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BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR
    UNIDAD NO. 1. INTRODUCCIÓN AL ESTUDIO DE LA BIOLOGÍA CELULAR Y
             MOLECULAR. BASES MOLECULARES DE LA VIDA.



               TEMA 5: Otras biomoléculas de
                  importancia biológica.
Regulación enzimática. Concepto. Tipos.
•   Inducción y represión.
•   Modificación alostérica.
•   Modificación covalente.
•   Otros tipos de regulación: proteólisis e isomerización.
Cofactores enzimáticos.
•   Generalidades.
•   Ejemplos
REGULACIÓN
Se da en sistemas o procesos
Capaz de variar su comportamiento en respuesta a
los cambios del entorno
La respuesta puede ser directa o indirecta
La respuesta tiende a modificar el estimulo
volviendo a la situación inicial.




                          Cap. 17: Págs. 299-300
COMPONENTES DE UN SISTEMA DE
                    REGULACIÓN
                                   Aumento de
                  SEÑAL           c(sust. Específ)


              ESTÍMULO
                                                                Modifica estímulo
                                                                     inicial
             RECEPTOR
                                             Convierte
                                         estímulo en señal
          TRANSDUCTOR                         interna



      Amplificador                    Efector                Respuesta
       Aumento intensidad
           de señal              Una o varias enzimas

Existe un patrón estructural o funcional en los organismos que tiende a mantenerse
estable frente a los cambios que se operan en el entorno. El sistema de regulación está
encaminado a mantener ese patrón estructural o funcional.
MECANISMOS DE REGULACIÓN
          ENZIMÁTICA

• Mecanismos que modifican la cantidad de
  enzimas:
   Inducción.
   Represión.

• Mecanismos que modifican la actividad
  enzimática:
   Modificación alostérica.
   Modificación covalente.
MECANISMOS QUE MODIFICAN LA
             [ENZIMAS]
• Inducción: la presencia de una sustancia en la
  célula puede activar el proceso de síntesis de la
  enzima y por tanto aumentar su cantidad.

• Represión: el estímulo determina la disminución
  de la síntesis enzimática por lo cual la cantidad
  de enzima disminuye.
Ambos son mecanismos lentos porque implican síntesis o degradación de
  enzimas involucradas y en ellos se da respuesta a una señal química
                             (metabolito)
MECANISMOS QUE MODIFICAN LA ACTIVIDAD DE LAS
                ENZIMAS

  MODIFICACIÓN ALOSTÉRICA

Mecanismo por el cual una sustancia denominada
efector alostérico se une a la enzima en un lugar llamado
sitio alostérico, mediante interacciones débiles y provoca
cambios conformacionales, que modifican la velocidad
de la reacción.
El modelo simétrico o concertado fue elaborado en 1965 por
Jacques Monod, Jeffries Wyrnan y Jean-Pierre Changeux del
Instituto Pasteur de París, fue el primer modelo propuesto en
términos moleculares y el más sencillo.
Propone que las enzimas están formadas por varias subunidades
(estructura cuaternaria) y todas se encuentran en el mismo estado
conformacional (simetría).


                        La        regulación
                        alostérica         se
                        fundamenta en la
                        existencia de dos
                        conformaciones de
                        la            enzima
                        oligomérica,    cada
                        una con actividad
                        diferente: una forma
                        activa o relajada (R)
                        y una forma inactiva
                        o tensa (T).
El modelo se nombra como concertado porque se transita
de un estado conformacional hacia otro, trasmitiéndose a
las otras subunidades haciendo que todas ellas adopten
la misma conformación.
El paso de una forma a la otra se produce por la unión, al
sitio alostérico, de un efector.

Los efectores son sustancias del propio metabolismo
celular.




        R                                  T

Ambas formas se encuentran en equilibrio
MODELO SIMÉTRICO O CONCERTADO
 Supongamos que tenemos:

 Enzima (E)           Sustrato (S)     Ligando A (A)          Ligando B (B)
                                     (estado R activo)      (estado T inactivo)

                                                            T           ENZIMA EN
SI       A    B          ENTONCES
                                            R
                                                R               T       EQUILIBRIO


                                                    R               T
                                                                            MAYOR
SI            S        ENTONCES                         R               T     V

                                                        S
SI
                                                    R               T
                                                                            MUCHA
     S            A              ENTONCES               R               T   MAYOR
                                                                              V
                                                    SA
 LOS COMPLEJOS RA, RS, RAS VAN A AUMENTAR LA V DE REACCIÓN
MODELO SIMÉTRICO O CONCERTADO
Supongamos que tenemos:

Enzima (E)    Sustrato (S)     Ligando A (A)       Ligando B (B)
                             (estado R activo)   (estado T inactivo)

LAS   UNIONES   R+A,  RA+S,  RS+A VAN A INCREMENTAR
CONSIDERABLEMENTE LA VELOCIDAD AL SER A UN ACTIVADOR
ALOSTÉRICO (EFECTO POSITIVO)
                                 R       T
EN CAMBIO SI:                      R       T

                                                        B
                                        R               T
                                                                MUCHA
AÑADIMOS           B      ENTONCES          R               T   MENOR
                                                                  V
EL LIGANDO B POSEE CONFORMACIÓN T, POR LO QUE SE DESPLAZA
EL EQUILIBRIO HACIA EL AUMENTO DE LA CONFORMACIÓN T EN LA
ENZIMA, Y AL SER ESTA INACTIVA, LA VELOCIDAD DE REACCIÓN
DISMINUYE
MODELO SECUENCIAL

Propone que:

• Existen dos conformaciones (R y T) posibles para
cada subunidad de la enzima.

• La unión del sustrato cambia la conformación de la
subunidad a la que se une, pero no altera de forma
apreciable la del resto de las subunidades.

• La transformación que ocurra en esa subunidad
puede determinar si la velocidad va a aumentar o
disminuir porque influye en la afinidad por el sustrato
del resto de las unidades (la incrementa o disminuye).
La curva que se obtiene de [S] vs velocidad
 es en forma sigmoidal (forma de S alargada).




Curvas de velocidad de una de las reacciones la síntesis de pirimidinas. La
Aspartato transcarbamoilasa (ATCasa) cataliza la formación de N-
carbamoilaspartato de carbamoil fosfato y ácido aspártico
CARACTERÍSTICAS DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS
 • Son proteínas oligoméricas de elevado peso
   molecular.
 • Existen en varios estados conformacionales
   interconvertibles y con afinidad diferente para cada
   uno de sus ligandos.
 • Los ligandos se unen a la enzima en sitios
   específicos por fuerzas no covalentes y de forma
   reversible, afectando el estado conformacional de
   las enzimas.
 • Los cambios conformacionales en una subunidad se
   comunican en mayor o menor grado al resto de las
   subunidades.
EJEMPLO DE REGULACIÓN
               ALOSTÉRICA
La pareja que con mayor frecuencia cumple estas funciones es la
formada por el ATP y el ADP, sus concentraciones relativas controlan
un gran número de actividades enzimáticas.
          Formación de ATP:
          ADP + Pi          ATP + H2O

          Formación de ADP:
          ATP + H2O         ADP + Pi
Al aumentar las concentraciones de ATP disminuyen las de ADP y
viceversa.

Ej: En la fosfofructoquinasa el ATP es un efector negativo (inhibidor) y
el ADP es positivo (activador), como las concentraciones de ambos
no pueden aumentar simultáneamente, en cada momento la enzima
sólo estará expuesta a elevadas concentraciones de uno de ellos y así
será su respuesta.
MODIFICACIÓN COVALENTE
Es el mecanismo mediante el cual la unión por enlace
covalente de un grupo químico a la enzima, le provoca
un cambio conformacional que produce una variación
de la velocidad de reacción.


Los tipos mis difundidos de modificación covalente son:

Fosforilación – desfosforilación (P),

Adenilación - desadenilación (AMP grupo adenilato); y

Intercambio de sulfihidrilos (SH) – disulfuros (SS).
Fosforilación-Desfosforilación
Ciertos residuos de serina, treonina o tirosina de la
proteína enzimática pueden ser fosforilados por
determinadas quinasas.
                   ATP             ADP


             OH          Quinasa           O-(P)


                         Fosfatasa

                   Pi                H2O


 La forma activa puede ser la fosforilada o la no
 fosforilada en dependencia de la enzima.
                  Cap. 17: Págs. 306-309 y 311
CARACTERÍSTICAS DE LA
   MODIFICACIÓN COVALENTE

• Se modifica la composición de la
  enzima, que conduce a un cambio
  conformacional        secundario y
  modificación de la actividad.

• Menor rapidez que la modificación
  alostérica.
OTROS MECANISMOS DE REGULACIÓN
           Proteólisis parcial (por hidrólisis)
(se sintetizan enzimas inactivas y se activan por ruptura de enlace peptídicos)
                  H2O
                                                             +
                            Enzima
                          proteolítica

      Zimógeno                           Enzima activa
    (precursor inactivo
       de la enzima)
 Es una variedad de modificación covalente (por la ruptura de
 enlaces peptídicos), aunque no posee carácter irreversible.
 Este tipo de regulación está presente en varias enzimas digestivas
 (Ej: quimotripsina, que participa en la proteólisis de proteínas y
 tiene como precursor el quimotripsinógeno enzimáticamente
 inactivo).
OTROS MECANISMOS DE REGULACIÓN
                           Isoenzimas
Isoenzimas: son formas diferentes de una misma enzima que se diferencian
en sus propiedades cinéticas y químicas y hacen que las reacciones que ellas
catalizan presenten características diferentes.

 LDH: está presente en todos los tejidos y en ellos cataliza la misma
 reacción (conversión de ácido láctico a ácido pirúvico y viceversa)
 presente, por ejemplo, en el metabolismo anaerobio de la glucosa con el fin
 de obtener energía en células musculares esqueléticas.


Enzima
tetramérica
                HHHH          HHHM           HHMM            HMMM          MMMM


                                           ISOENZIMAS
 Formada por la combinación de dos tipos de cadenas diferentes: las designadas H
 del miocardio (con afinidad por el lactato) y las M del músculo estriado esquelético
 (poseen afinidad por el piruvato).
COFACTORES
Sustancias de carácter no proteico y
bajo peso molecular; son moléculas o
iones imprescindibles para la acción
catalítica de muchas enzimas.
FORMAS DE ACTUACIÓN DE LOS
         COFACTORES
• Contribuyen a la unión entre la enzima
  y el sustrato.
• Estabilizan  la   enzima     en    su
  conformación más activa.
• Constituyen frecuentemente parte del
  grupo catalítico principal.
• Son transportadores intraenzimáticos
  o interenzimáticos en la reacción
  catalizada.     Cap. 19: Págs. 334-335
TIPOS DE COFACTORES

   INORGÁNICOS                            ORGÁNICOS




         Iones
                                     Grupos Prostéticos
    (Mg2+ Zn2+ Ca2+
                                      Coenzimas (Vit B)
      Fe2+ Mn2+ K+
 Ej: en la catalasa el grupo prostético hemo se une al Fe para darle
actividad a la enzima que posee función protectora contra peróxidos.

   APOENZIMA + COFACTOR = HOLOENZIMA (ENZIMA ACTIVA)
β Mercaptoetilamina   Ácido pantoténico



                                      3’ Fosfoadenosín difosfato


                                  Cap. 19: Págs. 343-344
                       Coenzima A
Nicotinamida




      Nicotinamín adenín dinucleótido (NAD+

Cap. 19: Págs. 335-337
Riboflavina




Flavín adenín dinucleótido (FAD)


              Cap. 19: Págs. 337-338
Enlaces anhidridos de ácidos




                   Adenosín trifosfato (ATP)

                        Cap. 19: Págs. 347-348
CONCLUSIONES
•   Las enzimas aceleran la velocidad de las reacciones disminuyendo
    la energía de activación y su mecanismo básico de acción consta
    de dos etapas, la de unión y la de transformación.
•   La estructura tridimensional del centro activo y sus componentes
    determinan la especificidad de sustrato y de acción de las
    enzimas.
• Existen factores que influyen en la velocidad de la reacción
  enzimática, modificando la estructura de la enzima y en particular
  de su centro activo, aspecto de gran importancia en la práctica
  médica.
• Las formas básicas de regulación enzimática se manifiestan por
    variación en la cantidad, ya sea por inducción o represión y por
    variación en su actividad, como la regulación alostérica y
    covalente.
TAREA EVALUATIVA INDIVIDUAL
Explique porqué se realiza la determinación de
los niveles de enzimas séricas como la LDH
para detectar casos de infarto agudo del
miocardio.

 ENTREGAR:
 POR ESCRITO

 FECHA DE ENTREGA:
VIERNES 12/10/2012

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Regulación enzimática

  • 1. BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR UNIDAD NO. 1. INTRODUCCIÓN AL ESTUDIO DE LA BIOLOGÍA CELULAR Y MOLECULAR. BASES MOLECULARES DE LA VIDA. TEMA 5: Otras biomoléculas de importancia biológica. Regulación enzimática. Concepto. Tipos. • Inducción y represión. • Modificación alostérica. • Modificación covalente. • Otros tipos de regulación: proteólisis e isomerización. Cofactores enzimáticos. • Generalidades. • Ejemplos
  • 2. REGULACIÓN Se da en sistemas o procesos Capaz de variar su comportamiento en respuesta a los cambios del entorno La respuesta puede ser directa o indirecta La respuesta tiende a modificar el estimulo volviendo a la situación inicial. Cap. 17: Págs. 299-300
  • 3. COMPONENTES DE UN SISTEMA DE REGULACIÓN Aumento de SEÑAL c(sust. Específ) ESTÍMULO Modifica estímulo inicial RECEPTOR Convierte estímulo en señal TRANSDUCTOR interna Amplificador Efector Respuesta Aumento intensidad de señal Una o varias enzimas Existe un patrón estructural o funcional en los organismos que tiende a mantenerse estable frente a los cambios que se operan en el entorno. El sistema de regulación está encaminado a mantener ese patrón estructural o funcional.
  • 4. MECANISMOS DE REGULACIÓN ENZIMÁTICA • Mecanismos que modifican la cantidad de enzimas:  Inducción.  Represión. • Mecanismos que modifican la actividad enzimática:  Modificación alostérica.  Modificación covalente.
  • 5. MECANISMOS QUE MODIFICAN LA [ENZIMAS] • Inducción: la presencia de una sustancia en la célula puede activar el proceso de síntesis de la enzima y por tanto aumentar su cantidad. • Represión: el estímulo determina la disminución de la síntesis enzimática por lo cual la cantidad de enzima disminuye. Ambos son mecanismos lentos porque implican síntesis o degradación de enzimas involucradas y en ellos se da respuesta a una señal química (metabolito)
  • 6. MECANISMOS QUE MODIFICAN LA ACTIVIDAD DE LAS ENZIMAS MODIFICACIÓN ALOSTÉRICA Mecanismo por el cual una sustancia denominada efector alostérico se une a la enzima en un lugar llamado sitio alostérico, mediante interacciones débiles y provoca cambios conformacionales, que modifican la velocidad de la reacción.
  • 7. El modelo simétrico o concertado fue elaborado en 1965 por Jacques Monod, Jeffries Wyrnan y Jean-Pierre Changeux del Instituto Pasteur de París, fue el primer modelo propuesto en términos moleculares y el más sencillo. Propone que las enzimas están formadas por varias subunidades (estructura cuaternaria) y todas se encuentran en el mismo estado conformacional (simetría). La regulación alostérica se fundamenta en la existencia de dos conformaciones de la enzima oligomérica, cada una con actividad diferente: una forma activa o relajada (R) y una forma inactiva o tensa (T).
  • 8. El modelo se nombra como concertado porque se transita de un estado conformacional hacia otro, trasmitiéndose a las otras subunidades haciendo que todas ellas adopten la misma conformación. El paso de una forma a la otra se produce por la unión, al sitio alostérico, de un efector. Los efectores son sustancias del propio metabolismo celular. R T Ambas formas se encuentran en equilibrio
  • 9. MODELO SIMÉTRICO O CONCERTADO Supongamos que tenemos: Enzima (E) Sustrato (S) Ligando A (A) Ligando B (B) (estado R activo) (estado T inactivo) T ENZIMA EN SI A B ENTONCES R R T EQUILIBRIO R T MAYOR SI S ENTONCES R T V S SI R T MUCHA S A ENTONCES R T MAYOR V SA LOS COMPLEJOS RA, RS, RAS VAN A AUMENTAR LA V DE REACCIÓN
  • 10. MODELO SIMÉTRICO O CONCERTADO Supongamos que tenemos: Enzima (E) Sustrato (S) Ligando A (A) Ligando B (B) (estado R activo) (estado T inactivo) LAS UNIONES R+A, RA+S, RS+A VAN A INCREMENTAR CONSIDERABLEMENTE LA VELOCIDAD AL SER A UN ACTIVADOR ALOSTÉRICO (EFECTO POSITIVO) R T EN CAMBIO SI: R T B R T MUCHA AÑADIMOS B ENTONCES R T MENOR V EL LIGANDO B POSEE CONFORMACIÓN T, POR LO QUE SE DESPLAZA EL EQUILIBRIO HACIA EL AUMENTO DE LA CONFORMACIÓN T EN LA ENZIMA, Y AL SER ESTA INACTIVA, LA VELOCIDAD DE REACCIÓN DISMINUYE
  • 11. MODELO SECUENCIAL Propone que: • Existen dos conformaciones (R y T) posibles para cada subunidad de la enzima. • La unión del sustrato cambia la conformación de la subunidad a la que se une, pero no altera de forma apreciable la del resto de las subunidades. • La transformación que ocurra en esa subunidad puede determinar si la velocidad va a aumentar o disminuir porque influye en la afinidad por el sustrato del resto de las unidades (la incrementa o disminuye).
  • 12. La curva que se obtiene de [S] vs velocidad es en forma sigmoidal (forma de S alargada). Curvas de velocidad de una de las reacciones la síntesis de pirimidinas. La Aspartato transcarbamoilasa (ATCasa) cataliza la formación de N- carbamoilaspartato de carbamoil fosfato y ácido aspártico
  • 13. CARACTERÍSTICAS DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS • Son proteínas oligoméricas de elevado peso molecular. • Existen en varios estados conformacionales interconvertibles y con afinidad diferente para cada uno de sus ligandos. • Los ligandos se unen a la enzima en sitios específicos por fuerzas no covalentes y de forma reversible, afectando el estado conformacional de las enzimas. • Los cambios conformacionales en una subunidad se comunican en mayor o menor grado al resto de las subunidades.
  • 14. EJEMPLO DE REGULACIÓN ALOSTÉRICA La pareja que con mayor frecuencia cumple estas funciones es la formada por el ATP y el ADP, sus concentraciones relativas controlan un gran número de actividades enzimáticas. Formación de ATP: ADP + Pi ATP + H2O Formación de ADP: ATP + H2O ADP + Pi Al aumentar las concentraciones de ATP disminuyen las de ADP y viceversa. Ej: En la fosfofructoquinasa el ATP es un efector negativo (inhibidor) y el ADP es positivo (activador), como las concentraciones de ambos no pueden aumentar simultáneamente, en cada momento la enzima sólo estará expuesta a elevadas concentraciones de uno de ellos y así será su respuesta.
  • 15. MODIFICACIÓN COVALENTE Es el mecanismo mediante el cual la unión por enlace covalente de un grupo químico a la enzima, le provoca un cambio conformacional que produce una variación de la velocidad de reacción. Los tipos mis difundidos de modificación covalente son: Fosforilación – desfosforilación (P), Adenilación - desadenilación (AMP grupo adenilato); y Intercambio de sulfihidrilos (SH) – disulfuros (SS).
  • 16. Fosforilación-Desfosforilación Ciertos residuos de serina, treonina o tirosina de la proteína enzimática pueden ser fosforilados por determinadas quinasas. ATP ADP OH Quinasa O-(P) Fosfatasa Pi H2O La forma activa puede ser la fosforilada o la no fosforilada en dependencia de la enzima. Cap. 17: Págs. 306-309 y 311
  • 17. CARACTERÍSTICAS DE LA MODIFICACIÓN COVALENTE • Se modifica la composición de la enzima, que conduce a un cambio conformacional secundario y modificación de la actividad. • Menor rapidez que la modificación alostérica.
  • 18. OTROS MECANISMOS DE REGULACIÓN Proteólisis parcial (por hidrólisis) (se sintetizan enzimas inactivas y se activan por ruptura de enlace peptídicos) H2O + Enzima proteolítica Zimógeno Enzima activa (precursor inactivo de la enzima) Es una variedad de modificación covalente (por la ruptura de enlaces peptídicos), aunque no posee carácter irreversible. Este tipo de regulación está presente en varias enzimas digestivas (Ej: quimotripsina, que participa en la proteólisis de proteínas y tiene como precursor el quimotripsinógeno enzimáticamente inactivo).
  • 19. OTROS MECANISMOS DE REGULACIÓN Isoenzimas Isoenzimas: son formas diferentes de una misma enzima que se diferencian en sus propiedades cinéticas y químicas y hacen que las reacciones que ellas catalizan presenten características diferentes. LDH: está presente en todos los tejidos y en ellos cataliza la misma reacción (conversión de ácido láctico a ácido pirúvico y viceversa) presente, por ejemplo, en el metabolismo anaerobio de la glucosa con el fin de obtener energía en células musculares esqueléticas. Enzima tetramérica HHHH HHHM HHMM HMMM MMMM ISOENZIMAS Formada por la combinación de dos tipos de cadenas diferentes: las designadas H del miocardio (con afinidad por el lactato) y las M del músculo estriado esquelético (poseen afinidad por el piruvato).
  • 20. COFACTORES Sustancias de carácter no proteico y bajo peso molecular; son moléculas o iones imprescindibles para la acción catalítica de muchas enzimas.
  • 21. FORMAS DE ACTUACIÓN DE LOS COFACTORES • Contribuyen a la unión entre la enzima y el sustrato. • Estabilizan la enzima en su conformación más activa. • Constituyen frecuentemente parte del grupo catalítico principal. • Son transportadores intraenzimáticos o interenzimáticos en la reacción catalizada. Cap. 19: Págs. 334-335
  • 22. TIPOS DE COFACTORES INORGÁNICOS ORGÁNICOS  Iones Grupos Prostéticos (Mg2+ Zn2+ Ca2+ Coenzimas (Vit B) Fe2+ Mn2+ K+ Ej: en la catalasa el grupo prostético hemo se une al Fe para darle actividad a la enzima que posee función protectora contra peróxidos. APOENZIMA + COFACTOR = HOLOENZIMA (ENZIMA ACTIVA)
  • 23. β Mercaptoetilamina Ácido pantoténico 3’ Fosfoadenosín difosfato Cap. 19: Págs. 343-344 Coenzima A
  • 24. Nicotinamida Nicotinamín adenín dinucleótido (NAD+ Cap. 19: Págs. 335-337
  • 25. Riboflavina Flavín adenín dinucleótido (FAD) Cap. 19: Págs. 337-338
  • 26. Enlaces anhidridos de ácidos Adenosín trifosfato (ATP) Cap. 19: Págs. 347-348
  • 27. CONCLUSIONES • Las enzimas aceleran la velocidad de las reacciones disminuyendo la energía de activación y su mecanismo básico de acción consta de dos etapas, la de unión y la de transformación. • La estructura tridimensional del centro activo y sus componentes determinan la especificidad de sustrato y de acción de las enzimas. • Existen factores que influyen en la velocidad de la reacción enzimática, modificando la estructura de la enzima y en particular de su centro activo, aspecto de gran importancia en la práctica médica. • Las formas básicas de regulación enzimática se manifiestan por variación en la cantidad, ya sea por inducción o represión y por variación en su actividad, como la regulación alostérica y covalente.
  • 28. TAREA EVALUATIVA INDIVIDUAL Explique porqué se realiza la determinación de los niveles de enzimas séricas como la LDH para detectar casos de infarto agudo del miocardio.  ENTREGAR: POR ESCRITO  FECHA DE ENTREGA: VIERNES 12/10/2012