Glaeser, E. - El triunfo de las ciudades [2011].pdf
BIOINFORMATICA.pptx
1. REFERNCIAS BIBLIOGRAFICAS. Para empezar a buscar referencia
bibliográficas relacionadas a mi tema puedo dirigirme desglosando la
pestaña de opciones ALDATABASE e ir a PUBMED o directamente a través
del enlace https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ allí coloco mi palabra clave
especificando, depurando , añadiendo, descartando y usando operadores
boléanos. Por ejemplo en este caso use el operador boleano and, coloque
la proteína involucrada, la enfermedad relacionada DIABETES y la especie
en estudio HOMO SAPIENS
Transporte de agua a través de las membranas celulares relacionadas con algunas enfermedades
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
PADMED : Es una base de datos dentro del
ncbi que carga toda la literatura científica por
tanto este será el primer paso para empaparme
de mi investigación
2. RESULTADOS OBTENIDOS:
según mi filtro se pudo
encontrar 530 resultados de
estos eligiere los de
importancia para mi tema de
estudio
No descarga una relación de
diversos autores que han
investigado el gen AQP2 en
orden cronológico
3. GENES DE INTERES RELACIONADOS CON LA PROTEINA ACUAPORINA
Investiguemos los genes involucrados en el transporte de
agua en la membrana celular usando la plataforma NCBI
En la pestaña ALDATABASE nos muestra las
opciones a elegir según lo que deseamos que nos
carge , en este caso vamos a la opción GEN para
estudiar su genoma
Al dar buscar no aparece los genes relacionados
vemos que tenemos 30 opciones a continuación
escogeremos uno para explicar la información que
nos brinda
Eligiéremos el gen AQP2 acuaporin 2 homo sapiens
hacemos doble clic para el ingreso a este gen y poder
ver sus característica
4. Nos muestra un resumen de las
CARACTERÍSTICAS DEL GEN que escogimos
en este caso acuaporin 2 se encuentra como
AQP 2 este es el nombre con que fue
guardado en la base de datos
EN EL CONTEXTO GENÓMICO
Nos muestra su localización
cromosómica no dice que esta
ubicado en el cromosoma 12
brazo q región 1 banda 3 sub
banda 12
Nos muestra y visualiza la ubicación del gen
aquaporin 2 en el cromosoma y que otros genes
están junto a el y cuales son sus linderos de su
posición
5. AQP2. Es expresada exclusivamente en
membranas apicales en los túbulos distales y
colectores renales y es la responsable de la
permeabilidad apical al agua de este
segmento de la nefrona
•
EXPRESION: RESTRINGIDA A RIÑON
6. Revisamos la secuencia genómica de nuestro gen en
estudio podemos observar que hay 2 gormas de
visualización , en 2 formatos FASTA Y GENBANK
GENBANK: muestra las bases nucleotídicas enumeradas
FASTA: muestra las bases nucleotídicas sin enumerar
Lo que nos interesa a nosotros es conocer la
información del gen su secuencia en un formato
muy conocido y usado que es el formato FASTA
en donde nos va mostrar las bases nuclotidicas
sin enumerar para esto tenemos varias formas
de descarga
7. Descargamos la secuencia genómica en
formato FASTA y lo guardamos en una carpeta
para su posterior análisis