.

1. ASIGNATURA
“SIMULACIÓN
MOLECULAR DEL ADN
USANDO EL SOFTWARE
SNAPGENE”
INFORME:
DOCENTE:
Dr. Hernan Hebert Soto Gonzales
ALUMNA:
Yanina Maribel Mamani Goya
CURSO:
Biotecnologia
CICLO:
VII
ILO-PERU

2. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
“Año de la unidad, la paz y el desarrollo”
BIOTECNOLOGIA
VII CICLO
TEMA:
“SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN GEL DE AGAROSA
UTILIZANDO EL SOFTWARE SNAPGENE”
DOCENTE:
Dr. SOTO GONZALES, HEBERT HERNAN
DESARROLLADO POR:
MAMANI GOYA YANINA MARIBEL
ILO-PERU
Junio 2023

3. INDICE
I. INTRODUCCION..........................................................................................................................3
II. OBJETIVOS..................................................................................................................................4
2.1. Objetivo General: ...............................................................................................................4
2.2. Objetivos Específicos:.........................................................................................................4
III. MARCO TEORICO....................................................................................................................4
3.1. Electroforesis:.....................................................................................................................4
3.2. Secuencias del ADN:...........................................................................................................5
3.3. Gel de Sacarosa ..................................................................................................................5
3.4. Software “SnapGene”.........................................................................................................5
3.5. Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI): .............................................6
IV. MATERIALES Y METODOLOGIA...............................................................................................6
V. METODOLOGIA...........................................................................................................................6
VI. CONCLUCIONES....................................................................................................................10
VII. REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS.............................................................................................11

4. I. INTRODUCCION
El estudio del ADN de los microorganismos ha potenciado la identificación de estos a partir de
diferentes técnicas moleculares, tal es caso de la electroforesis, la electroforesis en gel es una
técnica utilizada para separar fragmentos de ADN (u otras macromoléculas, como ARN y proteínas)
por su tamaño y carga. La electroforesis consiste en aplicar una corriente a través de un gel que
contiene las moléculas de interés. Con base en su tamaño y carga, las moléculas se desplazarán por
el gel en diferentes direcciones o a distintas velocidades, con lo que se separan unas de otras.
en la electroforesis en gel participa un gel: un bloque de material similar a la gelatina. Los geles para
separar ADN suelen estar hechos de un polisacárido llamado agarosa, que se consigue como
hojuelas secas pulverizadas.
Cuando la agarosa se calienta en una solución amortiguadora (agua mezclada con algunas sales) y
deja enfriar, se forma un gel sólido ligeramente blando. A nivel molecular, el gel es una matriz de
moléculas de agarosa que se mantienen unidas por puentes de hidrógeno y que forman pequeños
poros.
El software SnapGene proporciona la forma más fácil y seguro de planificar, visualizar y registrar sus
procedimientos diarios de biología molecular.

5. II. OBJETIVOS
2.1. Objetivo General:
 Realizar la electroforesis en gel de agarosa utilizando el software Bioinformática
“SnapGene” de un artículo científico.
2.2. Objetivos Específicos:
 Aprender a utilizar y conocer las características del software “SnapGene”.
 Utilizar los conceptos básicos del software Snap Gene y el programa NCBI.
III. MARCO TEORICO
3.1. Electroforesis:
La electroforesis es una técnica de laboratorio que se usa para separar moléculas de
ADN, ARN o proteínas en función de su tamaño y carga eléctrica. Se usa una corriente
eléctrica para mover las moléculas a través de un gel o de otra matriz.
Una electroforesis se realiza generalmente en una especie de caja que tiene una carga
positiva en un extremo y una carga negativa en el otro. Y como todos aprendimos en
las clases de física, cuando se pone una molécula cargada en un entorno así, las
moléculas negativas van a la carga positiva, y viceversa. Al analizar las proteínas en un
gel, en una de estas cajas, por lo general se toma la proteína completa para ver lo grande
que es. Cuanto más corta, más migran en el gel, de modo que las proteínas pequeñas
terminarán en la parte inferior del gel.

6. 3.2. Secuencias del ADN:
Proceso de laboratorio que se usa para conocer la secuencia exacta (orden) de los
cuatro bloques o bases que conforman el ADN. La información se almacena en el ADN
en un código que resulta de la disposición de las cuatro bases (identificadas por las letras
A, C, G, y T) en diferentes órdenes. La secuenciación de ADN se puede utilizar para
encontrar mutaciones (cambios) en el ADN que pueden causar enfermedades.
3.3. Gel de Sacarosa
El gel de agarosa es un material ampliamente utilizado en biología molecular y genética
para la separación y análisis de fragmentos de ADN, ARN y proteínas en un proceso
conocido como electroforesis. La Agarosa es un polisacárido derivado de las algas
marinas, y se utiliza en forma de gel debido a su capacidad para formar una matriz
porosa cuando se disuelve en agua caliente y se enfría. Esta matriz de gel actúa como
un tamiz molecular, permitiendo que los fragmentos de ácidos nucleicos o proteínas se
muevan a través de ella en función de su tamaño y carga eléctrica cuando se aplica un
campo eléctrico.
3.4. Software “SnapGene”
Es un software de clonación que ayudas en planear y simulando manipulaciones de
ADN. SnapGene es el software y herramienta de clonación molecular preferida por los
científicos de hoy y de mañana. SnapGene hace que sus manipulaciones de ADN sean
fáciles de visualizar y simular, le advierte de los errores antes de que sucedan y
automáticamente documenta cada paso a lo largo del camino. Solicite patrocinio y
reciba licencias SnapGene gratuitas para su equipo. (IGEM Foundation, s.f.)

7. 3.5. Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI):
El Centro Nacional para la Información Biotecnológica (en inglés: National Center for
Biotechnology Information [NCBI]) es parte de la Biblioteca Nacional de Medicina de
Estados Unidos, una rama de los Institutos Nacionales de Salud. Está localizado en
Bethesda (Maryland) y fue fundado el 4 de noviembre de 1988con la misión de ser una
importante fuente de información de biología molecular. Almacena y constantemente
actualiza la información referente a secuencias genómicas en Gen Bank, un índice de
artículos científicos referentes a biomedicina, biotecnología, bioquímica, genética y
genómica en Pub Med, una recopilación de enfermedades genéticas humanas en
OMIM, además de otros datos biotecnológicos de relevancia en diversas bases de
datos.
El NCBI ofrece además algunas herramientas bioinformáticas para el análisis de
secuencias de ADN, ARN y proteínas, siendo BLAST una de las más usadas. NCBI alberga
genoma secuenciado en Gen Bank, y un índice de los artículos biomédicos de
investigación en Pub Med Centraly Pub Med, así como otra información relevante a la
biotecnología. Todas estas bases de datos son accesibles en línea con el motor de
búsqueda de Entrez.
IV. MATERIALES Y METODOLOGIA
 NCBI
 SNAPGENE
 Laptop
V. METODOLOGIA
1) Primeramente, se utilizó los N° de Accesión de las cepas bacteriana aislada del
Articulo, proporcionado por el docente.

8. 2) Por consiguiente, se ingresaron los códigos de cada secuencia en el buscador del
NCBI (Centro Nacional para la Información Biotecnológica) y se procede a
descargar en formato FASTA.
3) Una vez ingresado cada código, se guardó en una carpeta, con el fin de llevar un
orden.

9. 4) Luego abrimos el programa software Bioinformática “SnapGene” y damos click en
OPEN  FILES , Continuando seleccionamos los archivos que guardamos para
luego volver a guardarlos con la opción FILES  SAVE AS y guardamos en formato
“SnapGene” ADN.
 Formato guardado en “SNAP GENE” ADN o DNA

10. 5) Seleccionamos en la barra de herramientas la opción TOOLS y luego en SIMULATE
AGAROSE GEL, para realizar cada uno de los códigos guardados, la simulación en
gel de agarosa de las secuencias guardadas en el archivo.
6) Posteriormente, aparecerá una ventana donde visualizaremos el rango de PCR y
demás características y así sucesivamente agregamos las demás secuencias.

11. 7) Finalmente se mostrará la simulación de Gel Agarosa.
VI. CONCLUCIONES
 El Software “SnapGene” fue fácil de utilizar con cada una de las indicaciones dadas
por el docente. Se pudo concluir satisfactoriamente la simulación de un Gel de
Agarosa para las 13 cepas Bacterianas del Artículo. Nos permitió visualizar el rango
de PCR y demás características de cada secuencia y conocer el grafico de las bandas
sin ningún inconveniente.
 El software SnapGene es de mucha utilidad para visualizar cada secuencia de ADN,
anotación de secuencias, la edición de las mismas secuencias, la clonación, la
visualización de proteínas y nucleótidos.

12. VII. REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
 SnapGene – Becker Medical Library. (n.d.). Becker Library. Retrieved June
6, 2023, from https://becker.wustl.edu/resources/software/snapgene/
 Electroforesis. (2023, June 2). National Human Genome Research Institute.
Retrieved June 6, 2023, from https://www.genome.gov/es/genetics-
glossary/Electroforesis
 Electroforesis en gel (artículo). (n.d.). Khan Academy. Retrieved June 6,
2023, from https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-
expression-and-regulation/biotechnology/a/gel-electrophoresis
 (n.d.). National Center for Biotechnology Information. Retrieved June 6,
2023, from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/