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Gestión de Datos Científicos
Taller sobre Gestión de la Información en
Observatorios / Proyectos / Redes
6 de Marzo de 2015
DATOS
OPEN DATA Gobierno Abierto
DATOS Tercer Sector + Ciudadano
ABIERTOS Periodismo de Datos
Openness → Open Science
Open Access + Open Data + Open Source
+ Innovación + Colaboración
Big Data: Volumen, Velocidad, Variedad y
Veracidad
Explotación de Datos y Descubrimiento del Conocimiento
(Data Mining & Knowledge Discovery)
→ hechos, observaciones o experiencias (basado argumento, teoría o prueba)
→ pueden ser numéricos, descriptivos o visuales.
→ pueden ser en estado bruto o analizado,
→ pueden ser experimentales u observacionales.
→ pueden ser abiertos o cerrados
¿Qué son los datos de investigación?¿Qué son los datos de investigación?
Los datos incluyen: cuadernos de laboratorio, cuadernos de campo, datos de
investigación primaria (incluidos los datos en papel o en soporte informático),
cuestionarios, cintas de audio, videos, desarrollo de modelos, fotografías,
películas, y las comprobaciones y las respuestas de la prueba.
Las colecciones datos para la investigación pueden incluir diapositivas; diseños
y muestras.
En la información sobre la procedencia de los datos también se podría incluir:
el cómo, cuándo, donde se recogió y con que (por ejemplo, instrumentos). El
código de software utilizado para generar, comentar o analizar los datos
también pueden ser considerados datos.”
¿Qué son los datos de investigación?¿Qué son los datos de investigación?
● Observacionales: datos capturados en tiempo real, comúnmente únicos e irremplazables
Ej: imágenes cerebrales, encuestas
● Experimentales: datos provenientes de resultados experimentales
Ej: Aquellos que provienen de aparatos de medición en laboratorios, comúnmente
reproducibles, pero caros.
● Simulación: datos generados de modelos de prueba donde el modelo y los metadatos pueden
ser mas importantes que los datos de salida del modelo.
Ej: Modelos económicos o climáticos.
● Desarrollados o compilados: resultado de procesar y/o combinar datos “crudos”,
comúnmente reproducibles pero caros.
Ej. Bases de datos compiladas,Resultados de text mining, Datos de censos consolidados.
● Reference or canonical: Una (estática u orgánica) conglomeración o colección de datasets
mas pequeños (revisados por pares), la mayor parte de ellos publicados y “curados”
Ej. Bancos de datos genéticos, bases de datos cristalográficas.
¿Qué son los datos de investigación?
Construcción de datos
científicos: tipos
● Es una colección de datos reunidos durante la ejecución de un
proyecto de investigación.
● Son objetos digitales compuestos y heterogéneos.
● Constituye la base de la investigación y va asociado a una
publicación científica (resultado de la investigación).
● Se almacena y gestiona en Repositorios Interoperables conforme a
estándares internacionales.
Es el objeto específico de
control, organización,
descripción y preservación
de datos científicos
DATASET
BENEFICIOS #DatosAbiertos
● Ayuda a verificar los resultados.
● Evitar la fabricación y falsificación de datos.
● Diferentes interpretaciones o enfoques aplicados
a datos existentes contribuyen a los avances
científicos.
● Optimización en el uso de recursos.
● Preservación a largo plazo bien gestionada,
permite mantener la integridad de los datos.
TenopirC, Allard S, Douglass K, AydinogluAU, et al. (2011) Data Sharing by Scientists: Practices and
Perceptions. PLoSONE 6(6): e21101. doi:10.1371/journal.pone.0021101
http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0021101
Una gestión adecuada de los datos requiere
al menos los siguientes aspectos:
● Políticas a nivel de agencias de financiación e institucionales.
Definición de roles/responsabilidades de los distintos actores.
● Recursos financieros a largo plazo ya que los datos son
acumulativos y se preservan.
● Recursos humanos especializados (para generación de datos,
normalización, explotación y preservación).
● Infraestructuras coordinadas para garantizar su
interoperabilidad. Entre los requisitos de las infraestructuras
destacar: preservación, acceso, data curation, data processing,
distribución.
Para dar respuesta a estos aspectos es necesaria una
formación adecuada, equipamientos, sistemas de
almacenamiento masivo de datos y redes de alta capacidad.
Los investigadores pueden ser reacios a compartir sus datos
públicamente debido a los costos individuales reales y / o percibidos.
Mayor resistencia: Cambio Cultural
ACTORES IMPLICADOS
- Investigadores / productores de datos
- Universidades y Centros de Investigación
- Repositorios Institucionales (corto-mediano plazo)
- Centro de Datos (largo plazo)
- Gestores de datos
- Usuarios que reutilizan los datos
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Tercer sector / Sociedad Civil
Científico de Datos:
nuevos conocimientos y competencias
Data Scientist
Antecedentes Políticas en las
Agencias de Financiamiento
●
Estados Unidos: National Science Foundation (NSF), National
Aeronautics and Space Administration (NASA), National Oceanographic Data
Center (NODC) y National Institutes of Health (NIH).
● Europa: Horizon2020
●
Reino Unido: AHRC, BBSRC, Cancer Research UK, EPSRC,
ESRC, MRC, NERC, STFC, WellcomeTrust.
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Regional: OCDE
● Argentina:
– Iniciativas Nacionales de Datos
http://sistemasnacionales.mincyt.gob.ar/
– Ley Nacional 26.899. Datos primarios en 5 años
disponibles. Excepciones
Líneas de Trabajo
● Plan de Gestión de Datos / Data Management Plan (DMP)
● e-Infraestructuras
Plan de Gestión de Datos (DMP)
● Referencia y nombre del set de
datos
● Descripción del set de datos
● Estándares y metadatos
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(incluyendo almacenamiento y copias de
seguridad)
● Formatos
● Metadatos
● Identificador digital de datos
● Marco legal relacionado con la
gestión y divulgación de datos de
investigación
– Acceso y datos
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– Depósito de los datos
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● Preservación
Horizon2020 (UE) FECYT (España)
e-Infraestructura
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Documentación compartida de Modelos de Datos y
Metadatos
● Directorio de Fuentes de Productor de Datos
●
Repositorio Interoperable de Datos
– Datos Públicos Argentina (CKAN, OKF), Zenodo (Invenio, CERN)
– DRYAD, PLICSS, LAGOS (DSpace, MIT & HP), Harvard
DATAVERSE (Eprints)
●
Plataforma de Trabajo para Investigadores
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●
Cluster de Almacenamiento y/o Procesamiento
Propuestas del
● Marco de verificación de calidad de metadata e infraestructura de datos
primarios científicos.
● Puesta en común de e-infraestructuras y experiencia en software.
Desarrollar e implementar e-infraestructura y plataformas de trabajo para
investigadores adaptada a las necesidades de la institución.
● Talleres de intercambio con los productores de datos.
– Conocer las características y los ciclos de vida de colecciones de datos
específicas.
– Puesta en común de e-infraestructuras y experiencia en software.
– Identificar necesidades y competencias a desarrollar o fortalecer.
● Formación en las necesidades y competencias detectadas durante los
Talleres de intercambio
● Apoyar a instituciones productoras de datos en el desarrollo de un Plan de
Gestión de Datos (DMP). Determinar políticas adecuadas para su gestión.
¿Preguntas, Dudas o Consultas?
Muchas Gracias
Equipo CAICYT-CONICET:
Mela Bosch, Diego Ferreyra, Fernando Ariel López y Mirna Prieto

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Gestión de Datos Científicos

  • 1. Gestión de Datos Científicos Taller sobre Gestión de la Información en Observatorios / Proyectos / Redes 6 de Marzo de 2015
  • 2. DATOS OPEN DATA Gobierno Abierto DATOS Tercer Sector + Ciudadano ABIERTOS Periodismo de Datos
  • 3. Openness → Open Science Open Access + Open Data + Open Source + Innovación + Colaboración
  • 4. Big Data: Volumen, Velocidad, Variedad y Veracidad Explotación de Datos y Descubrimiento del Conocimiento (Data Mining & Knowledge Discovery)
  • 5. → hechos, observaciones o experiencias (basado argumento, teoría o prueba) → pueden ser numéricos, descriptivos o visuales. → pueden ser en estado bruto o analizado, → pueden ser experimentales u observacionales. → pueden ser abiertos o cerrados ¿Qué son los datos de investigación?¿Qué son los datos de investigación?
  • 6. Los datos incluyen: cuadernos de laboratorio, cuadernos de campo, datos de investigación primaria (incluidos los datos en papel o en soporte informático), cuestionarios, cintas de audio, videos, desarrollo de modelos, fotografías, películas, y las comprobaciones y las respuestas de la prueba. Las colecciones datos para la investigación pueden incluir diapositivas; diseños y muestras. En la información sobre la procedencia de los datos también se podría incluir: el cómo, cuándo, donde se recogió y con que (por ejemplo, instrumentos). El código de software utilizado para generar, comentar o analizar los datos también pueden ser considerados datos.” ¿Qué son los datos de investigación?¿Qué son los datos de investigación?
  • 7. ● Observacionales: datos capturados en tiempo real, comúnmente únicos e irremplazables Ej: imágenes cerebrales, encuestas ● Experimentales: datos provenientes de resultados experimentales Ej: Aquellos que provienen de aparatos de medición en laboratorios, comúnmente reproducibles, pero caros. ● Simulación: datos generados de modelos de prueba donde el modelo y los metadatos pueden ser mas importantes que los datos de salida del modelo. Ej: Modelos económicos o climáticos. ● Desarrollados o compilados: resultado de procesar y/o combinar datos “crudos”, comúnmente reproducibles pero caros. Ej. Bases de datos compiladas,Resultados de text mining, Datos de censos consolidados. ● Reference or canonical: Una (estática u orgánica) conglomeración o colección de datasets mas pequeños (revisados por pares), la mayor parte de ellos publicados y “curados” Ej. Bancos de datos genéticos, bases de datos cristalográficas. ¿Qué son los datos de investigación? Construcción de datos científicos: tipos
  • 8. ● Es una colección de datos reunidos durante la ejecución de un proyecto de investigación. ● Son objetos digitales compuestos y heterogéneos. ● Constituye la base de la investigación y va asociado a una publicación científica (resultado de la investigación). ● Se almacena y gestiona en Repositorios Interoperables conforme a estándares internacionales. Es el objeto específico de control, organización, descripción y preservación de datos científicos DATASET
  • 9. BENEFICIOS #DatosAbiertos ● Ayuda a verificar los resultados. ● Evitar la fabricación y falsificación de datos. ● Diferentes interpretaciones o enfoques aplicados a datos existentes contribuyen a los avances científicos. ● Optimización en el uso de recursos. ● Preservación a largo plazo bien gestionada, permite mantener la integridad de los datos. TenopirC, Allard S, Douglass K, AydinogluAU, et al. (2011) Data Sharing by Scientists: Practices and Perceptions. PLoSONE 6(6): e21101. doi:10.1371/journal.pone.0021101 http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0021101
  • 10. Una gestión adecuada de los datos requiere al menos los siguientes aspectos: ● Políticas a nivel de agencias de financiación e institucionales. Definición de roles/responsabilidades de los distintos actores. ● Recursos financieros a largo plazo ya que los datos son acumulativos y se preservan. ● Recursos humanos especializados (para generación de datos, normalización, explotación y preservación). ● Infraestructuras coordinadas para garantizar su interoperabilidad. Entre los requisitos de las infraestructuras destacar: preservación, acceso, data curation, data processing, distribución. Para dar respuesta a estos aspectos es necesaria una formación adecuada, equipamientos, sistemas de almacenamiento masivo de datos y redes de alta capacidad.
  • 11. Los investigadores pueden ser reacios a compartir sus datos públicamente debido a los costos individuales reales y / o percibidos. Mayor resistencia: Cambio Cultural
  • 12. ACTORES IMPLICADOS - Investigadores / productores de datos - Universidades y Centros de Investigación - Repositorios Institucionales (corto-mediano plazo) - Centro de Datos (largo plazo) - Gestores de datos - Usuarios que reutilizan los datos - Agencias de financiación Tercer sector / Sociedad Civil
  • 13. Científico de Datos: nuevos conocimientos y competencias
  • 15. Antecedentes Políticas en las Agencias de Financiamiento ● Estados Unidos: National Science Foundation (NSF), National Aeronautics and Space Administration (NASA), National Oceanographic Data Center (NODC) y National Institutes of Health (NIH). ● Europa: Horizon2020 ● Reino Unido: AHRC, BBSRC, Cancer Research UK, EPSRC, ESRC, MRC, NERC, STFC, WellcomeTrust. ● Regional: OCDE ● Argentina: – Iniciativas Nacionales de Datos http://sistemasnacionales.mincyt.gob.ar/ – Ley Nacional 26.899. Datos primarios en 5 años disponibles. Excepciones
  • 16. Líneas de Trabajo ● Plan de Gestión de Datos / Data Management Plan (DMP) ● e-Infraestructuras
  • 17. Plan de Gestión de Datos (DMP) ● Referencia y nombre del set de datos ● Descripción del set de datos ● Estándares y metadatos ● Datos compartidos ● Archivo y preservación (incluyendo almacenamiento y copias de seguridad) ● Formatos ● Metadatos ● Identificador digital de datos ● Marco legal relacionado con la gestión y divulgación de datos de investigación – Acceso y datos – Privacidad y confidencialidad – Propiedad Intelectual y datos – Depósito de los datos – Licencias alternativas copyright ● Preservación Horizon2020 (UE) FECYT (España)
  • 18. e-Infraestructura ● Documentación compartida de Modelos de Datos y Metadatos ● Directorio de Fuentes de Productor de Datos ● Repositorio Interoperable de Datos – Datos Públicos Argentina (CKAN, OKF), Zenodo (Invenio, CERN) – DRYAD, PLICSS, LAGOS (DSpace, MIT & HP), Harvard DATAVERSE (Eprints) ● Plataforma de Trabajo para Investigadores – HubZero ( – MyExperiment.org ● Cluster de Almacenamiento y/o Procesamiento
  • 19. Propuestas del ● Marco de verificación de calidad de metadata e infraestructura de datos primarios científicos. ● Puesta en común de e-infraestructuras y experiencia en software. Desarrollar e implementar e-infraestructura y plataformas de trabajo para investigadores adaptada a las necesidades de la institución. ● Talleres de intercambio con los productores de datos. – Conocer las características y los ciclos de vida de colecciones de datos específicas. – Puesta en común de e-infraestructuras y experiencia en software. – Identificar necesidades y competencias a desarrollar o fortalecer. ● Formación en las necesidades y competencias detectadas durante los Talleres de intercambio ● Apoyar a instituciones productoras de datos en el desarrollo de un Plan de Gestión de Datos (DMP). Determinar políticas adecuadas para su gestión.
  • 20. ¿Preguntas, Dudas o Consultas? Muchas Gracias Equipo CAICYT-CONICET: Mela Bosch, Diego Ferreyra, Fernando Ariel López y Mirna Prieto