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Genoma humano
Dra. Martha Leticia Zamudio Aguilar
Facultad de Medicina Xalapa
UNIVERSIDAD VERACRUZANA
Genoma Humano
Es la secuencia de ADN contenida en 23 pares de cromosomas
en el núcleo de cada célula humana diploide.
tiene una longitud total aproximada de 3200 millones de
pares de bases de ADN (3200 Mb) que contienen unos 20 000-
25 000 genes.
De las 3200 Mb, 2950 Mb corresponden a eucromatina y
unas 250 Mb a heterocromatina.
Genoma humano
• La secuencia de ADN que conforma el genoma humano contiene la
información codificada, necesaria para la expresión del PROTEOMA
HUMANO, conjunto de las proteínas del ser humano.
• El PROTEOMA fundamenta la particular morfología y funcionalidad de
cada célula.
• Asimismo, la organización estructural y funcional de las distintas
células conforma cada tejido y cada órgano, y, finalmente, el
organismo vivo en su conjunto.
• El genoma humano contiene la información básica necesaria para el
desarrollo físico de un ser humano completo.
Genoma humano
• Presenta una densidad de genes muy inferior a la que inicialmente se había
predicho, con sólo 1.5 % de su longitud compuesta por exones codificantes
de proteínas.( Porciones funcionales,Codifican proteínas,Contiene
secuencias de BN)
• Un 70 % está compuesto por ADN extragénico y un 30% por secuencias
relacionadas con genes.
• Del total de ADN extragénico, aproximadamente un 70 % corresponde a
repeticiones dispersas,
• la mitad del genoma humano corresponde a secuencias repetitivas de
ADN. ( SON DE RELLENO)
• Por su parte, del total de ADN relacionado con genes se estima que el 95 %
corresponde a ADN no codificante: pseudogenes, fragmentos de genes,
intrones.
Genoma humano
• En el genoma humano se detectan más de 280 000
elementos reguladores, que se originaron por medio de
inserciones de elementos móviles (ancestros).
• Estas regiones reguladoras se conservan en elementos no
exónicos SINE, LINE, LTR.
Se sabe que al menos entre un 11 % y un 20 % de estas
secuencias reguladoras de genes, fue formado por elementos
móviles.
Genoma humano
• El Proyecto Genoma Humano, que se inició en el año
1990, tuvo como propósito descifrar el código
genético.
• En 2005 se dio por finalizado este estudio llegando a
secuenciarse aproximadamente 28 000 genes.
• Y, el 2 de junio de 2016, los científicos anunciaron
formalmente un plan para sintetizar el genoma
humano.​
Genoma humano
• La función de la gran mayoría de las bases del genoma humano es
desconocida.
• El Proyecto ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) ha trazado
regiones de transcripción, asociación a factores de transcripción,
estructura de la cromatina y modificación de las histonas.
• Estos datos han permitido asignar funciones bioquímicas para el 80 %
de los exones codificantes de proteínas.
• El proyecto ENCODE proporciona nuevos hallazgos y un recurso
importante para el estudio de la biología humana y las enfermedades.
Genes de ARN
• Además de los genes codificantes de proteínas, el genoma
humano contiene varios miles de genes ARN, cuya
transcripción reproduce ARN de transferencia (ARNt), ARN
ribosómico (ARNr), microARN (miARN), u otros genes ARN
no codificantes.
• Los microARN tienen gran importancia en la regulación de la
expresión génica
• Hasta un 20-30 % de los genes del genoma humano puede
estar regulado por interferencia por miARN.
miRNA
BLOQUEA EL
ENSAMBLADO DE LA
PROTEINA
Une a RNAm
Números
• La densidad media de genes es de 1 gen cada 100 kb,
• con un tamaño medio de 20-30 kb,
• y un número de exones promedio de 7-8 por cada gen,
• con un tamaño medio de 150 nucleótidos.
• El tamaño medio de un ARNm es de 1.8-2.2 kb, incluyendo
las regiones UTR (regiones no traducidas flanqueantes),
• La longitud media de la región codificante es de 1.4 kb.
Heterogeneidad
• El genoma humano se caracteriza por presentar una gran
heterogeneidad en su secuencia.
• En particular, la riqueza en bases de guanina (G) y citosina (C)
frente a las de adenina (A) y timina (T) se distribuye
heterogéneamente, con regiones muy ricas en G+C
flanqueadas por regiones muy pobres,
• los genes tienden a concentrarse en las regiones más ricas en
G+C.
Mecanismos reguladores del DNA:
• Unión de factores de transcripción a las secuencias promotoras,
• modificación epigenética (metilación del ADN o metilación-
acetilación de histonas)
• accesibilidad a los promotores determinada por el grado de
condensación de la cromatina;
• procesamiento, estabilidad y traducción del ARNm,
• la expresión génica está intensamente regulada
Pseudogenes
• 19 000 pseudogenes, son versiones completas o parciales de
genes con diversas mutaciones, generalmente no se
transcriben.
• Los pseudogenes no procesados son copias de genes
originadas por duplicación, no se transcriben por carecer de
una secuencia promotora y tener múltiples mutaciones,
• Los pseudogenes procesados son copias de ARN mensajero
retrotranscritas e insertadas en el genoma. En consecuencia
carecen de intrones y de secuencia promotora.
Pseudogenes
• Tienen secuencias homólogas a los genes
• Sin embargo, nunca se expresan
• Tienen cambios menores que evitan:
• Su transcripción (no se produce RNAm) o
• Su traducción (Aunque haya RNAm, no funciona al interactuar con
RNAt-RNAr)
DNA extragénico
• Las regiones intergénicas o extragénicas comprenden la mayor parte de la
secuencia del genoma humano
• su función es generalmente desconocida.
• Buena parte de estas regiones está compuesta por elementos repetitivos,
clasificables como repeticiones en tándem o repeticiones dispersas,
aunque el resto de la secuencia no responde a un patrón definido y
clasificable.
• Gran parte del ADN intergénico puede ser un artefacto evolutivo sin una
función determinada en el genoma actual, por lo que tradicionalmente
estas regiones han sido denominadas ADN "basura" , incluye también las
secuencias intrónicas y pseudogenes.
•
Transposones
• Clase I: retrotransposones
• Clase II: transposones de ADN
• los transposones de ADN completos poseen la potencialidad de
autopropagarse sin un intermediario de ARNm seguido de
retrotranscripción.
• Un transposón contiene el gen de una enzima transposasa,
• Su mecanismo de transposición se basa en cortar y pegar, moviendo
su secuencia a otra localización distinta del genoma.
Enfermedades de base genética
• La alteración de la secuencia de puede causar la expresión anormal
de uno o más genes, originando un fenotipo patológico.
• Tres opciones:
• Mutaciones
• Alteración en la regulación
• Alteraciones cromosómicas
• La alteración del genoma de las células germinales de un individuo se
transmite frecuentemente a su descendencia.
• El número de enfermedades genéticas conocidas es de 4 000 aprox.
Genoma mitocondrial
• Es el genoma propio de las mitocondrias de células eucariotas.
• La mitocondria es de origen endosimbionte,
• Es decir, antiguamente fueron organismos procariotas independientes
captados por una célula eucariota ancestral, con la que desarrollaron
una relación simbiótica.
• su código genético es ligeramente distinto al considerado universal.
• se ha ido reduciendo sustancialmente a lo largo de su coevolución, en
la actualidad tiene 16 569 pares de bases.
DNA mitocondrial
• La gran mayoría de las proteínas localizadas en las mitocondrias (1500
en mamíferos) están codificadas por el genoma nuclear.
• Estos genes fueron transferidos de la mitocondria al núcleo celular
durante la coevolución de la célula eucariota.
• En la mayoría de mamíferos, sólo la hembra transmite al zigoto sus
mitocondrias, por lo que presentan, un patrón hereditario matrilineal.
• En general una célula humana media contiene 100-10 000 copias del
genoma mitocondrial por cada célula.
Genes mitocondriales
• 13 genes codificantes de proteínas: codifican 13
polipéptidos que forman parte de los complejos
multienzimáticos de la fosforilación oxidativa .
• 2 genes ARNr, que codifican las dos subunidades del ARN
ribosómico de la matriz mitocondrial.
• 22 genes ARNt, que codifican los 22 ARN transferentes
necesarios para la síntesis proteica en la matriz mitocondrial.
DNA mitocondrial
• Al contrario del DNA nuclear, el genoma mitocondrial el 97 %
corresponde a secuencias codificantes.
• Es una única molécula de ADN doble hebra circular.
• Una de las hemihebras recibe el nombre de cadena pesada o
cadena H, y contiene 28 de los 37 genes (2 ARNr, 14 ARNt y
12 polipéptidos).
• La hemihebra complementaria (cadena ligera o L) codifica los
9 genes restantes.
DNA mitocondrial

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05 genoma humano 5

  • 1. Genoma humano Dra. Martha Leticia Zamudio Aguilar Facultad de Medicina Xalapa UNIVERSIDAD VERACRUZANA
  • 2. Genoma Humano Es la secuencia de ADN contenida en 23 pares de cromosomas en el núcleo de cada célula humana diploide. tiene una longitud total aproximada de 3200 millones de pares de bases de ADN (3200 Mb) que contienen unos 20 000- 25 000 genes. De las 3200 Mb, 2950 Mb corresponden a eucromatina y unas 250 Mb a heterocromatina.
  • 3. Genoma humano • La secuencia de ADN que conforma el genoma humano contiene la información codificada, necesaria para la expresión del PROTEOMA HUMANO, conjunto de las proteínas del ser humano. • El PROTEOMA fundamenta la particular morfología y funcionalidad de cada célula. • Asimismo, la organización estructural y funcional de las distintas células conforma cada tejido y cada órgano, y, finalmente, el organismo vivo en su conjunto. • El genoma humano contiene la información básica necesaria para el desarrollo físico de un ser humano completo.
  • 4. Genoma humano • Presenta una densidad de genes muy inferior a la que inicialmente se había predicho, con sólo 1.5 % de su longitud compuesta por exones codificantes de proteínas.( Porciones funcionales,Codifican proteínas,Contiene secuencias de BN) • Un 70 % está compuesto por ADN extragénico y un 30% por secuencias relacionadas con genes. • Del total de ADN extragénico, aproximadamente un 70 % corresponde a repeticiones dispersas, • la mitad del genoma humano corresponde a secuencias repetitivas de ADN. ( SON DE RELLENO) • Por su parte, del total de ADN relacionado con genes se estima que el 95 % corresponde a ADN no codificante: pseudogenes, fragmentos de genes, intrones.
  • 5. Genoma humano • En el genoma humano se detectan más de 280 000 elementos reguladores, que se originaron por medio de inserciones de elementos móviles (ancestros). • Estas regiones reguladoras se conservan en elementos no exónicos SINE, LINE, LTR. Se sabe que al menos entre un 11 % y un 20 % de estas secuencias reguladoras de genes, fue formado por elementos móviles.
  • 6. Genoma humano • El Proyecto Genoma Humano, que se inició en el año 1990, tuvo como propósito descifrar el código genético. • En 2005 se dio por finalizado este estudio llegando a secuenciarse aproximadamente 28 000 genes. • Y, el 2 de junio de 2016, los científicos anunciaron formalmente un plan para sintetizar el genoma humano.​
  • 7. Genoma humano • La función de la gran mayoría de las bases del genoma humano es desconocida. • El Proyecto ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) ha trazado regiones de transcripción, asociación a factores de transcripción, estructura de la cromatina y modificación de las histonas. • Estos datos han permitido asignar funciones bioquímicas para el 80 % de los exones codificantes de proteínas. • El proyecto ENCODE proporciona nuevos hallazgos y un recurso importante para el estudio de la biología humana y las enfermedades.
  • 8. Genes de ARN • Además de los genes codificantes de proteínas, el genoma humano contiene varios miles de genes ARN, cuya transcripción reproduce ARN de transferencia (ARNt), ARN ribosómico (ARNr), microARN (miARN), u otros genes ARN no codificantes. • Los microARN tienen gran importancia en la regulación de la expresión génica • Hasta un 20-30 % de los genes del genoma humano puede estar regulado por interferencia por miARN.
  • 9. miRNA BLOQUEA EL ENSAMBLADO DE LA PROTEINA Une a RNAm
  • 10. Números • La densidad media de genes es de 1 gen cada 100 kb, • con un tamaño medio de 20-30 kb, • y un número de exones promedio de 7-8 por cada gen, • con un tamaño medio de 150 nucleótidos. • El tamaño medio de un ARNm es de 1.8-2.2 kb, incluyendo las regiones UTR (regiones no traducidas flanqueantes), • La longitud media de la región codificante es de 1.4 kb.
  • 11. Heterogeneidad • El genoma humano se caracteriza por presentar una gran heterogeneidad en su secuencia. • En particular, la riqueza en bases de guanina (G) y citosina (C) frente a las de adenina (A) y timina (T) se distribuye heterogéneamente, con regiones muy ricas en G+C flanqueadas por regiones muy pobres, • los genes tienden a concentrarse en las regiones más ricas en G+C.
  • 12. Mecanismos reguladores del DNA: • Unión de factores de transcripción a las secuencias promotoras, • modificación epigenética (metilación del ADN o metilación- acetilación de histonas) • accesibilidad a los promotores determinada por el grado de condensación de la cromatina; • procesamiento, estabilidad y traducción del ARNm, • la expresión génica está intensamente regulada
  • 13. Pseudogenes • 19 000 pseudogenes, son versiones completas o parciales de genes con diversas mutaciones, generalmente no se transcriben. • Los pseudogenes no procesados son copias de genes originadas por duplicación, no se transcriben por carecer de una secuencia promotora y tener múltiples mutaciones, • Los pseudogenes procesados son copias de ARN mensajero retrotranscritas e insertadas en el genoma. En consecuencia carecen de intrones y de secuencia promotora.
  • 14. Pseudogenes • Tienen secuencias homólogas a los genes • Sin embargo, nunca se expresan • Tienen cambios menores que evitan: • Su transcripción (no se produce RNAm) o • Su traducción (Aunque haya RNAm, no funciona al interactuar con RNAt-RNAr)
  • 15. DNA extragénico • Las regiones intergénicas o extragénicas comprenden la mayor parte de la secuencia del genoma humano • su función es generalmente desconocida. • Buena parte de estas regiones está compuesta por elementos repetitivos, clasificables como repeticiones en tándem o repeticiones dispersas, aunque el resto de la secuencia no responde a un patrón definido y clasificable. • Gran parte del ADN intergénico puede ser un artefacto evolutivo sin una función determinada en el genoma actual, por lo que tradicionalmente estas regiones han sido denominadas ADN "basura" , incluye también las secuencias intrónicas y pseudogenes. •
  • 16. Transposones • Clase I: retrotransposones • Clase II: transposones de ADN • los transposones de ADN completos poseen la potencialidad de autopropagarse sin un intermediario de ARNm seguido de retrotranscripción. • Un transposón contiene el gen de una enzima transposasa, • Su mecanismo de transposición se basa en cortar y pegar, moviendo su secuencia a otra localización distinta del genoma.
  • 17.
  • 18. Enfermedades de base genética • La alteración de la secuencia de puede causar la expresión anormal de uno o más genes, originando un fenotipo patológico. • Tres opciones: • Mutaciones • Alteración en la regulación • Alteraciones cromosómicas • La alteración del genoma de las células germinales de un individuo se transmite frecuentemente a su descendencia. • El número de enfermedades genéticas conocidas es de 4 000 aprox.
  • 19. Genoma mitocondrial • Es el genoma propio de las mitocondrias de células eucariotas. • La mitocondria es de origen endosimbionte, • Es decir, antiguamente fueron organismos procariotas independientes captados por una célula eucariota ancestral, con la que desarrollaron una relación simbiótica. • su código genético es ligeramente distinto al considerado universal. • se ha ido reduciendo sustancialmente a lo largo de su coevolución, en la actualidad tiene 16 569 pares de bases.
  • 20. DNA mitocondrial • La gran mayoría de las proteínas localizadas en las mitocondrias (1500 en mamíferos) están codificadas por el genoma nuclear. • Estos genes fueron transferidos de la mitocondria al núcleo celular durante la coevolución de la célula eucariota. • En la mayoría de mamíferos, sólo la hembra transmite al zigoto sus mitocondrias, por lo que presentan, un patrón hereditario matrilineal. • En general una célula humana media contiene 100-10 000 copias del genoma mitocondrial por cada célula.
  • 21. Genes mitocondriales • 13 genes codificantes de proteínas: codifican 13 polipéptidos que forman parte de los complejos multienzimáticos de la fosforilación oxidativa . • 2 genes ARNr, que codifican las dos subunidades del ARN ribosómico de la matriz mitocondrial. • 22 genes ARNt, que codifican los 22 ARN transferentes necesarios para la síntesis proteica en la matriz mitocondrial.
  • 22. DNA mitocondrial • Al contrario del DNA nuclear, el genoma mitocondrial el 97 % corresponde a secuencias codificantes. • Es una única molécula de ADN doble hebra circular. • Una de las hemihebras recibe el nombre de cadena pesada o cadena H, y contiene 28 de los 37 genes (2 ARNr, 14 ARNt y 12 polipéptidos). • La hemihebra complementaria (cadena ligera o L) codifica los 9 genes restantes.