La magnetoterapia no se recomienda durante el embarazo, la menstruación o en pacientes con marcapasos u otros dispositivos médicos electrónicos. Tampoco se recomienda en pacientes con tumores recientes sin el aval médico, o en combinación con esteroides o electrotratamiento. Siempre se debe consultar al médico antes de someterse a magnetoterapia, especialmente en casos de enfermedades desconocidas, diabetes, hemorragias, infecciones o tuberculosis.