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Aviles González Gabriela Areli
SISTEMÁTICA
ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO LYNX Y OTRA ESPECIE
DE LA FAMILIA FELIDAE
INTRODUCCION
El género Lynx se incluye en la subfamilia felinae Fischer de Waldheim, (1817).
Actualmente la subfamilia felinae contiene 11 géneros. La familia Felidae surgió en Eurasia
durante el Oligoceno, posiblemente a partir de la familia Miacidae. Estos primeros félidos
de pequeño tamaño fueron expandiéndose, alcanzando África y Norteamérica a principios
del Mioceno. En el Mioceno medio se diversificaron, apareciendo los llamados dientes de
sable (Machairodontinae), los felinos (…), que se dispersaron por Eurasia, África y
Norteamérica. A finales delPlioceno llegaron también a Sudamérica durante el denominado
Gran Intercambio Americano Salesa et al,.(2012). Dentro de los félidos encontramos al
género Lynx.
El lince es un gran félido que es relativamente abundante en gran parte del subcontinente
de Rusia y los países vecinos Rueness et al., (2014) Los linces son predadores que se han
adaptado a distintos hábitats. Las especies actuales se caracterizan por presentar un
tamaño medio (45-75 cm de altura) poseen un pelaje de coloración grisácea o pardo
provisto de un moteado negro muy variable, rayas dorsales y franjas en las extremidades.
Característica morfológica más notable dentro de este género es la posesión de barbas en
las mejillas y sus orejas terminan en punta con una coloración de pelo negra. Su cola es
relativamente corta (11-26 cm de longitud) (Arribas, 2008, p.115).
“Actualmente se reconocen cuatro especies de linces: el lince boreal
(Lynx Lynx), el lince ibérico (Lynx pardinus), el lince rojo o bobcat
(Lynx rufus) y el lince canadiense (Lynx canadensis)” (Arribas, 2008,
p.117) algunos autores relacionan a otro félido dentro de estegénero
(mal llamado) lince caracal pues presentan características
morfológicas muy parecidas. (fig. 1)
OBJETIVOS
El objetivo específicode este estudio es: 1) Demostrar por medio de un análisis filogenético
que el caracal no pertenece al mismo género Lynx, hecho que nos permite concluir que la
relación entre estas especies no es estrecha y por lo tanto evolucionaron distintamente.
MATERIALES
Secuencias (DNA) (CytB) de las especies de L. rufus, L. pardinus, L. canadensis, L. Lynx, Felis
caracal.
SOFTWARE Bioedi v7t, MEGA v 6.06
METODOLOGÍA
Se tomaron las secuencias de la base de datos de NCBI Gen Bank de cuatro especies del
género Lynx, y una secuencia del caracal, 384 bp todas del cytochrome b (Cytb). Las
secuencias fueron alineadas en el software Bioedit versión 7, posteriormente las secuencias
alineadas fueron introducidas al software MEGA versión 6.06 para realizar un árbol por el
método estadísticode Máximum Likelihood , con el modelo o método de Tamura-Nei model
ANÁLISIS
figura1
Las secuencias cytb fueron alineadas con las secuencias equivalentes para el lince
canadiense (números de acceso AY31948- AY319505, Cr y AY319506-AY319512 cytb) así
como las secuencias de las otras dos especies del género Lynx, el lince ibérico (Lynx
pardinus), cytb: AY499323 y el lince rojo (Lynx rufus) cytb: AY499331, y (Caracal caracal),
cytb: KJ93343.1
RESULTADOS
Figure. Molecular Phylogenetic analysis by Maximum Likelihood method (timetree)
The timetree shown was generated using the RelTime method [1], Divergence times for all
branching points in the topology were calculated using the Maximum Likelihood method
based on the Tamura-Nei model [2], Bars around each node represent 95% confidence
intervals which were computed using the method described in Tamura et al. (2013) [1], The
estimated log likelihood value of the topology shown is -882.5096. The tree is drawn to
scale, with branch lengths measured in the relative number of substitutions per site. The
analysis involved 5 nucleotide sequences. Codon positions included were
1st+2nd+3rd+Noncoding. All positions containing gaps and missing data were eliminated.
There were a total of 383 positions in the final dataset. Evolutionary analyses were
conducted in MEGA6 [3],
1. Tamura K„ Battistuzzi FU, Billing-Ross P, Murillo 0, Filipski A, and Kumar S. (2012).
Estimating Divergence Times in Large Molecular Phylogenies. Proceedings of the National
Academy of Sciences 109:19333-19338.
2. Tamura K. and Nei M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions
in the control region of mitochondrial DNAin humans and chimpanzees. Molecular Biology
and Evolution 10:512-526.
3. Tamura K„ Stecher G. Peterson D„ Filipski A., and Kumar S. (2013). MEGA6:
Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution30:
2725-2729.
Disclaimer: Although utmost care has been taken to ensure the correctness of the caption,
the caption text is provided 'as is" without any warranty of any kind. Authors advise the
user to carefully check the caption prior to its use for any purpose and report any errors or
problems to the authors immediately (www.megasoftivare.net). In no event shall the
authors and their employers be liable for any damages, induding but not limited to special.
Consequential, or other damages. Authors superficially disdaim all other warranties
expressed or implied, induding but not limited to the determination of suitability of this
caption text for a spedfic purpose, use. Or application.
DISCUSIÓN
A pesar de que ambos (especies del género Lynx y caracal) pueden contener similitudes
morfológicas muy parecidas, el estudio genético en base a secuencias de ADN nos muestra
que las especies de lynx no alcanzan a tener una relación estrecha filogenéticamente con el
caracal pues la distancia que hay entre ambas es significativamente grande.

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  • 1. Aviles González Gabriela Areli SISTEMÁTICA ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO LYNX Y OTRA ESPECIE DE LA FAMILIA FELIDAE INTRODUCCION El género Lynx se incluye en la subfamilia felinae Fischer de Waldheim, (1817). Actualmente la subfamilia felinae contiene 11 géneros. La familia Felidae surgió en Eurasia durante el Oligoceno, posiblemente a partir de la familia Miacidae. Estos primeros félidos de pequeño tamaño fueron expandiéndose, alcanzando África y Norteamérica a principios del Mioceno. En el Mioceno medio se diversificaron, apareciendo los llamados dientes de sable (Machairodontinae), los felinos (…), que se dispersaron por Eurasia, África y Norteamérica. A finales delPlioceno llegaron también a Sudamérica durante el denominado Gran Intercambio Americano Salesa et al,.(2012). Dentro de los félidos encontramos al género Lynx. El lince es un gran félido que es relativamente abundante en gran parte del subcontinente de Rusia y los países vecinos Rueness et al., (2014) Los linces son predadores que se han adaptado a distintos hábitats. Las especies actuales se caracterizan por presentar un tamaño medio (45-75 cm de altura) poseen un pelaje de coloración grisácea o pardo provisto de un moteado negro muy variable, rayas dorsales y franjas en las extremidades. Característica morfológica más notable dentro de este género es la posesión de barbas en las mejillas y sus orejas terminan en punta con una coloración de pelo negra. Su cola es relativamente corta (11-26 cm de longitud) (Arribas, 2008, p.115).
  • 2. “Actualmente se reconocen cuatro especies de linces: el lince boreal (Lynx Lynx), el lince ibérico (Lynx pardinus), el lince rojo o bobcat (Lynx rufus) y el lince canadiense (Lynx canadensis)” (Arribas, 2008, p.117) algunos autores relacionan a otro félido dentro de estegénero (mal llamado) lince caracal pues presentan características morfológicas muy parecidas. (fig. 1) OBJETIVOS El objetivo específicode este estudio es: 1) Demostrar por medio de un análisis filogenético que el caracal no pertenece al mismo género Lynx, hecho que nos permite concluir que la relación entre estas especies no es estrecha y por lo tanto evolucionaron distintamente. MATERIALES Secuencias (DNA) (CytB) de las especies de L. rufus, L. pardinus, L. canadensis, L. Lynx, Felis caracal. SOFTWARE Bioedi v7t, MEGA v 6.06 METODOLOGÍA Se tomaron las secuencias de la base de datos de NCBI Gen Bank de cuatro especies del género Lynx, y una secuencia del caracal, 384 bp todas del cytochrome b (Cytb). Las secuencias fueron alineadas en el software Bioedit versión 7, posteriormente las secuencias alineadas fueron introducidas al software MEGA versión 6.06 para realizar un árbol por el método estadísticode Máximum Likelihood , con el modelo o método de Tamura-Nei model ANÁLISIS figura1
  • 3. Las secuencias cytb fueron alineadas con las secuencias equivalentes para el lince canadiense (números de acceso AY31948- AY319505, Cr y AY319506-AY319512 cytb) así como las secuencias de las otras dos especies del género Lynx, el lince ibérico (Lynx pardinus), cytb: AY499323 y el lince rojo (Lynx rufus) cytb: AY499331, y (Caracal caracal), cytb: KJ93343.1 RESULTADOS Figure. Molecular Phylogenetic analysis by Maximum Likelihood method (timetree) The timetree shown was generated using the RelTime method [1], Divergence times for all branching points in the topology were calculated using the Maximum Likelihood method based on the Tamura-Nei model [2], Bars around each node represent 95% confidence intervals which were computed using the method described in Tamura et al. (2013) [1], The estimated log likelihood value of the topology shown is -882.5096. The tree is drawn to scale, with branch lengths measured in the relative number of substitutions per site. The analysis involved 5 nucleotide sequences. Codon positions included were 1st+2nd+3rd+Noncoding. All positions containing gaps and missing data were eliminated. There were a total of 383 positions in the final dataset. Evolutionary analyses were conducted in MEGA6 [3],
  • 4. 1. Tamura K„ Battistuzzi FU, Billing-Ross P, Murillo 0, Filipski A, and Kumar S. (2012). Estimating Divergence Times in Large Molecular Phylogenies. Proceedings of the National Academy of Sciences 109:19333-19338. 2. Tamura K. and Nei M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNAin humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution 10:512-526. 3. Tamura K„ Stecher G. Peterson D„ Filipski A., and Kumar S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution30: 2725-2729. Disclaimer: Although utmost care has been taken to ensure the correctness of the caption, the caption text is provided 'as is" without any warranty of any kind. Authors advise the user to carefully check the caption prior to its use for any purpose and report any errors or problems to the authors immediately (www.megasoftivare.net). In no event shall the authors and their employers be liable for any damages, induding but not limited to special. Consequential, or other damages. Authors superficially disdaim all other warranties expressed or implied, induding but not limited to the determination of suitability of this caption text for a spedfic purpose, use. Or application. DISCUSIÓN A pesar de que ambos (especies del género Lynx y caracal) pueden contener similitudes morfológicas muy parecidas, el estudio genético en base a secuencias de ADN nos muestra que las especies de lynx no alcanzan a tener una relación estrecha filogenéticamente con el caracal pues la distancia que hay entre ambas es significativamente grande.