La biotecnología ambiental se entiende como la aplicación de herramientas y métodos biotecnológicos a problemas ambientales. Combina biotecnología, con procesos como ingeniería genética, y ecología. Los reactores de tratamiento de aguas son abundantes pero ignorados por la biotecnología. Son sistemas biológicos abiertos con interacciones entre especies microbianas. El biotecnólogo debería aplicar principios ecológicos para identificar microorganismos y optimizar la degradación de