Este documento presenta una propuesta para diseñar alternativas biológicas como humedales artificiales y biofiltros de flujo horizontal para el tratamiento de aguas residuales agrícolas y pecuarias en el Departamento del Cauca, Colombia. Se argumenta que estas tecnologías han demostrado ser efectivas para la remoción de contaminantes orgánicos y patógenos de las aguas residuales. Se propone realizar ensayos de estas alternativas biotecnológicas para el tratamiento de vertimientos del centro agropecuario SENA