Las funciones de las entidades de salud incluyen dirigir el sector salud a nivel departamental de acuerdo con la normatividad, promover planes y programas de salud, y formular planes para el desarrollo del sector salud y el sistema de seguridad social. También supervisan y controlan los recursos, implementan el sistema de información en salud, y promueven la participación social en materia de seguridad social en salud.