Este documento presenta una revisión de plataformas con elementos de vigilancia epidemiológica. Se realizan observaciones generales sobre la estructura, edición, operatividad y accesibilidad de la plataforma HLB-FAO, así como sobre su potencial para el análisis, toma de decisiones y capacitación. También se analizan secciones específicas como el espacio público de libre acceso y el espacio privado restringido, con énfasis en la información, mapas, gráficas y capacitación. Finalmente, se
1. Revisión de Plataformas con
elementos de Vigilancia
Epidemiológica
COLEGIO DE POSTGRADUADOS
SINAVEF LAB
Gustavo Mora Aguilera
Gerardo Acevedo
Jorge Flores Sánchez
Santiago Domínguez
Texcoco Edo México.
01 jun 2013
Plataforma FAO CMS libre código cerrado
3. Temática de las observaciones
• Estructura
• Edición
• Operatividad
• Accesibilidad
• Crecimiento futuro
• Módulos educativos
Las observaciones a la plataforma de HLB-FAO se realizaron
bajo la siguiente temática:
Se realizaron capturas de imágenes y sobre ellos se imprimen los
comentarios respectivos con ejemplos de la propuesta
SCOPE(DGSV), FAOSTAT (FAO), INFIT (Grupo Interdisciplinario de
Investigación Fitosanitaria) y otras plataformas fitosanitarias de México.
Al inicio se realiza una serie de observaciones generales de la
plataforma.
4. Observaciones generales
1. La plataforma aun tiene un fuerte enfoque INFORMATIVO (el
que, como y donde esta el HLB). Creo que la meta es que
permita también el ANALISIS (mediante mapas y
modelos), toma de DECISIONES (mediante esquemas de
Planes de Acción) y CAPACITACION (cursos en línea y
presenciales). Creo que debemos asegurar que estos atributos
sean explícitos para el usuario.
2. Es una plataforma estática. Es decir, no es dinámica lo cual no
permite el flujo de archivos por múltiples usuarios autorizados.
Por la naturaleza de la plataforma y su alcance regional
creemos que se requiere un sistema centralizado en lo
operativo pero descentralizado en el flujo de información para
una actualización eficiente en la información. Consideramos
que se requiere una plataforma de la cual los usuarios se
apropien y opere como un red social informativa pero con el
respectivo filtrado técnico.
5. Observaciones generales
4. Debido al carácter estático aun no se definen distintos niveles de acceso
publico y privado. Nuestra experiencia con INFIT (Plataforma con fines de
investigación aun en desarrollo) estos niveles de acceso se deben definir
desde la fase de la planeación de la Plataforma con el fin de que se tenga una
estructura lógica de ‘embudo’ de lo general a lo específico (de lo público a lo
privado). La fase privada puede requerir subniveles de acceso:
• Nivel 1 ONPF (introduce datos de su país)
• Nivel 2 ORPF (valida datos subregionales i.e. OIRSA)
• Nivel 3 Panel de expertos (valida datos regionales, genera, valida y
modifica modelos epidemiológicos y de riesgo)
• Nivel 4 FAO (administra integralmente los recursos computacionales y
temáticos de la plataforma: fuentes, directorios, cursos, etc.).
5. Una de las fortalezas que podrá tener le Plataforma es el integrar insumos para
la toma de decisiones. Esto implica que los módulos capacitación en línea y de
administración de archivos deben ser robustos, simples y escalables.
6. La totalidad de los componentes temáticos de la plataforma aun no se definen:
normatividad, paneles expertos, directorios de ORPF, ONPF, expertos, etc.
(creo que una se deben definir algunos con base en el estatus actual del HLB)
7. PLATAFORMA HLB-FAO: ESPACIO PUBLICO
Pros: Diseño y Estructura
Simple
Facilita navegación
Este espacio
puede ser
destinado al
módulo de
ANALISIS
como se
propone con
SRI FAO:
productos
mapas y
gráficos
Este espacio
puede ser
destinado al
módulo de:
INFORMACION
productos: los
que se
muestran en
recuadro
Capacitación eventos
El nombre a definir con criterios
que eventualmente permita la
incorporación de otras plagas
reglamentadas de importancia
regional en citricos u otro cultivo
de interes regional (mas de un
país). P.e.
LatinPest;
StatusPest;
FAO@pest;
FAO@lert
FAO@epidem
FAOPEST
Logos Juntos
satura imagen
9. Espacio público: ¿QUÉ ES EL HLB?
Sobre este tema tenemos una Ficha Técnica que
elaboramos para Sanidad Vegetal. Creo que se puede
emplear. Tiene división temática como:
Descripción
Origen
Mecanismos de dispersión
Vector
Guía de síntomas
Variantes
Impactos económicos
Rango Hospederos
Condiciones favorable (clima, manejo, etc.)
Etc.
10. Programas y Proyectos
Debido a la integración de N-programas y
proyectos podría convenir un sistema de
búsqueda:
Por país
Por programa
Por tipo de programa
Por línea de investigación
En siguiente diapositiva se muestra ejemplo
INFIT
12. Se propone un sistema dinámico para subir y
descargar archivos (búsqueda) por temas:
•Histología
•Epidemiología
• Técnicas Moleculares
Etc.
Y por tipo de publicación:
Científica, divulgativas, manual, etc.
El criterio de búsqueda puede ser análogo al
ejemplificado en diapositiva previa
Biblioteca
13. Para este apartado se propone la incorporación
de un FORO de discusión o sistema vía chat de
conversación múltiple donde los expertos realicen
preguntas y/o respuestas sobre un tema
determinado. En plataforma INFIT se propone
como un BANNER…
Otra opción que puede ser externa al portal es
mediante GoToWebinar la cual tiene un costo.
Puntos focales y Panel de expertos
Foro
15. Los mapas es uno de los productos fundamentales de la plataforma:
Se proponen dos tipos de mapas:
a) Mapas Descriptivos
Mapas de presencia-ausencia de patógeno
Mapas de presencia-ausencia del vector
Mapas de presencia-ausencia del hospedante por especie citrícola
Restringido al publico
b) Mapas de Riesgo
Mapas de riesgo del ocurrencia y dispersión del patógeno
Mapas de riesgo de ocurrencia y dispersión del vector
16. A). Mapas descriptivos
Creo que este módulo se puede integrar a la sección de ANALISIS
de la información para generar mapas con opciones seleccionadas por el
Usuario a nivel: mundial, continental, regional y país, municipal. Se buscaría no tener
Dos áreas generadora de mapas dentro del Portal.
17. Ejemplos de mapas descriptivos: 1. INEGI
Uno de los elementos de la propuesta de INEGI (Mexico)
es la visualización por capas temáticas
Los temas pueden ser:
El vector
Patógeno
Hospedante
Laboratorios de cría org. biológico
Centros de germoplasma
Centros de investigación cítricos
ORPF
ONPF
OIPF
18. Uno de los elementos de la propuesta de SINAVEF (México) es la visualización interactiva de
mapas a nivel estatal y municipal. Esta planeado para múltiples plagas. Para este tipo de mapa
podemos tener apoyo de SINAVEF México. Contacto Rigoberto González
Ejemplos de mapas descriptivos: Mapa multimedia
Nuestras categorías podrían ser:
con a) países en escenario 1, 2 y 3.
b) La infraestructura de
diagnóstico, manejo, operación
c) Notar aquí las claves de acceso
lo cual puede ser para subir
información de datos nuevos
19. Acceso al sistema a
diferentes niveles (Ver
INFIT). Esto lo
podemos aplicar para
mapas de riesgo no
para los descriptivos
Plataforma SCOPE (DGSV)
Ejemplos de mapas descriptivos: SCOPE
Aquí se
define el
nivel
espacial
de interés:
país, estad
o y
municipio.
20. Ejemplos de mapas descriptivos: SIAFESON
Notar la información por predio
22. Los gráficos temporales es otro de los productos fundamentales de la plataforma:
Se proponen dos tipos de gráficos:
a) Gráficos Descriptivos
Gráficos de barras de incidencia países HLB
Gráficos de barras de incidencia países Vector
Gráficos de barras de incidencia municipios HLB
Gráficos de barras de incidencia municipios vector
Gráficos de hospedante por especie citricola
b) Gráficos Analíticos se genera parámetros Yf, ABCPE, 1/b Weibull
Gráficos de líneas y-incidencia vs. x-tiempo
Gráficos de Area Bajo la Curva por país, municipio, parcela
Con acceso restringido a ONPF y ORPF
Gráficos simulativos Monte Carlo de incidencia municipios/estado
Gráficos simulativos Monte Carlo de incidencia predios/mpio
Gráficos simulativos Monte Carlo de incidencia arboles/enfermos
23. Nota: Esta opción es
la que hemos tenido
en mente para
generar reportes
específicos a las
necesidades del
usuario.
Observar que existe
un menú de
selección y un
resumen de
resultados, lo cual
pudiera adaptarse a
plataforma HLB con
las variables que
incluyo en recuadro
Plataforma FAOSTAT
(FAO)
Variable:
Incidencia
Severidad
Producción total
Superficie total
Rendimiento
Cultivo:
Naranja
Limón mexicano
Limón italiano
Mandarina
Toronja
otros
FAOSTAT Modelo: base de datos para aplicar modelos epidémicos
Pais:
Brasil
Argentina
Uruguay
Paraguay
Chile
Etc.
Estado:
San Paulo
Parana
Bahia
Etc.
Mpio:
Aracuara
Rio Claro
Etc.
Pais:
Brasil
Argentina
Uruguay
Paraguay
Chile
Etc.
A) Gráficos descriptivos
24. Menú
selección lo
podemos
indicar por
subregión, p
aís, año
Resultados en formato
Gráfico de Barras.
Notar que se pude
incluir mas de una
variable por grafica. Pe
incidencia de HLB y
vector (dos Y’s)
Resultados en
formato
matricial
(excelente
para análisis)
Plataforma FAOSTAT
(FAO)
Esperaríamos algo similar en
plataforma HLB, donde p.e. se pueda
seleccionar parámetros de epidemias
de HLB que sean graficados o
arrojados en formato matricial para
análisis regional, etc.
A) Gráficos descriptivos
25. Ejemplo de Gráficos Incidencia y Severidad variables HLB
Tecomán, Colima.
10 Huertos muestreados
Distancia aproximada del
muestreo 45 km
28.2 %
Incidencia
0
50
100
150
200
Enfermos Sanos
No.Árboles
Incidencia en muestreo de 10 Huertos
Árboles Incidencia
0
50
100
150
200
0% 25% 50% 75% 100%
No.Árboles
% Severidad
Severidad en muestreo de 10 Huertos 238 árboles muestreados
67 enfermos
27. Ejemplo de NIVELES DE ACCESO: La Plataforma INFIT (Grupo Interdisciplinario de Investigación
Fitosanitaria, Coordinador Dr. Gustavo Mora), se planeo con 5 niveles de acceso:
1. Público General (vista principal, libre acceso); 2. Sector Oficial y Privado; 3. Investigadores; 4. Estudiantes; 5. Administrador
Organizació
n
Producto
s
Servicios Cursos Eventos Sitios relacionados
ORGANIZACIÓN
-- Proyectos
-- Líneas de Invest.
-- Directorio expertos
-- Perfil Investigador
- Etc.
PRODUCTOS
-- Publicaciones
-- Artículos
-- Presentaciones
-- Vídeos y fotos
SERVICIOS
-- Asesorías
-- Tesistas y Serv.
Social
-- Capacitación
-Etc.
EVENTOS
-- Nacionales
-- Internacionales
Documentos Trabajo Encuestas Publicaciones y
Cápsulas
Sitios
Relacionados
DOCUMENTOS
-- Formatos campo o lab
-- Manuales
-- Protocolos
-- Presentaciones
-- Capacitación
ENCUESTAS
-- Generales
-- Específicas
PUBLICACIONES Y
CAPSULAS
--Cápsulas
Epidemiológicas
-- Publicaciones
-- Mapas
Publicaciones y
Cápsulas
Administración Logística Investigación Publicaciones Imágenes y
Videos
Sector oficial
y privado
Software
ADMINISTRACIÓN
-- Formatos
-- Instructivos
-- Convenios
LOGÍSTICA
-- Foro
-- Agenda
-- Directorio completo
INVESTIGACIÓN
-- Informes de Avances
-- Protocolo de Invest.
-- Formatos de campo
-- Matrices de datos
-- Presentaciones
-- Encuesta general
IMÁGENES Y VIDEOS
-- Mapas en desarrollo
-- Mapas finales
-- Fotografías
-- Videos
SECTOR OFICIAL Y
PRIV.
-- Capacitaciones
-- Encuestas Generales
--Encuestas específicas
-- Manuales
-- Presentaciones
-- Protocolos
-- Formatos
-- Instructivos
-- Foro
INVEST.
EPIDEMIOLÓGICAS
-- Cápsulas
-- Publicaciones
Software
SOFTWARE
-- Programas simulacion
-- Otros programas
a
a
PUBLICACIONES
-- Publicaciones INFIT-
Científicas
-- Publicaciones INFIT-
Divulgación
-- Acervo bibliográfico
28. Espacio Restringido a ORPF y ONPF: hoja 2
Cursos
• Detección y Evaluación de la
enfermedad
•Detección y medición poblacional del vector
• Epidemiología del HLB
• Control Biológico del HLB
• Métodos de georeferenciación y transferencia
real de datos de campo
• Métodos Espaciales de localización y dispersión
del HLB
• Métodos de evaluación y estimación de
pérdidas productivas por HLB
Entrenamientos
• Análisis molecular de tejido vegetal
• Análisis molecular de insectos
• Uso del GPRS
Protocolos y Manuales
• Protocolos Campo Muestreo de
Enfermedad
• Protocolo de Campo Muestreo
de Diaphorina citri
• Protocolo de detección
síntomas
• Protocolo Laboratorio
Detección de Candidatus en
Planta
• Protocolo laboratorio
•Detección de Candidatus en
Vector
• Manual Operativo de Campana
contra el HLB México
29. Capacitación
La opción de Capacitación debe contener aspectos más dinámicos en cuanto a E-
learnig y presenciales. La opción Moodle es actualmente muy usada para
programar sistemas de capacitación en línea.
Se propone dos niveles de acceso para:
a) Instructores
b) Estudientes
Se proponen módulos para compartir archivos en dos vías:
a) Instructor-Capacitado
b) Capacitado-Instructor
Se propone en el nivel Instructor la creación de Exámenes o pruebas de opción
múltiple seleccionables. Moodle permite esto con facilidad.
Se propone la posibilidad de foros de discusión y videoconferencia
Un ejemplo con algunos de los elementos mencionados en sig. diapositiva
30. Capacitación
En plataforma INFIT se proponen 2 niveles
Instructor: Con capacidad de subir cursos, temáticas, material del curso
(publicaciones, revistas, etc), actividades relativas al curso, dar de alta
cursos, etc.
Estudiantes: Visita y descarga material del curso y una opción de subir
archivos como ensayos, prácticas, avances, publicaciones, etc.
A continuación se muestra ejemplo de formato Dar Alta cursos y Subir
Archivos.
31. Capacitación
Tanto Subir archivos como dar de alta cursos se realizan por el Autor del
curso y el nombre del curso ubicando la ruta de subida del archivo
33. Ejemplos: Caso 1. Morelos
Problema: muy
dependiente de un
equipo tecnico y requiere
recursos para pagos de
analistas. Centralizado.
Dificultad: Obtener datos
de campo. No hay una red
de técnicos
34. Notar. Imágenes de mapas por
periodos y secuenciados. Ver esta
y siguiente diapositiva. O sea es
estático con análisis externo a la
plataforma.
35.
36. SISTEMA DE ALERTA FITOSANITARIA DEL ESTADO DE GUANAJUATO
Ejemplos: Caso 2. Guanajuato
Problema: muy
dependiente de un
equipo tecnico y requiere
recursos para pagos de
analistas. Centralizado.
Ventaja: tiene red de
técnicos CESG
38. LOS ESTUDIOS DE RIESGO DE
PLAGAS Y ENFERMEDADES
MUESTRAN UN ANALISIS DE
BASES DE DATOS DE CLIMA
HISTORICOS. Modelos
climáticos
39. EL MAPA MUESTRA UN ANALISIS CON EL PROGRAMA SIMPEC DE DATOS HISTORICOS DE
TEMPERATURA LOS CUALES SE MANDAN COMO shape PARA ArcView (puede cualquier
sistema GIS como Qgis que es formato libre)
Mapa de Riesgo
para un insecto
Plaga de Maiz
40. EL MONITOREO FITOSANITARIO SE REALIZA CALCULANDO HORAS
CONTINUAS DE CONDICIONES ESPECIFICAS CON DATOS DE CLIMA
POR HORA
Caso Hongo antracnosis – frijol
Notar: selección por usuario
de la localidad y fecha
41. LA GRAFICA SEMANAL MUESTRA LAS HORAS CONTINUAS CON
RIESGO PARA CADA DIA DE LA SEMANA. Modelo climático
Grafica temporal de riesgo:
Caso Hongo antracnosis - frijol
42. Ejemplos: Caso 3. Sonora
Problema: muy
dependiente de un
equipo técnico y requiere
recursos para pagos de
analistas. Centralizado.
Ventaja: tiene red de
técnicos CESV
Problema: Fuerte énfasis
en modelos climáticos.
Mapas descriptivos
43. Sección privada con
pronósticos en nuestro caso
Notar graficas y mapas
descriptivas de
detecciones. Esta parte seria
publica
44. Sección privada con
pronósticos en nuestro caso.
Modelo climático. En nuestro
caso pude ser agroclimático
para los 3 escenarios HLB
45. Sección privada con pronósticos
en nuestro caso. Modelo
climático. Notar que no es un
mapa interpolado. Muestra sitios
puntuales para una periodo de
tiempo especifico
46. Mapa Índice Multivariado (Factor 1 y 2) de Colima con predios citrícolas SIAP. GIIIC, 2011 No Publicado
Mapa basado en algoritmo multivariado
Propuesta G Mora Sinavef Lab
HLB estado de Colima Mex.
50. Herramientas que ayudan al usuario a buscar
información.
Estas herramientas con dinamicas.
Herramientas de consulta
51. Formularios de consulta de las diferentes Herramientas
Algunas plataformas tienen elementos
de biblioteca, esta plataforma
desfragmento la biblioteca en
diferentes elementos
52. Formularios de consulta de las diferentes Herramientas
Herramientas de apoyo para el
usuario, mediante las cuales puede
localizar en donde se encuentra el
recurso humano y la infraestructura
necesaria
53. Esquema Epidemiológico para tener una perspectiva del HLB
Muestra un breve resumen de los
elementos que hacen referencia al
problema del HLB y su análisis.
54. Eventos y Noticias
Estas herramientas son administradas por diferentes usuarios, es decir cada usuario
puede cargar un evento o noticia.
Estas herramientas muestran los últimos eventos que a registrado algún usuario, cuando
el evento o noticia caduca. el sistema ya no lo muestra.
55. Sistema de Seguridad de la Plataforma
Esta plataforma cuenta con 3 niveles de seguridad, cada nivel muestra
información diferente, solo en lagunas aplicaciones.
Este elementos es privado y solo los
usuarios registrados podrán ver los
elementos internos.