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Unidad 5. Diversidad del Mundo microbiano

Objetivos
Conocer
    Los microorganismos más importantes y sus características
    Las diferentes aplicaciones de la microbiología

Asimilar
    -Los microorganismos evolucionan, los mutantes mejor adaptados a un medio son
         seleccionados. Frecuentemente esta evolución no supone una alteración de
         las capacidades de los microorganismos pero permite clasificarlos
         filogenéticamente


Comprender y discutir
    -La diversidad microbiana y su cambiante clasificación
UNIDAD V.- Diversidad del Mundo microbiano

Tema 14.- Bacterias: Las Proteobacterias: α, β, γ ,δ y ε
proteobacteria
Las proteobacterias
                               Proteobacterias
   •   Representan en la actualidad el grupo más diverso de bacterias
   •   Muestran una gran diversidad filogenética, fisiológica, morfológica y
       ambiental
   •   Desde el punto de vista evolutivo se diferencian 5 clases α, β, δ, ε, γ
   •   En la actualidad se han secuenciado más de 258 genomas de
       proteobacterias
   •   Clásicamente se han distinguido dentro de las proteobacterias grupos
       como la bacterias púrpura, las endoparásitas (Rickettsia y Coxiella) y
       las bacterias nitrificantes que no pertenecen a una sola de las clases
        – Bacterias púrpura fotosintéticas se encuentran en las clases α, β, y γ
        – Rickettsia es una α-proteobacteria y Coxiella una γ-proteobacteria
        – Bacterias nitrificantes se encuentran en las clases α, β, y γ
α-proteobacteria
Clase Alphaproteobacteria: muy diversa. Se han secuenciado 71 genomas de esta
clase
                         •Bacterias púrpura no del azufre: fotosintéticos
                              •Fija nitrógeno
                                        •Rickettsias: endoparásitos
                                      •Caulobacter e Hyphomicrobium: con estructura celulares

                                      •Agrobacterium y Rhizobium: Invaden plantas
                           •Agente causante de Brucelosis (zoonosis: enfermedades animales
                           que pueden ser transmitidas a humanos)




                                                                                                    bacteria
                                                                                                         o
                                                              Orgánulos




                                                                                                 α-prote
                                       •Vesículas de gas
                                                •Metilotrofos       Cy
                                                                       a   no
                                      •Nitrobacter: nitrificantes               ba
                                                                                     cte
                                                                                           ria


Evolutivamente están próximas a las mitocondrias lo que
sugiere que una α-proteobacteria fue el ancestro de las
mitocondrias
α-proteobacteria
α-proteobacteria
    Bacterias púrpuras no del azufre
    -morfológicamente diversas
    -todas son α-proteobacterias excepto el
    género Rhodocyclus (β-proteobacteria)
                                                              Rhodospirillum
•     metabólicamente flexible
       – en general crece anaeróbicamente como
          fotoorganoheterótrofo anoxigénico
            • tiene bacterioclorofila a o b en fotosistemas
              situados en membranas que son
              continuación de la membrana plasmática
            • algunos pueden emplear bajos niveles de
              H2S como fuente de electrones
       – en ausencia de luz, la mayoría crecen
          aeróbicamente como quimioorganotrofos
       – en ausencia de luz, algunos llevan a cabo
          fermentaciones y crecen anaeróbicamente             Rhodospirillum
•     se encuentran en fangos, lagos y balsas con
      abundante materia orgánica y bajos niveles de
      azufre. Algunas especies son marinas
•     Los géneros más característicos son Rhodobacter,
      Rhodopseudomonas y Rhodospirillum
•     Durante años su aparato fotosintético ha sido
      un modelo del fostosistema II de plantas
      superiores
α-proteobacteria
Rickettsia y Coxiella
•   género Rickettsia
     – clase Alphaproteobacteria; orden Rickettsiales; familia
       Rickettsiaceae
•   género Coxiella
     – clase Gammaproteobacteria; orden Legionellales;
       familia Coxiellaceae
•   Son de distinta clase pero se estudian juntas
    porque tienen importantes similitudes

•todas las especies son parásitas o mutualistas                  Coxiella burnetti creciendo en
                                                                 el interior de una vacuola de un
    -las especies parásitas crecen en los eritrocitos de
                                                                 fibroblasto
    vertebrados, macrófagos y las células del epitelio
    vascular
      •a menudo viven en artrópodos que se alimentan de sangre que actúan como vectores o
      como huéspedes primarios
Ciclo de vida parásito
                    Rickettsia                                        Coxiella
penetra en el huésped induciendo la fagocitosis penetra en el huésped induciendo la fagocitosis
                        ↓                                                ↓
             abandonan el fagosoma                         permanece en el fagosoma
                        ↓                                                ↓
         se reproducen en el citoplasma                 se reproducen en el fagolisosoma
                        ↓                                                ↓
            la célula huésped estalla                        la célula huésped estalla
α-proteobacteria
                                   Rickettsia
 •   Rickettsia prowazekii : Agente causante del tifus epidémico. Se transmite de
     persona a persona a través de los piojos (Pediculus humanus), que también
     mueren (por lo tanto no son reservorios). Si no se trata es mortal en el 40% de los
     casos.
 •   Rickettsia typhi: Es el agente causante del tifus endémico. El reservorio más
     importante son las ratas. El vector es una pulga. Si no se trata es mortal en el 2%
     de los casos.




                         rientia
α-proteobacteria
Las Caulobacteraceae e Hyphomicrobiaceae          Hyphomicrobium
•   tienen como mínimo una de las siguientes 3
    características
      – prosteca: extensión celular que incluye
        membrana plasmática y que es más
        estrecha que la célula madura
      – pedúnculo
          • apéndice no vivo producido por la
            célula y que se extiende desde ella
      – reproducción por gemación
      – Hyphomicrobium es metilotrofo
      – Caulobacter es un modelo de desarrollo
        celular



                                                         Caulobacter


       Gemación y
       división de
       Caulobacter
α-proteobacteria                         •
                                           ni estimula la formación de nódulos ni fija
Género terrestre de vida libre que fija    nitrógeno
nitrógeno atmosférico de forma no        • invaden la copa, las raíces y los tallos de
simbiótica                                 muchas plantas
                                             – transforma las células infectadas de
                                                la planta en tumores que proliferan
                     Family Rhizobiaceae        de forma autónoma
                                         • Ej.: Agrobacterium tumefaciens
                                             – penetra en muchas plantas de hoja
                                                ancha a través de lesiones y
                                                ocasiona tumoraciones en forma de
                                                agallas por medio del plásmido
                                                inductor de tumores (Ti). Muy
                                                empleado en biotecnología vegetal
                                          • bacilos móviles gram negativos
                                               – frecuentemente contienen gránulos
                                                  de poli-β-hydroxybutyrate
                                               – en condiciones adversas se
                                                  vuelven pleomorfos
                                          • crecen simbióticamente como
                                             bacteroides fijadores de nitrógenos
                                             entre nódulos de las raíces de las
                                             leguminosas
α-proteobacteria
Nitrificación

 •   conversión de amonio en nitrato por la acción de dos géneros
      – e.g., Nitrosomonas – amonio a nitrito (Beta-proteobacteria)
      – e.g., Nitrobacter – nitrito a nitrato (Alpha- proteobacteria)
 •   importancia del nitrato
      – fácilmente asimilable por las plantas
      – se pierde en el suelo por lixiviado y desnitrificación
 • son gram-negativos, aeróbicos, que no diferencian endosporas
 • las bacterias cuyo nombre comienza por “nitroso” oxidan el amonio a nitrito, las
 que comienzan por “nitro” oxidan nitrito a nitrato


 •   se encuentran en varios taxa
      – clase Betaproteobacteria; familia Nitrosomonadaceae: ej. género Nitrosomonas
         (se encuentra en fangos, suelos, aguas dulces y saladas) y Nitrosospira (se
         encuentra en el suelo)
      – clase Alphaproteobacteria; family Bradyrhizobiaceae : ej., género Nitrobacter
         (se encuentra en suelos, aguas dulces y saladas)
      – clase Gammaproteobacteria
           • familia Ectothiorhodospiraceae – ej., género Nitrococcus (Marina)
           • Familia Chromatiaceae – ej. genus Nitrosococcus (Marina obligada)
β-proteobacteria
  Clase Betaproteobacteria
β-proteobacteria
β-proteobacteria
Genus Neisseria
• Coccos gram negativos no móviles, se encuentran frecuentemente por parejas con
    la cara adyacente aplanada, pueden tener cápsulas y fimbrias
• aerobios químiorganotrofos, oxidasa positivos y, en general, catalasa positivo
• Habitan en las mucosas de los mamíferos
      – algunos son patógenos de humanos
          • Neisseria gonorrhoeae – gonorrea
          • Neisseria meningitidis - meningitis
β-proteobacteria
                                                    Burkholderia cepacia
Burkholderia cepacia
  • degrada > 100 moléculas orgánicas
       – muy activos en el reciclaje de materia
         orgánica
  • patógeno de plantas
  • pude provocar enfermedades en pacientes
      hospitalizados
       – en particular es problemático en pacientes
         con fibrosis cística


Género Bordetella
   •   cocobacilo gram negativo
        – algunos tienen cápsula                                     Bordetella pertussis
   •   aerobios quimiorganotrofos
        – metabolismo respiratorio
        – requiere azufre orgánico y aminoácidos para crecer
   •   parásitos de mamíferos que se multiplican en las células epiteliales respiratorias
            • e.g., Bordetella pertussis
                 – no móvil y encapsulada
                 – causa la Tos ferina
β-proteobacteria

Género Thiobacillus




•   se encuentra en el suelo y hábitats acuáticos
     – produce ácido sulfúrico que puede provocar corrosión del hormigón y
        estructuras metálicas
     – puede aumentar la fertilidad del suelo desprendiendo sulfato
     – se emplea en el lixiviado de metales en minas de baja calidad
β-proteobacteria
Género Thiobacillus
En USA, El 11% de la producción anual de cobre es extraído de minas de baja calidad mediante
lixiviado microbiano inducido por la bacteria Thiobacillus ferrooxidans. Las minas se irrigan con
agua y la bacteria que crece en la superficie genera ácido sulfúrico que libera el cobre. El cobre
liberado se concentra por electrolisis.
γ-proteobacteria
                          Clase Gammaproteobacteria




                   Principales grupos de γ-proteobacterias
                   •Es el grupo de bacterias más diverso
                   •Se han secuenciado 133 genomas
                   •Incluye importantes patógenos y numerosas
                   especies de interés ambiental
γ-proteobacteria
γ-proteobacteria    Family Chromatiaceae
•   son las típicas bacterias púrpura del azufre (anaerobios estrictos)
•   frecuentemente fotolitoautótrofos
      – emplean H2S como donador de electrones (depositan gránulos de azufre
         internamente, eventualmente oxidan azufre a sulfato)
      – pueden emplear hidrógeno como donador de electrones
•   se encuentran frecuentemente en zonas anaerobias ricas en azufre de lagos
      – se pueden producir afloramientos en los pantanos y lagunas
•   ej., géneros Thiospirillum, Thiocapsa, and Chromatium
γ-proteobacteria         Orden Thiotrichales
-contiene varios géneros de bacterias del azufre incoloras
-los géneros mejor estudiados son Beggiatoa, Leucothrix and Thiothrix
Leucothrix •      aeróbicos químioorganotrofos que se dispersan formando gonidios




                                    Síntesis de
                                    zarcillos




       L. mucor



 Beggiatoa
-es microaerófilo y forma filamentos sin vaina
-metabolismo versátil
    – puede oxidar H2S a azufre (depositado en vesículas internas formadas por invaginaciones
      de la membrana plasmática)
    – puede crecer heterotróficamente con acetato como fuente de carbono
    – algunos son autótrofos
    – crecen en hábitat azufrados
γ-proteobacteria
Thiothrix
 •   relacionado con Leucothrix
 •   forman filamentos con vaina
 •   quimiolitotrofos oxidan sulfuro de hidrógeno, depositan gránulos de azufre
     internamente, mixotrofos (combinan la autotrofía con la heterotrofía) )
           • emplean fuentes de energía inorgánicas y fuentes orgánicas de carbono)
 •   ciclo de vida similar a Leucothrix
       – los gonidios se desprenden del extremo abierto de una vaina
 •   se encuentran en aguas ricas en azufre y sistemas de tratamiento de lodos
     residuales
γ-proteobacteria
   Orden Methylococcales
• morfológicamente diversos
    – ej., genus Methylococcus – esféricos, no móviles
    – e.g., genus Methylomonas – bacilos rectos curvados y ramificados con un solo
       flagelo polar)
    – casi todos tienen algún tipo de fase de reposo a menudo consiste en un cisto
       similar al de las azobaterias
• Metilotrofos (emplean compuestos de un solo carbono como fuente de energía
   y poder reductor como el metano, metanol)
  Orden Pseudomonadales
  Los generos Pseudomonas y Azotobacter son los principales
Importancia práctica de las pseudomonas
 • metabólicamente versátiles                             • Químioorganotrofos
     – degrada una gran variedad de moléculas orgánicas • fija nitrógeno en forma no
     – mineralización                                       simbiótica
          • degradación microbiana de compuestos y        • muy abundantes en suelos y
            materiales orgánicos a sustancias inorgánicas
                                                            agua
 • importantes en investigación. Modelos
    experimentales
 • algunos son patógenos de plantas y animales
 • algunos causan el deterioro de comida refrigerada
     – pueden crecer a 4°C
γ-proteobacteria
• Tres ordenes de γ-proteobacteria contienen géneros muy importantes desde el punto
    de vista práctico, todos ellos tienen una sola familia:
     – Enterobacteriales
     – Vibrionales
     – Pasteureales




Order Enterobacteriales
• contiene 1 familia, Enterobacteriaceae; 41 géneros
     – conocidas como enterobacterias o bacterias entéricas
•   anaerobios facultativos
•   quimioorganotrofos que degradan azúcares mediante rutas glicolíticas
     – pueden degradar el piruvato a ácido fórmico (fermentación ácido fórmica)
γ-proteobacteria
Order Enterobacteriales
• contiene 1 familia, Enterobacteriaceae; 41 géneros
     – conocidas como enterobacterias o bacterias entéricas
•   anaerobios facultativos
•   quimioorganotrofos que degradan azúcares mediante rutas glicolíticas
     – pueden degradar el piruvato a ácido fórmico (fermentación ácido fórmica)
γ-proteobacteria
Order Enterobacteriales
Importantes bacterias entéricas patógenas
• Salmonella – fiebres tifoideas (S. typhi) y grastroenteritis (S. typhimurium)
• Shigella – disentería bacilar
• Klebsiella – neumonía (K. pneumoniae)
• Yersinia – Peste bubónica (Y. pestis)
• Erwinia – Patógenos de plantas de cultivo, producen marchitamiento (E. amylovora,
   destruye manzanos y perales)

Escherichia coli
• probablemente la bacteria mejor estudiada
• es un organismo modelo en investigación E. coli K12 y E. coli DH5α
• vive en el tracto digestivo de los animales
• se emplea como organismos indicador de contaminación fecal en agua
• algunas cepas son patógenas
    – gastroenteritis E. coli O157:H7 (enterohemorrágica)
    – infecciones del tracto urinario E. coli CFT073
γ-proteobacteria
Order Enterobacteriales
para la identificación en de géneros de
    enterobacterias se emplean llaves
    dicotómicas.
• ONPG: β-Galactosidasa
• VP: Voges-Proskauer

son el fundamento de los métodos
   API 10 y API 20
También se identifican con medios
   selectivos y diferenciales
γ-proteobacteria                         Agar verde brillante
Lactose and Saccharose are the
carbohydrates in the medium. Phenol
Red is the pH indicator that turns the
medium a yellow color with the
formation of acid when lactose and/or
sucrose is fermented. Sodium Chloride
maintains the osmotic balance in the
medium. Brilliant Green inhibits gram-
positive bacteria and most gram-
negative bacilli other than Salmonella
spp. Lactose/sucrose fermenters are
usually inhibited.11 Bacto Agar is the
solidifying agent.

MacConkey                                                       Es el medio primario selectivo y
                                                                diferencial que se emplea mas a
                                                                menudo; contiene violeta cristal para
                                                                inhibir el crecimiento de cocos
                                                                grampositivos y rojo neutro como
                                                                indicador de pH, que le otorga
                                                                propiedades diferenciales. Los bacilos
                                                                gramnegativos crecen fácilmente ; los
                                                                fermentadores de lactosa producen
                                                                metabolismo ácidos que disminuyen
                                                                el pH de medio próximo a la colonia.
                                                                En esa zona el rojo neutro vira al rojo.
                                                                Los no fermentadores de lactosa
                                                                permanecen incoloros y translúcidos.
γ-proteobacteria                 EMB




Peptone is a source of nitrogen and other nutrients in the formulation. Eosin and methylene blue
are dyes which combine to form a precipitate at an acid pH. The dyes act both as pH indicators and
inhibitors. Gram-positive bacteria are partially inhibited on the medium. Lactose and Sucrose are
fermentable carbohydrates. Phosphate acts as a buffer. Bacto Agar is a solidifying agent.
γ-proteobacteria
Order Vibrionales                                     Vibrio fischeri
•   contiene 1 familia, Vibrionaceae; 6 géneros   •   bioluminiscente
•   la mayoría acuáticos
                                                       – emisión de luz catalizada
     – de vida libre
                                                          por la luciferasas
     – algunos son patógenos importantes
     – algunos son simbiontes en los órgano            – también se observa en al
        luminiscentes de los peces                        menos dos especies de
•   muy relacionados con otros dos órdenes                Photobacterium
     – Enterobacteriales and Pasteurellales       •   puede emplear AMP cíclico
                                                      como fuente de C, N, and P
Vibrio cholerae                                   •   de vida libre
• causa el cólera
• su genoma ha sido secuenciado
     – tiene dos cromosomas circulares                   Bioluminiscencia de V. fischeri

     – las copias de algunos genes están en
        ambos cromosomas
γ-proteobacteria
Order Pasteurellales
• poco diversa pero contiene importantes patógenos
• Pasteurella multilocida – Cólera aviar
• Pasteurella haemolytica – neumonia en ganado vacuno, ovino y caprino
• Haemophilus influenzae – diversas enfermedades incluida la meningitis infantil.
    Fue el primer organismo cuyo genoma fue secuenciado




Haemophilus influenzae (Coloracion de
Gram, hémocultivo)




                                             Haemophilus influenzae (En agar sangre)
δ y ε-proteobacteria
 Clase Deltaproteobacteria                   Clase Epsilonproteobacteria
• muy diversa                               • es la clase menos diversa de las
     – se divide en dos amplios grupos         proteobacterias
         • Predadores quimiorganotrofos     • un orden, Campylobacteriales; dos
           aerobicos
                                               familias, Campylobacteriaceae y
         • reductores de azufre y sulfato
           quimiorganotrofos anaeróbicos       Helicobacteraceae
ε-proteobacteria

Campylobacter y Helicobacter son
patógenos muy importantes




                                                             Premio Nobel 2005,
                                                             Barry J. Marshall and
                                                             J. Robin Warren




        Campylobacter jejuni

Intoxicaciones alimentarias a lo largo del año 1996 en USA
δ-proteobacteria




Stigmatella        Myxococcus         Myxococcus
aurantiaca         fulvus             stipitatus


Las mixobacterias (Stigmatella y
Myxococcus) son un interesante
grupo de bacterias deslizantes
que forman cuerpos fructíferos
en condiciones de carencia          Margen de una colonia    Mixobacterias agrupadas
nutricional.                        de Mixobacterias         en cuerpos fructiferos




                                   Mixobacterias agrupadas
                                   en cuerpos fructiferos     Diferenciación progresiva en
                                                              mixosporas
δ-proteobacteria




                   Bdellovibrio es la
                   bacteria depredadora
                   mejor caracterizada.
                   Taladra la pared
                   celular e invade el
                   periplasma en el que
                   se reproduce hasta
                   lisar la bacteria.

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Diversidad microbiana

  • 1. Unidad 5. Diversidad del Mundo microbiano Objetivos Conocer Los microorganismos más importantes y sus características Las diferentes aplicaciones de la microbiología Asimilar -Los microorganismos evolucionan, los mutantes mejor adaptados a un medio son seleccionados. Frecuentemente esta evolución no supone una alteración de las capacidades de los microorganismos pero permite clasificarlos filogenéticamente Comprender y discutir -La diversidad microbiana y su cambiante clasificación
  • 2. UNIDAD V.- Diversidad del Mundo microbiano Tema 14.- Bacterias: Las Proteobacterias: α, β, γ ,δ y ε proteobacteria
  • 3. Las proteobacterias Proteobacterias • Representan en la actualidad el grupo más diverso de bacterias • Muestran una gran diversidad filogenética, fisiológica, morfológica y ambiental • Desde el punto de vista evolutivo se diferencian 5 clases α, β, δ, ε, γ • En la actualidad se han secuenciado más de 258 genomas de proteobacterias • Clásicamente se han distinguido dentro de las proteobacterias grupos como la bacterias púrpura, las endoparásitas (Rickettsia y Coxiella) y las bacterias nitrificantes que no pertenecen a una sola de las clases – Bacterias púrpura fotosintéticas se encuentran en las clases α, β, y γ – Rickettsia es una α-proteobacteria y Coxiella una γ-proteobacteria – Bacterias nitrificantes se encuentran en las clases α, β, y γ
  • 4. α-proteobacteria Clase Alphaproteobacteria: muy diversa. Se han secuenciado 71 genomas de esta clase •Bacterias púrpura no del azufre: fotosintéticos •Fija nitrógeno •Rickettsias: endoparásitos •Caulobacter e Hyphomicrobium: con estructura celulares •Agrobacterium y Rhizobium: Invaden plantas •Agente causante de Brucelosis (zoonosis: enfermedades animales que pueden ser transmitidas a humanos) bacteria o Orgánulos α-prote •Vesículas de gas •Metilotrofos Cy a no •Nitrobacter: nitrificantes ba cte ria Evolutivamente están próximas a las mitocondrias lo que sugiere que una α-proteobacteria fue el ancestro de las mitocondrias
  • 6. α-proteobacteria Bacterias púrpuras no del azufre -morfológicamente diversas -todas son α-proteobacterias excepto el género Rhodocyclus (β-proteobacteria) Rhodospirillum • metabólicamente flexible – en general crece anaeróbicamente como fotoorganoheterótrofo anoxigénico • tiene bacterioclorofila a o b en fotosistemas situados en membranas que son continuación de la membrana plasmática • algunos pueden emplear bajos niveles de H2S como fuente de electrones – en ausencia de luz, la mayoría crecen aeróbicamente como quimioorganotrofos – en ausencia de luz, algunos llevan a cabo fermentaciones y crecen anaeróbicamente Rhodospirillum • se encuentran en fangos, lagos y balsas con abundante materia orgánica y bajos niveles de azufre. Algunas especies son marinas • Los géneros más característicos son Rhodobacter, Rhodopseudomonas y Rhodospirillum • Durante años su aparato fotosintético ha sido un modelo del fostosistema II de plantas superiores
  • 7. α-proteobacteria Rickettsia y Coxiella • género Rickettsia – clase Alphaproteobacteria; orden Rickettsiales; familia Rickettsiaceae • género Coxiella – clase Gammaproteobacteria; orden Legionellales; familia Coxiellaceae • Son de distinta clase pero se estudian juntas porque tienen importantes similitudes •todas las especies son parásitas o mutualistas Coxiella burnetti creciendo en el interior de una vacuola de un -las especies parásitas crecen en los eritrocitos de fibroblasto vertebrados, macrófagos y las células del epitelio vascular •a menudo viven en artrópodos que se alimentan de sangre que actúan como vectores o como huéspedes primarios Ciclo de vida parásito Rickettsia Coxiella penetra en el huésped induciendo la fagocitosis penetra en el huésped induciendo la fagocitosis ↓ ↓ abandonan el fagosoma permanece en el fagosoma ↓ ↓ se reproducen en el citoplasma se reproducen en el fagolisosoma ↓ ↓ la célula huésped estalla la célula huésped estalla
  • 8. α-proteobacteria Rickettsia • Rickettsia prowazekii : Agente causante del tifus epidémico. Se transmite de persona a persona a través de los piojos (Pediculus humanus), que también mueren (por lo tanto no son reservorios). Si no se trata es mortal en el 40% de los casos. • Rickettsia typhi: Es el agente causante del tifus endémico. El reservorio más importante son las ratas. El vector es una pulga. Si no se trata es mortal en el 2% de los casos. rientia
  • 9. α-proteobacteria Las Caulobacteraceae e Hyphomicrobiaceae Hyphomicrobium • tienen como mínimo una de las siguientes 3 características – prosteca: extensión celular que incluye membrana plasmática y que es más estrecha que la célula madura – pedúnculo • apéndice no vivo producido por la célula y que se extiende desde ella – reproducción por gemación – Hyphomicrobium es metilotrofo – Caulobacter es un modelo de desarrollo celular Caulobacter Gemación y división de Caulobacter
  • 10. α-proteobacteria • ni estimula la formación de nódulos ni fija Género terrestre de vida libre que fija nitrógeno nitrógeno atmosférico de forma no • invaden la copa, las raíces y los tallos de simbiótica muchas plantas – transforma las células infectadas de la planta en tumores que proliferan Family Rhizobiaceae de forma autónoma • Ej.: Agrobacterium tumefaciens – penetra en muchas plantas de hoja ancha a través de lesiones y ocasiona tumoraciones en forma de agallas por medio del plásmido inductor de tumores (Ti). Muy empleado en biotecnología vegetal • bacilos móviles gram negativos – frecuentemente contienen gránulos de poli-β-hydroxybutyrate – en condiciones adversas se vuelven pleomorfos • crecen simbióticamente como bacteroides fijadores de nitrógenos entre nódulos de las raíces de las leguminosas
  • 11. α-proteobacteria Nitrificación • conversión de amonio en nitrato por la acción de dos géneros – e.g., Nitrosomonas – amonio a nitrito (Beta-proteobacteria) – e.g., Nitrobacter – nitrito a nitrato (Alpha- proteobacteria) • importancia del nitrato – fácilmente asimilable por las plantas – se pierde en el suelo por lixiviado y desnitrificación • son gram-negativos, aeróbicos, que no diferencian endosporas • las bacterias cuyo nombre comienza por “nitroso” oxidan el amonio a nitrito, las que comienzan por “nitro” oxidan nitrito a nitrato • se encuentran en varios taxa – clase Betaproteobacteria; familia Nitrosomonadaceae: ej. género Nitrosomonas (se encuentra en fangos, suelos, aguas dulces y saladas) y Nitrosospira (se encuentra en el suelo) – clase Alphaproteobacteria; family Bradyrhizobiaceae : ej., género Nitrobacter (se encuentra en suelos, aguas dulces y saladas) – clase Gammaproteobacteria • familia Ectothiorhodospiraceae – ej., género Nitrococcus (Marina) • Familia Chromatiaceae – ej. genus Nitrosococcus (Marina obligada)
  • 12. β-proteobacteria Clase Betaproteobacteria
  • 14. β-proteobacteria Genus Neisseria • Coccos gram negativos no móviles, se encuentran frecuentemente por parejas con la cara adyacente aplanada, pueden tener cápsulas y fimbrias • aerobios químiorganotrofos, oxidasa positivos y, en general, catalasa positivo • Habitan en las mucosas de los mamíferos – algunos son patógenos de humanos • Neisseria gonorrhoeae – gonorrea • Neisseria meningitidis - meningitis
  • 15. β-proteobacteria Burkholderia cepacia Burkholderia cepacia • degrada > 100 moléculas orgánicas – muy activos en el reciclaje de materia orgánica • patógeno de plantas • pude provocar enfermedades en pacientes hospitalizados – en particular es problemático en pacientes con fibrosis cística Género Bordetella • cocobacilo gram negativo – algunos tienen cápsula Bordetella pertussis • aerobios quimiorganotrofos – metabolismo respiratorio – requiere azufre orgánico y aminoácidos para crecer • parásitos de mamíferos que se multiplican en las células epiteliales respiratorias • e.g., Bordetella pertussis – no móvil y encapsulada – causa la Tos ferina
  • 16. β-proteobacteria Género Thiobacillus • se encuentra en el suelo y hábitats acuáticos – produce ácido sulfúrico que puede provocar corrosión del hormigón y estructuras metálicas – puede aumentar la fertilidad del suelo desprendiendo sulfato – se emplea en el lixiviado de metales en minas de baja calidad
  • 17. β-proteobacteria Género Thiobacillus En USA, El 11% de la producción anual de cobre es extraído de minas de baja calidad mediante lixiviado microbiano inducido por la bacteria Thiobacillus ferrooxidans. Las minas se irrigan con agua y la bacteria que crece en la superficie genera ácido sulfúrico que libera el cobre. El cobre liberado se concentra por electrolisis.
  • 18. γ-proteobacteria Clase Gammaproteobacteria Principales grupos de γ-proteobacterias •Es el grupo de bacterias más diverso •Se han secuenciado 133 genomas •Incluye importantes patógenos y numerosas especies de interés ambiental
  • 20. γ-proteobacteria Family Chromatiaceae • son las típicas bacterias púrpura del azufre (anaerobios estrictos) • frecuentemente fotolitoautótrofos – emplean H2S como donador de electrones (depositan gránulos de azufre internamente, eventualmente oxidan azufre a sulfato) – pueden emplear hidrógeno como donador de electrones • se encuentran frecuentemente en zonas anaerobias ricas en azufre de lagos – se pueden producir afloramientos en los pantanos y lagunas • ej., géneros Thiospirillum, Thiocapsa, and Chromatium
  • 21. γ-proteobacteria Orden Thiotrichales -contiene varios géneros de bacterias del azufre incoloras -los géneros mejor estudiados son Beggiatoa, Leucothrix and Thiothrix Leucothrix • aeróbicos químioorganotrofos que se dispersan formando gonidios Síntesis de zarcillos L. mucor Beggiatoa -es microaerófilo y forma filamentos sin vaina -metabolismo versátil – puede oxidar H2S a azufre (depositado en vesículas internas formadas por invaginaciones de la membrana plasmática) – puede crecer heterotróficamente con acetato como fuente de carbono – algunos son autótrofos – crecen en hábitat azufrados
  • 22. γ-proteobacteria Thiothrix • relacionado con Leucothrix • forman filamentos con vaina • quimiolitotrofos oxidan sulfuro de hidrógeno, depositan gránulos de azufre internamente, mixotrofos (combinan la autotrofía con la heterotrofía) ) • emplean fuentes de energía inorgánicas y fuentes orgánicas de carbono) • ciclo de vida similar a Leucothrix – los gonidios se desprenden del extremo abierto de una vaina • se encuentran en aguas ricas en azufre y sistemas de tratamiento de lodos residuales
  • 23. γ-proteobacteria Orden Methylococcales • morfológicamente diversos – ej., genus Methylococcus – esféricos, no móviles – e.g., genus Methylomonas – bacilos rectos curvados y ramificados con un solo flagelo polar) – casi todos tienen algún tipo de fase de reposo a menudo consiste en un cisto similar al de las azobaterias • Metilotrofos (emplean compuestos de un solo carbono como fuente de energía y poder reductor como el metano, metanol) Orden Pseudomonadales Los generos Pseudomonas y Azotobacter son los principales Importancia práctica de las pseudomonas • metabólicamente versátiles • Químioorganotrofos – degrada una gran variedad de moléculas orgánicas • fija nitrógeno en forma no – mineralización simbiótica • degradación microbiana de compuestos y • muy abundantes en suelos y materiales orgánicos a sustancias inorgánicas agua • importantes en investigación. Modelos experimentales • algunos son patógenos de plantas y animales • algunos causan el deterioro de comida refrigerada – pueden crecer a 4°C
  • 24. γ-proteobacteria • Tres ordenes de γ-proteobacteria contienen géneros muy importantes desde el punto de vista práctico, todos ellos tienen una sola familia: – Enterobacteriales – Vibrionales – Pasteureales Order Enterobacteriales • contiene 1 familia, Enterobacteriaceae; 41 géneros – conocidas como enterobacterias o bacterias entéricas • anaerobios facultativos • quimioorganotrofos que degradan azúcares mediante rutas glicolíticas – pueden degradar el piruvato a ácido fórmico (fermentación ácido fórmica)
  • 25. γ-proteobacteria Order Enterobacteriales • contiene 1 familia, Enterobacteriaceae; 41 géneros – conocidas como enterobacterias o bacterias entéricas • anaerobios facultativos • quimioorganotrofos que degradan azúcares mediante rutas glicolíticas – pueden degradar el piruvato a ácido fórmico (fermentación ácido fórmica)
  • 26. γ-proteobacteria Order Enterobacteriales Importantes bacterias entéricas patógenas • Salmonella – fiebres tifoideas (S. typhi) y grastroenteritis (S. typhimurium) • Shigella – disentería bacilar • Klebsiella – neumonía (K. pneumoniae) • Yersinia – Peste bubónica (Y. pestis) • Erwinia – Patógenos de plantas de cultivo, producen marchitamiento (E. amylovora, destruye manzanos y perales) Escherichia coli • probablemente la bacteria mejor estudiada • es un organismo modelo en investigación E. coli K12 y E. coli DH5α • vive en el tracto digestivo de los animales • se emplea como organismos indicador de contaminación fecal en agua • algunas cepas son patógenas – gastroenteritis E. coli O157:H7 (enterohemorrágica) – infecciones del tracto urinario E. coli CFT073
  • 27. γ-proteobacteria Order Enterobacteriales para la identificación en de géneros de enterobacterias se emplean llaves dicotómicas. • ONPG: β-Galactosidasa • VP: Voges-Proskauer son el fundamento de los métodos API 10 y API 20 También se identifican con medios selectivos y diferenciales
  • 28. γ-proteobacteria Agar verde brillante Lactose and Saccharose are the carbohydrates in the medium. Phenol Red is the pH indicator that turns the medium a yellow color with the formation of acid when lactose and/or sucrose is fermented. Sodium Chloride maintains the osmotic balance in the medium. Brilliant Green inhibits gram- positive bacteria and most gram- negative bacilli other than Salmonella spp. Lactose/sucrose fermenters are usually inhibited.11 Bacto Agar is the solidifying agent. MacConkey Es el medio primario selectivo y diferencial que se emplea mas a menudo; contiene violeta cristal para inhibir el crecimiento de cocos grampositivos y rojo neutro como indicador de pH, que le otorga propiedades diferenciales. Los bacilos gramnegativos crecen fácilmente ; los fermentadores de lactosa producen metabolismo ácidos que disminuyen el pH de medio próximo a la colonia. En esa zona el rojo neutro vira al rojo. Los no fermentadores de lactosa permanecen incoloros y translúcidos.
  • 29. γ-proteobacteria EMB Peptone is a source of nitrogen and other nutrients in the formulation. Eosin and methylene blue are dyes which combine to form a precipitate at an acid pH. The dyes act both as pH indicators and inhibitors. Gram-positive bacteria are partially inhibited on the medium. Lactose and Sucrose are fermentable carbohydrates. Phosphate acts as a buffer. Bacto Agar is a solidifying agent.
  • 30. γ-proteobacteria Order Vibrionales Vibrio fischeri • contiene 1 familia, Vibrionaceae; 6 géneros • bioluminiscente • la mayoría acuáticos – emisión de luz catalizada – de vida libre por la luciferasas – algunos son patógenos importantes – algunos son simbiontes en los órgano – también se observa en al luminiscentes de los peces menos dos especies de • muy relacionados con otros dos órdenes Photobacterium – Enterobacteriales and Pasteurellales • puede emplear AMP cíclico como fuente de C, N, and P Vibrio cholerae • de vida libre • causa el cólera • su genoma ha sido secuenciado – tiene dos cromosomas circulares Bioluminiscencia de V. fischeri – las copias de algunos genes están en ambos cromosomas
  • 31. γ-proteobacteria Order Pasteurellales • poco diversa pero contiene importantes patógenos • Pasteurella multilocida – Cólera aviar • Pasteurella haemolytica – neumonia en ganado vacuno, ovino y caprino • Haemophilus influenzae – diversas enfermedades incluida la meningitis infantil. Fue el primer organismo cuyo genoma fue secuenciado Haemophilus influenzae (Coloracion de Gram, hémocultivo) Haemophilus influenzae (En agar sangre)
  • 32. δ y ε-proteobacteria Clase Deltaproteobacteria Clase Epsilonproteobacteria • muy diversa • es la clase menos diversa de las – se divide en dos amplios grupos proteobacterias • Predadores quimiorganotrofos • un orden, Campylobacteriales; dos aerobicos familias, Campylobacteriaceae y • reductores de azufre y sulfato quimiorganotrofos anaeróbicos Helicobacteraceae
  • 33. ε-proteobacteria Campylobacter y Helicobacter son patógenos muy importantes Premio Nobel 2005, Barry J. Marshall and J. Robin Warren Campylobacter jejuni Intoxicaciones alimentarias a lo largo del año 1996 en USA
  • 34. δ-proteobacteria Stigmatella Myxococcus Myxococcus aurantiaca fulvus stipitatus Las mixobacterias (Stigmatella y Myxococcus) son un interesante grupo de bacterias deslizantes que forman cuerpos fructíferos en condiciones de carencia Margen de una colonia Mixobacterias agrupadas nutricional. de Mixobacterias en cuerpos fructiferos Mixobacterias agrupadas en cuerpos fructiferos Diferenciación progresiva en mixosporas
  • 35. δ-proteobacteria Bdellovibrio es la bacteria depredadora mejor caracterizada. Taladra la pared celular e invade el periplasma en el que se reproduce hasta lisar la bacteria.