Caracteristicas de las bases de datos Refseq y Genbank

1. CARACTERISTICAS DE LAS BASES
DE DATOS REFSEQ Y GENBANK
¿Qué es? 1.
Almacena y constantemente actualiza la
información referente a secuencias
genómicas en GenBank, un índice de
artículos científicos referentes a
biomedicina, biotecnología, bioquímica,
genética y genómica en PubMed, una
recopilación de enfermedades genéticas
humanas en OMIM, además de otros datos
biotecnológicos de relevancia en diversas
bases de datos. (1)
Bases de
datos
NCBI (EEUU)
EMBL (Europa)
DDBJ (Japón)
Flybase (Drosophila)
SGD (Levadura)
TAIR (Arabidopsis)
ENSEML (Hombre, ratón y
otros)
Uniprot
Swiss-prot
PDB
MMDB
SCOP
Bases de datos se secuencias
de nucleótidos:
Bases de datos de genomas
de organismos concretos:
Bases de datos de proteínas:
Pubmed
KEGG
OMIM
Genbank
Refseq
Uniprot
PDB, Protein Data
Bank
PubMed
Bibliografía:
Rutas metabólicas:
Enfermedades genéticas
humanas:
Bases de datos de
secuencias
(2)
Base de datos de
Refseq
Es una base incorpora a NCBI que
toma los datos de GenBank y de bases
de proteinas y proyectos genomas con
el fin de hacer una anotación
ordenada. Es una base curada (3)
2.
3
Base de datos de
Genbank
GenBank es una base de datos
exhaustiva, una colección anotada de
las secuencias de nucleótidos
disponibles al público de decenas de
miles de organismos. (4)
4
Juan Antonio Gallegos López*
Dana Julissa Alvarado Villarreal
1- Riba, J., Riba, J., Riba, J., Riba, J., Riba, J. & Riba, J. (2021, 21 enero). NCBI – National Center for Biotechnology Information.
Enfocatss. https://enfocatss.com/buscadores/ncbi-national-center-for-biotechnology-information/
2- Bases de datos biológicas — Bioinformatics at COMAV 0.1 documentation. (s. f.).
https://bioinf.comav.upv.es/courses/intro_bioinf/bases_datos.html
3- Mongiardini, E. file:///C:/Users/soyda/Downloads/bases%20de%20datos_Elias.pdf
4- Cañedo, R., Rodríguez, R. & Vázquez, Y. (2009, abril). Centro Nacional para la Información Biotecnológica de los Estados Unidos:
un palacio de la información para la medicina molecular. SciELO.
Referencias
Genbank
Es un almacén público de secuencias.
No modifican las secuencias sin el
consentimiento de los autores.
Es redundante, pueden haber varias
secuencias para un gen determinado,
etc
(2)
RefSeq
Es una base de datos secundaria.
Es una colección de secuencias de ADN,
ARN y proteínas mantenida y revisada.
Sólo tiene una secuencia por gen y
organismo.
(2)