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Definición
¿Qué es la genómica?
Es de suma importancia entender este concepto para comprender su contexto y
alcances. La Genómica se puede definir como una sub-disciplina de la genética,
que involucra diversas ciencias y técnicas como la biología molecular, bioquímica,
genética cuantitativa, estadística, entre otras, para el estudio integral del
funcionamiento, evolución y origen de los genomas.
En otras palabras, el GENOMA nos permite leer la información encriptada dentro
del ADN (ácido desoxirribonucleico), ya que el orden de los ácidos nucleicos que lo
conforman, es el que determina si una vaca producirá una mayor cantidad de leche
durante toda su vida o si un becerro pesará más kilogramos cuando sea destetado
o si un animal sufrirá una enfermedad a lo largo de su vida. Claro está que la
influencia del medio ambiente (alimentación, manejo en el rancho, etc.) es muy
importante para que estos eventos sucedan de la manera en que está codificado en
el genoma.
La vaca fue el primer animal de interés ganadero que fue secuenciado, este genoma
alberga más de 22,000 genes, que son los encargados de la expresión, regulación
e interacción de las proteínas, algunas de las cuales juegan un papel vital dentro de
la fisiología del animal. Como dato curioso, el 80% de los genes en el ganado
bovino, son comunes con los del ser humano.
Otra definición
La genómica es un campo de la biología que se centra en el estudio de todo el ADN
de un organismo, es decir, su genoma. Esa tarea incluye identificar y caracterizar
todo los genes y elementos funcionales del genoma de un organismo, así como la
forma en que interactúan.
La genómica se refiere al estudio del genoma completo, de todos los genes que se
encuentran en un organismo, en contraste con la genética la cual estudia genes de
forma individuales. Un investigador del genoma, estudia el ADN al completo, toda
la secuencia en un organismo, y saca sus conclusiones en base a esto. Mientras
que un genetista puede estudiar todo el ADN de un organismo, pero también puede
estudiar un gen de forma individual. Por ejemplo, podría estudiar la genética de un
gen y la secuencia de ese gen. Si quisiera estudiar la genómica de un organismo o
una persona usted podría secuenciar todos sus genes y todo su ADN y podría
buscar las diferencias y compararlas con los genomas de otros individuos.
¿Con qué trabaja la genómica?
Como se describió anteriormente, la genómica trabaja con la secuencia nucleotídica
de cada uno de los genes que conforman el genoma. Los bovinos
independientemente de la raza o del individuo poseen los mismos genes, lo que los
hace “diferentes”, son las variaciones en estas secuencias. Me refiero a qué una
variante del gen (alelos) se expresa en el animal. Estas variantes pueden tener un
efecto directo o sumarse a otras para crear un efecto en el fenotipo del animal
(kilogramos producidos de carne, jugosidad de la carne, entre otros). Cualquier
variante genética puede ser caracterizada por los marcadores moleculares o
conocidos también como marcadores genéticos.
Marcadores moleculares ¿Qué son?
Los marcadores moleculares como su nombre lo indica son regiones específicas
que “marcan” o sirven de referencia para detectar variaciones que pueden asociarse
positiva o negativamente con un rasgo productivo en cualquier especie animal.
Existen diversos tipos de marcadores, clasificados de diferente manera, pero en la
actualidad para la producción bovina los más utilizados son los polimorfismos de un
solo nucleótido o SNP´s (por sus siglas en inglés, single nucleotide polymorphism).
Su amplio uso se debe a la facilidad de reproducirlos en el laboratorio, al igual que
la cantidad de SNP´s que se encuentran en el genoma bovino (el 90% de las
variaciones genéticas son SNP). Estas variaciones se deben a los cambios que se
han dado en el ADN a lo largo del tiempo y solamente afecta a una base
nucleotídica.
Los SNP no necesariamente tienen que formar parte de los genes, pero si están
bien distribuidos, muchos de ellos estarán próximos a zonas del ADN, responsables
de caracteres productivos de interés, es decir estarán asociados a genes. El objetivo
de la genómica con estos marcadores será entonces identificar asociaciones entre
los SNP y las distintas características que interesen estudiar en lo individuos.
Uso de la genómica en la ganadería
En general, los productores podrían beneficiarse a través de cuatro aplicaciones de
la genómica:
1) La identificación de progenitores. Incluye el procedimiento de asignación de
identidad, verificación o asignación de padres. Se basa en la genotipificación que
determina cuál genotipo corresponde a cada individuo incluido en el estudio.
2) La detección de individuos portadores de defectos genéticos, como es el caso de
algunas enfermedades. Lo importante es que esta detección puede hacerse antes
de que el defecto se manifieste en las crías. En los años 50, un toro se hizo popular
en Estados Unidos por poseer una conformación compacta y pelo rizado, “Short
Snorter”. Veinte años después se descubrió que este animal poseía genes para el
enanismo lo que impactó negativamente a la industria ganadera en ese país.
3) La detección de genes que favorecen la producción de carne. La identificación
de cada gen involucrado en la formación de músculo, caracterizarlo en la población
e identificar las variables más favorables desde el laboratorio. Uno de los frutos más
importantes de esta aplicación, es el descubrimiento de la miostatina, la calpaína y
la calpastatina, genes involucrados en el crecimiento muscular y marmoleo de la
carne.
4) Selección de individuos sobresalientes. Esta aplicación es a la que más se le ha
apostado en los últimos años, el poder seleccionar animales con ayuda de
marcadores moleculares ha causado un gran auge en la ganadería bovina. Esto
permitiría saber qué animales tienen cualidades genéticas superiores para producir
más carne, desde el nacimiento o antes de que tengan crías y podamos comprobar
su superioridad en el comportamiento de su progenie. Esto supondría ahorrarse
mucho tiempo y dinero, lo que en esta industria es de suma importancia.
A este tipo de selección se le conoce como selección asistida por marcadores o
SAM, o como MAM (manejo asistido por marcadores).
La aplicación del conocimiento genómico ayudará a disminuir los costos y períodos
para identificar animales que posean las características genéticas que se quieran
heredar a la siguiente generación, esto puede ayudar a la industria ganadera
nacional a mejorar genéticamente sus hatos de forma dirigida y más precisa, lo cual
se traducirá en una mejora económica para los productores de ganado bovino.
El genoma y su correlación con la producción del animal
Otro de los desarrollos para cuantificar el potencial productico de animales
cruzados, es la capacidad de identificar la composición racial de un animal basada
en el genoma y su correlación con la producción individual de un animal. Cada uno
de los animales productos de cruzamientos de 3 o más razas “puras” o de F2 en
adelante, tienen un porcentaje diferente de ancestría de las razas que los originaron.
Como ejemplo, si analizamos con pruebas genéticas a un grupo de animales
catalogados por un criador como 5/8-3/8 Brangus, todos tendrían una proporción
diferente de ancestría Angus y Brahman. Es decir, en realidad ese concepto de 5/8-
3/8 es una aproximación muy cruda de lo que en realidad tienen en su ADN dichos
animales. Esto se debe a que hay procesos biológicos que recombinan la
información genética en la meiosis y por ello no todos los hermanos completos son
iguales en su genotipo.
La relación entre la ancestría y la producción se evidencian en trabajos como el de
un grupo de la Universidad de Cornell (“Impact of genomic breed composition on
production traits in crossbred dairy cattle” Jaafar et al. 2021) donde muestran que
hay una correlación entre el porcentaje de ancestría de un animal cruzado con
producción de leche. Esto posiblemente se podrá aplicar también en ganadería de
carne. Por lo cual, establecer los porcentajes de ancestría podrá ser un criterio de
selección para mejorar las producciones de las unidades productivas en un futuro
cercano.
Qué es la genómica y cómo se aplica en el sector pecuario
En la ganadería, el mejoramiento genético de las distintas razas de ganado bovino,
ovino, caprino y porcino, es hoy una realidad y se está escribiendo una nueva
historia de éxito.
Por lo que la vinculación científica y tecnológica aplicada en materia pecuaria, como
es el caso de la genómica -conjunto de ciencias y técnicas dedicadas al estudio del
funcionamiento, contenido, evolución y origen de las características de los seres
vivos que pueden ser hereditarias- permite, en un período más corto, obtener
resultados con las características deseadas, en este caso, del ganado.
La genómica también permite que se haga el diagnóstico oportuno de
enfermedades, el desarrollo de vacunas, la creación de nuevos productos bioactivos
(hormonas), así como la producción de cultivos resistentes a plagas y herbicidas.
La genómica tiene muchas aplicaciones prácticas que benefician la producción
pecuaria como son: análisis de paternidad en el ganado de registro y pie de cría;
selección de sementales y vientres con mejoras productivas y reproductivas;
identificación de animales con resistencia a enfermedades, así como la eliminación
de las características no deseables que pudieran transmitirse

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  • 1. Definición ¿Qué es la genómica? Es de suma importancia entender este concepto para comprender su contexto y alcances. La Genómica se puede definir como una sub-disciplina de la genética, que involucra diversas ciencias y técnicas como la biología molecular, bioquímica, genética cuantitativa, estadística, entre otras, para el estudio integral del funcionamiento, evolución y origen de los genomas. En otras palabras, el GENOMA nos permite leer la información encriptada dentro del ADN (ácido desoxirribonucleico), ya que el orden de los ácidos nucleicos que lo conforman, es el que determina si una vaca producirá una mayor cantidad de leche durante toda su vida o si un becerro pesará más kilogramos cuando sea destetado o si un animal sufrirá una enfermedad a lo largo de su vida. Claro está que la influencia del medio ambiente (alimentación, manejo en el rancho, etc.) es muy importante para que estos eventos sucedan de la manera en que está codificado en el genoma. La vaca fue el primer animal de interés ganadero que fue secuenciado, este genoma alberga más de 22,000 genes, que son los encargados de la expresión, regulación e interacción de las proteínas, algunas de las cuales juegan un papel vital dentro de la fisiología del animal. Como dato curioso, el 80% de los genes en el ganado bovino, son comunes con los del ser humano. Otra definición La genómica es un campo de la biología que se centra en el estudio de todo el ADN de un organismo, es decir, su genoma. Esa tarea incluye identificar y caracterizar todo los genes y elementos funcionales del genoma de un organismo, así como la forma en que interactúan. La genómica se refiere al estudio del genoma completo, de todos los genes que se encuentran en un organismo, en contraste con la genética la cual estudia genes de
  • 2. forma individuales. Un investigador del genoma, estudia el ADN al completo, toda la secuencia en un organismo, y saca sus conclusiones en base a esto. Mientras que un genetista puede estudiar todo el ADN de un organismo, pero también puede estudiar un gen de forma individual. Por ejemplo, podría estudiar la genética de un gen y la secuencia de ese gen. Si quisiera estudiar la genómica de un organismo o una persona usted podría secuenciar todos sus genes y todo su ADN y podría buscar las diferencias y compararlas con los genomas de otros individuos. ¿Con qué trabaja la genómica? Como se describió anteriormente, la genómica trabaja con la secuencia nucleotídica de cada uno de los genes que conforman el genoma. Los bovinos independientemente de la raza o del individuo poseen los mismos genes, lo que los hace “diferentes”, son las variaciones en estas secuencias. Me refiero a qué una variante del gen (alelos) se expresa en el animal. Estas variantes pueden tener un efecto directo o sumarse a otras para crear un efecto en el fenotipo del animal (kilogramos producidos de carne, jugosidad de la carne, entre otros). Cualquier variante genética puede ser caracterizada por los marcadores moleculares o conocidos también como marcadores genéticos. Marcadores moleculares ¿Qué son? Los marcadores moleculares como su nombre lo indica son regiones específicas que “marcan” o sirven de referencia para detectar variaciones que pueden asociarse positiva o negativamente con un rasgo productivo en cualquier especie animal. Existen diversos tipos de marcadores, clasificados de diferente manera, pero en la actualidad para la producción bovina los más utilizados son los polimorfismos de un solo nucleótido o SNP´s (por sus siglas en inglés, single nucleotide polymorphism). Su amplio uso se debe a la facilidad de reproducirlos en el laboratorio, al igual que la cantidad de SNP´s que se encuentran en el genoma bovino (el 90% de las variaciones genéticas son SNP). Estas variaciones se deben a los cambios que se
  • 3. han dado en el ADN a lo largo del tiempo y solamente afecta a una base nucleotídica. Los SNP no necesariamente tienen que formar parte de los genes, pero si están bien distribuidos, muchos de ellos estarán próximos a zonas del ADN, responsables de caracteres productivos de interés, es decir estarán asociados a genes. El objetivo de la genómica con estos marcadores será entonces identificar asociaciones entre los SNP y las distintas características que interesen estudiar en lo individuos. Uso de la genómica en la ganadería En general, los productores podrían beneficiarse a través de cuatro aplicaciones de la genómica: 1) La identificación de progenitores. Incluye el procedimiento de asignación de identidad, verificación o asignación de padres. Se basa en la genotipificación que determina cuál genotipo corresponde a cada individuo incluido en el estudio. 2) La detección de individuos portadores de defectos genéticos, como es el caso de algunas enfermedades. Lo importante es que esta detección puede hacerse antes de que el defecto se manifieste en las crías. En los años 50, un toro se hizo popular en Estados Unidos por poseer una conformación compacta y pelo rizado, “Short Snorter”. Veinte años después se descubrió que este animal poseía genes para el enanismo lo que impactó negativamente a la industria ganadera en ese país. 3) La detección de genes que favorecen la producción de carne. La identificación de cada gen involucrado en la formación de músculo, caracterizarlo en la población e identificar las variables más favorables desde el laboratorio. Uno de los frutos más importantes de esta aplicación, es el descubrimiento de la miostatina, la calpaína y la calpastatina, genes involucrados en el crecimiento muscular y marmoleo de la carne. 4) Selección de individuos sobresalientes. Esta aplicación es a la que más se le ha apostado en los últimos años, el poder seleccionar animales con ayuda de
  • 4. marcadores moleculares ha causado un gran auge en la ganadería bovina. Esto permitiría saber qué animales tienen cualidades genéticas superiores para producir más carne, desde el nacimiento o antes de que tengan crías y podamos comprobar su superioridad en el comportamiento de su progenie. Esto supondría ahorrarse mucho tiempo y dinero, lo que en esta industria es de suma importancia. A este tipo de selección se le conoce como selección asistida por marcadores o SAM, o como MAM (manejo asistido por marcadores). La aplicación del conocimiento genómico ayudará a disminuir los costos y períodos para identificar animales que posean las características genéticas que se quieran heredar a la siguiente generación, esto puede ayudar a la industria ganadera nacional a mejorar genéticamente sus hatos de forma dirigida y más precisa, lo cual se traducirá en una mejora económica para los productores de ganado bovino. El genoma y su correlación con la producción del animal Otro de los desarrollos para cuantificar el potencial productico de animales cruzados, es la capacidad de identificar la composición racial de un animal basada en el genoma y su correlación con la producción individual de un animal. Cada uno de los animales productos de cruzamientos de 3 o más razas “puras” o de F2 en adelante, tienen un porcentaje diferente de ancestría de las razas que los originaron. Como ejemplo, si analizamos con pruebas genéticas a un grupo de animales catalogados por un criador como 5/8-3/8 Brangus, todos tendrían una proporción diferente de ancestría Angus y Brahman. Es decir, en realidad ese concepto de 5/8- 3/8 es una aproximación muy cruda de lo que en realidad tienen en su ADN dichos animales. Esto se debe a que hay procesos biológicos que recombinan la información genética en la meiosis y por ello no todos los hermanos completos son iguales en su genotipo. La relación entre la ancestría y la producción se evidencian en trabajos como el de un grupo de la Universidad de Cornell (“Impact of genomic breed composition on production traits in crossbred dairy cattle” Jaafar et al. 2021) donde muestran que hay una correlación entre el porcentaje de ancestría de un animal cruzado con
  • 5. producción de leche. Esto posiblemente se podrá aplicar también en ganadería de carne. Por lo cual, establecer los porcentajes de ancestría podrá ser un criterio de selección para mejorar las producciones de las unidades productivas en un futuro cercano. Qué es la genómica y cómo se aplica en el sector pecuario En la ganadería, el mejoramiento genético de las distintas razas de ganado bovino, ovino, caprino y porcino, es hoy una realidad y se está escribiendo una nueva historia de éxito. Por lo que la vinculación científica y tecnológica aplicada en materia pecuaria, como es el caso de la genómica -conjunto de ciencias y técnicas dedicadas al estudio del funcionamiento, contenido, evolución y origen de las características de los seres vivos que pueden ser hereditarias- permite, en un período más corto, obtener resultados con las características deseadas, en este caso, del ganado. La genómica también permite que se haga el diagnóstico oportuno de enfermedades, el desarrollo de vacunas, la creación de nuevos productos bioactivos (hormonas), así como la producción de cultivos resistentes a plagas y herbicidas. La genómica tiene muchas aplicaciones prácticas que benefician la producción pecuaria como son: análisis de paternidad en el ganado de registro y pie de cría; selección de sementales y vientres con mejoras productivas y reproductivas; identificación de animales con resistencia a enfermedades, así como la eliminación de las características no deseables que pudieran transmitirse