La película sigue a Adso de Melk y al Fraile Franciscano Guillermo de Baskerville mientras investigan una serie de misteriosas muertes en una abadía benedictina. Guillermo utiliza la lógica y el razonamiento en lugar del dogmatismo religioso para descubrir la verdad. Eventualmente descubre que el bibliotecario ciego está envenenando a los monjes para ocultar secretos prohibidos en los libros de la biblioteca.