La época de los grandes reinos (1000-1450 d.C.) fue un periodo de transición en el que se desintegraron los Huari y los Incas expandieron su imperio. Hubo una mezcla de culturas regionales sin rupturas claras y fronteras inestables. La organización política varió entre reinos, señoríos y curacazgos en la sierra, mientras que en la costa hubo una organización más compleja a través de valles. Las artes como la alfarería, textiles y metalurgia florecieron de forma divergente.