La ocratoxina es un agente mutagénico y genotóxico. Un agente mutagénico es una sustancia química capaz de causar cambios hereditarios en la estructura o número de genes a través de reacciones directas o indirectas con los ácidos nucleicos. Un compuesto es genotóxico si puede reaccionar con el ADN, como uniéndose covalentemente a las bases nitrogenadas para formar adductos. Si esta interacción con el ADN resulta en una mutación estable y hereditaria, el compuesto se considera mutagénico