1. ¿Cómo se estudia una
Epidemia?
Objetivo
Introducir ideas generales de cómo estudiar
una epidemia
Gustavo Mora A
morag@colpos.mx
Colegio de Postgraduados
3. ¿Cómo se estudian las epidemias (cambios de estructura)?
~2ha
18
0 to 1
1 to 5
En un proceso espacial:
5 to 10
10 to 15
15 to 40 Por medio de la disposición espacial de
16
40 to 80 valores de intensidad de enfermedad por
unidad poblacional (p.e. Planta)
14
Mapel Quadra4
Tommy
Amplitude:0-78
12 Média: 28.3
Variância: 371.5 Tamaño de la población: Grande (pe. 0.5ha -
Std.: 19.27
20ha). Unidades poblacionales en una espacio
Planta
10 continuo
Representacion gráfica de la epidemia: Mapas
8
o Gradientes
6 Análisis cuantitativo: Unidimensional, bi y
tridimensionalpe. Indices de dispersión,
4 autocorrelación
Variable empleada: Severidad,
2
Incidencia
número de unidades
enfermas o con daño
1 2 3 4 5 6 7 8
Proceso: Progreso espacial de enfermedad
Linha
Mapa bidimensional campo
4. ¿Como ocurre un progreso espacial?
Mapas interpolativos
1987 1987
1988 1988
Citrus sinensis-
Ustulina deusta
Cancro Basal de los cítricos
1990 1990
1994 1994
1996 1996
B.Reyes et al, 2002
6. • Autocorrelación
7.5
6.5
Fundamento: Forma, tamaño, dependencias
5.5
discontinuas +5 4.5
Autocorrelación significativa entre plantas (4m)
+4
3.5
+3
2.5
+2
+1 1.5
0 0.5
-1 -0.5
-2
-1.5
-3
Patrón -4
-5
-5 -4 -3 -2 -1 0 +1 +2 +3 +4 +5
Autocorrelación significativa entre ruas (8m)
Entre Surcos Entre hileras Entre Surcos e hileras
24
x y
y i y 4 i 4
x x i x
24
y
Ruíz et al., 2004 Loeza-Kuk et al., 2003
7. Descripción matemática de la
Dispersión Intraparcela
1
0
0 1
0
0
Gt
rE
ae
d.s 8 Gs
rO
a t
de
.e
Pdd
r e .
e lo
c M
i
s
. Pdd
r e .
e lo
c M
i
s
.
2 2
1 0
r.
=77 2=
r.
08
1
8 2=
0 r. 2
3= 8
0 0
2 2
07
6 r.8
1
2 6 2
4=
r.
08
0
3=
r.
0
83 2 2
2 5=
r.
08
9
4 0
r.
=96 4
6
0 2
4 6= 6
2
0 0
r.8
7
6=
r.
07
7 7 2
2 7=
r.
08
5
7=
r.
09
1 5
2
3
8=
r.
08
3 6
4
0 4
0
7
3
2
0 2
0
%IncidenciadelAmarilmentoLeal
1
0 0
366 1 2 0 7 0 262
2 260 4 4 166 3
14 12 2 22 114
218 7 28 21
Dar e tdof i (
i nP l e e dc m
s ai C Fe c )
ti a
ac tr
dn o I
r
o cn n
eó
8. ¿Cómo se estudian las epidemias (cambios de estructura)?
En un proceso temporal:
Por medio de la estimación de valores de
intensidad de enfermedad por unidad de
100 tiempo. La información espacial se pierde.
100
Tamaño de la población: pequeña (pe.
80 3, 10, 20 unidades). No se requiere un
80
espacio continuo
Incidence
Incidence
60 Representación gráfica de la epidemia:
60
Curvas o gráficas de intensidad de
enfermedad vs. tiempo
40 40
Análisis cuantitativo: modelos de
progreso, parámetros de localización e
20 integración (p.e. Yo o20ABCPE)
Variable empleada: Produccion, Severidad,
0 Incidencia,
0
J
E F MM AA M J
F M J J
J A
A S O N D número de M A M
J F unidades J
Meses enfermas o con daño
Con datos de Avila 2000
Time Proceso: progreso temporal de enfermedad Tim
9. Estructura de epidemias: dimensión Temporal
Parámetros de localización, integración y forma de curva
1
0
0
Y
f f
Y
o -
Yb1
5
0
To
i p
em c
A
B
CP
E
IntesidaeEnfermda(%)
Y
o
0
X
o Tró E i(m
tD n p a p
= a di m o
uc ed t
i e i
e)
To
ip
em
10. Una epidemia es un proceso inductivo y regulable
Lycopersicum sp / Nacobus aberrans Carica Papaya-PRSV (Con y sin barreras)
100 SB CB
Número de agallas por planta
Rep. 1 Rep. 2 Rep. 3 Rep4. TT
400
80
TC
300 60
40
200
IC 20
100
0
0 0 47 66 91 106 121 134
0 10 20 30 40 50
Días despues del trasplante Jairo et al., 2006 Rivas et al., 2003
Dendranthema grandiflora - TSWV (vectores:Trips)
18 70 Mangifera indica-Fusarium spp
INCIDENCE VG1
16
INCIDENCE VG2
INCIDENCE VG3
Ochoa et al., 2006B
60
THRIPS WITHIN CROP VG1
14 THRIPS WITHIN CROP VG2
THRIPS WITHIN CROP VG3 50
12
Número de trips
40
Incidencia (%)
10
8 30
6
20
4
10
2
0 0
9-may
28-sep
12-oct
25-may
26-oct
17-aug
8-jun
3-aug
20-jul
22-jun
31-aug
23-nov
14-sep
7-dec
6-jul
9-nov
A. Mora et al, 2003
11. Periodicidad de Intensidad de Epidemia
Ocurrencia cíclica de atributos estructurales y funcionales de una epidemia
conferida por variaciones en los procesos biológicos, climáticos o de
manejo que operan a nivel de unidad de producción o de región en un lapso
de tiempo mayor a Severidad Sigatoka Negra Tabasco (1985-1987)
un cliclo productivo. Las caracteristicas de esta
Ramírez-Sandoval, 1988
periodicidad determina una condición Endémica y Epidémica
30
Severidad Sigatoka Negra Tabasco (1985-1987)
Ramírez-Sandoval, 1988
25
30
20
25
SEVERIDAD
15
20
10
SEVERIDAD
15
FASE EXPONENCIAL FASE TERMINAL FASE EXPONENCIAL FASE TERMINAL
5 Mayor producción y Formación de inóculo Mayor producción y
dispersión de inóculo ascospórico dispersión de inóculo
conidial conidial
10
0
1
5
9
13
17
21
25
29
33
37
41
45
49
53
57
61
65
69
73
77
81
85
89
93
97
101
105
109
113
117
FASE EXPONENCIAL FASE TERMINAL FASE EXPONENCIAL FASE TERMINAL
TIEMPO (Semanas)
12. Citrus sinensis - Virus Tristeza de los cítricos
6.2 ha Árbol positivo en octubre de 2001
Árbol positivo en diciembre de 2001
24 ha Árbol positivo en marzo de 2002
Árbol positivo en septiembre de 2002
Árbol positivo muerto o erradicado
Árbol muerto por manejo
•Incidencia en el área de dispersión
activa de la enfermedad 6.2 ha es
de 5.72 %. I. A.= 1.14 %
Loeza 2002
13. 100o 99o 98o
Citrus sinensis - Virus Tristeza de los cítricos
27o
Zonas con alta incidencia de CTV
26o
y dispersión
25o Zonas libres con moderado riesgo de
establecimiento
Ocampo
24o
Zonas de alto riesgo de establecimiento
23o
50 km
22o
Góngora 2004
14. Triticum sp - Fusarium graminearum
Potencialidad climática de la Región Pampeana
en relación a la incidencia de la FET
Serie: 1971-2002
-30
-31 CORDOBA
RAFAELA
CONCORDIA
S.VIEJO
MANFREDI PARANA
-32
C.del URUGUAY
OLIVEROS
M.JUAREZ
ROSARIO GUALEGUAYCHU 30%
RIO CUARTO
-33
SAN PEDRO
PERGAMINO 25%
-34 LABOULAYE
JUNIN
CASTELAR
20%
LaPLATA
-35
latitud
N.deJULIO
G.PICO 15%
PEHUAJO
Las FLORES
-36 BOLIVAR
ANGUIL
AZUL
10%
-37 TANDIL
C.SUAREZ
PIGUE 5%
BALCARCE
BORDENAVE
Probabilidad de ocurrencia -38 BARROW
0%
de la fusariosis de la B.BLANCA
espiga del trigo -39
H.ASCASUBI
(incidencia >45%) según
la potencialidad climática -40
de la región pampeana de
Argentina -41
-66 -65 -64 -63 -62 -61 -60 -59 -58 -57 -56
longitud
Fuente: INTA-SMN
Moschini 2003
15. Fragaria sp – Secadera
Noviembre 2003 (floración) Febrero 2004 (fructificación) Mayo 2004 (fructificación)
1-1.7
1.7-2.5
3.3-4.1
4.1-4.8
4.8-5.6
5.6-6.4
6.4-7.2
7.2-7.9
Figura 1.13. Gradientes de incidencia de la secadera o marchitamiento de la frutilla
(Fragaria x ananassa) en el Valle de Zamora (Michoacán, México)(Ceja et al., 2004).
Ceja 2004
16. b
b b
b
b
bb b
b
b b b
b b
b b b
b bb
b b b
b b b
b bb b b b
bb ^
b
b b
b b
b b
b
b 72
66
b 60
b 54
Black Spot b
48
42
36
% de Incidencia b 30
24
0- 19.9 18
-
12
20.0- 29.6 6
29.7 - 38.9 0
40.0 - 48.3
48.4 - 57.7
+
57.8 - 69.0
> 69.0
17. b
b b
b
b
bb b
b
b b b
b b
b b b
b bb
b b b
b b b
b bb b 2000
b b
bb ^
b
b b
b b
b b
b
b
4
b
b
4
Cactus wevil
3
b
3
2
% de Incidencia b 2
2
0 - 8.0 2000
-
1
8.1 - 15.0498000 1
0
15.1 - 23.4
+
0
23.5 - 31.5
31.6 - 41.7
41.8 - 63.0
> 63.0