1. Año de la unidad, la paz y el desarrollo”
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
MONOGRAFÍA:
“USO Y CONTROL DE CROMATOGRAMAS DE ADN
UTILIZANDO EL SOFTWARE BIOEDIT”
Presentado por:
Aragón Arce, Nicole Lucia
Docente:
Dr. Soto Gonzáles, Herbert
Asignatura:
Biotecnología
Ciclo:
VII
Fecha:
03 de noviembre del 2023
ILO – PERÚ
2023
2. 1. INTRODUCCIÓN
En los últimos años la industria biotecnológica, así como los avances en
modelado molecular, la caracterización de enfermedades, el descubrimiento
farmacéutico, el cuidado de la salud clínica, la medicina forense y otras muchas
áreas biosanitarias, han demostrado un continuo desarrollo, avanzando a pasos
agigantados en un entorno global. Estos avances han impactado en la economía
global y en la sociedad, aunque no siempre ha sido así, ya que hasta hace pocos
años existían limitaciones en cuestiones de investigación y desarrollo. Sin
embargo, la llegada de nuevas tecnologías, como la aplicación de las ciencias
computacionales a la biología y la biotecnología, ha facilitado el rápido desarrollo
de este campo. Principalmente el desarrollo de la bioinformática, ha sido el factor
clave para estos avances.
Pues está se ha convertido en una disciplina imprescindible, ya que permite
descifrar y gestionar las enormes cantidades de datos generados a diario o que
ya se encuentran disponibles en el campo de la genética.
Debido a ello, existe la necesidad de suministrar y/o actualizar conocimientos en
bioinformática general, en este caso sobre el aprendizaje acerca del manejo
básico de distintos programas que permiten el análisis y secuenciación de ADN.
Para la realización de la práctica se hizo uso del paquete computacional Bioedit,
y de secuencias de material genético de especies de interés para cada
estudiante, así como el GenBank del NCBI. Se hizo uso de Bioedit utilizando
archivos guardados en formato FASTA, para su posterior identificación y mejor
análisis de la secuencia de la información del taxón.
2. OBJETIVO
Revisar y analizar las secuencias brindadas para revisar su calidad e
identificación más cercana, haciendo uso del software BIOEDIT.
3. MARCO TEÓRICO
3.1.Bioinformática
Es la investigación, el desarrollo o aplicación de herramientas
computacionales y enfoques informáticos para ampliar el uso de datos
médicos, de salud o de comportamiento biológico, incluidas las
competencias de adquirir, almacenar, organizar, archivar, analizar o
visualizar estos datos (Instituto Nacional de la Salud, 2000).
3.2.ADN
También conocido como ácido desoxirribonucleico y DNA, es la molécula
del interior de las células que contiene la información genética necesaria
para que las personas y la mayoría de organismos se desarrollen y
crezcan. Estas moléculas se transmiten de una generación a la siguiente.
El ADN está compuesto por dos cadenas que se enroscan formando una
estructura de doble hélice, como una escalera en espiral. Cada cadena
3. está formada por una cadena principal (esqueleto) compuesta por
moléculas de azúcar y fosfato que se unen a una de cuatro bases: la
adenina (A), la timina (T), la guanina (G) y la citosina (C). Las bases se
emparejan entre ellas (A con T y G con C) para formar enlaces químicos
que actúan como peldaños de una escalera. Estos peldaños mantienen
juntas las dos cadenas del ADN.
Figura 01. Estructura del ADN. Fuente NCBI
3.3.BIOEDIT
Bioedit es un programa gratuito para edición de alineamientos y análisis
de secuencias que funciona únicamente sobre ambiente MS/Windows. Es
uno de los programas más conocidos para edición de secuencias para
dicho sistema operativo. BioEdit cuenta con varias herramientas que van
desde la creación de alineamientos hasta la anotación de plásmidos. En
la ventana principal de BioEdit, el alineamiento de nuestras secuencias,
por defecto cada aminoácido es resaltado en un color diferente, este
esquema de colores puede ser cambiado en cualquier momento mediante
la utilización de las diferentes opciones en la barra de herramientas.
4. METODOLOGÍA
4.1.Materiales
BIOEDIT
NCBI
Microsoft Excel
Muestras de secuenciación para análisis
4. 4.2. Procedimiento
Descargamos las secuencias que nos brindó el docente.
Abrimos en BIOEDIT y cada archivo lo convertimos en formato FASTA.
El archivo FASTA lo abrimos con el bloc de notas y por filas eliminamos
las N que interfirieren en la identificación.
Esta nueva secuencia la insertamos en el NCBI – FASTA e
identificamos el organismo más cercano o igual a la serie.
Del mismo modo, en BIOEDIT revisamos la calidad de la secuencia.
5. RESULTADOS
EXCEL ANEXADO
AL AULA VIRTUAL
6. BIBLIOGRAFÍA
Menéndez Gutiérrez, E. y Rivas González, R. (junio, 2015)
BIOINFORMÁTICA PARA PRINCIPIANTES I: ANÁLISIS DE
SECUENCIAS NUCLEOTÍDICAS (DNA). EducaFarma, Departamento de
Microbiología y Genética de la Universidad de Salamanca.
Diccionario de Cáncer del NCI. (s. f.). Instituto Nacional del Cáncer.
Recuperado de:
https://www.cancer.gov/espanol/publicaciones/diccionarios/diccionario-
cancer/def/adn