El lago Titicaca está contaminado en algunas zonas debido a los vertidos de aguas residuales municipales sin tratar. Un estudio encontró que las aguas de las bahías interiores de Puno y Yunguyo tienen altas concentraciones de nutrientes como nitrógeno y fósforo, haciendo el agua tóxica para los peces. Sin embargo, la mayor parte del lago aún no se ve afectada y no se han detectado sustancias tóxicas. Se recomienda tratar adecuadamente las aguas residuales y reubicar