Las proteínas son nutrientes complejos que contienen nitrógeno en su estructura. El metabolismo de las proteínas exógenas implica su hidrólisis en el estómago por la pepsina y en el duodeno por enzimas pancreáticas como la tripsina y la quimotripsina, las cuales rompen los enlaces peptídicos para obtener péptidos pequeños y aminoácidos que son absorbidos en la sangre.