BIOINFORMATICA

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA DE SEGUNDA ESPECIALIDAD
Docente:
María Noemí Llanos Román
M.Sc. Biología Computacional y Bioinformatica ETH Zurich
Doctorando en Ciencias Biomédicas UNT
Predicción de estructuras de proteínas – PRACTICA 3.1
Curso: Bioinformática - 2022-I
Mención: BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA

2. Softwares para predicción de proteínas

3. Softwares para predicción de proteínas

4. • Input: aa
• PredictProtein
• SwissModel
• Phyre2
• I-tasser
• Mfold (the Mfold Web
Server), RasMol, PyMol:
visualizar proteína terciaria
Observar proteínas estructura terciaria & predicción

5. En el NCBI, para hacer predicción de proteínas, recuerde que debe también bajar la secuencia en
amino ácidos y grabarla en formato FASTA

6. https://predictprotein.org/
Observar proteínas estructura terciaria & predicción

7. Copie aquí la secuencia en aminoácidos para hacer la predicción de estructura de proteína

8. Resultado de la predicción de estructura de proteína

9. Resultado de la predicción de estructura de proteína

10. Resultado de la predicción de estructura de proteína

11. http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~phyre2/html/page.cgi?id=index
Observar proteínas estructura terciaria & predicción

12. https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/
Observar proteínas estructura terciaria & predicción

13. Observar proteínas estructura terciaria & predicción

21. Predicción de estructura de proteína:
ROBETTA
Previamente necesitaría registrarse en
https://robetta.bakerlab.org/

22. Observar proteínas estructura terciaria & predicción
https://robetta.bakerlab.org/submit.php
Input es sin encabezado del FASTA, sólo la secuencia

23. Observar proteínas estructura terciaria & predicción

24. Predicción de estructura de proteína:
https://robetta.bakerlab.org/submit.php

26. Tarea:
1. Seleccione una proteína de su interés y según eso obtenga su secuencia de amino
ácidos.
2. Haga la predicción de proteínas con 2 de las herramientas utilizadas en clase:
https://predictprotein.org/
http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~phyre2/html/page.cgi?id=index
https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/
https://robetta.bakerlab.org/
SUS TRABAJO DEBE MOSTRAR PASO A PASO TODO LO REALIZADO PARA LLEGAR A LOS
RESULTADOS SOLICITADOS.
Presentar esta tarea – vía email- hasta las 8 am del día LUNES 20 DE JUNIO DEL 2022. El
retraso tiene penalidad de -4 puntos sobre la calificación.
Escoja 2 para su trabajo

27. ¡Muchas gracias por
su atención!
Algunas imágenes/expresiones utilizadas en esta
presentación no son de nuestra autoría, se han
usado sólo con fines académicos. Se respetan
todos los derechos de autor.
Prof. M. Sc. María Noemí Llanos Román
Biología Computacional & Bioinformática
Doctorando en Ciencias Biomédicas