Santa Cruz de la Sierra fue fundada el 26 de febrero de 1561 por el capitán español Ñuflo de Chaves tras una expedición de 158 españoles que partieron desde Asunción. La nueva población fue bautizada como Santa Cruz de la Sierra en honor a la ciudad natal del fundador. Actualmente, el lugar original de la fundación es conocido como Santa Cruz la Vieja, donde se realizan proyectos de investigación arqueológica.