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G. Antiñolo
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Genética y Genómica:
Nuestra herencia, Nuestro futuro
Guillermo Antiñolo
Unidad Clínica de Genética y Reproducción
Hospitales Universitarios Virgen del Rocío
Sevilla
G. Antiñolo
mar2k6
Nuestra herencia
Nuestro futuro
 Genética ¿el pasado?
 Genómica
 El Proyecto Genoma Humano
 Medicina Genómica
 Medicina Genómica, genética e
investigación
 Genómica y Sociedad
¿Por qué es importante el genoma?
 El genoma contiene toda la información
necesaria para todos los aspectos
relacionados con:
 Embriogénesis
 Desarrollo
 Crecimiento
 Metabolismo
 Reproducción
¿Cómo se organiza el genoma?
 Los genes, ADN, gracias a diversas
proteínas (estructurales y reguladoras)
están empaquetados formando los
cromosomas.
 Excepto durante la división celular, la
cromatina está homogéneamente
distribuida en el núcleo.
Genética vs Genómica
 Genética: estudio de los
genes y sus efectos (por
ejemplo CFTR y la Fibrosis
Quística)
 Genómica: estudio de
TODOS los genes del
genoma, incluyendo sus
interacciones con los
factores medio
ambientales.
Genética, ¿el pasado?
 Enfermedades causadas por la presencia o
ausencia de un cromosoma o región
cromosómica
 Enfermedades causadas por mutaciones de
un único gen
Carga Genética
 Enfermedades Monogénicas 3,6/1000
Autosómicas dominantes 1,4/1000
Autosómicas recesivas 1,7/1000
Ligadas al X 0,5/1000
 Anomalias cromosómicas 1,8/1000
 Enfermedades Multifactoriales 46,4/1000
 Anomalías congénitas 26,6/1000
 Otras 1,6/1000
El 8% de las personas es diagnosticado antes de los 25 años de
una enfermedad que tiene un componente genético
Enfermedad rara
 Es aquella enfermedad con una prevalencia de:
 1/1350 (National Institute of Health)
 1/2000 (Unión Europea)
 Entre las enfermedades denominadas raras, más del 80%
presenta una base genética.
 Prevalencia en R.N. vivos de EBG > 2%
 30-50% de los ingresos pediátricos
 Primera causa de mortalidad en Andalucía hasta los 14 años
 Afectan a la seguridad reproductiva
 5% de la carga de enfermedad en nuestra población
 Morbimortalidad perinatal, infantil y adulta
 Dificultad diagnóstica y retraso en el diagnóstico
 suponen una gran carga social y familiar
EFECTO DE LAS ENFERMEDADES DE
BASE GENÉTICA
 Esperanza de Vida.
 Calidad de Vida.
 Reproducción.
 Adaptación Individual, Familiar y Social.
Enfermedad con
Componente Genético
Localización del gen
Identificación del gen
Función
Diagnóstico
T
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Proyecto
Genoma
Humano
G. Antiñolo
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Diagnóstico Genético
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Medicina Molecular
Consejo
Genético
Diagnóstico
Prenatal
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Región 4p16.3
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Síndrome de Wolf-Hirschhorn
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Fibrosis Quística
 Desequilibrio iónico por alteración del transporte del ion cloro lo cual
provoca la formación de moco obstructivo en pulmones y páncreas y
elevadas concentraciones de cloro en las secreciones sudoríparas.
 Enfermedad de herencia autosómica recesiva.
 Gen responsable: CFTR (Cystic Fibrosis transmembrane regulator)
 Localización molecular: 7q31
 Alteración molecular: mutaciones en el gen CFTR
Análisis de las mutaciones mas
frecuentes en Fibrosis Quística
F508 G542X G551D
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Amniocentesis
G. Antiñolo
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DIAGNÓSTICO GENÉTICO
PREIMPLANTATORIO
Biopsia d +3
Fijación
núcleo
citoplasma
núcleo
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Verde - Cromosoma X
Acqua - Cromosoma 18
Verde – Cromosoma 13
Rojo – Cromosoma 21
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Blastocisto
Análisis de la expansión en Corea de
Huntington
Nº de repeticiones Edad de aparición de
síntomas
39 72-59
40 61-56
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Cáncer hereditario
¿Cual es mi riesgo de
desarrollar cáncer?
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Genetic Susceptibility is NOT Health Destiny
Genetics is
just one
piece of the
“puzzle”
Factores que afectan a la penetrancia
Genes
modificadores Carcinógenos
No todo el que tiene un gen alterado desarrolla cáncer
Respuesta al daño
del ADN
Otros
factores
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PROVISIÓN DE SERVICIOS DE SALUD
 Prevención primaria y secundaria en enfermedades de base genética
 Resultados e impacto de los servicios de genética en pacientes y familias
 Validez y utilidad clinica de los análisis genéticos
 Bases de datos de pacientes
 Integración de la genética médica en la práctica clínica
Life Science and Biotechnology - A strategy for Europe
Second Progress report and future orientations
(07/04/2004)
Priorities for future actions by Commission and Member States
• to engage in EU-wide co-ordination of efforts to ensure the
highest quality of genetic testing in the EU and beyond EU-25,
• to establish EU-wide networking of national centres for
exchanges of information regarding quality assurance of genetic
testing, including training activities, and EU-wide networking for
genetic testing of rare diseases.
QA IN GENETIC TESTING
Enfermedad con
Componente Genético
Localización del gen
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Terapia Génica
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Proyecto
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Investigación en
Genética
Entender la
enfermedad
Entender la respuesta
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Nuevas Terapias
Individualizar el
tratamiento
Enfermedades complejas o
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Identificación de
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involucrados en el
desarrollo y progresión
de enfermedades
complejas
Bases moleculares de
la neoplasia endocrina
múltiple y el cáncer
medular de tiroides
familiar
Identificación y caracterización
molecular de nuevos loci de
susceptibilidad para la enfermedad de
Hirschsprung y el cáncer medular de
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De la genética médica a la
medicina genómica
Genética y genómica: herramientas
disponibles
Databases
Databases
Técnicas de detección de
mutaciones: SSCP, análisis de
heterodúplex, dHPLC y
secuenciación
Genotipación de marcadores
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bioinformáticas
Análisis de SNPs mediante
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Banco DNA
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“Family history is very genomic”
--Sharon Kardia, Univ of Michigan
• Shared genes,
environments,
behaviors,and
their interactions
The Family History Public Health Initiative
http://www.cdc.gov/genomics/activities/famhx.htm
Perfil genético: preparados, listos, YA!!!
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ENFERMEDAD
METABOLOMA
PROTEOMA
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Consulta Médica
Datos del paciente seguros y confidenciales
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Personalizada
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Transcriptoma Metaboloma
Proteoma
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medicina genómica?
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(2020?) - Alzheimer Disease, for example
 5 or 6 genetic variations identified that strongly predispose for
Alzheimer disease; another 10 or 12 with weaker association
 Chip-based genetic test gives personal likelihood of developing the
condition
 Chip-based genetic test identifies the drug most likely to be
effective for given individual
 Chip-based genetic test determines individual likelihood of drug
side effects
medicina genómica?
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How Do Health Professionals Prepare for Genomic Medicine?
 Need to learn to “think genetically” - to:
 realize when genetic factors play a role
 effectively use family hx & genetic tests
 be able to explain genetics concepts
 deal with “risk” & genetic predisposition
 realize personal and societal impact of genetic
information
 protect genetic privacy
 use genetics to individualize patient care
 use genetics to preserve health
Misperceptions
 “Genomics isn’t relevant to me or the area of public health in
which I work”
Did you know that …
9 of the top 10 causes of death in the
U.S. have a genetic component?
Top 10 Causes of Death in the U.S. (2000)
 HEART DISEASE
 CANCER
 CEREBROVASCULAR DISEASE
 CHRONIC LOWER RESPIRATORY DISEASE
? ACCIDENTS/UNINTENTIONAL INJURIES
 DIABETES
 PNEUMONIA/INFLUENZA
 ALZHEIMER’S DISEASE
 KIDNEY DISEASE
 SEPTICEMIA
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Misperceptions
 “There are no interventions based on
genomics”
It’s true, we can’t change our genes.
BUT we can use this knowledge to …
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Potential Interventions
 Modify screening and medical
recommendations
 More Frequent Screenings
 Genetic Testing/Evaluation
 Interventions or Prevention
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Potential Interventions
 Target messages and
interventions aimed at changing
behaviors of high-risk groups
 Diet
 Physical Activity
 Smoking Cessation
 Alcohol Avoidance
 Others?
Aspectos éticos
 Equidad
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 Uso adecuado de la información genética
 Investigación biomédica
¿Cómo preparar a la sociedad en la
era de la genómica?
 Educación e información accesible con los objetivos de entender:
 La base científica de la genética
 La utilización de la genética en la práctica clínica
 Riesgo y predisposición
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“To wrest from nature the secrets
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they may be quicly avalaible for the
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(William Osler, Montreal Medical
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  • 2. Genética y Genómica: Nuestra herencia, Nuestro futuro Guillermo Antiñolo Unidad Clínica de Genética y Reproducción Hospitales Universitarios Virgen del Rocío Sevilla
  • 3. G. Antiñolo mar2k6 Nuestra herencia Nuestro futuro  Genética ¿el pasado?  Genómica  El Proyecto Genoma Humano  Medicina Genómica  Medicina Genómica, genética e investigación  Genómica y Sociedad
  • 4. ¿Por qué es importante el genoma?  El genoma contiene toda la información necesaria para todos los aspectos relacionados con:  Embriogénesis  Desarrollo  Crecimiento  Metabolismo  Reproducción
  • 5. ¿Cómo se organiza el genoma?  Los genes, ADN, gracias a diversas proteínas (estructurales y reguladoras) están empaquetados formando los cromosomas.  Excepto durante la división celular, la cromatina está homogéneamente distribuida en el núcleo.
  • 6. Genética vs Genómica  Genética: estudio de los genes y sus efectos (por ejemplo CFTR y la Fibrosis Quística)  Genómica: estudio de TODOS los genes del genoma, incluyendo sus interacciones con los factores medio ambientales.
  • 7. Genética, ¿el pasado?  Enfermedades causadas por la presencia o ausencia de un cromosoma o región cromosómica  Enfermedades causadas por mutaciones de un único gen
  • 8. Carga Genética  Enfermedades Monogénicas 3,6/1000 Autosómicas dominantes 1,4/1000 Autosómicas recesivas 1,7/1000 Ligadas al X 0,5/1000  Anomalias cromosómicas 1,8/1000  Enfermedades Multifactoriales 46,4/1000  Anomalías congénitas 26,6/1000  Otras 1,6/1000 El 8% de las personas es diagnosticado antes de los 25 años de una enfermedad que tiene un componente genético
  • 9. Enfermedad rara  Es aquella enfermedad con una prevalencia de:  1/1350 (National Institute of Health)  1/2000 (Unión Europea)  Entre las enfermedades denominadas raras, más del 80% presenta una base genética.
  • 10.  Prevalencia en R.N. vivos de EBG > 2%  30-50% de los ingresos pediátricos  Primera causa de mortalidad en Andalucía hasta los 14 años  Afectan a la seguridad reproductiva  5% de la carga de enfermedad en nuestra población  Morbimortalidad perinatal, infantil y adulta  Dificultad diagnóstica y retraso en el diagnóstico  suponen una gran carga social y familiar EFECTO DE LAS ENFERMEDADES DE BASE GENÉTICA  Esperanza de Vida.  Calidad de Vida.  Reproducción.  Adaptación Individual, Familiar y Social.
  • 11. Enfermedad con Componente Genético Localización del gen Identificación del gen Función Diagnóstico T i e m p o Proyecto Genoma Humano
  • 12. G. Antiñolo mar2k6 Diagnóstico Genético y Medicina Molecular Consejo Genético Diagnóstico Prenatal Diagnóstico Presintomático Tiempo
  • 13. Exon 1 Exon 12b Exon 25a 90 Kb 165 Kb WHSCR Región 4p16.3 cen Tel Síndrome de Wolf-Hirschhorn
  • 14. Síndrome de DiGeorge/VCFS 3’ TUPLE 1 D22S553 D22S609 D22S942 110 Kb N25 D22S75 CTP CLATHRI N LSI TUPLE 1 22q11.2 cen Tel
  • 15. Fibrosis Quística  Desequilibrio iónico por alteración del transporte del ion cloro lo cual provoca la formación de moco obstructivo en pulmones y páncreas y elevadas concentraciones de cloro en las secreciones sudoríparas.  Enfermedad de herencia autosómica recesiva.  Gen responsable: CFTR (Cystic Fibrosis transmembrane regulator)  Localización molecular: 7q31  Alteración molecular: mutaciones en el gen CFTR
  • 16. Análisis de las mutaciones mas frecuentes en Fibrosis Quística F508 G542X G551D R553X 1717-1G>A N1303K R117H 621+1G>T W1282X 1078 del T R334W R1162X A455E 3659 del C 3849+10kbC>T D1507 S1251N R347P D1152H E60X 2183AA>G 711+1G>T 1898+1G>A 3120+1G>A 2184delA G85E 2789+5G>A I148T R560T
  • 17.
  • 19. G. Antiñolo mar2k6 DIAGNÓSTICO GENÉTICO PREIMPLANTATORIO Biopsia d +3 Fijación núcleo citoplasma núcleo FISH Verde - Cromosoma X Acqua - Cromosoma 18 Verde – Cromosoma 13 Rojo – Cromosoma 21 Día +4 Blastocisto
  • 20. Análisis de la expansión en Corea de Huntington Nº de repeticiones Edad de aparición de síntomas 39 72-59 40 61-56 41 56-52 42 50-48 43 45-42 44 43-40 45 39-36 46 37-35 47 35-31 48 34-30 49 32-25 50 30-24
  • 21. Cáncer hereditario ¿Cual es mi riesgo de desarrollar cáncer?
  • 22. G. Antiñolo mar2k6 Genetic Susceptibility is NOT Health Destiny Genetics is just one piece of the “puzzle”
  • 23. Factores que afectan a la penetrancia Genes modificadores Carcinógenos No todo el que tiene un gen alterado desarrolla cáncer Respuesta al daño del ADN Otros factores
  • 25. PROVISIÓN DE SERVICIOS DE SALUD  Prevención primaria y secundaria en enfermedades de base genética  Resultados e impacto de los servicios de genética en pacientes y familias  Validez y utilidad clinica de los análisis genéticos  Bases de datos de pacientes  Integración de la genética médica en la práctica clínica
  • 26. Life Science and Biotechnology - A strategy for Europe Second Progress report and future orientations (07/04/2004) Priorities for future actions by Commission and Member States • to engage in EU-wide co-ordination of efforts to ensure the highest quality of genetic testing in the EU and beyond EU-25, • to establish EU-wide networking of national centres for exchanges of information regarding quality assurance of genetic testing, including training activities, and EU-wide networking for genetic testing of rare diseases. QA IN GENETIC TESTING
  • 27. Enfermedad con Componente Genético Localización del gen Identificación del gen Medicina Predictiva Función Diagnóstico Terapia Génica Farmacogenética Terapia Farmacológica T i e m p o Proyecto Genoma Humano
  • 28. G. Antiñolo mar2k6 Investigación en Genética Entender la enfermedad Entender la respuesta al tratamiento Nuevas Terapias Individualizar el tratamiento
  • 30. Identificación de factores genéticos involucrados en el desarrollo y progresión de enfermedades complejas Bases moleculares de la neoplasia endocrina múltiple y el cáncer medular de tiroides familiar Identificación y caracterización molecular de nuevos loci de susceptibilidad para la enfermedad de Hirschsprung y el cáncer medular de tiroides De la genética médica a la medicina genómica
  • 31. Genética y genómica: herramientas disponibles Databases Databases Técnicas de detección de mutaciones: SSCP, análisis de heterodúplex, dHPLC y secuenciación Genotipación de marcadores microsatélites Herramientas bioinformáticas Análisis de SNPs mediante genotipación espectral y minisecuenciación Banco DNA
  • 32. G. Antiñolo mar2k6 “Family history is very genomic” --Sharon Kardia, Univ of Michigan • Shared genes, environments, behaviors,and their interactions The Family History Public Health Initiative http://www.cdc.gov/genomics/activities/famhx.htm
  • 33. Perfil genético: preparados, listos, YA!!! Abra la boca y diga: ACGT
  • 35. G. Antiñolo mar2k6 Consulta Médica Datos del paciente seguros y confidenciales Medicina Personalizada • Diagnóstico individualizado • Prescripción mas eficaz • Mejores resultados en salud • Reducción de costes sanitarios Transcriptoma Metaboloma Proteoma Genoma Historia clínica Bioinformática Análisis y cruce de datos en tiempo real medicina genómica?
  • 36. G. Antiñolo mar2k6 (2020?) - Alzheimer Disease, for example  5 or 6 genetic variations identified that strongly predispose for Alzheimer disease; another 10 or 12 with weaker association  Chip-based genetic test gives personal likelihood of developing the condition  Chip-based genetic test identifies the drug most likely to be effective for given individual  Chip-based genetic test determines individual likelihood of drug side effects medicina genómica?
  • 37. G. Antiñolo mar2k6 How Do Health Professionals Prepare for Genomic Medicine?  Need to learn to “think genetically” - to:  realize when genetic factors play a role  effectively use family hx & genetic tests  be able to explain genetics concepts  deal with “risk” & genetic predisposition  realize personal and societal impact of genetic information  protect genetic privacy  use genetics to individualize patient care  use genetics to preserve health
  • 38. Misperceptions  “Genomics isn’t relevant to me or the area of public health in which I work” Did you know that … 9 of the top 10 causes of death in the U.S. have a genetic component?
  • 39. Top 10 Causes of Death in the U.S. (2000)  HEART DISEASE  CANCER  CEREBROVASCULAR DISEASE  CHRONIC LOWER RESPIRATORY DISEASE ? ACCIDENTS/UNINTENTIONAL INJURIES  DIABETES  PNEUMONIA/INFLUENZA  ALZHEIMER’S DISEASE  KIDNEY DISEASE  SEPTICEMIA
  • 40. G. Antiñolo mar2k6 Misperceptions  “There are no interventions based on genomics” It’s true, we can’t change our genes. BUT we can use this knowledge to …
  • 41. G. Antiñolo mar2k6 Potential Interventions  Modify screening and medical recommendations  More Frequent Screenings  Genetic Testing/Evaluation  Interventions or Prevention
  • 42. G. Antiñolo mar2k6 Potential Interventions  Target messages and interventions aimed at changing behaviors of high-risk groups  Diet  Physical Activity  Smoking Cessation  Alcohol Avoidance  Others?
  • 43. Aspectos éticos  Equidad  Confidencialidad  Uso adecuado de la información genética  Investigación biomédica
  • 44. ¿Cómo preparar a la sociedad en la era de la genómica?  Educación e información accesible con los objetivos de entender:  La base científica de la genética  La utilización de la genética en la práctica clínica  Riesgo y predisposición  Como afecta la información genética individualmente  El impacto de la genética en la sociedad
  • 45. G. Antiñolo mar2k6 La desinformación genética Elija el sexo de su hijo, de forma natural. Al menos el 50% de las veces acertamos.
  • 46. “To wrest from nature the secrets which have perplexed philosophers in all ages, to track to their sources the causes of diseases, to correlate the vast stores of knowledge, that they may be quicly avalaible for the prevention and cure of disease - these are our ambitions.” (William Osler, Montreal Medical Journal, 1902).