Memoria Instituto de Agricultura Sostenible 2015

2 3
1. PRESENTACIÓN DEL INSTITUTO
• Introducción.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
• Estructura y Organigrama. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
• Servicios y Apoyo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2. JUNTA DEL INSTITUTO
3. ESTADÍSTICAS
• Personal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
• Financiación. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
• Actividades Científicas.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
4. DEPARTAMENTOS y GRUPOS DE INVESTIGACIÓN
• Agronomía. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
I Manejo y Conservación de Aguas y Suelos.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 7
• Mejora Genética Vegetal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
I Biotecnología vegetal.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
II Genómica y adaptación de cultivos (GAC). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
III Mejora genética de cultivos oleaginosos anuales. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
IV Mejora vegetal por resistencia a estreses bióticos y abióticos. . . . . . . . . . . . . . . . . 38
V Mejora genética de poblaciones para una agricultura de bajos insumos.. . . . . . . . . . . . 40
• Protección de Cultivos.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
I Agroecología de malas hierbas.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
II Etiología y Control de Enfermedades de Cultivos.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
III Fitopatología de Sistemas Agrícolas Sostenibles.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
IV Teledetección Aplicada a Agricultura de Precisión y Malherbología. . . . . . . . . . . . . . . 51
5. ALGUNOS DESCUBRIMIENTOS IMPORTANTES
7
16
19
24
54
Índice

6. PUBLICACIONES
• Agronomía. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
I Manejo y Conservación de Aguas y Suelos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
• Mejora Genética Vegetal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
I Biotecnología vegetal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
II Genómica y adaptación de cultivos (GAC). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
III Mejora genética de cultivos oleaginosos anuales. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
IV Mejora vegetal por resistencia a estreses bióticos y abióticos. . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
V Mejora genética de poblaciones para una agricultura de bajos insumos .. . . . . . . . . . . . 75
• Protección de Cultivos.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
I Agroecología de malas hierbas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
II Etiología y Control de Enfermedades de Cultivos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
III Fitopatología de Sistemas Agrícolas Sostenibles.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
IV Teledetección Aplicada a Agricultura de Precisión y Malherbología. . . . . . . . . . . . . . 82
7. PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN VIGENTESTESIS DOCTORALES
8. CONVENIOS Y CONTRATOS VIGENTES
9. TESIS DOCTORALES, TESINAS, MASTERS y D.E.A
10. ACTIVIDADES ACADÉMICAS: CURSOS Y PROGRAMAS DE DOCTORADO,
CURSOS DE MASTER, OTROS
11. ORGANIZACIÓN Y PARTICIPACIÓN EN CONGRESOS, CONFERENCIAS
Y EVENTOS RELEVANTES
12. PREMIOS, RECONOCIMIENTOS Y SERVICIOS
MemoriadeActividades2014
69
83
94
100
103
114
108
Memoria de Actividades del Instituto de Agricultura Sostenible
Diseño y maquetación:
Al margen Comunicación 2015

8 9
D i r e c c i ó n y v i c e d i r e c c i ó n
DIRECCIÓN
José Alfonso Gómez Calero | Director
Blanca B. Landa Del Castillo | Vicedirectora
Leonardo Velasco Varo | Vicedirector
GERENCIA
Dulcenombre Ramírez Pérez | Gerente
D e p a r t a m e n t o s d e i n v e s t i g a c i ó n
JEFATURA DE DEPARTAMENTOS
Agronomía
Helena A. Gómez Macpherson
Mejora genética vegetal
Begoña Pérez Vich
Protección de cultivos
Leire Molinero Ruiz
S e r v i c i o s
UNIDADES DE SERVICIOS Y APOYO
Gerente
Dulcenombre Ramírez Pérez
Administración
Juan Luis Biechy Baldan
Ángela Pérez Ortega
José Juan Sánchez Martínez
Aníbal Bravo Nacarino
Juan A. Bravo Antequera
Secretaría de Dirección
José Antonio Palacios Sánchez
Oficina de proyectos
Rosario Gómez Figueroa
Informática
Manuel Lázaro Muñoz Urbano
Francisco Javier Carazo Gil
Mantenimiento y Apoyo General
Rafael Lomeña García | Jefe de mantenimiento
JoséManuelPriegoTorres | Ayudante de Servicios Generales
ElInstitutodeAgriculturaSostenible(IAS)fuefundadoen
1992 como un centro singular del Consejo Superior de In-
vestigaciones Científicas (CSIC) en investigación agraria,
con un enfoque específico hacia los sistemas agrícolas
andaluces, como cultivos herbáceos de secano y regadío
y olivar, con objeto de compatibilizar la producción de
alimentos con la conservación de los recursos naturales
y protección medioambiental. Esta declaración de inten-
ciones identificaba como objetivo principal la investiga-
ción orientada hacia las necesidades socioeconómicas
del entorno.
Casi 20 años más tarde, los objetivos del IAS, recogidos
en su Plan Estratégico 2014-17, se centran en el análisis
estratégico de los recursos para mejorar la sostenibili-
dad de la agricultura, así como en investigar opciones
existentes para explotar estos recursos de una forma
sostenible y económicamente viable y con el fin de opti-
mizar su uso y minimizar la degradación ambiental.
Parallevaracabodichosobjetivos,elIAS-CSICcuentacon
36 investigadores cuyas líneas de trabajo se encuadran
en los Departamentos de Agronomía, Mejora Genética
Vegetal, y Protección de Cultivos, y suma un total de 166
personas contando el personal de administración y ser-
vicios, técnicos e investigadores pre y post-doctorales.
INTRODUCCIÓN
ESTRUCTURA
Y ORGANIGRAMA

10 11
Dulcenombre Ramírez Pérez
gerencia.ias@csic.es
Tlf.: 957 499 202
La Gerencia del IAS es responsable de:
• Lagestióneconómicaypresupuestaria,lacontratacióndeobrasyservicios
externosyconfeccióndelpresupuestoanualdefuncionamiento.
• Los Servicios Administrativos del Instituto.
• La jefatura del personal en lo que se refiere a su régimen y la supervisión
de todas las unidades de servicios administrativos o técnicos.
• El régimen interno.
• El mantenimiento y los servicios generales.
• La gestión económica y de personal de los proyectos o contratos en
curso, sin perjuicio de las atribuciones de los investigadores principa-
les en los mismos.
• La Secretaría de la Junta de Instituto.
GERENCIA
SERVICIOS ADMINISTRATIVOS MANTENIMIENTO
Gestión Económico-Financiera y
Presupuestaria
Ángela Pérez Ortega
pagadora@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 203
• Gestión presupuestaria y contable: Ingresos y gastos.
• Control de tesorería, arqueo de caja, conciliaciones bancarias, banca
electrónica, etc.
• Pagos.
• Cuentas internas.
Aníbal Bravo Nacarino
anibal.bravo@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 178
• Servicio de ingresos.
José A. Palacios Sánchez
palacios@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 200
• Secretaría de dirección
• Control horario.
• Solicitud de ayudas
José J. Sánchez Martínez
jjsan@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 256
• Tramitación de Dietas y viajes.
• Inventario de Bienes.
• Cargos internos.
Juan A. Bravo Antequera
jbravo@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 248
• Apoyo administrativo.
Oficina de Proyectos
Rosario Gómez Figueroa
rgomez@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 177
• Justificación y seguimiento de Proyectos.
• Seguimiento de contratos con empresas.
• Facturación interna.
Área de Recursos Humanos
Juan Luis Biechy Baldán
recursoshumanos@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 230
• Tramitación de contratos temporales y becas.
• Trámites Seguridad Social.
• Tramitación solicitudes al Departamento de Acción
Social-CSIC.
• Administrativos
Mantenimiento Responsable Jefe
Rafael Lomeña García
rlg@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 275
Este Servicio es el responsable del Mantenimiento, conservación del equi-
pamiento y de las infraestructuras generales del Instituto:
• Mantenimiento preventivo de infraestructuras e instalaciones.
• Supervisión y control de las actuaciones realizadas por contratas.
• Gestión de reparaciones/mejoras.
• Supervisión y control de instalaciones del edificio.
• Diseño y Asesoramiento técnico de nuevas instalaciones.
SERVICIOS Y APOYO

12 13
Servicios Generales
José M. Priego Torres
jmprito@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 287
• Apoyo a servicios generales.
• Encargado del mantenimiento de la flota de Vehículos.
• Tramitación de la recogida de residuos tóxicos.
• Asistencia a reprografia y fax.
SERVICIO DE INFORMÁTICA
INVERNADEROS Y
FINCA EXPERIMENTAL
CÁMARAS DE CULTIVOS
El Servicio de Informática es el encargado del desarrollo, manteni-
miento, gestión y control de los recursos de las tecnologías de la
información y las comunicaciones (datos y telefonía) del IAS, así como
de proveer soporte técnico a los usuarios.
Soporte informático
Manuel L. Muñoz Urbano
mmunoz@ias.csic.es
Tlf.: 957 499 222
• Orientación, negociación y seguimiento en la adquisición de hard-
ware corporativo.
• Gestión de los usuarios de la red, cuentas de correo electrónico y
listas de distribución.
• Manejo de incidencias, soporte tecnológico, asesoramiento al
usuario y ayuda.
• Desarrollo y mantenimiento de la infraestructura de red de datos,
inalámbrica, de medios audiovisuales y telefonía.
• Instalación, configuración y mantenimiento de servidores locales.
• Instalación, mantenimiento y reparación del equipamiento soft-
ware y hardware de usuario final.
INFRAESTRUCTURAS COMUNES
El IAS está ubicado en la finca Alameda del Obispo, propiedad de la
Junta de Andalucía, de ellas tienen cedidas 12 Ha. destinadas a finca
experimental.
Actualmente el IAS tiene tres invernaderos, los dos primeros son uno
de 580 m2 y otro de 270 m2, destinados a experimentación.
El tercero, es un nuevo nvernadero multicapilla que cuenta con 5
módulos. Entre ellos un módulo para experimentación con cultivos
transgénicos. Su superficie total es de 240m2.
El IAS dispone de un total de 16 cámaras: 9 cámaras para crecimiento
de plantas con un total de 133 m2 y 7 cámaras frigoríficas para con-
servación y banco de germoplasma con un total de 117 m2.
Soporte de Experimentos con Plantas
Manuel Sánchez Gómez
msanchez@ias.csic.es
Tlf.: 95749176
• Reservas y apoyo al desarrollo de experimentos en cámaras de
crecimiento, umbráculo, invernaderos y campo
• Gestiones de finca experimental con IFAPA

14 15
SALAS DE
EQUIPAMIENTO CIENTÍFICO
UMBRÁCULOS
VEHÍCULOS
SALAS DE REUNIONES
El IAS dispone de 240 m2 de salas climatizadas para la instalación
de equipamiento científico.El IAS dispone de un total de 16 cámaras:
9 cámaras para crecimiento de plantas con un total de 133 m2 y 7
cámaras frigoríficas para conservación y banco de germoplasma con
un total de 117 m2.
El Instituto también cuenta con 3 umbráculos de uso común, organiza-
dos interiormente en módulos para los diferentes experimentos. Todos
disponen de malla antitrips y grifos para el riego.
Los dos primeros, de 480 m2 cada uno, son uno de techo plano y el otro
en forma de capilla, están vallados perimetralmente con malla antiroe-
dores y se dedican al cultivo en macetas sobre malla antihierba; mien-
tras que el tercero, de 340 m2 y forma de túnel, se utiliza para cultivo
directamente en suelo.
El IAS dispone de una flota de 15 vehículos de uso general destinados
a realizar los desplazamientos de prospecciones de campo y a las
distintas fincas donde se llevan a cabo los experimentos.
Actualmente hay disponibles 4 salas de reuniones, 2 en el edifico anexo
y 2 en el principal:
Edificio Principal:
• Sala para pequeñas reuniones 11 m2.
• Sala de Juntas y conferencias 35.6 m2.
• Edificio Anexo: dos salas de reuniones convertible en 1 con un total
de 55.6 m2.

16 17
• José Alfonso Gómez Calero | Director
• Blanca B. Landa Del Castillo | Vicedirectora
• Leonardo Velasco Varo | Vicedirector
• Dulcenombre Ramírez Pérez | Gerente
• Helena A. Gómez Macpherson | Jefa del Departamen-
to de Agronomía
• Begoña Pérez Vich | Jefa del Departamento de Mejora
Genética Vegetal
• Leire Molinero Ruíz | Jefa del Departamento de Pro-
tección de Cultivos
• Luca Testi | Representante de Personal
• M. José Suso Llamas | Representante de Personal
• M. José Giménez Alvear | Representante de Personal
JUNTA DEL
INSTITUTO
2

20 21
PERSONAL FINANCIACIÓN
Gráfica de Evolución del Personal 2010-2014
Gráfica de Evolución del Presupuesto Ordinario 2010-2014
Gráfica de Evolución durante el periodo 2010-2014 de los recursos obtenidos mediante proyectos
de investigación competitivos (nacionales, regionales e internacionales), contratos con empre-
sas y entidades públicas, prestaciones de servicio y presupuesto ordinario.
350
300
250
200
150
100
50
0
2010 2011 2012 2013 2014
Personal Cientíﬁco
Personal Administración y Servicios
Personal Contratado
Personal Funcionario y Laboral Fijo/Interino
Personal IAS
1,00 €
0,90 €
0,80 €
0,70 €
0,60 €
0,50 €
0,40 €
0,30 €
0,20 €
0,10 €
0,00 €
2010 2011
Presupuesto Ordinario 2010-2014
2012 2013 2014
2010 2011 2012 2013 2014
3,50 $
3,00 $
2,50 $
2,00 $
1,50 $
1,00 $
0,50 $
0,00 $
Contratos Prestación de Servicios Proyectos Presupuesto ordinario - CSIC

22 23
Gráfica de distribución del presupuesto por fuentes de financiación
Estadísticas Resultados Actividades Científicas
Año Proyectos Contratos
Prestación de
servicios
Presupuesto
ordinario - CSIC
2010 3.174.875,30 € 895.923,44 € 21.260,74 € 562.446,06 €
2011 2.216.736,60 € 621.319,92 € 14.579,64 € 464.174,66 €
2012 1.987.125,00 € 680.094,15 € 92.217,09 € 440.965,96 €
2013 2.624.705,56 € 632.857,19 € 90.808,30 € 388.667,06 €
2014 2.784.827,31 € 702.005,44 € 82.420,26 € 372.120,37 €
TOTAL 10-14 12.788.269,77 3.532.200,14 301.286,03 2.228.374,11
CATEGORÍA ACTIVIDAD NÚMERO
Producción Científica Artículos Indexados 160
Artículos no indexados 1
Capítulos de libros 9
Congresos Congresos Nacionales Comunicaciones 15
Congresos Nacionales Pósters 24
Congresos Internacionales Comunicaciones 45
Congresos Internacionales Pósters 29
Formación Dirección de Trabajos leídas 8
Cursos de postgrado (horas impartidas) 333
Transferencia del conocimiento Patentes solicitadas (Prioritarias + PCT’s) 4
Patentes licenciadas 5
Cultura Científica Eventos 15
Materiales 14
Gráfica de distribución del Presupuesto por procedencia de fondos
ACTIVIDADES CIENTÍFICASPresupuesto Ordinario - CSIC
12%
DISTRIBUCIÓN PRESUPUESTO 2010-2014
Prestación de servicios
1%
Contratos
19% Proyectos
68%
Proyectos
68%
MINECO
41%
CCAA
17%
INIA
1%
CSIC
3%AECID
2%
Unión Europea
15%
Otros
21%

24 25
• AGRONOMÍA
• MEJORA GENÉTICA VEGETAL
• PROTECCIÓN DE CULTIVOS
DEPARTAMENTOS
Y GRUPOS
DE INVESTIGACIÓN
4

26 27
Manejo y Conservación
de Aguas y Suelos
El grupo coincide al momento con el departamento de
agronomía en su totalidad. Sus actividades consisten en
las siguientes grandes líneas de investigación:
1. La mejora de la eficiencia del uso del agua en siste-
mas de cultivo mediterráneos.
2. El desarrollo de enfoques interactivos hacía la agri-
cultura de conservación, protegiendo el suelo y la
buena calidad de los flujos hídricos de retorno.
3. El desarrollo de modelos numéricos y metodologías
para el seguimiento y evaluación de las respuestas
de los cultivos y de los sistemas de riego a distintas
escalas.
Departamento de Agronomía
1
JUNTA DEL
INSTITUTO
AGRONOMÍA
DEPARTAMENTO de

28 29
1) Asistencia técnica en países en desarrollo
Elías Fereres Castiel, Helena Gómez Macpherson, Lucia-
no Mateos Iñiguez, Victoria Gonzalez Dugo, Luca Testi
• Formulación, seguimiento y/o evaluación de proyec-
tos de investigación en agronomía y riego para el
desarrollo
• Asesoramiento científico-técnico
Instituciones para las que se ha trabajado:
• Banco Mundial
• Banco Interamericano de Desarrollo (BID)
• Common Fund for Commodities (CFC)
• Organización de las Naciones Unidas para la Agricul-
tura y la Alimentación (FAO)
• Organización de las Naciones Unidas para la Educa-
ción, la Ciencia y la Cultura (UNESCO)
• Grupo Consultivo para la Investigación Agrícola In-
ternacional (CGIAR)
• Centro Internacional de Investigaciones Agrícolas
en Zonas Áridas (ICARDA)
• Ministerio de Desarrollo Rural de Mauritania
• Arab Science & Technology Foundation
• Centre International des Hautes Etudes Agronomi-
ques (CIHEAM)
2) Apoyo Científico a Empresas: teledetección / agricul-
tura de precisión / asesoramiento riego
Pablo J. Zarco Tejada, Elias Fereres, Victoria González-Dugo
• Realización de vuelos con sensores multiespectrales
y térmicos para detección de estrés hídrico, nutricio-
nal, y enfermedades.
• Generación de mapas de la variabilidad espacial de
la temperatura asociada a las necesidades hídricas
mediante aviones tripulados y no tripulados.
• Realización de vuelos sobre fincas agrícolas y zonas
forestales para cartografiado del estado de la vege-
tación.
Empresas:
• Bioibérica
• DAP
• EGMASA
• AURENSIS
• Codorniu
• Tepro S.L..
SERVICIOS
OFERTADOS COMPONENTES
3) Apoyo científico a empresas y comunidades de regan-
tes. Mejora del uso del agua en la olivicultura de riego
Francisco Orgaz, Francisco Villalobos, Luca Testi
• Cálculo de las necesidades hídricas de olivares, a ni-
vel de parcela y finca, en función de las característi-
cas climáticas locales, dimensión de copa y densidad
de plantación.
• Programación de riegos: planificación para máxima
producción y para el incremento de la eficiencia del
recurso agua bajo restricciones (riego deficitario).
• Prueba y análisis de productos y técnicas de manejo
agronómico para la optimizar producción y uso de
agua en cultivos herbáceos y arbóreos.
Empresas:
• Empresas agrarias y sociedades de regantes.
• Alcaliber S.A.
• Fertiberia S.A.
• Luis Eduardo Ahumada Orellana | Autorizado
• Jose Carlos Bueno Gomez | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• María Burguet Marimon | Becario-JAE
• Ignacio Calatrava Bernier Colaborador I+D+i
• Rocío Calderón Madrid | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Inmaculada Carmona Moreno | Titulado medio de actividades técnicas y profesionales
• Antonio José Carpio Camargo | Contrato FPI
• Carlos Castillo Rodríguez | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Óscar Castro Orgaz | Autorizado
• Patricio Cid | Autorizado
• Rafael Del Río Celestino | Ayudante actividades técnicas y profesionales

30 31
• Pablo Elorza Martinez | Autorizado
• Jose Gaspar Escudier Vega | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Mónica Espadafor Fernández-Amigo | Becario-FPI
• Elías Fereres Castiel | Catedrático UCO
• Pedro Pablo Gamero Ojeda | Autorizado
• Ana Belén García Carneros | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Omar García Tejera | Becario-FPI
• Margarita García Vila | Autorizado
• Juan Vicente Giráldez Cervera | Catedrático UCO
• José Alfonso Gómez Calero | Científico titular
• Alfredo Gómez Dominguez | Colaborador I+D+i
• Helena A. Gómez Macpherson | Científico titular
• Mª Victoria González Dugo | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Manuel González Pérez | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Rafaela Gutiérrez Rodríguez | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Alberto Hornero Luque | Titulado medio de actividades técnicas y profesionales
• Ana María Jurado Millán | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Álvaro López Bernal | Becario-JAE
• Manuel López López | Contrato FPI
• Daniel Lozano Pérez | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Rafael Luque Luque | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Luciano Mateos Íñiguez | Investigador científico
• Manuela Medina Peláez | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• David Moldero Romero | Autorizado
• Manuel Morales Priego | Autorizado
• Helene Hoffman Munk Nielsen | Autorizado
• Hector Nieto Solana | Investigador
• David Notario Rosingana | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Marcos Orgaz Ortiz | Autorizado
• Francisco Orgaz Rosua | Investigador científico
• Azahara Ramos Rodriguez | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Manuel Redondo Rodríguez | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• María Román Jáimez | Autorizado
• Rafael Romero Montilla | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Carmen Ruz Ortíz | Especialista I+D+i
• Manuel Salmoral Cuesta | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Mª Auxiliadora Soriano Jiménez | Autorizado
• Inaja Francisco De Sousa | Autorizado
• Encarnación Victoria Taguas Ruiz | Autorizado
• Luca Testi | Científico titular
• Clemente Trujillo Toro | Colaborador I+D+i
• José Luis Vázquez Taguas | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• María Vega Humanes | Titulado medio de actividades técnicas y profesionales
• Alberto Vera Toscano | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Francisco Villalobos Martín | Catedrático UCO
• Alberto Facundo Vita Serman | Autorizado
• Pablo J. Zarco Tejada | Investigador científico

32 33
MEJORA GENÉTICA
DEPARTAMENTO de
La línea de investigación persigue la mejora de diferen-
tes cultivos, principalmente cereales, pero también bra-
sicas, leguminosas y olivo, para el desarrollo de nuevo
germoplasma mejor adaptado, con mayor valor añadido
o con nuevos usos y con el incremento del conocimiento
de la base genética de los caracteres de interés. Para ello
el grupo aplica técnicas de: mejora tradicional, citoge-
nética, mapeo genético, transcriptómica, transgénesis y
RNA de interferencia entre otras.
Estudios novedosos se centrán en la manipulación cro-
mosómica en cereales y el uso de herramientas biotec-
nológicas para facilitar la introgresión en cultivos (trigo
principalmente) de genes de interés agronómico y para
promover la recombinación interespecífica en cereales.
Entre los caracteres en estudio destacan el incremen-
to del contenido en pigmentos carotenoides en grano
de trigo y tritórdeo; caracteres agronómicos en olivo,
incluyendo contenido en aceite y componentes del ren-
dimiento; resistencia a enfermedades en leguminosas;
producción de bioetanol a partir del material lignocelu-
lósico; calidad harino-panadera y nutricional de trigo y
tritordeum; desarrollo de nuevas variedades de cereales
aptas para celíacos.
Biotecnología
Vegetal
1
Departamento de Mejora Genética Vegetal
VEGETAL

34 35
DESCRIPCIÓN Y
SERVICIOSOFERTADOS
Mejora de diferentes cultivos, principalmente cereales,
pero también brasicas, leguminosas y olivo, para el desa-
rrollo de nuevo germoplasma mejor adaptado, con ma-
yor valor añadido o con nuevos usos y con el incremento
del conocimiento de la base genética de los caracteres
COMPONENTES
Genómica y adaptación
de cultivos
El objetivo general de esta línea de investigación es el
desarrollo y explotación de herramientas genómicas de
utilidad para la agricultura sostenible (genómica trasla-
cional). Ello incluye la participación en proyectos de ge-
nómica estructural, y la aplicación de los conocimientos
generados en diversas áreas, como la caracterización
2 Departamento de Mejora
Genética Vegetal
molecular y selección de recursos fitogenéticos, la tra-
zabilidad de productos agroalimentarios y la determi-
nación de mecanismos de adaptación de los cultivos en
condiciones de agricultura sostenible. Para el desarrollo
de esta línea de investigación se colabora con la Univer-
sidad de Córdoba en proyectos conjuntos.
COMPONENTES
• Josefa Enriqueta Alos Ros | Titulado superior de activi-
dades técnicas y profesionales
• Sergio G. Atienza Peñas | Científico titular
• Francisco Barro Losada | Investigador científico
• Tadeo Bellot Bernabe | Técnico superior de activida-
des técnicas y profesionales
• Mª Carmen Calderón Pérez | Titulado medio de activi-
• Almudena Castillo López | Titulado superior de activi-
• María Jose Cobos Vazquez | Titulado superior de activi-
• María Dolores García Molina | Becario-FPI
• Ana Adela García Rull | Auxiliar inves. OPIS
• Mª José Giménez Alvear | Técnico I+D+I
• Diego Dionisio González Espinola | Autorizado
• Julio César Masaru Iehisa Ouchi | Autorizado
• Rocío López Manzano | Oficial de actividades técnicas
y profesionales
• Jose Luis Luque Ojeda | Especialista I+D+i
• Eva María Madrid Herrero | Investigador
• Antonio Martín Muñoz | Profesor investigador
de interés. Para ello el grupo aplica técnicas de: mejora
tradicional, citogenética, mapeo genético, transcriptó-
mica, transgénesis y RNA de interferencia entre otras.
• Hibridación interespecífica.
• Producción de haploides (cultivo de microsporas, an-
teras, etc.).
• Transformación genética de cereales.
• Análisis cromosómico en cereales.
• Identificación de marcadores moleculares relaciona-
dos con caracteres de interés agrícola.
• Alba Martínez Castilla | Autorizado
• María Gabriela Mattera | Becario-FPI
• Josefa Ortiz Moreno | Ayudante actividades técni-
cas y profesionales
• Francisco José Ostos Garrido | Becario-FPI
• Carmen Victoria Ozuna Serafini | Titulado superior
de actividades técnicas y profesionales
• Fernando Pistón Pistón | Investigador
• Ana María Pozo Cruz | Técnico superior de activi-
• Pilar Prieto Aranda | Científico titular
• Carmen Ramírez Alcántara | Ayudante investiga-
ción OPIS
• Encarnación Ramos Naz | Auxiliar inves. OPIS
• María Dolores Rey Santomé | Titulado superior de
actividades técnicas y profesionales
• Cristina Rodríguez Suárez | Titulado superior de
• Susana Sánchez León | Autorizado
• Myrian M. Villatoro Pulido | Investigador
• Leticia Ayllon Egea | Autorizado
• María Teresa Hernández Gutierrez | Titulado superior
de actividades técnicas y profesionales
• Pilar Hernández Molina | Científico titular
• María Rosa Mérida García | Autorizado
• Margarita Pérez Jiménez | Titulado medio de
• Francesco Scollo | Autorizado
• Leticia Villalba Benito | Autorizado

36 37
El objetivo general del grupo es el desarrollo y transfe-
rencia al sector privado de nuevo material vegetal de
especies oleaginosas anuales con mejoras significativas
en caracteres de calidad y agronómicos. Los primeros
incluyen un amplio rango de variación de componentes
de calidad del aceite (ácidos grasos, tocoferoles, fitoes-
teroles) y de la harina y partes verdes (glucosinolatos,
minerales, fibra). Los segundos incluyen resistencia a es-
Mejora genética de cultivos
oleaginosos anuales
3
SERVICIOS OFERTADOS
Los servicios ofertados se resumen fundamentalmente
en las siguientes acciones de transferencia y apoyo tec-
nológico a empresas:
• Uno de los principales objetivos y área de actividad del
grupo es la transferencia al sector privado de nuevos
caracteres en especies oleaginosas anuales y el cono-
cimiento sobre sus bases genéticas, de forma que se
facilite su introgresión en material élite. Asimismo, se
presta apoyo tecnológico en el desarrollo de nuevos
caracteres, su caracterización genética y el desarrollo
de herramientas moleculares de selección.
• Otro objetivo es el asesoramiento al sector privado
en la implementación de nuevos métodos de análi-
sis de componentes de calidad y de técnicas de eva-
luación para resistencia a enfermedades (jopo de gi-
rasol), siembras tempranas y biofumigación, y apoyo
en la introgresión de caracteres en material élite en
programas de mejora.
• Finalmente se realizan análisis de componentes de
la calidad de semillas y otras partes consumibles de
las plantas (proteína, aceite, ácidos grasos, tocofero-
les, fitoesteroles, fibras (ADF, NDF), minerales, gluco-
sinolatos y estudio de las propiedades anticarcino-
génicas de componentes nutracéticos de plantas.
COMPONENTES
treses bióticos (jopo de girasol) y abióticos y potencial
para biofumigación.
Se aborda asimismo el desarrollo y aplicación de meto-
dologías aplicadas a la mejora, incluyendo nuevos mé-
todos de análisis de componentes de la calidad, espec-
troscopía en el infrarrojo cercano (NIRS), marcadores
moleculares y aproximaciones genómicas.
• Marta Aguirre González | Investigador
• Antonio De Haro Bailón | Profesor investigador
• Lidia Del Moral Navarrete | Titulado superior de activi-
• Sonia Fernández Martínez | Ayudante de Actividades
técnicas y profesionales
• José María Fernández Martínez | Profesor investigador
• Benito Gallardo Castro | Ayudante actividades técnicas
y profesionales
• David González Arce | Ayudante actividades técnicas y
profesionales
• Angustias Jiménez Muñoz | Auxiliar inves. OPIS
• Juan Francisco López Cobos | Autorizado
• Juan Mateos Cerrillo | Ayudante actividades técnicas y
profesionales
• Alberto Merino Ortega | Técnico superior de actividades
• Plácida Nieto Moreno | Oficial de actividades
• Sara Obregón Cano | Titulado superior de activi-
• Pedro Pérez Castillo | Ayudante actividades
• Begoña Pérez Vich | Científico titular
• Rocío Pineda Martos | Autorizado
• Antonio Romero López | Ayudante actividades
• José Ropero Pérez | Ayudante actividades técni-
cas y profesionales
• Javier Sainz Sánchez | Autorizado
• Antonio José Serrano Robustillo | Autorizado
• Juan Carlos Torres García | Ayudante activida-
des técnicas y profesionales
• Juan Carlos Trillo Molino | Autorizado
• Leonardo Velasco Varo | Investigador científico

38 39
Mejora por Resistencia a
estreses bióticos
y abióticos
El principal objetivo de la mejora vegetal es asegurar la
producción y calidad de los cultivos para poder respon-
der al aumento constante en la población mundial. Sin
embargo el potencial genético de las plantas se encuen-
tra a menudo amenazado por los estreses ambientales
(incluyendo factores bióticos y abióticos) que limitan la
producción y la calidad.
Nuestro grupo de investigación en el Instituto de Agri-
cultura Sostenible (IAS-CSIC) se centra en el estudio de
la resistencia a los principales estreses que limitan a los
cultivos, particularmente a las leguminosas y los cerea-
les con el fin último de mejorar su comportamiento en el
campo. Estos estudios se realizan a diferentes niveles: 1)
molecular (genes, proteínas, metabolitos, rutas de seña-
lización), 2) celular (determinación microscópica de los
mecanismos de resistencia), 3) planta (estudios fisiológi-
cos), 4) cultivo (ensayos de campo, intercropping).
El objetivo final es la mejora de los cultivos para una re-
sistencia durable frente a patógenos y tolerancia frente
a los estreses ambientales abióticos, principalmente
aquellos que afectan al área mediterránea.
COMPONENTES4
• Rosario Alarcón Expósito | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Mariano Alfaro Moreno | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Thais Aznar Fernández | Becario-FPI
• Moustafa Bani | Autorizado
• Eleonora Barilli | Investigador
• Antonio Manuel Benavides del Sar | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Braulio Bermudez Fernández | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Francisco Jose Canales Castilla | Autorizado
• M. Ángeles Castillejo Sánchez | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• José Jaime Castillo Felipe | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Sara Fondevilla Aparicio | Investigador
• Francisco Javier García León | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Rebeca Iglesias García | Investigador
• Susana Leitao | Autorizado
• María José Llamas Moreno | Autorizado
• Pedro José Luna Casado | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Salvador Luque Grajales | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Ana Moral Jiménez | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Juan Moral Moral | Investigador
• Antonio A. Nadal Moyano | Oficial de actividades técnicas y profesionales
• Elena Prats Pérez | Científico titular
• Nicolas Rispail | Investigador
• Diego Rubiales Olmedo | Profesor investigador
• Ouarda Saoudi | Autorizado
• Ángel María Villegas Fernández | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales

40 41
COMPONENTESDesarrollo de aproximaciones de mejora genética inte-
gradas con el manejo de las abejas polinizadoras para: 1)
obtener poblaciones con una base genética amplia que
manifiesten alta producción y resiliencia mediada por la
heterosis y que, además, sean respetuosas con los poli-
nizadores, y 2) progresar en cuestiones básicas de tipo
práctico, orientadas a una mejor explotación de la hete-
rosis en las leguminosas.
Mejora genética de poblaciones
para una agricultura de
bajos insumos
5
SERVICIOS OFERTADOS
Se diseña y desarrolla tecnología híbrida basada en la
comprensión de la interface planta-polinizador para el
incremento de la polinización cruzada asistida por insec-
tos polinizadores usando herramientas de la ecología de
la polinización, la mejora genética y la bioinformática. Se
enfoca en Vicia faba como una planta modelo, ya que es
una especie parcialmente alógama, polinizada por abe-
jas diversas y que muestra una heterosis significativa en
la estabilidad del rendimiento y la resiliencia.
• Desarrollo de Programas de Mejora en especies
parcialmente alógamas para sistemas agrícolas de
bajos-insumos y respetuosos con los polinizadores.
• Stocks genéticos de Vicia faba para su uso en siste-
mas convencionales, de bajos insumos y ecológicos
(poblaciones en polinización abierta, líneas puras,
sintéticos)
• Valoración de distancias de aislamiento en la pro-
ducción de semillas para una agricultura ecológica
y convencional
• Evaluación de los requerimientos de polinización e
impacto de los polinizadores
• Desarrollo de tecnología de hibridación mediada
por los insectos
• Asesoramiento en características de descubrimien-
to, atracción y recompensa a las abejas polinizado-
ras.
• Manejo de los polinizadores en sistemas agrícolas
de bajo insumos y ecológicos.
• Maria del Carmen Blanca Bustamante | Autorizado
• Rosario Ana Del Río Encuentra | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Javier Lopez Nevado | Autorizado
• David Rodriguez Cantarero | Autorizado
• María José Suso Llamas | Científico titular

42 43
PROTECCIÓN de
DEPARTAMENTO de
CULTIVOS

44 45
Agroecología de malas
hierbas
Departamento de Protección de Cultivos
Los esfuerzos del grupo se centran en la comprensión
de los principios ecológicos subyacentes en las pobla-
ciones y comunidades de malas hierbas en los cultivos
mediterráneos con el objetivo de desarrollar estrategias
integradas de manejo que sean económica y ecológica-
mente sostenibles.
Las principales líneas de investigación son las siguientes:
• Biodiversidad de la malas hierbas y los servicios eco-
sistémicos que proporcionan en los cultivos.
• Efecto del cambio global sobre las poblaciones y co-
munidades de malas hierbas y su relación competiti-
va con los cultivos.
1 Dentrodeestecontextoelobjetivogeneraldenuestra inves-
tigación es comprender mejor las interacciones ecológicas
que sustentan los sistemas de producción agrícola con el
fin de mejorar la sostenibilidad económica y ambiental de
la agricultura.
Bajo esta perspectiva, las principales líneas interrelaciona-
das de investigación de nuestro grupo son:
• Estudiar la diversidad de la malas hierbas y los servi-
cios ecosistémicos que proporcionan en los cultivos
mediterráneos
• Establecer las reglas de ensamblaje de las comunida-
des de malas hierbas
• Estudiar efecto del cambio climático sobre las pobla-
ciones y comunidades de malas hierbas y su relación
competitiva con los cultivos
DESCRIPCIÓN
SERVICIOS
OFERTADOS
COMPONENTES
• Desarrollo de modelos de emergencia de malas hier-
bas e implantación en sistema de soporte a la deci-
sion (web, app, etc.)
• Desarrollo de modelos de resistencia a herbicidas
• Desarrollo de sistemas informáticos aplicados a la
protección de cultivos
• José María Berral Hens | Autorizado
• Rosana Claudia Ferrero Romer | Autorizado
• José Luis González Andújar | Investigador científico
• Lucía González Día | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Maria Eva Hernández Plaza | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Jane Morrison | Autorizado
• Claudia Mariela Morvillo | Autorizado
• Yesica Pallavicini Fernandez | Becario-FPI
Para el desarrollo de las citadas líneas de investigación
nuestro grupo está financiado por proyecto nacionales e
internacionales y cuenta con la colaboración estable de in-
vestigadoresdelaUniversidadPolitécnicadeCataluñayde
la Universidad de Huelva.
Nuestro grupo posee una amplia red de conexiones in-
ternacionales, colaborando con instituciones del presti-
gio de Rothamsted Research (Reino Unido), Universidad
California (Davis, USA), USDA (USA) e INRA (Francia), entre
otras. Ello permite el desarrollar las investigaciones en un
contexto mas internacional y mejorar la formación con el
intercambio de investigadores. También estamos asocia-
dos al Laboratorio Internacional de Cambio Climático cuyo
objetivo es comprender, predecir y formular estrategias de
respuesta al impacto del cambio global sobre los ecosiste-
mas marinos y terrestres.

46 47
Etiología y control de
enfermedades de cultivos
Investigación en enfermedades de cultivos causadas
por patógenos del suelo, con énfasis en: a) biotecno-
logía y bases moleculares de las interacciones planta-
microorganismo, tanto patogénicas como beneficiosas,
b) diversidad genética y patogénica de poblaciones de
patógenos y su detección molecular en planta y suelo, y
c) control integrado de enfermedades de cultivos medi-
COMPONENTES
2
• María Teresa Ariza Fernández | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• María Isabel Arjona Girona | Autorizado
• Óscar Ballesteros Barranco | Ayudante laboratorio
• David Cabrera Jiménez | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Carmen Cañizares Nolasco | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Carlos Casanova Muñoz | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Ana Belén García Carneros | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Benilde Gómez Jimémez | Autorizado
• Carmen Gómez-Lama Cabanas | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Josefa Gutiérrez Jiménez | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Antonia Herrerias Navarro | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• María Jiménez Rueda | Autorizado
• Carlos Germán Lemus Minor | Becario-JAE
• Carlos J. López Herrera | Científico titular
• José María Melero Vara | Profesor investigador
• Virginia Mellado Jiménez | Autorizado
• Jesús Mercado Blanco | Científico titular
• M. Leire Molinero Ruiz | Científico titular
• Carmen María Ortiz Bustos | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Encarnación Pérez Artes | Científico titular
• Leticia Romero Pérez | Autorizado
• David Ruano Rosa | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Carmen María Sánchez Valverde | Autorizado
• Antonio Valverde Corredor | Ayudante investigación OPIS
• María Linarejos Vera Pedrosa | Autorizado
terráneos, principalmente verticilosis del olivo, fusario-
sis del clavel y de cultivos hortícolas, mildiu y jopo del
girasol, podredumbres de raíz del aguacate y marchitez
tardía del maíz, incluyendo agentes de biocontrol, en-
miendas orgánicas y resistencia genética.

48 49
Fitopatología de sistemas
agrícolas sostenibles
En nuestro grupo se pretende evitar o reducir los per-
juicios económicos y medioambientales que ocasio-
nan las enfermedades causadas por patógenos que
residen en el suelo mediante estrategias de manejo
integrado innovadoras y respetuosas con el medioam-
biente, que aseguren el uso eficiente de los recursos
de los sistemas agrícolas mediterráneos y el rendi-
miento, calidad y salubridad de sus producciones.
Las áreas de investigación que abordamos las llevamos
a cabo con un enfoque multidisciplinar que incluye
metodologías de diagnóstico, interacciones planta-or-
ganismo, taxonomía, diversidad genética y estructura
de poblaciones, biogeografía de organismos patógenos
y beneficiosos, y respuesta de genotipos del huésped
a éstos. Todo ello con el uso de herramientas clásicas
y moleculares en los campo de morfogénesis y estruc-
tura de plantas, histología vegetal cualitativa y cuanti-
tativa, epidemiología cuantitativa, modelización e im-
pacto del cambio climático en organismos patógenos
y beneficiosos, ecología microbiana, metagenómica y
control biológico.
3
COMPONENTES
• Diagnóstico específico de bacterias, hongos y nematodos en cultivos agrícolas, y de sus razas, patotipos o biotipos,
mediante procedimientos convencionales y basados en análisis de ADN.
• Caracterización de la estructura genética y patogénica de poblaciones de agentes fitopatógenos y de biocontrol en
suelo y material vegetal de siembra y plantación.
• Aislamiento, identificación, caracterización y selección de agentes de control biológico de enfermedades.
• Aplicación de técnicas de secuenciación masiva para el estudio de poblaciones totales de microorganismos (hon-
gos, arqueas, bacterias, micorrizas, etc.) y nematodos residentes en suelo y rizosfera de cultivos y los cambios pro-
ducidos en sus poblaciones por el uso de sistemas de manejo/aplicación productos fitosanitarios, enmiendas, etc.
• Desarrollo de métodos moleculares “a la carta” de detección y cuantificación de microorganismos en distintas
matrices complejas (suelo, planta, agua, etc.).
• Caracterización de la diversidad de poblaciones microbianas a distinta escala mediante técnicas de genotipado
de ADN y secuenciación (AFLP, RFLP, SSR, MLST, filogenia, etc.).
• Evaluación y caracterización de la resistencia a agentes fitopatógenos así como del efecto de formulaciones de productos
químicos de síntesis o naturales, microorganismos, fertilizantes, y fortificantes en el desarrollo de enfermedades y creci-
miento de cultivos.
• Medidas y análisis de floración, cuajado y desarrollo del fruto en olivo, incluyendo desarrollo fenología floral, incidencia de
aborto pistilar, calidad de flor, calidad de polen, endurecimiento del hueso y crecimiento de la aceituna.
SERVICIOS OFERTADOS
• Carlos Aranda Porras | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Antonio Archidona Yuste | Contrato FPI
• Amira Bouzoumita | Autorizado
• Carolina Cantalapiedra Navarrete | Titulado medio de actividades técnicas y profesionales
• Irene Carrero Cardon | Autorizado
• Pablo Castillo Castillo | Investigador científico
• Ester García-Cuevas Agredano | Ayudante investigación OPIS
• Clizia Gennai | Autorizado
• Raquel Ghini | Autorizado
• David Gramaje Pérez | Doctor
• Ilhem Guesmi | Autorizado
• Rafael Manuel Jiménez Díaz | Catedrático UCO

50 51
Teledetección aplicada a agricultura de
precisión y malherbología
Las principales líneas de investigación del Grupo de In-
vestigación “Teledetección Aplicada a Agricultura de Pre-
cisión y Malherbología” están dirigidas a la optimización
del uso de agroquímicos mediante estrategias basadas
en aplicaciones localizadas. Sus objetivos se centran en:
• Detección y cartografía de malas hierbas y otras va-
riables agronómicas en cultivos aplicando técnicas
de teledetección a Imágenes procedentes de Satéli-
tes de elevada resolución espacial y de Vehículos Aé-
reos No Tripulados (UAV: Unmanned Aerial Vehicles)
• Diseño, Desarrollo y Evaluación de procedimientos
automatizados basados en Objetos (OBIA: Object-
Based-Image-Analysis) para la segmentación y cla-
sificación de diferentes objetivos agronómicos en
imágenes remotas
• Desarrollo de algoritmos de análisis de imágenes
remotas basados en Geoestadística y software add-
on” – “plug-in” para estrategias de agricultura de
precisión, la reducción de errores de co-registro y la
clasificación de sistemas de cultivo
4
• Daniel Jiménez Fernández | Autorizado
• María José Jiménez Moreno | Autorizado
• Blanca B. Landa del Castillo | Investigador científico
• Guillermo León Ropero | Técnico superior de actividades técnicas y profesionales
• Jorge Martín Barbarroja | Ayudante investigación OPIS
• Miguel Montes Borrego | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Inmaculada Moreno Alías | Investigador
• Juan A. Navas Cortés | Investigador científico
• Concepción Olivares García | Autorizado
• Juan Emilio Palomares Rius | Investigador
• Purificación Piqueras Giménez | Ayudante actividades técnicas y profesionales
• Hava Rapoport Goldberg | Investigador científico
• Miguel Ángel Rosa Peinazo | Autorizado
• José Luis Trapero Casas | Especialista I+D+i
COMPONENTES

52 53
COMPONENTES
SERVICIOS OFERTADOS
• Adquisición de imágenes mediante vehículos aéreos no tripulados (UAVs, drones)
• Análisis de imágenes remotas (teledetección) para objetivos agronómicos y forestales:
• Mapas de malas hierbas en diferentes estados fenológicos. Mapas de tratamientos para su control localizado
• Mapas de fenotipado (variedades genéticas) según estados fenológicos
• Mapas de estimación de cosecha y estado del cultivo
• Mapas de arquitectura y volumen de cultivos leñosos y masas forestales
• Irene Borra Serrano | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Juan José Caballero Novella | Titulado medio de actividades técnicas y profesionales
• Luis García Torres | Profesor investigador
• Montserrat Jurado Expósito | Científico titular
• Francisca López Granados | Investigador científico
• José Manuel Peña Barragán | Doctor
• María Pérez Ortiz | Titulado medio de actividades técnicas y profesionales
• Angelica Serrano Pérez | Titulado superior de actividades técnicas y profesionales
• Amparo Torre Sabariego | Auxiliar inves. OPIS
• Jorge Torres Sanchez | Becario-FPI

54 55
ALGUNOS
DESCUBRIMIENTOS
IMPORTANTES
5

56 57
Publicación
Object-Based Image Classification of Summer Crops
with Machine Learning Methods. Remote Sensing 6:
5019-5041. doi:10.3390/rs6065019 (Open Access).
La monitorización y la gestión estratégica de los cul-
tivos de regadío herbáceos y leñosos tiene repercu-
siones agro-ambientales y económicas relevantes. En
este trabajo se ha cartografiado la distribución de los
principales cultivos de regadío a distintas escalas me-
diante técnicas teledetección aplicadas a imágenes
multitemporales del satélite ASTER. Se han utilizando
procedimientos de análisis robustos y automatiza-
dos (OBIA, Machine Learning y Métodos de Aprendiza-
je Avanzados) que han discriminado de forma precisa
cultivos que poseen respuestas espectrales y patro-
nes de cultivo similares. El conocimiento espacial
de cada cultivo que se genera en esta investigación
permite mejorar la toma de decisiones del riego que
requiere cada uno.
Este trabajo ha contado con la participación de in-
vestigadores del Instituto de Agricultura Sostenible
(CSIC-Córdoba), del Departamento de Ciencias Ve-
getales (Universidad de California, Davis-USA) y del
Departamento de Informática y Análisis Numérico
(Universidad de Córdoba) y ha sido co-financiado por
los proyectos TIN2011-22794 (MINECO-FEDER), P2011-
TIC-7508 (Junta de Andalucía) y la Fundación Kearney
de Ciencias del Suelo (USA). La investigación de José
M. Peña fue co-financiada por los Programas Postdoc-
toral Fulbright-MEC y JAEdoc-CSIC-FEDER. Las imágenes
ASTER utilizadas fueron facilitadas por la NASA EOS
Scientific Investigator Affiliation.
Autores
José M. Peña, Pedro A. Gutiérrez, César Hervás-Martínez, Johan Six,
Richard E. Plant and Francisca López-Granados
Publicación
Arbuscular mycorhizal fungi associated with the oli-
ve crop across the Andalusian landscape: Factors dri-
ving community differentiation. PLoS ONE 9(5): e96397.
doi:10.1371/journal.pone.0096397

En este trabajo se han utilizado dos métodos moleculares
independientes del cultivo para estudiar las comunidades
de Micorrizas arbusculares (AMF) asociadas con olivares en
una amplia región del sur de España, incluyendo 96 puntos
de muestreo. El uso de T-RFLP y análisis pirosecuenciación
de secuencias del ADNr proporcionó la primera evidencia
de un efecto de las características agronómicas y climáti-
cas y las propiedades físico-químicas del suelo en la com-
posición de las comunidades de AMF asociadas con olivo.
Los factores más fuertemente asociados a la distribución
AMF variaron con la técnica utilizada pero incluyeron las
característicasagronómicasdelolivar,elgenotipodelculti-
var y la edad de la plantación y el régimen de riego, pero no
dependió del sistema de manejo de los olivares (orgánico
o convencional), o de la presencia de un cultivo de cober-
tura para prevenir la erosión del suelo. Las propiedades fí-
sico-químicas del suelo y las características climáticas más
fuertemente asociadas con la composición de las comuni-
dades de AMF incluyeron el pH, componentes texturales y
contenido de nutrientes del suelo, y la evapotranspiración
y la precipitación media, y la temperatura mínima de los lu-
gares muestreados. El análisis de pirosecuenciación reveló
33 OTUs (especies) de AMF pertenecientes a cinco familias,
con Archaeospora spp., Diversispora spp. y Paraglomus
Autores
Montes-Borrego, M., Metsis, M.,
& Landa, B.B.
spp., siendo las primeras citas en olivo. Curiosamente, dos
de los OTUs más frecuentes incluyen un grupo diverso de
Claroideoglomeraceae y secuencias de Glomeraceae, no
asignados a ninguna especie de AMF de las conocidas co-
múnmente por su uso como inoculantes en olivo durante
la propagación viverística. Nuestros datos sugieren que las
AMF pueden ejercer mayor especificidad de huésped en
olivo que la inicialmente pensada, lo cual puede tener im-
plicaciones importantes para redireccionar el proceso de
producción viverística de olivo en el futuro, así como para
tener en consideración los suelos específicos y ambientes
donde se establecerán los plantones de olivos micorriza-
dos. El trabajo se realizó con la colaboración del Dr. Metsis
de Tallinn University, Institute of Mathematics and Natural
Sciences, Tallinn, Estonia.

58 59
Publicación
Low Strigolactone Root Exudation: a Novel Mechanism
of Broomrape (Orobanche and Phelipanche spp.) resis-
tance Available for Faba Bean Breeding. Journal of Agri-
cultural and Food Chemistry 62: 7063-7071.
Trabajo multidisciplinar en colaboración con químicos
japoneses que continua y culmina estudios previos so-
bre resistencia a Orobanche crenata en leguminosas.
Se identifica por primera vez resistencia a nivel de no
inducción de la germinación debida a la baja exudación
de strigolactonas a la rizosfera. Esta resistencia es par-
ticularmente prometedora ya que es efectiva no solo a
Autores
Fernández-Aparicio, M., Kisugi,
T., Xie, X., Rubiales, D., & Yoneyama, K..
Publicación
The biocontrol endophytic bac-
terium Pseudomonas fluorescens PICF7 in-
duces systemic defense responses in
aerial tissues upon colonization
of olive roots. Frontiers in Mi-
crobiology 5:427.
Uno de los principales proble-
mas que afecta al olivar en la
cuenca Mediterránea es la Verti-
cilosis, causada por el hongo Ver-
ticillium dahliae. La lucha contra este
patógeno requiere la aplicación de una estra-
tegia de control integrado, basada sobre todo en medi-
das preventivas. Entre ellas, el uso de agentes de control
biológico (ACB) ofrece una interesante alternativa desde
el punto de vista medioambiental. Esta publicación su-
giere que uno de los mecanismos potencialmente impli-
cados en el control biológico del patotipo defoliante de
V. dahliae, ejercido por la bacteria endófita beneficiosa
Pseudomonas fluorescens PICF7, reside en la activación
de un amplio rango de respuestas defensivas que actúan
incluso a nivel sistémico.
Se construyó una genoteca sustractiva de cDNA (SSH) en-
riquecida en genes inducidos durante la interacción de
raíces de olivo con la cepa PICF7. Se observó que un ele-
Autores
Carmen Gómez-Lama Cabanás,
Elisabetta Schiliro`, Antonio Valverde-Corredor
and Jesús Mercado-Blanco
vado número de genes inducidos esta-
ban relacionados con respuesta de defensa.
El análisis bioinformático permitió identificar los proce-
sos biológicos más relevantes en este sentido. Se efec-
tuó una selección de algunos genes representativos de
estos procesos para su validación y análisis del patrón
de expresión en un intervalo temporal (1-15 días) me-
diante qRT-PCR. Se demostró la inducción de genes que
codifican para lipoxigenasa 2, catalasa, 1-aminociclopro-
pano-1-carboxilato oxidasa, y fenilalanina amonio-liasa.
Este es uno de los primeros trabajos donde se elucidan
las respuestas que tienen lugar a nivel transcriptómico
en una planta leñosa de interés agrícola como el olivo en
respuesta a la colonización por un ACB. Además, aporta
avances en el conocimiento de los mecanismos de bio-
control desplegados por una bacteria endófita.
O. crenata, sino también a O. aegyptiaca y O. foetida, las
otras especies que afectan a habas en el próximo oriente
y en Túnez, respectivamente.

60 61
Publicación
Olive Cultivation, its Impact on Soil Erosion and its Pro-
gression into Yield Impacts in Southern Spain in the Past
as a Key to a Future of Increasing Climate Uncertainty.
Agriculture 4, 170-198; doi:10.3390/agriculture4020170
La degradación de suelo en olivar es una problemática
ambienta recurrentemente señalada en Andalucía, pero
en pocas ocasiones se pone en perspectiva su evolución a
lo largo de los últimos siglos, su variabilidad dentro de las
diferentes tipologías de olivares dentro de la región y su
implicación sobre la productividad potencial de olivares
situados en condiciones edafoclimáticas muy diferentes.
Aproximar respuestas a estos interrogantes fue el objetivo
de este trabajo de revisión realizado por un equipo multi-
disciplinar perteneciente a cuatro instituciones diferentes.
En este trabajo se señalan como aunque las tasas de ero-
sión se aceleraron a partir de la décadas de 1960 existen
indicadores claros de que el manejo del olivar desde prin-
cipio del siglo XIX en zonas en pendientes en Andalucía era
insostenible desde el punto de vista de conservación del
suelo. También indica que aunque el uso de cubiertas ve-
getales reduce la erosión hídrica de manera drástica, sólo
esasícuandoseimplantanconsuficientecoberturaduran-
te todo el periodo de lluvias. Una evaluación con modelos
su impacto teniendo en cuenta varios escenarios, incluido
uno en que se contempla el hecho de la insuficiente cober-
tura proporcionada por las cubiertas, en numerosas zonas
en pendiente indica que en numerosas comarcas las tasas
de erosión en ladera siguen estando por encima de lo to-
lerable. La última de las conclusiones más destacables es
que la reducción de la productividad potencial debido a la
pérddida de la capacidad de almacenamiento de agua al
perderse el horizonte explorable por la raíces por erosión
haamplificadolasdiferenciasenproductividadentreeloli-
var de secano en las zonas en montaña con el de secano en
las zonas alomadas de los valles (que tienen a tener suelo
con mayor espesor y mayor capacidad de almacena-
miento de agua que el de las zonas de montaña). En
un caso de estudio se estima esa diferencia en unos
200 € h−1
año -1
.
Autores
José A. Gómez , Juan Infante-Amate , Manuel González de Molina ,
Tom Vanwalleghem , Encarnación V. Taguas e Ignacio Lorite
La teledetección es una poderosa herramienta tecnoló-
gica para su uso en agricultura. Consiste esencialmente
en la toma de imágenes remotas en diversos estados del
desarrollo de los cultivos y su posterior procesamiento.
No obstante, para que la teledetección llegue a ser apli-
cable en agricultura necesariamente debe de ser econó-
micamente viables, o sea los costes que conlleva, esto es
la toma y el procesado de imágenes, deben de ser meno-
res a los beneficios que produzca. Y para que así ocurra
necesariamente hay que automatizar todos sus los pa-
sos o etapas. Por otro lado, el calibrado o normalización
radiométrica de imágenes multitemporales es un paso
previo necesario a su procesado para definir en cada
zona de la parcela los insumos (fertilizantes, fitosanita-
rios, o riego, entre otros) que necesita.
Un grupo de investigación de este Instituto (IAS-CSIC)
ha desarrollado un procedimiento original de norma-
lización radiométrica de imágenes multitemporales
denominado ARIN (1) y lo ha automatizado mediante el
desarrollo de un software de fácil aplicación (ARIN®, 2).
ARIN puede ser usado en escenas agrícolas y forestales
en las que se defina un uso de suelo vegetativo “pseudo-
invariante”, por ejemplo plantaciones de árboles (olivos,
cítricos, y praderas permanentes, entre otros). La gran
ventaja de ARIN es que se implementa de forma mucho
más fácil que los métodos de calibración absolutos, los
cuales conllevan complejos algoritmos basados en pará-
metros físicos tales como la posición del sol y diversas
condiciones meteorológicas en el momento de la toma
de cada imagen. Por todo lo anterior se considera que
ARIN puede facilitar en gran medida el uso de la telede-
tección en agricultura. El procedimiento ARIN se ha pa-
tentado (3).
Mapas de promedios de erosión en olivar por comarcas de
acuerdo a cuatro escenarios. Escenario 1 considera manejo
basado en suelo desnudo, el 2, implantación moderada de
cubiertas vegetales (el que consideramos existe en la región), los
escenarios 3 y 4 son hipotéticos con uso más extenso e intenso
de cubiertas vegetales en zonas con mayor riesgo de erosión
(1) Artículo: Garcia-Torres L, Caballero-Novella JJ, Gómez-Candón D,
De-Castro AI (2014) Semi-Automatic Normalization of Multitemporal
Remote Images Based on Vegetative Pseudo-Invariant Features. PLoS
ONE 9(3): e91275. Vol. 9, issue 3, 13 pp. 6 March 2014, doi:10.1371/jour-
nal.pone.0091275
(2) Software registrado: Garcia-Torres L, Gomez-Candón D, Caballero-
Novella JJ, Jurado-Expósito M, Peña- Barragan JM, Lopez Granados F
(2012) ARIN software for the automatic radiometric normalization of
multi-temporal series images based in pseudo-invariant features (in
Spanish). Spanish Property Registration Office, Public Notary Proto-
col 1391/2012, 16 November 2012.
(3) Patente: Garcia-Torres L, Gomez-Candón D, Caballero-Novella JJ,
Peña- Barragan J M, Lopez-Granados F (2012) ARIN procedure for the
automatic radiometric normalization of multi-temporal series ima-
ges based in pseudo-invariant features (in Spanish). Spanish Patent
and Trademark Office, Application date 28 December 2012, Priority
number 201232054, PCT/ES2013/070873.
Fotografía: Definición de pseudo-invariantes en agrios,
olivar y alameda
SEMI-AUTOMATIC NORMALIZATION OF MULTI-TEMPORAL
REMOTE IMAGES BASED ON VEGETATIVE
PSEUDO-INVARIANT FEATURES (ARIN)

62 63
La clasificación de los cultivos mediante imágenes re-
motas es importante para la obtención de estadísticas
agrarias y el seguimiento de las medidas ambientales
demandadas por las administraciones.
Un grupo de investigación de este Instituto (IAS-CSIC) ha
desarrollado un procedimiento original de clasificación
de cultivos y otros usos de suelo en base a imágenes
multitemporales de una escena agraria, denominado
CROPCLASS (1). Consiste básicamente en: i) definir las
parcelas censales en cada imagen mediante archivos
del contorno (vectores); ii) extraer los valores espectra-
les medios de las bandas (SB) e índices de vegetación
(VI) de cada parcela en cada imagen; iii) conformar la
matriz de datos de la información extraída (SB + VI); y
iv) generar modelos predictivos SQL (“Structured Query
Language”, SQL) para cada cultivo mediante clasifica-
ción estadística (“arboles de decisión”, DT) de la matriz
de datos. Esta incluye la identificación de cultivos/ usos
de suelo en un reducido número de parcelas mediante
visitas al campo llevadas a cabo el primer año de estu-
dio. Los modelos predictivos SQL se usan para clasificar
los cultivos u otros usos de suelo no identificados en
las escenas/ imágenes en las que se han generado los
modelos. Antes del desarrollarse CROPCLASS las meto-
dologías de clasificación de cultivos en teledetección
eran muy diversas y requerían un tremendo esfuerzo
de visitas al campo y de procesado de imágenes. CROP-
CLASS se maneja semiautomáticamente mediante un
software registrado (CROPCLASS-2.0®), lo que facilita
Publicación
Faba bean gene-pools development for low-input agri-
culture: understanding early stages of natural selec-
tion. Euphytica 196:77-93 DOI 10.1007/s10681-013-1015-y
La investigación se centra en uno de los retos -calidad de
la polinización y su papel en el apoyo a la producción de
alimentos- considerados por la Plataforma Interguber-
namental sobre la Biodiversidad y Servicios de los Eco-
sistemas (IPBES) del Programa de Naciones Unidas para
el Medio Ambiente.
Las autoras presentan en el artículo resultados iniciales
del proyecto de investigación, SOLIBAM (Strategies for
Organic and Low-input Integrated Breeding and Mana-
gement) financiado por la Unión Europea en el 7 Progra-
ma Marco. En el marco de este proyecto multinacional y
multidisciplinario y teniendo en cuenta que, a raíz de los
informes de la dramática disminución de las abejas soli-
tarias y sociales, se deben desarrollar aproximaciones de
mejora basadas en la conservación de la biodiversidad
y el uso eficiente de los polinizadores, la investigación
explora la interacción planta-polinizador.
Este estudio, portada del volumen correspondiente en
la revista Euphytica, examina la selección fenotípica
ejercida por los polinizadores en características florales
involucradas en la interacción planta-polinizador y en la
robustez y resiliencia de las habas (Vicia faba) bajo dife-
Autores
Suso MJ y del Rio, R.
rentes estrategias de polinización (con presencia de abe-
jas polinizadoras locales y con exclusión de los poliniza-
dores). Se estudian características florales funcionales
-de descubrimiento, atracción y eficiencia de la transfe-
rencia de polen- relacionadas con los vectores de polen
mediante el uso de Análisis Digital de Imagen. Se utilizan
una serie de análisis multivariantes de componentes
principales y discriminantes para explorar si la variación
en las características florales relacionada con los vecto-
res de polen se asocia con diferencias en los patrones
de producción de semillas y de adaptación. Los autores
muestran que el examen de la interacción planta-poli-
nizador abrirá nuevas posibilidades en el desarrollo de
estrategias ganador-ganador donde tanto la producción
de semillas como los polinizadores se co-beneficien.
en gran medida el manejo de imágenes multitemporales
de cada área geográfica. EL procedimiento CROPCLASS
se ha patentado (3).
(1) Artículo: García-Torres L, Caballero-Novella JJ, Gómez-Candón D,
Peña JM (2015) Census Parcels Cropping System Classification from
Multitemporal Remote Imagery: A Proposed Universal Methodology.
PLoS ONE 10(2): e0117551; doi:10.1371/journal.pone.0117551; Digital
Repository: http://dx.doi.org/10.5061/dryad.j958j
(2) Software registrado: Garcia-Torres L., Caballero- Novella JJ, Gómez-
Candón D, Jurado-Expósito M, López-
Granados F, Peña- Barragan JM (2014) CROPCLASS-2.0 software for the
classification of census parcels from remote images (in Spanish),
CSIC- Public Registration Office, Madrid, Protocol 962, 26/ May/ 2014.
(3) Patente: García-Torres L, J.J Caballero-Novella, D. Gómez-Candón, J. M
Peña-Barragán, F. López-Granados, M. Jurado-Expósito. 2014. Procedure
for the classification of crops and others land uses based in census
parcels and multitemporal remote images (In Spanish), Spanish
Patents and Trademark Office, Owner: IAS-CSIC; Application date 25 July
2014, Priority number 201431127.
Definición de parcelas censales mediante archivos vectores
CENSUS PARCELS CROPPING SYSTEM CLASSIFICATION
FROM MULTITEMPORAL REMOTE IMAGERY: A PROPOSED
UNIVERSAL METHODOLOGY

64 65
Publicación
Quantum dot and superparamagnetic nanoparticle inte-
raction with pathogenic fungi: internalization and toxi-
city profile. ACS Applied Materials and Interfaces 6: 9100-
9110. DOI: 10.1021/am501029g
Este trabajo se incluye en una línea de investigación que
pretende explorar los nuevos avances en el ámbito de
la nanotecnología para diseñar nuevos métodos diag-
nóstico y de control de las enfermedades de plantas. En
concreto en esta publicación hemos evaluado las posi-
bilidades del uso de las nanoparticulas para el control y
diagnóstico del patógeno de suelo Fusarium oxysporum.
Este hongo es en un importante patógeno de suelo que
causa grandes pérdidas en un gran número de cultivos.
El control de esta enfermedad es muy difícil y es nece-
sario desarrollar nuevos estrategias de control más efi-
cientes y especificas así como mejorar los métodos de
diagnóstico. En este trabajo hemos evaluado la interac-
ción de este patógeno con diferentes tipos de nanopar-
ticulas y evaluado su toxicidad. Hemos demostrado por
primera vez que las células fúngicas son capaces de in-
ternalizar una gran cantidad de nanoparticulas de tipo
Quantum Dots mientras las nanoparticulas magnéticas
se adhieren a su superficie. La interacción positiva y la
no toxicidad de ambos tipos de nanoparticulas confir-
man su potencial para el diagnóstico temprano de esta
enfermedad.
Publicación
Globalandtime-resolvedmonitoringofcrop
photosynthesis with chlorophyll fluores-
cence. Proceedings of the National Academy
ofSciences.DOI10.1073/pnas.1320008111
La fotosíntesis es el proceso mediante el cual las plantas captu-
ranenergíaenformadeluzparatransformardióxidodecarbono
yaguaencompuestosorgánicos,principalmentecarbohidratos.
Esteprocesobioquímicoesdevitalimportanciaparalavidaenla
tierra,yaqueeslaprincipalfuentedeenergíaparatodoslosseres
vivos.Poresoestanimportantecomprenderlafotosíntesisaes-
calaglobalycómorespondealcambioclimáticoyalimpactodel
serhumano.Elproblemaprincipalparamonitorizarlafotosínte-
sisaescalaglobalradicaenquelasestimacionesdelaproducti-
vidadprimariaqueseobtienendelosmodelosactualessonmuy
imprecisas,sobretodoenzonasdegraninterés,comolasáreas
deintensaactividadagrícola.Elnuevosistemademediciónofre-
ceestimacionesglobalesyprecisas.Duranteañossehanpuesto
a punto métodos de cuantificación de la fluorescencia a escala
foliar en laboratorio, así como en condiciones de iluminación
naturalencultivosyzonasforestalesrealizandovuelosconvehí-
culostripuladosynotripuladosysensoreshiperespectrales.Sin
embargo,elpasoalaescalaglobalmediantesatélitesescompleja
debidoalosefectosatmosféricosylaresoluciónespacialqueob-
tienen dichos sensores embarcados en plataformas espaciales.
Un equipo internacional de investigadores con participación
del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha de-
mostradolacapacidaddeestimarlafotosíntesisaescalaglobal
mediante satélite a partir de la cuantificación de la fluorescen-
cia clorofílica usando técnicas de espectroscopia. En el estudio,
publicado en Proceedings of the National Academy of Sciences
Autores
Nicolas Rispail, Laura De Matteis, Raquel Santos, Ana S Miguel, Laura Custardoy, Pilar
Testillano, María C Risueño, Alejandro Pérez-de-Luque, Christopher Maycock, Pedro
Fevereiro, Abel Oliva, Rodrigo Fernández-Pacheco, M Ricardo Ibarra, Jesus M de la
Fuente, Clara Marquina, Diego Rubiales, Elena Prats.
El trabajo, en el que han participado investigadores del
Instituto Tecnológica Química e Biológica de la Universi-
dad Nova de Lisboa (Portugal), del centro IFAPA de Cór-
doba, del Instituto de Nanociencias de la Universidad de
Zaragoza y de tres centros de investigación del CSIC, el
Instituto de Ciencias Materiales de Aragón de Zaragoza,
el Centro de Investigaciones Biológicas de Madrid, y el
Instituto de Agricultura Sostenible de Córdoba.
(PNAS),seexponelarelaciónqueexisteentrelafotosíntesisyla
fluorescenciaclorofílicamedidadesdeelespacio,loquepermite
observar la variación espacio-temporal de la productividad pri-
maria.Elproblemaprincipalresideenquelosnivelesdeemisión
de la fluorescencia son muy bajos, y su medición es extremada-
mentedifícil.Estenuevométodopuedecontribuiramejorarlas
proyeccionessobrelaproductividadagrícolayafinarlassimula-
cionessobreelimpactodelcambioclimático.
La principal demostración de la validez del trabajo reside en que
laestimacióndelafotosíntesismediantelasobservacionesdela
fluorescencia clorofílica realizadas a bordo del satélite MetOp-A
durantecuatroañosdemuestrasersuperioraotrasaproximacio-
nestradicionalesmediantesatélitequenosebasanenlacuantifi-
cacióndelafluorescencia.Tambiénhamostradosuventajasobre
las simulaciones realizadas mediante modelos globales del ciclo
de carbono utilizadas hasta ahora. Los resultados indican, por
ejemplo, que la fotosíntesis estimada en zonas agrícolas intensi-
vasdeEEUUeIndiaesentreun50%yun75%superioralacuan-
tificaciónrealizadaporlosmodelosglobalesdelciclodelcarbono
utilizadosactualmente.
En la elaboración del trabajo han participado, junto al Instituto
deAgriculturaSostenibledelCSIC,equiposdelaNASA,elDepar-
tamento de Agricultura de EE UU, la Universidad de Stanford, el
MaxPlanckInstitutfürPhysikylaFreieUniversitätBerlin,ycen-
trosdeSuecia,Australia,Suiza,FranciaeItalia.
Autores
Luis Guanter, Yongguang Zhang, Martin Jung, Joanna Joiner, Maximilian Voigt, Joseph A.
Berry, Christian Frankenberg, Alfredo R. Huete, Pablo Zarco-Tejada, Jung-Eun Lee, M. Susan
Moran, Guillermo Ponce-Campos, Christian Beer, Gustavo Camps-Valls, Nina Buchmann,
Damiano Gianelle, Katja Klumpp, Alessandro Cescatti, John M. Baker y Timothy J. Griffis.

66 67
Publicación
RECOMBINATION BETWEEN CLONAL LINEAGES OF THE
ASEXUAL FUNGUS VERTICILLIUM DAHLIAE DETECTED BY
GENOTYPING BY SEQUENCING. PLOS ONE 9 (9): e106740.
Las Verticilosis causadas por Verticillium dahliae son en-
fermedades de difícil control que afectan a numerosos
cultivos agrícolas de gran significación para la alimenta-
ción mundial, incluyendo algodón, hortícolas, olivo y fru-
tales de hueso. V. dahliae es un hongo mitospórico que
sobrevive prolongadamente en el suelo y se distribuye
en semillas y plantones infectados, cuyas poblaciones se
conciben estables y de estructura estrictamente clonal
compuestas de linajes (VCGs) en los cuales se ha podido
producir variación genética y patogénica mediante mu-
taciones. Sin embargo, recientemente se han puesto de
manifiesto discrepancias en las relaciones evolutivas en-
tre dichos linajes, que se explican más fácilmente por la
ocurrencia de eventos de recombinación genética entre
los VCGs que por mutaciones. Esta hipotética recombi-
nación tendría importantes repercusiones potenciales
sobre la durabilidad (estabilidad) de variedades resisten-
tes a V. dahliae, que son clave para la gestión integrada
de las Verticilosis. En este estudio, publicado en PLoS
ONE y realizado en el marco del proyecto AGL2011-24935
con la participación de investigadores del Instituto de
Agricultura Sostenible y de las Universidades de Córdo-
ba, Cornell y del Estado de Pennsylvania, se ha contrasta-
do la hipótesis de que los linajes clonales de V. dahliae se
han producido por eventos de recombinación mediante
genotipado por secuenciación masiva (GBS) de 217 ais-
lados del hongo de gran diversidad de huéspedes y ori-
gen geográfico. El análisis de 27.000 SNPs identificados
en el genoma de V. dahliae ha detectado 430 eventos de
recombinación homogéneamente distribuidos en el mis-
mo, de cuyo análisis hemos inferido linajes recombinan-
tes en los siguientes casos: i) el linaje 6 que comprende
aislados de pimiento en California e interpretamos como
recombinante entre los linajes 2B824
y 4A; ii) un nuevo el
linaje, 2BR1
, que interpretamos como recombinante en-
tre los clados I y II, y comprende aislados de olivo en An-
dalucía; y iii) el linaje 2B334
resultante de recombinación
entre los linajes 1A/1B y 2B824
en el clado II, que solo se
ha encontrado infectando alcachofa en la Comunidad
Valenciana junto con los linajes 1A/1B y 2B824
. Dicha re-
combinación genética se ha podido derivar de reproduc-
ción sexual más que de un fenómeno parasexual, según
lo sugiere la existencia de los dos tipos de compatibili-
dad sexual (MAT1-1, MAT1-2) en los aislados de estudio
y de homólogos de ocho de los 12 genes que regulan la
meiosis en otros hongos de reproducción sexual conoci-
da. No obstante la evidencia de recombinación y la in-
ferencia del origen recombinante de algunos linajes clo-
nales, el resultado del análisis filogenético de los 27.000
SNPs coincidió con el de otros anteriores basados en
VCGs y marcadores de ADN neutrales, confirmando que
las actuales poblaciones de V. dahliae son de estructura
marcadamente clonal. Aunque la existencia de los genes
relacionados con la compatibilidad sexual y la meiosis
Autores
Milgroom, M.G.; Jiménez-Gasco, M.M.; Olivares-García, C.; Drott, M.T.;
Jiménez-Díaz, R.M. 2014.
en V. dahliae es consistente con el potencial de repro-
ducción sexual e incremento de la diversidad genética
en sus poblaciones, proponemos que la actual estructu-
ra clonal de este patógeno es resultado de un proceso
selectivo en favor de los genotipos mejor adaptados a la
intensificación y homogeneidad genética características
de la agricultura moderna, que da lugar a poblaciones de
estructura epidémica similares a las descritas en bacte-
rias fitopatógenas y algunos hongos fitopatógenos, que
también se componen de clones originalmente deriva-
dos de recombinación sexual.
Leyenda de figura
Relaciones filogenéticas entre linajes clonales derivadas de análi-
sis ‘neighbor-joining’ de 26.748 SNPs en 141 aislados de V. dahliae
y distribución de eventos de recombinación en el hongo. Cada cla-
do o linaje contó con soporte bootsrap >99% en 1000 repeticiones.
Los linajes clonales (de arriba a abajo) 1A/1B, 2B334
, 2A, 4B, 4A, 6 y
2B824
se denominaron de acuerdo con su correspondiente grupo
de compatibilidad vegetativa (VCGs). El linaje 2BR1
no había sido
descrito anteriormente. Los linajes recombinantes 2BR1
y 6 se indi-
can mediante flechas y asteriscos. Los haplotipos recombinantes
de los aislados VEM481 (clado I), 395, V496 y V498 (clado II-1) y 320
(clado II-2) se indican mediante flechas. Los números a la derecho
de los clados y subclados indican corresponden a eventos de re-
combinación.

68 69
Autores
Castillo A, Atienza SG, Martín AC
Publicación
Fertility of CMS wheat is restored by two Rf loci loca-
ted on a recombined acrocentric chromosome. Journal
of Experimental Botany. 65: 6667-6677. Doi: 10.1093/jxb/
eru388. La carencia de un sistema óptimo para la produc-
ción de semilla híbrida en trigo ha limitado el desarrollo
de esta tecnología en este cultivo. En 2008 se describió
en el IAS un nuevo sistema de androesterilidad citoplás-
mica (msH1) basado en el citoplasma de la línea H1 de H.
chilense. En este trabajo se estudia en detalle un cromo-
Leyenda de figura
Hibridación in situ de células en metafase tomadas del ápice radicular de la línea T749.
A. Doble señal FISH con ADN genómico de H. chilense (magenta) identificado mediante streptavidin-Cy3 y una sonda repetitiva telomerica
(verde) detectada con FITC. El cromosoma acrocéntrico (Hchac) aparece completamente magenta, lo que indica que sólo contiene ADN de
H. chilense. Las secuencias teloméricas se pueden observar en ambos extremos del cromosoma acrocéntrico Hchac.
B. Señales FISH de la sonda repetitiva pAs1 marcada con FITC. Esta sonda muestra un patrón de hibridación característico en H. chilense
que permite la identificación de los diferentes brazos cromosómicos. El cromosoma acrocéntrico Hchac muestra zonas de hibridación en
ambos brazos cromosómicos.
soma acrocéntrico que restaura la fertilidad del polen en
el sistema msH1. La combinación de estudios citogenéti-
cos (FISH, GISH y apareamiento meiótico) y moleculares
ha permitido demostrar que este cromosoma acrocéntri-
co está formado por la combinación de los cromosomas
1HchS y 6HchS. Este cromosoma lleva dos loci de restau-
ración, uno de cada cromosoma, con potencial para el
desarrollo de un sistema de producción de trigo híbrido.
PUBLICACIONES
6

70 71
Departamento de
Agronomía
Manejo y Conservación
de Aguas y Suelos
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