamaño. Están
caracterizados y representan a todos los individuos
de una especie.
Todos los humanos tienen el “x”…”XX”=hembra;
“XY”=macho
Cariotipo Cariograma
EL PROYECTO GENOMA HUMANO
1.020 BASES
3.200 MILLONES!!
EL PROYECTO GENOMA HUMANO (PGH)
• Se inició en el año 1990, con una previsión
de 15 años.
• Proyecto coordinado que pretendía
identificar y cartografiar los genes del
genoma humano desde un punto de vista
físico (secuenciación) y funcional (qué
codifica cada gen).
• El primer borrador se presentó el 26 de
junio de 2000), finalmente el genoma
completo fue presentado en abril del 2003,
dos años antes de lo esperado. Incompleto.
• El PGH fue declarado como Patrimonio de la
Humanidad por la UNESCO.
primera presentación
impresa del genoma
humano
OBJETIVOS DEL PGH
• Hacer una serie de mapas o diagramas descriptivos de
cada cromosoma humano con resoluciones cada vez
más finas.
• Encontrar y describir el orden y localización de los
genes u otros marcadores, el espaciamiento entre ellos
en cada cromosoma y desarrollar herramientas para el
uso de esta información en el estudio de la biología
humana y de la medicina.
• Buscar la secuencia de todos los genes y determinar
su actividad o función en el desarrollo de la variedad
de células especializadas diferentes, como las de los
músculos, cerebro, corazón, ojos, piel, sangre y tejidos
que componen a un ser humano.
• Adquirir conocimientos sobre los factores
medioambientales y genéticos presentes en la
predisposición y la resistencia a la enfermedad, la
denominada epidemiología genética.
• Brindar una base de datos donde el hombre pueda
cotejar su información y determinar su estado genético
(éste es muy controvertido debido a la discriminación
genética).
¿Cuántos genes tiene el ser humano?
BASE DE DATOS DEL GENOMA HUMANO
• En la actualidad funcionan principalmente dos tipos de bases de
datos genómicos:
• El Consorcio Internacional de Bases de Datos de Secuencias está
formado por GenBank, el Banco de datos de ADN de Japón (DDBJ) y
el del EMBL.
• Alberga los datos de secuencias. Las tres bases comparten y
complementan la información.
• En España existe un nodo de EMBL residente en el Centro Nacional
de Biotecnología (CNB) de Madrid.
¿Qué hemos descubierto respecto al genoma
humano?
PROPIEDADES DEL GENOMA HUMANO
• El genoma humano está constituido por 3.272.480.987 pb.
• Constituido por 20.000-25.000 genes codificantes de proteínas. Proyecto
ENCODE: 22.286 genes.
• Los genes estructurales (codifican para proteínas o RNA) constituyen menos
del 2% del total de ADN.
• Distribuido entre los cromosomas; varía entre 50 (Cromosoma Y) y 240
millones de pb (I y II) y entre 50 y 2.500 genes por cromosoma.
• Los cromosomas más densos (con más genes codificadores de proteínas)
son el 17, 19 y el 22. Los cromosomas X, Y, 4, 18 y 13 son los más áridos.
CROMOSOMAS Y ENFERMEDADES
http://www.iqb.es/diccio/c/cromosomas.htm
locus Enfermedad
1p Susceptibilidad a la anorexia nerviosa
1p Enfermedad de Parkinson
1p Susceptibilidad a la psoriasis
1p Coreoatetosis paroxística con ataxia episódica
1p13 Reflujo vesicouretral
1p21
Anemia hemolítica por deficiencia de piruvato
kinasa de los eritrocitos
1p21 Carcinoma del tiroides con neoplasia papilar renal
1p21 Dermatitis atópica
1p22 Dihidropirimidinuria
1p24 Sordera
1p11 Meningioma inducido por radiación
1p31 Enfermedad arterial oclusiva
1p31 Susceptibilidad a las enfermedades autoinmunes
1p32 Leucemia linfocítica aguda de células T
1p32 Lipofuscinosis ceroide
1p34 Fucosidosis
1p34 Síndrome de Van der Woude
1p36 Ataxia cerebrospinal
1p36 Enfermedad inflamatoria intestinal
1p36.1 Exóstosis múltiple familiar
1pter-p36.13 Cataratas congénitas, tipo Volkmann
Genesproteinas
2%
Intrones
26%
LINE (elementos
nucleareslargos)
20%
SINE (elementos
nuclearescortos)
13%
Transposones
3%
(LTR) Repeticiones
terminales largas
8%
Duplicaciones
segmentos
5%
Repeticionessecuencias
simples
3%
Secuenciasúnicas, varias
12%
Heterocromatina y ADN
diverso
8%
Tipos de secuencias en el ADN humano
OTROS GENOMAS SECUENCIADOS
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse/
Bases de datos de ADN
• En plantas. Jardín Botánico de Kew (Londres).
• http://data.kew.org/cvalues
• Y de animales
• http://www.genomesize.com/
• Ostreococcus tauri
• Octodon degus
• Género Porphyra
• Género Gracilaria
• Mamíferos marinos
• Reptiles marinos
• Clasificación taxonómica
¿Quién es?
• ¿Cuántos juegos
cromosómicos dispone?
• ¿Cuál es el tamaño de su
genoma?
• ¿Cuántos genes se han
descrito?
• ¿Qué otras características
puedes señalar?
¿Existe alguna relación entre la complejidad de un
organismo y su tamaño de ADN?
CANTIDADES Y RELACIONES GENÓMICAS
Cantidad de ADN
(Nº pares de bases)
Nº de Cromosomas Nº de genes
Organismo 2N
Humanos 46
Canguro 12
Maiz 20
Mosquito 6
Ratón 40
Myrmecia (Hormiga) 2
Aulacantha (Protozoo) 1600
Perro 78
Burro 62
Ballena azul 44
Delfín mular 44
Mango 40
Pollo 78
Coyote 78
Agrodiaetus (Mariposa) 268
LA CONSTANCIA DE LA CANTIDAD DE ADN
• La cantidad de ADN (por juego de
cromosomas) dentro de un organismo es
constante. ADN células estómago = ADN
células hígado. Lo que existe es
Expresión diferencial.
• El contenido (cantidad) de ADN de un
juego de cromosomas es, por lo general,
invariable entre los miembros de una
misma especie
– ADN Paky = ADN Paco.
• Todos los individuos de la misma especie,
en general, tienen los mismos genes,
con distinta expresión, claro está.
Todos los individuos de la misma especie
tienen (en general) la misma cantidad de
ADN
Todos los individuos de la misma especie
tienen los mismos genes
Todas las células de un mismo individuo
dispone de los mismos genes y la misma
secuencia de nucleótidos
La paradoja del valor C
• Se refiere a una aparente paradoja que existe al no
observarse una relación directa entre el contenido de
material genético y la complejidad evolutiva de las especies.
• Los organismos más complejos no tienen necesariamente
genomas más grandes que los organismos más simples.
• Algunas especies relacionadas exhiben contenidos de ADN
divergentes. Especies con el mismo nivel de complejidad
morfológica, poseen genomas con contenidos de ADN
diferentes en órdenes de magnitud.
Tamaños de los genomas en diferentes grupos de organismos
Paradoja del valor de C por grupos (genomebiology.com)
Algunos datos de Genome size
Nº especies
4972 (3231 Vertebrados,
1741 No Vertebrados)
Genoma animal
más pequeño
0.02pg, Pratylenchus coffeae,
(parásito de plantas, nematodo)
Genoma animal
más grande
132.83pg, Protopterus
aethiopicus, (Marbled lungfish)
Protopterus aethiopicus
Pratylenchus coffeae
20.000
¿Mayor número de cromosomas =
Mas cantidad de ADN?
¿Mayor número de cromosomas =
mayor complejidad del organismo?
¿Mayor número de cromosomas =
mayor número de genes?
¿Mayor número de genes = Mayor
complejidad del organismo/especie?
¿Todos los individuos de la misma especie
tienen los mismos cromosomas?
¿Todos los individuos de la misma especie
tienen los mismos genes?
¿Todos los individuos de la misma especie
tienen las mismas secuencias de
nucleótidos?
¿Mas cantidad de ADN = mayor
número de genes?
¿Todas las células (excepto los gametos) de
un mismo individuo dispone de los mismos
genes?
INTRA-INDIVIDUO
INTRA-ESPECIFICO
INTER-INDIVIDUO
INTER-ESPECIFICO
1a
¿Todas las células (excepto los gametos) de
un mismo individuo dispone de la misma
secuencia de nucleótidos?
1b
2a
2b
2c
3a
3b
3c
3d
3e
RAZONES DE LA PARADOJA DEL VALOR C
• La mayoría del ADN no codifica para proteínas. Existe gran
cantidad de ADN repetido. Su origen y función aún es un
problema sin resolver. Función en la regulación.
• El tamaño del genoma no es proporcional al número de
genes.
• El tamaño del genoma solo es proporcional a la cantidad de
ADN de un organismo.
¿Mayor número de cromosomas =
Mas cantidad de ADN?
Razón: Diferente forma de
empaquetamiento
3c

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2.-genética-generalidades.pdf

  • 2. CONCEPTOS Y DEFINICIONES Gen Cariotipo (Cariograma) Cromosoma (homólogos y no homólogos) Locus (Loci) Ploidía. Diploide, triploide… Poliploide Alelo Genotipo Haploide-diploide-triploide ADN Fenotipo Cromosomas autosómicos - sexuales Gen Homocigótico- heterocigótico Genoma Entrecruzamiento Genes ligados Fenotipo dominante, recesivo, codominante
  • 3. TIPOS DE GENOMAS • Organismos acelulares: Virus (ADN y ARN). • Organismos procariotas: Cromosomas bacterianos y ADN plasmidial (Bacterias y algunas algas). • Organismos eucariotas: Genoma nuclear (Cromosomas) y Genoma de orgánulos (Mitocondrias y Cloroplastos). El genoma es la totalidad de la información genética que posee un organismo en particular. El término fue acuñado por Hans Winkler, profesor de Botánica en la Universidad de Hamburgo como un acrónimo de las palabras gene y chromosoma.
  • 4. ADN Estructura del ADN en doble hélice Histonas (proteínas de soporte) Cromosomas nucleares ADN Cloroplástico ADN Mitocondrial Genoma Bases nitrogenadas (nucleótidos) Bases complementarias (A=T, G=C)
  • 5. ..AGCTTTAGCCGTTATTAGCCGCAATGCCGCTAAGCC ..TCGAAATCGGCAATAATCGGCGTTACGGCGATTCGG 5’ 3’ 3’ 5’ Secuencia de nucleótidos La secuenciación es la determinación del orden preciso en que se encuentran los nucleótidos (Adenina, Timina, Citosina o Guanina) en un trozo de ADN dado.
  • 6. Medidas del tamaño del genoma • Pares de bases o pares de nucleótidos. Mide la longitud del ADN. 1, 10pb. 1000pb= 1Kpb. 106pb = 1Mpb • El contenido de ADN de un juego de cromosomas haploide recibe el nombre de VALOR C (C-Value). Pico gramos. 1 pg = 10-12 g • 1 pg de ADN = 978 Mpb = 109 pb = 1000 millones pb • Ejemplo: Genoma humano: 3.203 × 109 pb
  • 7. GENOMAS VIRALES • Los virus (acelulares) están formados por una cubierta proteica y un núcleo central que contiene el genoma. • Pueden estar constituidos por ADN (cadena sencilla o doble) o ARN (doble o sencilla).Tanto circular como lineal. • Tamaños muy variables. Aprox. 50.000 pb (50 Kb). GENOMA BACTERIANO • Se encuentra en un único cromosoma. Es una molécula de ADN doble hélice y circular. • Tamaños variables: • Mycoplasma genitalium: 580 Kb. Burkhorderia xenovorans: 9703 Kb Escherichia coli: 3200 Kb • Cada célula procariota puede contener más de una copia del genoma circular. Virus Pb Nº genes Hepatitis D virus 1.700 2 Hepatitis B virus 3.200 4 HIV-1 9.200 9 Bacteriophage λ 48.500 92
  • 8.
  • 9. EL ADN MITOCONDRIAL • Esta representado por 1-10 copias por orgánulo. • Forma circular, doble cadena y superenrollado. • No está empaquetado en nucleosomas. • Su longitud varía entre 15-17 Kb. (16.559-16.570 pb). • Codifican entre 13-20 proteínas, 22 tRNA y 2 rRNA.
  • 10. EL ADN MITOCONDRIAL • Las secuencias son únicas, no se repiten y no disponen de intrones o espaciadores. • Se hereda maternalmente (con algunas excepciones). • No presenta recombinación (con excepciones). Significa que el ADNmt se presenta como un único haplotipo que se transmite de madres a hijos. • Ello implica que los únicos cambios que haya podido haber en el ADN mitocondrial se deben exclusivamente a mutaciones a lo largo de multitud de generaciones. Esto lo hace ideal para el estudio de locus que suministren información para estudios de ecología molecular, e.g. trazar poblaciones. • Tiene una elevada tasa de mutación (5-10 veces superior al nuclear). La tasa de sustituciones en mamíferos se ha calculado en 5,7 x 10-8 por sitio y por año. Ineficiencia en la reparación de errores en la replicación. La Región control (800-1.200 pb) es la zona más variable.
  • 11. ADN CLOROPLÁSTICO • Es mucho mas grande que el mitocondrial, entre 120-220 Kb (media: 150). • Mayor número de copias por orgánulo. Son circulares. • Tasas de variación son 3 veces mayor que en mtDNA en plantas superiores pero 4-5 veces menor que el ADN nuclear. Afecta a la resolución de los marcadores moleculares • Se heredan maternalmente (angiospermas). • En Nicotiana tabacum: 113 genes: 21 proteínas ribosomas, 4 rRNA, 30 tRNA, 29 genes de fotosíntesis. • Difieren entre los diferentes grupos de algas.
  • 12. GENOMA NUCLEAR EUCARIOTICO • ADN + Histonas = Cromosoma. • Localizados en el núcleo. • Variación en número, forma y tamaño. • Desde 2 cromosomas (N=1) (Myrmecia pilosula, hormiga) hasta 1.600 en Aulacantha (protozoa). En el ser humano: 46 (23 parejas) • En cada cromosoma hay una molécula de ADN. • En cada cromosoma hay un número variable de genes. Myrmecia pilosula Aulacantha
  • 13. Empaquetamiento del ADN para formar cromosomas
  • 14. De forma lineal la longitud del ADN humano sería 2 m Nº aprox. de células en el cuerpo humano (2 x 1012) 100.000 vueltas a La Tierra 4 billones de metros La secuencia completa de una célula humana ocuparía Una célula haploide humana posee aproximadamente 3,65 picogramos de ADN, lo cual equivale a unos 3.200 millones de pares de bases. Esto representa una razón de compactación de aproximadamente 10.000 a 1.
  • 15.
  • 16. Nº PARES DE BASES EN DIFERENTES MOLÉCULAS DE ADN
  • 17. Cariotipo y cariograma Cariotipo es el patrón cromosómico de una especie expresado a través de un código, establecido por convenio, que describe las características de sus cromosomas. Cariograma, es un esquema, foto o dibujo de los cromosomas de una célula metafásica ordenados de acuerdo a su morfología y tamaño. Están caracterizados y representan a todos los individuos de una especie. Todos los humanos tienen el “x”…”XX”=hembra; “XY”=macho
  • 19.
  • 22. EL PROYECTO GENOMA HUMANO (PGH) • Se inició en el año 1990, con una previsión de 15 años. • Proyecto coordinado que pretendía identificar y cartografiar los genes del genoma humano desde un punto de vista físico (secuenciación) y funcional (qué codifica cada gen). • El primer borrador se presentó el 26 de junio de 2000), finalmente el genoma completo fue presentado en abril del 2003, dos años antes de lo esperado. Incompleto. • El PGH fue declarado como Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO. primera presentación impresa del genoma humano
  • 23. OBJETIVOS DEL PGH • Hacer una serie de mapas o diagramas descriptivos de cada cromosoma humano con resoluciones cada vez más finas. • Encontrar y describir el orden y localización de los genes u otros marcadores, el espaciamiento entre ellos en cada cromosoma y desarrollar herramientas para el uso de esta información en el estudio de la biología humana y de la medicina. • Buscar la secuencia de todos los genes y determinar su actividad o función en el desarrollo de la variedad de células especializadas diferentes, como las de los músculos, cerebro, corazón, ojos, piel, sangre y tejidos que componen a un ser humano. • Adquirir conocimientos sobre los factores medioambientales y genéticos presentes en la predisposición y la resistencia a la enfermedad, la denominada epidemiología genética. • Brindar una base de datos donde el hombre pueda cotejar su información y determinar su estado genético (éste es muy controvertido debido a la discriminación genética).
  • 24. ¿Cuántos genes tiene el ser humano?
  • 25. BASE DE DATOS DEL GENOMA HUMANO • En la actualidad funcionan principalmente dos tipos de bases de datos genómicos: • El Consorcio Internacional de Bases de Datos de Secuencias está formado por GenBank, el Banco de datos de ADN de Japón (DDBJ) y el del EMBL. • Alberga los datos de secuencias. Las tres bases comparten y complementan la información. • En España existe un nodo de EMBL residente en el Centro Nacional de Biotecnología (CNB) de Madrid.
  • 26. ¿Qué hemos descubierto respecto al genoma humano?
  • 27. PROPIEDADES DEL GENOMA HUMANO • El genoma humano está constituido por 3.272.480.987 pb. • Constituido por 20.000-25.000 genes codificantes de proteínas. Proyecto ENCODE: 22.286 genes. • Los genes estructurales (codifican para proteínas o RNA) constituyen menos del 2% del total de ADN. • Distribuido entre los cromosomas; varía entre 50 (Cromosoma Y) y 240 millones de pb (I y II) y entre 50 y 2.500 genes por cromosoma. • Los cromosomas más densos (con más genes codificadores de proteínas) son el 17, 19 y el 22. Los cromosomas X, Y, 4, 18 y 13 son los más áridos.
  • 28. CROMOSOMAS Y ENFERMEDADES http://www.iqb.es/diccio/c/cromosomas.htm locus Enfermedad 1p Susceptibilidad a la anorexia nerviosa 1p Enfermedad de Parkinson 1p Susceptibilidad a la psoriasis 1p Coreoatetosis paroxística con ataxia episódica 1p13 Reflujo vesicouretral 1p21 Anemia hemolítica por deficiencia de piruvato kinasa de los eritrocitos 1p21 Carcinoma del tiroides con neoplasia papilar renal 1p21 Dermatitis atópica 1p22 Dihidropirimidinuria 1p24 Sordera 1p11 Meningioma inducido por radiación 1p31 Enfermedad arterial oclusiva 1p31 Susceptibilidad a las enfermedades autoinmunes 1p32 Leucemia linfocítica aguda de células T 1p32 Lipofuscinosis ceroide 1p34 Fucosidosis 1p34 Síndrome de Van der Woude 1p36 Ataxia cerebrospinal 1p36 Enfermedad inflamatoria intestinal 1p36.1 Exóstosis múltiple familiar 1pter-p36.13 Cataratas congénitas, tipo Volkmann
  • 29. Genesproteinas 2% Intrones 26% LINE (elementos nucleareslargos) 20% SINE (elementos nuclearescortos) 13% Transposones 3% (LTR) Repeticiones terminales largas 8% Duplicaciones segmentos 5% Repeticionessecuencias simples 3% Secuenciasúnicas, varias 12% Heterocromatina y ADN diverso 8% Tipos de secuencias en el ADN humano
  • 31. Bases de datos de ADN • En plantas. Jardín Botánico de Kew (Londres). • http://data.kew.org/cvalues • Y de animales • http://www.genomesize.com/
  • 32. • Ostreococcus tauri • Octodon degus • Género Porphyra • Género Gracilaria • Mamíferos marinos • Reptiles marinos • Clasificación taxonómica ¿Quién es? • ¿Cuántos juegos cromosómicos dispone? • ¿Cuál es el tamaño de su genoma? • ¿Cuántos genes se han descrito? • ¿Qué otras características puedes señalar?
  • 33. ¿Existe alguna relación entre la complejidad de un organismo y su tamaño de ADN?
  • 34. CANTIDADES Y RELACIONES GENÓMICAS Cantidad de ADN (Nº pares de bases) Nº de Cromosomas Nº de genes Organismo 2N Humanos 46 Canguro 12 Maiz 20 Mosquito 6 Ratón 40 Myrmecia (Hormiga) 2 Aulacantha (Protozoo) 1600 Perro 78 Burro 62 Ballena azul 44 Delfín mular 44 Mango 40 Pollo 78 Coyote 78 Agrodiaetus (Mariposa) 268
  • 35. LA CONSTANCIA DE LA CANTIDAD DE ADN • La cantidad de ADN (por juego de cromosomas) dentro de un organismo es constante. ADN células estómago = ADN células hígado. Lo que existe es Expresión diferencial. • El contenido (cantidad) de ADN de un juego de cromosomas es, por lo general, invariable entre los miembros de una misma especie – ADN Paky = ADN Paco. • Todos los individuos de la misma especie, en general, tienen los mismos genes, con distinta expresión, claro está. Todos los individuos de la misma especie tienen (en general) la misma cantidad de ADN Todos los individuos de la misma especie tienen los mismos genes Todas las células de un mismo individuo dispone de los mismos genes y la misma secuencia de nucleótidos
  • 36. La paradoja del valor C • Se refiere a una aparente paradoja que existe al no observarse una relación directa entre el contenido de material genético y la complejidad evolutiva de las especies. • Los organismos más complejos no tienen necesariamente genomas más grandes que los organismos más simples. • Algunas especies relacionadas exhiben contenidos de ADN divergentes. Especies con el mismo nivel de complejidad morfológica, poseen genomas con contenidos de ADN diferentes en órdenes de magnitud.
  • 37. Tamaños de los genomas en diferentes grupos de organismos
  • 38. Paradoja del valor de C por grupos (genomebiology.com)
  • 39. Algunos datos de Genome size Nº especies 4972 (3231 Vertebrados, 1741 No Vertebrados) Genoma animal más pequeño 0.02pg, Pratylenchus coffeae, (parásito de plantas, nematodo) Genoma animal más grande 132.83pg, Protopterus aethiopicus, (Marbled lungfish) Protopterus aethiopicus Pratylenchus coffeae
  • 41. ¿Mayor número de cromosomas = Mas cantidad de ADN? ¿Mayor número de cromosomas = mayor complejidad del organismo? ¿Mayor número de cromosomas = mayor número de genes? ¿Mayor número de genes = Mayor complejidad del organismo/especie? ¿Todos los individuos de la misma especie tienen los mismos cromosomas? ¿Todos los individuos de la misma especie tienen los mismos genes? ¿Todos los individuos de la misma especie tienen las mismas secuencias de nucleótidos? ¿Mas cantidad de ADN = mayor número de genes? ¿Todas las células (excepto los gametos) de un mismo individuo dispone de los mismos genes? INTRA-INDIVIDUO INTRA-ESPECIFICO INTER-INDIVIDUO INTER-ESPECIFICO 1a ¿Todas las células (excepto los gametos) de un mismo individuo dispone de la misma secuencia de nucleótidos? 1b 2a 2b 2c 3a 3b 3c 3d 3e
  • 42. RAZONES DE LA PARADOJA DEL VALOR C • La mayoría del ADN no codifica para proteínas. Existe gran cantidad de ADN repetido. Su origen y función aún es un problema sin resolver. Función en la regulación. • El tamaño del genoma no es proporcional al número de genes. • El tamaño del genoma solo es proporcional a la cantidad de ADN de un organismo.
  • 43. ¿Mayor número de cromosomas = Mas cantidad de ADN? Razón: Diferente forma de empaquetamiento 3c