La biorremediación por hongos implica usar hongos para descontaminar suelos. Los hongos segregan enzimas que pueden degradar contaminantes debido a que sus estructuras químicas son similares a la lignina y celulosa que los hongos descomponen naturalmente. La mico remediación identifica la cepa de hongos más adecuada para cada contaminante y tiene un costo menor que otras técnicas de remediación como la excavación.