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REPLICATION OF
MITOCHONDRIAL DNA
OCCURS BY STRAND
DISPLACEMENT WITH
ALTERNATIVE LIGHT-STRAND
ORIGINS, NOT VIA STRAND-
COUPLED MECHANISM
Thimothy A. Brown, Ciro Cecconi, Ariana N.
Tkachuk, Carlos Bustamante y David A. Clayton

                      Cornaglia Schaffer, Mayra
Estudios nuevos propusieron un modelo
 de replicación bidireccional en tejidos




      Puso en duda el modelo de
    replicación por desplazamiento



    Objetivo: demostrar lo contrario
COMPARACIÓN ENTRE AMBOS
MODELOS PROPUESTOS
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   Re-examinan el modelo de replicación
    mitocondrial en mamíferos, contradiciendo toda
    evidencia previa.
¿QUÉ DETECTARON?

   Usando electroforesis bidimensional de agarosa,
    se encontraron con y-arcs entre las dos
    secuencias de origen, concluyendo que era
    inconsistente con el modelo asimétrico.
¿CÓMO JUSTIFICAN?


 Atribuyen   resultados anteriores a errores
 experimentales, que llevan a la
 degradación preferencial de la cadena
 retrasada por un contaminante en las
 muestras con actividad RNasa.
Estudios      Electroforesis 2D
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                 -Microscopía de
                 Fuerza Atómica
Estrategia            (AFM)
                -Electroforesis 2D




                 -Sólo se evidencia la
                    replicación por
Resultado          desplazamiento
s             -Se reveló la presencia de
             orígenes alternativos de la
                  cadena liviana (L)
AFM (ATOMIC FORCE MICROSCOPE)



                  Instrumento mecánico
                   óptico que permite el
                   mapeo topográfico de una
                   muestra, con altísima
                   resolución (del orden de los
                   nanometros)
PROTOCOLO DE PREPARACIÓN DE
    MUESTRAS PARA SU REVELADO
    POR AFM

   Con el objetivo de mejorar la visibilidad
    de los segmentos de DNA de simple
    cadena al microscopio, se propuso incubar
    las muestras con SSBp.
   El protocolo demostró ser funcional en
    muestras de M13 (B).
   Se aplicó entonces el mismo protocolo a
    las muestras de mtDNA (C).
   Se demostró además que el protocolo no
    afecta a la correcta interpretación de los
    resultados.
VISUALIZACIÓN DIRECTA DEL
     MTDNA POR AFM
INTERMEDIARIOS REPLICATIVOS
 DEL MTDNA




Azul: hebra parental
Rojo: ssDNA + SSB
Celeste: cadena H
naciente
Verde: cadena L
naciente
LONGITUDES PERCEPTIBLES DE
LAS REGIONES DESPLAZADAS DE
EXP-D Y GPC
POSIBLES ORÍGENES DE LA
CADENA LIVIANA




                    Azul: hebra parental
                    Rojo: ssDNA + SSB
                    Celeste: cadena H
                    naciente
                    Verde: cadena L
                    naciente
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Paper genética

  • 1. REPLICATION OF MITOCHONDRIAL DNA OCCURS BY STRAND DISPLACEMENT WITH ALTERNATIVE LIGHT-STRAND ORIGINS, NOT VIA STRAND- COUPLED MECHANISM Thimothy A. Brown, Ciro Cecconi, Ariana N. Tkachuk, Carlos Bustamante y David A. Clayton Cornaglia Schaffer, Mayra
  • 2. Estudios nuevos propusieron un modelo de replicación bidireccional en tejidos Puso en duda el modelo de replicación por desplazamiento Objetivo: demostrar lo contrario
  • 4. PAPERS ANTERIORES  Re-examinan el modelo de replicación mitocondrial en mamíferos, contradiciendo toda evidencia previa.
  • 5. ¿QUÉ DETECTARON?  Usando electroforesis bidimensional de agarosa, se encontraron con y-arcs entre las dos secuencias de origen, concluyendo que era inconsistente con el modelo asimétrico.
  • 6. ¿CÓMO JUSTIFICAN?  Atribuyen resultados anteriores a errores experimentales, que llevan a la degradación preferencial de la cadena retrasada por un contaminante en las muestras con actividad RNasa.
  • 7. Estudios Electroforesis 2D Anteriores -Microscopía de Fuerza Atómica Estrategia (AFM) -Electroforesis 2D -Sólo se evidencia la replicación por Resultado desplazamiento s -Se reveló la presencia de orígenes alternativos de la cadena liviana (L)
  • 8. AFM (ATOMIC FORCE MICROSCOPE)  Instrumento mecánico óptico que permite el mapeo topográfico de una muestra, con altísima resolución (del orden de los nanometros)
  • 9. PROTOCOLO DE PREPARACIÓN DE MUESTRAS PARA SU REVELADO POR AFM  Con el objetivo de mejorar la visibilidad de los segmentos de DNA de simple cadena al microscopio, se propuso incubar las muestras con SSBp.  El protocolo demostró ser funcional en muestras de M13 (B).  Se aplicó entonces el mismo protocolo a las muestras de mtDNA (C).  Se demostró además que el protocolo no afecta a la correcta interpretación de los resultados.
  • 10. VISUALIZACIÓN DIRECTA DEL MTDNA POR AFM
  • 11. INTERMEDIARIOS REPLICATIVOS DEL MTDNA Azul: hebra parental Rojo: ssDNA + SSB Celeste: cadena H naciente Verde: cadena L naciente
  • 12. LONGITUDES PERCEPTIBLES DE LAS REGIONES DESPLAZADAS DE EXP-D Y GPC
  • 13. POSIBLES ORÍGENES DE LA CADENA LIVIANA Azul: hebra parental Rojo: ssDNA + SSB Celeste: cadena H naciente Verde: cadena L naciente
  • 15. ¡¡Muchas gracias por su atención!!  ¿Alguna pregunta?