1. Análisis Temporal de
Epidemias
Instructor del tema:
Gustavo Mora Aguilera CP, México
morag@colpos.mx
595 95 20200 ext 1620
oficina 218

2. Epidemia:
Cambio de intensidad Enfermedad
en
Población de Plantas
1
en
Tiempo y Espacio
0
.
8 por
Clima, Hospedero, Patógeno, Manejo,
0
.
6 y otros
0
.
4
Incidencia/Sevrida
0
.
2
Tiempo
0
4
0 4
8 5
4 6
1 6
8 7
5 8
2 8
9 9
5
To .í D sa b
i p e s p ei r
e ( Ds d e)
m p a u lS a
. eé m

3. Patógeno
Manejo
Vector Agronómico
Hospedante
Objetivo del Análisis
? Suelo
Temporal de Epidemias
Clima
Medir el efecto de los
1 componentes del
sistema epidemiológico
a través del análisis de
0
.
8
curvas de progreso de
enfermedad
0
.
6
Se puede clasificar como:
1) Descriptivo
0
.
4
2) Comparativo
Incidencia/Sevrida
3) Inferencial
0
.
2
Tiempo
0
4
0 4
8 5
4 6
1 6
8 7
5 8
2 8
9 9
5
To .í D sa b
i p e s p ei r
e ( Ds d e)
m p a u lS a
. eé m

4. Objetivo Análisis Temporal:
Caracterizar, comparar y modelar el proceso temporal
de epidemias con respecto al tiempo y a factores
bióticos y abióticos del sistema epidemiológico
empleando procedimientos exploratorios gráficos y
métodos cuantitativos determinísticos y/o estocásticos
con el propósito de evaluar el efecto ambiental así
como estrategias de manejo de enfermedades.

5. Estructura de una epidemia temporal
Parámetros de Parámetros de
Localización o Integración o
Punto Fijo Punto Flotante
1
0
0
Tasa de Infección
Yf Inc. o Sev. f
Y
Aparente Final
Forma de
la Curva
-
1
Yb
o
5
0
To
i p
em c
Incidencia o A
B
CP
E
Severidad Inicial Area Bajo
la Curva Tiempo Total
IntesidaeEnfermda(%)
Y
o de Epidemia
Tiempo a Inicio
de Epidemia
0
X
o Tró E i(m
tD n p a p
= a di m o
uc ed t
i e i
e)
To
ip
em

6. 200 Diversidad de Epidemias
100
Lycopersicum sp / Nacobus aberrans
0 Citrullus lanatus / ZYMV-WMV2/(Vectores:áfidos)
1 1 994
AC
Proporcion de plantas enfermas
Lote 1
Número de agallas por planta
400
0.8
Lote 2
300 Lote 3
0.6
Lote 4
200
0.4 Fl Fr 0
C
3-4 r 5r 83-88
100 15% 35% 50% 90% 98% 100%
0.2 0
0
0 10 20 30 40 50 0 0
41 44 48 51 54 58 62 65 69 72 76 79
Días despues del trasplante
Days after Dias despue s de la siembra
Dendranthema grandiflora - TSWV (vectores:Trips)
18
transplanting
70
Citrus sinensis-Colletotrichum sp
INCIDENCE VG1 Yf ABCPE
16
INCIDENCE VG2 B 90 MT Bloque I 88a 812a
INCIDENCE VG3 60
THRIPS WITHIN CROP VG1
80 MT Bloque II 48b 322b
14 THRIPS WITHIN CROP VG2
(%)
THRIPS WITHIN CROP VG3 50
70 MTR Bloque I 74a 736a
12
Incidencia acumulada
Número de trips
40 60 MTR Bloque II 60a
Incidencia (%)
640a
10
50
8 30
40
6
20 30
4
20
10
2
10
0 0
9-may
28-sep
12-oct
25-may
26-oct
17-aug
8-jun
3-aug
20-jul
22-jun
31-aug
23-nov
14-sep
7-dec
6-jul
9-nov
0
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18
Días

7. Ley de Inductividad Mínima
100
ALELI
IE1
ARUPO
Pérdida Relativa de
80
Severidad de Roya Lineal (%)
ASE/3CM
CALIC
Severity of Stripe Rust
CENTI
IE1-IE2
CERRO
60 ESMER
Inductividad
ESPER
GLORI IE1-IE3
40 IE2
GRANA
GUANA
KLAGES
MARIS
20 PUEBLA
IE3
TROMP
0
0 10 20 30 40 50
Pérdida relativa de inductividad es la reducción
Tiempo (days)
Time (días) de inductividad epidémica con respecto
a la capacidad máxima ambiental para inducir
IEm = f (H | P, C, M, ,...,Sn) un valor-i de intensidad de epidemia

8. Familia de Curvas Epidemiológicas
Forma de S
tipo Sigmoide Asimétrico
Forma de S
tipo Sigmoide Simétrico
Forma de C
Fusarium spp-Mangifera indica Puccinia striformis-Hordeum vulgare
1 100
A
tipo monomolecular T ree1 T ree2 T ree3 T ree4
In c id e n c e o f M a n g o M a lf o r m a tio n
ALELI
0 .8
ARUPO
0 .6 80 ASE/3CM
CALIC
Severity of Stripe Rust
0 .4 CENTI
CERRO
0 .2 60 ESMER
ESPER
0
1 .0
GLORI
B
0 .8 40 GRANA
GUANA
0 .6 KLAGES
MARIS
0 .4 20 PUEBLA
TROMP
0 .2
0 0
Forma
k
k
k
k
v
p
c
ct
w
w
w
w
0 10 20 30 40 50
o
e
e
4
1
2
3
O
N
D
S
Exponencial
n
n
n
n
Ja
Ja
Ja
Ja
T im e ( m o n t h s , w e e k s ) Time (days)
Noriega et al, 1999 Sandoval et al, 1997

9. Intensidad de enfermedad
Acumulada vs. Cambio Absoluto
Abril 21,94 Incidencia = Abril 25,94 Incidencia = Abril 28,94 Incidencia =
Yi = [ (Y1...i) / N] Proporción,
0<yi<1 Citrullus lanatus / ZYMV-WMV2
Yi = [ (Y1...i) / N][100] Porcentaje, /(Vectores:áfidos)
1 0<yi<100
Estudios de02,94 Incidencia =
Mayo
caracterización Mayo 05,94 Incidencia = Mayo 08,94 Incidencia =
Cambio de Intensidad de Enfermedad
0
,
8
Intensidad de Enfermedad
Yi = [( Y i -  Y i-1) / N] Proporción,
0<yi<1
0 28,94 Incidencia =
,
6Abril Yi = [ (Y i+1 - Y i) / N][100] Porcentaje,
Mayo 12,94 Incidencia = Mayo 16,94 Incidencia = Mayo 19,94 Incidencia =
0<yi<100
Estudios de predicción,
Planta Planta Planta muerta
sana enferma Pérdidas de producción
0
,
4
ProptinfIcde
= Mayo 08,94 Incidencia =
0
,
2
0
4
1 4
44
85
1 54 58 6 2 6 56
97
27
67
9
Tiempo/Unidades fisiológicas
Mora, 1995

10. Generar la epidemia temporal
En su forma acumulada y cambios absolutos
Abril 21,94 Incidencia = Abril 25,94 Incidencia = Abril 28,94 Incidencia =
Mayo 02,94 Incidencia = Mayo 05,94 Incidencia = Mayo 08,94 Incidencia =
Mayo 12,94 Incidencia = Mayo 16,94 Incidencia = Mayo 19,94 Incidencia =
Planta Planta Planta muerta
sana enferma

11. Cambio Absoluto evidencia mejor las variaciones en
Intensidad de enfermedad
1 0
,
4
P1
lt
o
P1
lt
o P2
P2
lt
o
lt
o
0
,
8
0
,
3
0
,
6
Cgf c
h eI .
a o
n n
Po n Ic
r r o .
ot fn
pio 0
,
2
ChangeofIncidence
0
,
4
ProportionofIncidence
0
,
1
0
,
2
A
.l
m
in
d
d
e
t
oi
i
0 0
1 0
,
4
P3
lt
o
P3
lt
o P4
lt
o
0
,
8
0
,
3
0
,
6
0
,
2
0
,
4
ChangeofIncidence
ProprtionofIncidence
Watermelon mosaic virus
type 2 (WMV-2) 0
,
1
0
,
2
0 0
40 4
8 5
4 6
1 6
8 7
5 8
2 8
9 9
5 4
0 4
8 5
4 6
1 6
8 7
5 8
2 8
9 9
5
D arln
a f ptg
y t an
se i D arln
a f ptg
y t an
se i Mora, 1995

12. Exploración Gráfica de epidemias
PROPORTION OF INCIDENCE
PA PAYA - PA PAYA R IG SP O T V IR U S - P
1 .0
0 .8
0 .6
1. Epidemia de tipo sigmoidal 0 .4
2. Inflección aproximada en el 50%
0 .2
incidencia A
0 .0
3. No requiere corrección por Yf T V E C A N E B A R P R AY U N U L U G E P C T O V E C
OC NO D J F M A M J J A S O N D
T IM E (M O N T H )
1. La epidemia inferior tiene MANGO - F u s a riu m spp
Proportion of Infected Shoots
un efecto de dilución de 1
enfermedad. 0 .8
2. Epidemias de tipo monomolecular. 0 .6
0 .4
0 .2
C
0
S ep Oct N ov D ec J an 1w k J an 2w k J an 3w k J an 4w k
Tim e (m o n th s , w e e k s )
AV O C A D O / R H O D O D E N D R O N - P h y to p h th o ra c in n a m o m i
1. Curvas de tipo sigmoidal en un 100
P e rs e a R h o d o d e n d ro n 47 days
35 days
patógeno de raíz 80
40 days
% Incidence
25 days E nero
60 O c tubre
40
J ulio
20
17 days
A bril E
0
0 1 2 3 4 5

13. Exploración Grafica de epidemias
1. Curva superior necesita corrección por
PR O PO RTIO N O F IN CID EN CE
PAPAYA - PA PAYA R IG SP O T V IR U S - P C E B A D A - P uc cinia striform is f. sp. hordei
proyección a cero
1.0 100
Severity of Stripe Rust
2. Se debe corregir la escala de tiempo
0.8 80
3. La epidemia inferior requiere corrección
0.6 ALELI
60
por 0.4
asimptota. Curva de tipo exponencial. AR UPO
ESM ER
4. El ABCPE probablemente requiere 40
0.2
estandarizar porduración de epidemia. A
20
B
0.0
5. CorregirTNporCJYNfFenA RA P RM AtresU LA U GS E PO C TN O VD E C
OC
O V E A E M las J U J curvas y
D
B Y N 0
0 5 10 15 20 25 30 35 40 45
requeriría modelos (M O N T H )
T IM E
distintos. Mejor Tim e (d ays)
opción un modelo Ono flexible.
MANG - Fusarium spp TO M ATO - F u sa riu m oxysp oru m f. sp . lycop e rsica e
Proportion of Infected Shoots
1 100
% D iseased Plants
0 .8 80
1. La proyección por cero debe 0 .6 60
tomarse con reserva en este
0 .4 40
caso. Probablemente esta no se
0 .2 20
justifica. C D
0 0
Sep Oct N ov D ec J an 1w k J an 2w k J an 3w k J an 4w k
0 5 10 15 20 25 30
Tim e (m o n th s, w eeks)
D ays after p lan tin g
AV O C A D O / R H O D O D E N D R O N - P hytophthora cinnam om i
P E A R - E rw inia am ylovora
% B losson Sam ples Diseased
100
40
1. Posible efecto de muestreodays 47 days
35 days 40 mas P erse a R hodo den dron
80 1362
que de un efecto de dilución E nero
% Incidence
30
25 days
O ctubre 60
de enfermedad. 20
71
40
72
Julio 23 115
20 10
17 days 129
A bril E 229 323
F
0 0
0 1 2 3 4 5 0 1-100 101-200 201-300 301-400 401-500 501-600 over 600
Tim e D eg ree h o u rs ab o ve 18.3 C