La estructura organizativa de la Universidad Politécnica Territorial consta de un Consejo Superior, Consejo Académico Territorial, Consejo Universitario y Rectorado. El Rectorado está compuesto por el Rector, Vice Rector Académico y Vice Rector de Desarrollo Territorial, así como secretarías y direcciones generales. La Secretaría General supervisa varias direcciones de registro, archivos y políticas estudiantiles. El Vice Rectorado Académico dirige cuatro direcciones relacionadas con procesos educativos. El Vice Rectorado de Desar